Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2IVQ6

Protein Details
Accession A0A0D2IVQ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
161-187EEGTGKGKGRGRGRRKKRDRDEVEDIABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
165-179GKGKGRGRGRRKKRD
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 11.5, cyto 10.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
Amino Acid Sequences MEPRARAGRHKASLNFGPELSALLYAYGAPTHPDIVKPIGRSSQQYLSTLPTPNTTHPPTPFNQPFPETLRVLDEILTDFIIETCHNAVSVATYSGRAKLKLSDFEFVLRRDSIKLGRVQEMFKKKRDIDNKKKLFDTNEGREGTKMAVGDLVNLGEVVGEEGTGKGKGRGRGRRKKRDRDEVEDIAGLGQNKENVGDDDLEERASKRAKSEVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.53
3 0.43
4 0.38
5 0.3
6 0.28
7 0.21
8 0.15
9 0.1
10 0.08
11 0.08
12 0.07
13 0.07
14 0.06
15 0.06
16 0.07
17 0.08
18 0.1
19 0.11
20 0.12
21 0.14
22 0.19
23 0.23
24 0.23
25 0.25
26 0.28
27 0.29
28 0.32
29 0.35
30 0.37
31 0.36
32 0.35
33 0.34
34 0.33
35 0.34
36 0.33
37 0.28
38 0.25
39 0.25
40 0.27
41 0.32
42 0.32
43 0.33
44 0.33
45 0.36
46 0.34
47 0.42
48 0.43
49 0.4
50 0.4
51 0.37
52 0.38
53 0.39
54 0.41
55 0.32
56 0.28
57 0.26
58 0.24
59 0.22
60 0.19
61 0.14
62 0.11
63 0.1
64 0.1
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.05
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.07
79 0.06
80 0.08
81 0.08
82 0.12
83 0.14
84 0.13
85 0.13
86 0.16
87 0.19
88 0.23
89 0.25
90 0.22
91 0.21
92 0.24
93 0.25
94 0.22
95 0.21
96 0.16
97 0.14
98 0.14
99 0.15
100 0.14
101 0.16
102 0.19
103 0.19
104 0.23
105 0.24
106 0.25
107 0.31
108 0.39
109 0.4
110 0.39
111 0.43
112 0.42
113 0.48
114 0.57
115 0.61
116 0.62
117 0.69
118 0.73
119 0.7
120 0.7
121 0.64
122 0.57
123 0.55
124 0.52
125 0.47
126 0.46
127 0.44
128 0.43
129 0.4
130 0.37
131 0.29
132 0.22
133 0.16
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.03
147 0.03
148 0.04
149 0.04
150 0.05
151 0.06
152 0.07
153 0.11
154 0.16
155 0.23
156 0.32
157 0.43
158 0.53
159 0.63
160 0.74
161 0.81
162 0.87
163 0.92
164 0.93
165 0.93
166 0.91
167 0.89
168 0.87
169 0.79
170 0.71
171 0.6
172 0.5
173 0.39
174 0.33
175 0.24
176 0.16
177 0.13
178 0.12
179 0.11
180 0.12
181 0.13
182 0.13
183 0.15
184 0.15
185 0.14
186 0.16
187 0.16
188 0.16
189 0.15
190 0.15
191 0.18
192 0.21
193 0.21
194 0.22