Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2IRM5

Protein Details
Accession A0A0D2IRM5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-48LMSPKAKQQKQQPCKLQGLKKHydrophilic
239-260LKKDCRCWRCGKMFGNKFKQLKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, pero 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019808  Histidine_triad_CS  
IPR011146  HIT-like  
IPR036265  HIT-like_sf  
IPR032566  Znf-C2HE  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003824  F:catalytic activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006139  P:nucleobase-containing compound metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF11969  DcpS_C  
PF16278  zf-C2HE  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00892  HIT_1  
PS51084  HIT_2  
Amino Acid Sequences MNAIADGDAGEETSQPPSSTKRNAFAELMSPKAKQQKQQPCKLQGLKKLSNPKDWKNGLLTYILEPSKYSPGMVILHNDKTVLIRDAFPKATVHLLLLPRDPSKRDLHPRDALNDQAFLDMMRAEAAVAVKLAASELSRLISPYSESCEARISAMESDDPPDELPPGRDFSKECRVGIHAHPSMNHLHVHIISRDMHSDRLKNQKHYNSFNTDFFIPLEDFPLSSDDVRRSVSYQNGNLKKDCRCWRCGKMFGNKFKQLKDHLEDEFDAWKKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.14
4 0.19
5 0.26
6 0.35
7 0.39
8 0.44
9 0.48
10 0.51
11 0.5
12 0.46
13 0.47
14 0.41
15 0.41
16 0.35
17 0.31
18 0.32
19 0.41
20 0.43
21 0.42
22 0.49
23 0.56
24 0.63
25 0.73
26 0.78
27 0.75
28 0.81
29 0.83
30 0.8
31 0.77
32 0.77
33 0.73
34 0.71
35 0.74
36 0.69
37 0.71
38 0.71
39 0.69
40 0.69
41 0.65
42 0.61
43 0.55
44 0.52
45 0.43
46 0.37
47 0.31
48 0.23
49 0.26
50 0.23
51 0.18
52 0.17
53 0.18
54 0.2
55 0.19
56 0.17
57 0.12
58 0.15
59 0.17
60 0.17
61 0.19
62 0.19
63 0.2
64 0.2
65 0.2
66 0.17
67 0.16
68 0.17
69 0.15
70 0.13
71 0.13
72 0.15
73 0.19
74 0.19
75 0.19
76 0.18
77 0.16
78 0.17
79 0.15
80 0.13
81 0.14
82 0.15
83 0.16
84 0.17
85 0.18
86 0.19
87 0.2
88 0.21
89 0.21
90 0.24
91 0.3
92 0.39
93 0.44
94 0.48
95 0.53
96 0.52
97 0.52
98 0.49
99 0.44
100 0.35
101 0.29
102 0.22
103 0.16
104 0.15
105 0.11
106 0.09
107 0.06
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.03
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.03
119 0.04
120 0.03
121 0.03
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.1
132 0.13
133 0.13
134 0.13
135 0.15
136 0.15
137 0.14
138 0.14
139 0.11
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.1
152 0.1
153 0.12
154 0.13
155 0.14
156 0.15
157 0.21
158 0.3
159 0.3
160 0.29
161 0.28
162 0.29
163 0.32
164 0.33
165 0.36
166 0.29
167 0.27
168 0.28
169 0.28
170 0.28
171 0.26
172 0.23
173 0.15
174 0.14
175 0.14
176 0.16
177 0.15
178 0.15
179 0.15
180 0.15
181 0.18
182 0.18
183 0.22
184 0.23
185 0.26
186 0.3
187 0.39
188 0.44
189 0.47
190 0.55
191 0.58
192 0.63
193 0.66
194 0.66
195 0.64
196 0.63
197 0.57
198 0.52
199 0.43
200 0.37
201 0.3
202 0.26
203 0.19
204 0.15
205 0.16
206 0.13
207 0.12
208 0.12
209 0.14
210 0.12
211 0.12
212 0.15
213 0.15
214 0.17
215 0.19
216 0.19
217 0.2
218 0.23
219 0.29
220 0.33
221 0.37
222 0.46
223 0.51
224 0.53
225 0.55
226 0.56
227 0.54
228 0.57
229 0.61
230 0.57
231 0.58
232 0.63
233 0.69
234 0.73
235 0.77
236 0.75
237 0.76
238 0.8
239 0.82
240 0.83
241 0.82
242 0.78
243 0.73
244 0.71
245 0.67
246 0.66
247 0.62
248 0.57
249 0.5
250 0.5
251 0.47
252 0.42
253 0.43