FuNGI

A0A0D2IEC8

Protein Details

Accession

A0A0D2IEC8

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
13-48	NQPPGTAPLVKRKKPRSDPFFKATRKPLPPGRPQVN	Hydrophilic
533-556	GTDASTRKKKLKSKHISSSQPTPG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
23-43	KRKKPRSDPFFKATRKPLPPG
419-437	KREAEARKKNFRDLRKALE
495-524	GRKGKRGGTPSDREGGVKKSSSARSLKRPG
539-546	RKKKLKSK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MNPGSAPAGGLANQPPGTAPLVKRKKPRSDPFFKATRKPLPPGRPQVNGHPTPPVNGHPPLKPPVLRTSTPNPPRAASPSKPPIPEHERVSGFSDPRLTAEGIPYKDYKLVTTKKDILNGLRYHILQLASDKAIDIRNESEFTKPARLHRRDPRAPPPGQQQKEEEQQEPKDGLNAAEREELNKRKEARQKEREANLAQIAPSQNAGKKMNAFKKKTQQVFRPDFSAEERRRIQTNYEEKLPWHLEDFDNKHCLIGHHQIGSMGSHAAFIFEPAVDTSTGKFRLIPIEKVYQFKPKREIAPQMSIEEVEAAMKKRGTDPEWLIRQREARIAEASREIAARQSKGLFSGAQTSTIAGRTGEEADLDYEDDFADDEEGDLFADKDEDEKFAEKRIKEDQLQANFLDFKDLKEYDEAEAREKREAEARKKNFRDLRKALERRERNYNHGSDSEYESSTDSEEERERLERERLANIKREEETEGKKSAVSSSGTNTPSGRKGKRGGTPSDREGGVKKSSSARSLKRPGSPNLSEASGTDASTRKKKLKSKHISSSQPTPGHSRAMSPANVPSGSSAPQTLDPSAVLKPRKRGAAGSAGSDTDPMVSDRDGGAMSDGSRARRLKLKMSASPPATGTGTPQPSSRAGSPAPRSAPSPGAGSPQVFPTHQDIKNAIPPQGITIKDLMKVVAHPKERRADFVALVKEVARMDKERAVLVLK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.18
3	0.19
4	0.21
5	0.24
6	0.26
7	0.32
8	0.42
9	0.5
10	0.59
11	0.67
12	0.75
13	0.8
14	0.87
15	0.87
16	0.86
17	0.87
18	0.85
19	0.85
20	0.8
21	0.78
22	0.77
23	0.76
24	0.73
25	0.73
26	0.75
27	0.75
28	0.78
29	0.8
30	0.78
31	0.76
32	0.73
33	0.75
34	0.75
35	0.69
36	0.6
37	0.58
38	0.52
39	0.47
40	0.47
41	0.41
42	0.37
43	0.4
44	0.42
45	0.38
46	0.43
47	0.45
48	0.49
49	0.47
50	0.45
51	0.48
52	0.51
53	0.48
54	0.49
55	0.51
56	0.55
57	0.61
58	0.62
59	0.55
60	0.5
61	0.52
62	0.53
63	0.54
64	0.46
65	0.49
66	0.52
67	0.56
68	0.58
69	0.56
70	0.58
71	0.58
72	0.61
73	0.55
74	0.54
75	0.5
76	0.48
77	0.51
78	0.48
79	0.4
80	0.36
81	0.36
82	0.28
83	0.27
84	0.28
85	0.24
86	0.2
87	0.25
88	0.29
89	0.27
90	0.3
91	0.29
92	0.28
93	0.3
94	0.29
95	0.26
96	0.28
97	0.34
98	0.36
99	0.43
100	0.49
101	0.49
102	0.53
103	0.54
104	0.5
105	0.51
106	0.47
107	0.43
108	0.39
109	0.36
110	0.32
111	0.32
112	0.27
113	0.19
114	0.2
115	0.2
116	0.17
117	0.17
118	0.15
119	0.14
120	0.17
121	0.17
122	0.17
123	0.16
124	0.18
125	0.2
126	0.21
127	0.22
128	0.21
129	0.24
130	0.29
131	0.29
132	0.36
133	0.45
134	0.5
135	0.56
136	0.63
137	0.71
138	0.72
139	0.78
140	0.79
141	0.77
142	0.74
143	0.71
144	0.71
145	0.71
146	0.66
147	0.62
148	0.56
149	0.54
150	0.6
151	0.58
152	0.51
153	0.47
154	0.45
155	0.45
156	0.41
157	0.35
158	0.29
159	0.25
160	0.22
161	0.22
162	0.21
163	0.19
164	0.22
165	0.22
166	0.23
167	0.29
168	0.34
169	0.31
170	0.37
171	0.38
172	0.42
173	0.5
174	0.58
175	0.62
176	0.66
177	0.73
178	0.76
179	0.77
180	0.75
181	0.69
182	0.61
183	0.53
184	0.44
185	0.34
186	0.29
187	0.25
188	0.18
189	0.18
190	0.17
191	0.16
192	0.2
193	0.22
194	0.21
195	0.26
196	0.34
197	0.43
198	0.5
199	0.53
200	0.56
201	0.64
202	0.71
203	0.74
204	0.73
205	0.71
206	0.72
207	0.74
208	0.68
209	0.61
210	0.53
211	0.46
212	0.43
213	0.45
214	0.37
215	0.37
216	0.38
217	0.38
218	0.4
219	0.4
220	0.38
221	0.38
222	0.45
223	0.41
224	0.42
225	0.4
226	0.38
227	0.43
228	0.41
229	0.31
230	0.24
231	0.23
232	0.2
233	0.27
234	0.31
235	0.28
236	0.29
237	0.28
238	0.26
239	0.25
240	0.24
241	0.22
242	0.25
243	0.24
244	0.22
245	0.22
246	0.23
247	0.22
248	0.21
249	0.17
250	0.1
251	0.07
252	0.07
253	0.06
254	0.07
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.05
259	0.06
260	0.05
261	0.07
262	0.06
263	0.07
264	0.07
265	0.11
266	0.12
267	0.12
268	0.12
269	0.12
270	0.2
271	0.23
272	0.25
273	0.24
274	0.31
275	0.33
276	0.35
277	0.36
278	0.38
279	0.38
280	0.4
281	0.42
282	0.39
283	0.42
284	0.44
285	0.51
286	0.46
287	0.5
288	0.47
289	0.42
290	0.37
291	0.32
292	0.27
293	0.19
294	0.14
295	0.07
296	0.07
297	0.07
298	0.09
299	0.09
300	0.09
301	0.12
302	0.16
303	0.17
304	0.21
305	0.24
306	0.3
307	0.38
308	0.39
309	0.38
310	0.37
311	0.37
312	0.33
313	0.34
314	0.27
315	0.21
316	0.23
317	0.22
318	0.21
319	0.19
320	0.18
321	0.14
322	0.13
323	0.11
324	0.12
325	0.13
326	0.12
327	0.12
328	0.13
329	0.12
330	0.13
331	0.14
332	0.1
333	0.09
334	0.15
335	0.14
336	0.14
337	0.14
338	0.13
339	0.13
340	0.13
341	0.13
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.07
346	0.07
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.06
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.03
360	0.03
361	0.03
362	0.04
363	0.03
364	0.04
365	0.04
366	0.03
367	0.04
368	0.03
369	0.05
370	0.05
371	0.06
372	0.07
373	0.09
374	0.1
375	0.15
376	0.2
377	0.19
378	0.22
379	0.26
380	0.3
381	0.3
382	0.37
383	0.39
384	0.37
385	0.39
386	0.36
387	0.32
388	0.28
389	0.26
390	0.23
391	0.16
392	0.13
393	0.16
394	0.16
395	0.16
396	0.16
397	0.18
398	0.14
399	0.19
400	0.19
401	0.19
402	0.22
403	0.22
404	0.23
405	0.22
406	0.22
407	0.24
408	0.31
409	0.36
410	0.43
411	0.5
412	0.57
413	0.59
414	0.67
415	0.67
416	0.67
417	0.68
418	0.62
419	0.64
420	0.65
421	0.68
422	0.67
423	0.7
424	0.7
425	0.63
426	0.69
427	0.63
428	0.58
429	0.59
430	0.54
431	0.46
432	0.41
433	0.39
434	0.31
435	0.33
436	0.28
437	0.22
438	0.2
439	0.18
440	0.17
441	0.16
442	0.14
443	0.09
444	0.1
445	0.11
446	0.11
447	0.12
448	0.14
449	0.15
450	0.18
451	0.21
452	0.22
453	0.23
454	0.29
455	0.34
456	0.35
457	0.42
458	0.4
459	0.41
460	0.38
461	0.37
462	0.35
463	0.34
464	0.35
465	0.32
466	0.32
467	0.28
468	0.27
469	0.26
470	0.23
471	0.21
472	0.18
473	0.15
474	0.16
475	0.23
476	0.23
477	0.24
478	0.24
479	0.23
480	0.29
481	0.35
482	0.34
483	0.33
484	0.39
485	0.44
486	0.5
487	0.53
488	0.55
489	0.55
490	0.59
491	0.56
492	0.54
493	0.48
494	0.42
495	0.39
496	0.35
497	0.3
498	0.24
499	0.24
500	0.27
501	0.29
502	0.34
503	0.4
504	0.41
505	0.47
506	0.55
507	0.59
508	0.59
509	0.63
510	0.61
511	0.62
512	0.58
513	0.51
514	0.44
515	0.4
516	0.32
517	0.26
518	0.27
519	0.19
520	0.17
521	0.17
522	0.19
523	0.22
524	0.29
525	0.34
526	0.36
527	0.44
528	0.51
529	0.59
530	0.66
531	0.73
532	0.76
533	0.81
534	0.83
535	0.84
536	0.82
537	0.8
538	0.77
539	0.69
540	0.61
541	0.57
542	0.5
543	0.45
544	0.4
545	0.33
546	0.3
547	0.32
548	0.31
549	0.26
550	0.27
551	0.26
552	0.26
553	0.23
554	0.2
555	0.18
556	0.18
557	0.17
558	0.15
559	0.13
560	0.16
561	0.18
562	0.17
563	0.16
564	0.15
565	0.16
566	0.19
567	0.23
568	0.27
569	0.29
570	0.36
571	0.4
572	0.45
573	0.45
574	0.44
575	0.43
576	0.46
577	0.43
578	0.4
579	0.36
580	0.32
581	0.3
582	0.27
583	0.22
584	0.12
585	0.12
586	0.09
587	0.09
588	0.09
589	0.1
590	0.1
591	0.11
592	0.1
593	0.09
594	0.1
595	0.09
596	0.1
597	0.14
598	0.16
599	0.17
600	0.24
601	0.25
602	0.27
603	0.34
604	0.37
605	0.4
606	0.47
607	0.53
608	0.54
609	0.59
610	0.65
611	0.59
612	0.58
613	0.5
614	0.44
615	0.38
616	0.3
617	0.28
618	0.28
619	0.3
620	0.28
621	0.29
622	0.29
623	0.3
624	0.34
625	0.32
626	0.29
627	0.27
628	0.35
629	0.4
630	0.44
631	0.45
632	0.42
633	0.42
634	0.41
635	0.41
636	0.34
637	0.32
638	0.26
639	0.28
640	0.29
641	0.28
642	0.25
643	0.26
644	0.27
645	0.24
646	0.25
647	0.27
648	0.34
649	0.35
650	0.38
651	0.36
652	0.39
653	0.47
654	0.47
655	0.41
656	0.34
657	0.32
658	0.32
659	0.36
660	0.32
661	0.26
662	0.27
663	0.27
664	0.28
665	0.28
666	0.24
667	0.19
668	0.22
669	0.28
670	0.32
671	0.39
672	0.41
673	0.48
674	0.57
675	0.57
676	0.59
677	0.56
678	0.52
679	0.48
680	0.51
681	0.49
682	0.4
683	0.39
684	0.34
685	0.31
686	0.28
687	0.27
688	0.23
689	0.22
690	0.25
691	0.29
692	0.3
693	0.29

A0A0D2IEC8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer