Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2IRR6

Protein Details
Accession A0A0D2IRR6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-35PNPNSRRCRLHIRQQPRAARAHydrophilic
243-266GFPLKLKKGTREGGRRRRQQSGENBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
247-260KLKKGTREGGRRRR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.5, nucl 12, cyto 11, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021740  Velvet  
IPR037525  Velvet_dom  
IPR038491  Velvet_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF11754  Velvet  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51821  VELVET  
Amino Acid Sequences MGAPLEAQETLAKMPNPNSRRCRLHIRQQPRAARAGPDGKDRRAIDPPPILQLLMNDFDPDSPDDVAEIQSQFWIVHCRLVAGHAPDVDVSTVHHTTEDGKKEVQRLLLGTWVASPTTTQDDPDPQTMPSHPQTRPPTDPPPSPTTRFLPNPAEQGPGKAARHPYQIPGCFFIFADISVRRAGEYRLHFTLMKMDETFLEKGSLLPCIHQVTSEVFRVVNAKDFDQVQPSTNLVKGLLDRGAGFPLKLKKGTREGGRRRRQQSGENSDDDSRSEDNEY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.35
3 0.39
4 0.48
5 0.54
6 0.58
7 0.64
8 0.66
9 0.7
10 0.69
11 0.75
12 0.76
13 0.78
14 0.8
15 0.83
16 0.85
17 0.78
18 0.75
19 0.66
20 0.59
21 0.56
22 0.54
23 0.47
24 0.49
25 0.51
26 0.47
27 0.53
28 0.51
29 0.48
30 0.47
31 0.46
32 0.43
33 0.45
34 0.44
35 0.4
36 0.39
37 0.35
38 0.28
39 0.27
40 0.23
41 0.18
42 0.16
43 0.13
44 0.12
45 0.12
46 0.14
47 0.14
48 0.12
49 0.1
50 0.1
51 0.1
52 0.11
53 0.12
54 0.12
55 0.11
56 0.09
57 0.09
58 0.1
59 0.09
60 0.09
61 0.13
62 0.11
63 0.13
64 0.13
65 0.14
66 0.13
67 0.15
68 0.18
69 0.16
70 0.17
71 0.15
72 0.15
73 0.15
74 0.15
75 0.13
76 0.09
77 0.08
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.14
84 0.2
85 0.23
86 0.2
87 0.22
88 0.24
89 0.27
90 0.29
91 0.26
92 0.21
93 0.19
94 0.17
95 0.18
96 0.16
97 0.13
98 0.11
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.06
104 0.1
105 0.1
106 0.11
107 0.11
108 0.15
109 0.17
110 0.19
111 0.19
112 0.15
113 0.16
114 0.16
115 0.19
116 0.2
117 0.24
118 0.22
119 0.3
120 0.35
121 0.39
122 0.43
123 0.44
124 0.46
125 0.44
126 0.47
127 0.43
128 0.44
129 0.43
130 0.41
131 0.39
132 0.35
133 0.36
134 0.35
135 0.34
136 0.33
137 0.31
138 0.32
139 0.29
140 0.3
141 0.25
142 0.24
143 0.22
144 0.22
145 0.2
146 0.2
147 0.23
148 0.23
149 0.28
150 0.27
151 0.3
152 0.32
153 0.35
154 0.34
155 0.32
156 0.3
157 0.26
158 0.25
159 0.2
160 0.14
161 0.11
162 0.13
163 0.1
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.11
169 0.12
170 0.16
171 0.19
172 0.23
173 0.24
174 0.26
175 0.26
176 0.25
177 0.31
178 0.25
179 0.23
180 0.19
181 0.18
182 0.17
183 0.2
184 0.21
185 0.14
186 0.14
187 0.12
188 0.13
189 0.13
190 0.16
191 0.12
192 0.12
193 0.15
194 0.17
195 0.17
196 0.16
197 0.17
198 0.17
199 0.2
200 0.21
201 0.18
202 0.16
203 0.16
204 0.19
205 0.18
206 0.2
207 0.18
208 0.18
209 0.2
210 0.22
211 0.22
212 0.25
213 0.25
214 0.21
215 0.21
216 0.22
217 0.22
218 0.21
219 0.2
220 0.15
221 0.16
222 0.15
223 0.16
224 0.15
225 0.14
226 0.14
227 0.14
228 0.17
229 0.16
230 0.15
231 0.18
232 0.24
233 0.28
234 0.33
235 0.35
236 0.38
237 0.46
238 0.54
239 0.58
240 0.62
241 0.69
242 0.75
243 0.82
244 0.85
245 0.83
246 0.85
247 0.8
248 0.79
249 0.79
250 0.78
251 0.74
252 0.67
253 0.65
254 0.58
255 0.53
256 0.45
257 0.37
258 0.28