Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2J4I4

Protein Details
Accession A0A0D2J4I4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-133FQSVDEKMGRKRKRPREAREKEEEEEBasic
166-185PGDLTGKNRRSKQNLRQRFYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-128MGRKRKRPREAREK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_mito 7.5, cyto 7, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF14559  TPR_19  
PF13181  TPR_8  
Amino Acid Sequences MASRRDFLNQQAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSAEQIQEALARRAQQLGAAPPTAYGAIDKRGQEQEEDDDERFQDPDNESGLFASGHYDENDDEADRIFQSVDEKMGRKRKRPREAREKEEEEEYKRKNPTVQQQFADLKRPLATISDEEWANLPDPGDLTGKNRRSKQNLRQRFYAVPDSVLAGARDATEFQTSVQDDGVESSVSVDNKDGTMTNFADIGAARDKVLKARLDRAAQADAGTGSASTIDPKGYLTSLATSELKAIEVDVGDINRVRVLLESLIKTNPKHAPGWIAIARLEEVAGKIVTARKLMAQGCEQCPKSEDAWLENIRLNDSHNAKIIAANAIKNNERSTRLWIEAMKLESDPRAKKRVLRQAIDHIPQSVAIWKEAVNLEEDPEDAKLLLAKATEIIPLSVELWLALARLESPENAQAVLNKARKAVPTSHEIWIAAARLQEQMGNANKVNIMNRAVKALAKEGAMLKREEWITEAEKCEEEGAVLTCGAIIRETLGWSLDEDDDRKEVFKDDASASIGRGKYETARAIYAYALRIFPTSKSLWTAAADLERNHGTKEALWQLLEKAVEACPQSEVLWLQLAREKWHAGEVDDARRVLAKAFNQNPNNEEIWLAAVKLEADAKQVDQARELLATARQEAPTERVWYKSAAYERQLGNIDIALDLVLQGLTSTVVNKKETRFPRSAKLWMMKGQIYEDKGMIPQAREAYSQGTRSCPKSASLWLLAARLELKEGVIIKARSVLDRARLQNPKNAELWAESVRVELQAKPPNVQQAKILMSKALQECPKSGLLWSENIWHLQPRTQRKPLSLEAIKAVDNDPILFVTVARIFWSERRLDKAMSWFEKAIVLDSDLGDTWAWYLKFLTQHGTDEKREDVIAKCVASEPKHGEVWQRVRKDPRNAYLSTREVLKVVMSQLQSKEPMN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.31
3 0.23
4 0.2
5 0.15
6 0.12
7 0.1
8 0.09
9 0.08
10 0.09
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.31
26 0.28
27 0.33
28 0.32
29 0.27
30 0.25
31 0.22
32 0.2
33 0.25
34 0.25
35 0.21
36 0.21
37 0.23
38 0.23
39 0.26
40 0.25
41 0.22
42 0.24
43 0.27
44 0.28
45 0.27
46 0.26
47 0.23
48 0.24
49 0.22
50 0.17
51 0.14
52 0.13
53 0.16
54 0.21
55 0.22
56 0.26
57 0.31
58 0.32
59 0.31
60 0.32
61 0.33
62 0.35
63 0.38
64 0.34
65 0.3
66 0.3
67 0.29
68 0.27
69 0.21
70 0.21
71 0.19
72 0.21
73 0.21
74 0.21
75 0.2
76 0.2
77 0.2
78 0.14
79 0.12
80 0.11
81 0.1
82 0.11
83 0.12
84 0.13
85 0.12
86 0.14
87 0.15
88 0.13
89 0.12
90 0.11
91 0.12
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.09
96 0.11
97 0.12
98 0.16
99 0.19
100 0.22
101 0.3
102 0.4
103 0.47
104 0.54
105 0.64
106 0.71
107 0.77
108 0.84
109 0.87
110 0.88
111 0.91
112 0.9
113 0.9
114 0.85
115 0.77
116 0.75
117 0.69
118 0.64
119 0.63
120 0.58
121 0.55
122 0.53
123 0.53
124 0.5
125 0.53
126 0.57
127 0.59
128 0.62
129 0.56
130 0.6
131 0.65
132 0.61
133 0.61
134 0.51
135 0.42
136 0.37
137 0.35
138 0.28
139 0.23
140 0.24
141 0.19
142 0.2
143 0.22
144 0.2
145 0.2
146 0.21
147 0.19
148 0.17
149 0.15
150 0.12
151 0.09
152 0.1
153 0.11
154 0.12
155 0.12
156 0.16
157 0.25
158 0.32
159 0.39
160 0.46
161 0.52
162 0.6
163 0.7
164 0.76
165 0.77
166 0.81
167 0.8
168 0.78
169 0.74
170 0.69
171 0.64
172 0.61
173 0.51
174 0.41
175 0.36
176 0.32
177 0.28
178 0.25
179 0.19
180 0.11
181 0.11
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.15
190 0.15
191 0.15
192 0.15
193 0.13
194 0.12
195 0.13
196 0.14
197 0.08
198 0.07
199 0.09
200 0.12
201 0.12
202 0.12
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.12
207 0.11
208 0.09
209 0.14
210 0.14
211 0.14
212 0.13
213 0.13
214 0.13
215 0.12
216 0.13
217 0.12
218 0.11
219 0.11
220 0.14
221 0.14
222 0.17
223 0.22
224 0.24
225 0.24
226 0.31
227 0.36
228 0.36
229 0.39
230 0.38
231 0.36
232 0.31
233 0.28
234 0.22
235 0.16
236 0.14
237 0.11
238 0.07
239 0.05
240 0.06
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.09
248 0.08
249 0.09
250 0.08
251 0.09
252 0.1
253 0.13
254 0.13
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.1
260 0.09
261 0.07
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.08
274 0.09
275 0.12
276 0.13
277 0.15
278 0.18
279 0.2
280 0.2
281 0.25
282 0.27
283 0.26
284 0.26
285 0.25
286 0.27
287 0.26
288 0.32
289 0.27
290 0.24
291 0.21
292 0.21
293 0.2
294 0.16
295 0.14
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.07
302 0.1
303 0.11
304 0.11
305 0.12
306 0.11
307 0.16
308 0.18
309 0.19
310 0.21
311 0.25
312 0.28
313 0.35
314 0.34
315 0.3
316 0.3
317 0.3
318 0.26
319 0.25
320 0.23
321 0.18
322 0.24
323 0.25
324 0.25
325 0.24
326 0.24
327 0.21
328 0.2
329 0.19
330 0.19
331 0.2
332 0.2
333 0.2
334 0.2
335 0.19
336 0.2
337 0.19
338 0.18
339 0.16
340 0.16
341 0.16
342 0.18
343 0.2
344 0.2
345 0.21
346 0.2
347 0.23
348 0.22
349 0.27
350 0.28
351 0.28
352 0.29
353 0.27
354 0.27
355 0.26
356 0.25
357 0.19
358 0.16
359 0.15
360 0.16
361 0.21
362 0.24
363 0.25
364 0.29
365 0.3
366 0.35
367 0.44
368 0.52
369 0.54
370 0.52
371 0.52
372 0.55
373 0.61
374 0.57
375 0.49
376 0.39
377 0.31
378 0.28
379 0.24
380 0.19
381 0.12
382 0.1
383 0.1
384 0.09
385 0.12
386 0.12
387 0.12
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.1
392 0.1
393 0.08
394 0.08
395 0.07
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.06
401 0.05
402 0.05
403 0.06
404 0.06
405 0.07
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.05
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.03
419 0.03
420 0.04
421 0.05
422 0.05
423 0.06
424 0.08
425 0.08
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.12
430 0.19
431 0.2
432 0.19
433 0.2
434 0.22
435 0.23
436 0.25
437 0.26
438 0.21
439 0.23
440 0.26
441 0.26
442 0.25
443 0.24
444 0.21
445 0.18
446 0.16
447 0.12
448 0.09
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.07
454 0.11
455 0.12
456 0.14
457 0.13
458 0.13
459 0.14
460 0.14
461 0.15
462 0.12
463 0.14
464 0.15
465 0.15
466 0.16
467 0.15
468 0.15
469 0.15
470 0.15
471 0.13
472 0.1
473 0.11
474 0.13
475 0.15
476 0.16
477 0.16
478 0.14
479 0.16
480 0.16
481 0.15
482 0.13
483 0.13
484 0.14
485 0.16
486 0.17
487 0.15
488 0.15
489 0.15
490 0.14
491 0.11
492 0.08
493 0.07
494 0.06
495 0.06
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.04
502 0.03
503 0.04
504 0.04
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.06
510 0.07
511 0.07
512 0.08
513 0.08
514 0.09
515 0.1
516 0.1
517 0.1
518 0.09
519 0.1
520 0.1
521 0.1
522 0.12
523 0.11
524 0.13
525 0.14
526 0.14
527 0.13
528 0.17
529 0.17
530 0.14
531 0.13
532 0.13
533 0.12
534 0.15
535 0.17
536 0.13
537 0.14
538 0.14
539 0.14
540 0.14
541 0.14
542 0.12
543 0.11
544 0.1
545 0.1
546 0.1
547 0.1
548 0.1
549 0.13
550 0.12
551 0.12
552 0.14
553 0.15
554 0.15
555 0.15
556 0.16
557 0.13
558 0.15
559 0.15
560 0.13
561 0.15
562 0.15
563 0.15
564 0.14
565 0.14
566 0.12
567 0.11
568 0.16
569 0.18
570 0.17
571 0.17
572 0.17
573 0.17
574 0.19
575 0.18
576 0.13
577 0.1
578 0.09
579 0.12
580 0.12
581 0.11
582 0.09
583 0.1
584 0.1
585 0.11
586 0.1
587 0.08
588 0.11
589 0.1
590 0.11
591 0.13
592 0.14
593 0.15
594 0.17
595 0.17
596 0.14
597 0.17
598 0.17
599 0.15
600 0.21
601 0.22
602 0.24
603 0.25
604 0.25
605 0.22
606 0.22
607 0.21
608 0.16
609 0.17
610 0.16
611 0.24
612 0.3
613 0.39
614 0.41
615 0.42
616 0.42
617 0.42
618 0.39
619 0.3
620 0.24
621 0.16
622 0.14
623 0.13
624 0.11
625 0.07
626 0.07
627 0.06
628 0.07
629 0.08
630 0.06
631 0.08
632 0.08
633 0.08
634 0.13
635 0.17
636 0.17
637 0.17
638 0.17
639 0.16
640 0.16
641 0.16
642 0.12
643 0.11
644 0.11
645 0.12
646 0.14
647 0.14
648 0.14
649 0.15
650 0.18
651 0.18
652 0.23
653 0.21
654 0.21
655 0.22
656 0.23
657 0.23
658 0.25
659 0.27
660 0.26
661 0.28
662 0.32
663 0.31
664 0.34
665 0.34
666 0.29
667 0.25
668 0.21
669 0.18
670 0.12
671 0.11
672 0.07
673 0.05
674 0.05
675 0.04
676 0.03
677 0.03
678 0.03
679 0.03
680 0.04
681 0.04
682 0.06
683 0.09
684 0.13
685 0.16
686 0.19
687 0.22
688 0.31
689 0.38
690 0.43
691 0.47
692 0.48
693 0.54
694 0.56
695 0.59
696 0.58
697 0.57
698 0.54
699 0.51
700 0.51
701 0.44
702 0.4
703 0.38
704 0.35
705 0.31
706 0.28
707 0.23
708 0.19
709 0.18
710 0.21
711 0.19
712 0.16
713 0.17
714 0.19
715 0.2
716 0.2
717 0.2
718 0.22
719 0.23
720 0.26
721 0.24
722 0.27
723 0.3
724 0.32
725 0.34
726 0.3
727 0.29
728 0.29
729 0.32
730 0.32
731 0.3
732 0.3
733 0.28
734 0.28
735 0.26
736 0.23
737 0.19
738 0.14
739 0.13
740 0.1
741 0.08
742 0.1
743 0.11
744 0.12
745 0.17
746 0.17
747 0.16
748 0.22
749 0.23
750 0.21
751 0.23
752 0.25
753 0.26
754 0.33
755 0.37
756 0.41
757 0.48
758 0.49
759 0.52
760 0.53
761 0.5
762 0.44
763 0.4
764 0.33
765 0.27
766 0.28
767 0.25
768 0.21
769 0.18
770 0.17
771 0.17
772 0.17
773 0.17
774 0.15
775 0.2
776 0.27
777 0.29
778 0.3
779 0.32
780 0.4
781 0.41
782 0.39
783 0.35
784 0.32
785 0.36
786 0.37
787 0.35
788 0.26
789 0.25
790 0.3
791 0.3
792 0.31
793 0.3
794 0.28
795 0.29
796 0.32
797 0.33
798 0.27
799 0.25
800 0.25
801 0.23
802 0.24
803 0.23
804 0.25
805 0.25
806 0.26
807 0.26
808 0.25
809 0.24
810 0.27
811 0.34
812 0.4
813 0.47
814 0.54
815 0.58
816 0.58
817 0.64
818 0.63
819 0.65
820 0.58
821 0.51
822 0.47
823 0.45
824 0.41
825 0.35
826 0.3
827 0.23
828 0.19
829 0.17
830 0.13
831 0.11
832 0.12
833 0.11
834 0.1
835 0.11
836 0.12
837 0.12
838 0.12
839 0.14
840 0.14
841 0.18
842 0.23
843 0.25
844 0.27
845 0.34
846 0.36
847 0.37
848 0.39
849 0.45
850 0.49
851 0.47
852 0.47
853 0.41
854 0.39
855 0.4
856 0.36
857 0.3
858 0.21
859 0.19
860 0.16
861 0.16
862 0.17
863 0.13
864 0.14
865 0.11
866 0.1
867 0.09
868 0.13
869 0.13
870 0.12
871 0.13
872 0.16
873 0.2
874 0.22
875 0.27
876 0.24
877 0.29
878 0.36
879 0.41
880 0.4
881 0.39
882 0.4
883 0.35
884 0.34
885 0.33
886 0.28
887 0.28
888 0.29
889 0.25
890 0.24
891 0.27
892 0.32
893 0.31
894 0.35
895 0.35
896 0.36
897 0.39
898 0.39
899 0.42
900 0.47
901 0.55
902 0.56
903 0.57
904 0.6
905 0.68
906 0.75
907 0.79
908 0.78
909 0.77
910 0.74
911 0.71
912 0.7
913 0.68
914 0.63
915 0.54
916 0.49
917 0.4
918 0.35
919 0.33
920 0.27
921 0.22
922 0.2
923 0.24
924 0.22
925 0.26
926 0.28
927 0.32