Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2H4H9

Protein Details
Accession A0A0D2H4H9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
114-137EEVTVSKSKRNKSKRRSLSPSSSSHydrophilic
346-373LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
122-129KRNKSKRR
352-365KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.833, cyto 8, cyto_mito 6.833, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MTAKNKGSQGSGTGPSPQLLALVLSFLTDNGLEHTKKAFTRELQRLQDKFGWSTPESVQEGVSLQMIVESWKQNGASSPDLDSESDVTSSEGESSSNAVRDEDTSSDDSSESEEEVTVSKSKRNKSKRRSLSPSSSSSDSDADDEEEDGVEEPFTKPGKQALAHEPAVKNTLKRKAESSSSESSSSDSDSDSPDDDRRAKRARIAEGAVMNDIASSEGSASDSQEESDENATTASSESEEEEEESDVDDPPVNGTKMDAESEAPSDSSGTVVGDNLEAAKSSDSEDVADEKVEPATKHTKTPAMKKKHVGAKPTPLAQLSAQAIADSHISNAYRSYGYADRAYKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDISGGKGFKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.28
3 0.27
4 0.22
5 0.16
6 0.13
7 0.13
8 0.08
9 0.08
10 0.07
11 0.07
12 0.07
13 0.07
14 0.07
15 0.06
16 0.07
17 0.1
18 0.15
19 0.15
20 0.17
21 0.2
22 0.23
23 0.25
24 0.29
25 0.32
26 0.34
27 0.44
28 0.53
29 0.59
30 0.64
31 0.71
32 0.68
33 0.67
34 0.65
35 0.58
36 0.51
37 0.45
38 0.42
39 0.34
40 0.37
41 0.32
42 0.33
43 0.32
44 0.29
45 0.26
46 0.21
47 0.2
48 0.17
49 0.16
50 0.09
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.08
55 0.11
56 0.12
57 0.12
58 0.15
59 0.15
60 0.15
61 0.19
62 0.22
63 0.22
64 0.21
65 0.23
66 0.22
67 0.23
68 0.23
69 0.2
70 0.17
71 0.14
72 0.13
73 0.11
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.09
82 0.1
83 0.12
84 0.12
85 0.11
86 0.12
87 0.13
88 0.15
89 0.14
90 0.16
91 0.16
92 0.16
93 0.16
94 0.15
95 0.14
96 0.14
97 0.13
98 0.1
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.1
104 0.12
105 0.12
106 0.16
107 0.22
108 0.29
109 0.39
110 0.49
111 0.59
112 0.65
113 0.76
114 0.82
115 0.86
116 0.88
117 0.86
118 0.85
119 0.8
120 0.75
121 0.68
122 0.59
123 0.49
124 0.42
125 0.35
126 0.26
127 0.21
128 0.16
129 0.13
130 0.11
131 0.1
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.13
145 0.16
146 0.17
147 0.21
148 0.24
149 0.3
150 0.31
151 0.34
152 0.32
153 0.29
154 0.31
155 0.27
156 0.23
157 0.24
158 0.31
159 0.29
160 0.3
161 0.32
162 0.32
163 0.36
164 0.38
165 0.38
166 0.34
167 0.34
168 0.33
169 0.31
170 0.28
171 0.23
172 0.2
173 0.14
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.11
181 0.13
182 0.18
183 0.18
184 0.24
185 0.28
186 0.28
187 0.32
188 0.36
189 0.37
190 0.36
191 0.36
192 0.33
193 0.29
194 0.28
195 0.23
196 0.18
197 0.14
198 0.1
199 0.08
200 0.05
201 0.04
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.09
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.08
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.11
243 0.11
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.11
248 0.12
249 0.12
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.08
254 0.07
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.11
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.1
277 0.1
278 0.11
279 0.13
280 0.12
281 0.15
282 0.24
283 0.25
284 0.28
285 0.31
286 0.38
287 0.41
288 0.52
289 0.57
290 0.58
291 0.64
292 0.67
293 0.72
294 0.74
295 0.73
296 0.7
297 0.67
298 0.68
299 0.66
300 0.64
301 0.57
302 0.48
303 0.46
304 0.38
305 0.36
306 0.27
307 0.23
308 0.19
309 0.16
310 0.16
311 0.14
312 0.15
313 0.1
314 0.09
315 0.1
316 0.11
317 0.12
318 0.13
319 0.14
320 0.13
321 0.13
322 0.18
323 0.18
324 0.22
325 0.28
326 0.3
327 0.3
328 0.31
329 0.32
330 0.28
331 0.27
332 0.27
333 0.27
334 0.31
335 0.31
336 0.33
337 0.37
338 0.38
339 0.43
340 0.46
341 0.51
342 0.55
343 0.63
344 0.7
345 0.76
346 0.85
347 0.86
348 0.9
349 0.91
350 0.9
351 0.9
352 0.87
353 0.86
354 0.84
355 0.77
356 0.67
357 0.56
358 0.49
359 0.39
360 0.33
361 0.25
362 0.17
363 0.14