Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2HG48

Protein Details
Accession A0A0D2HG48    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
190-212SAPIEPPQPKRRQSGQRRQAVTPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 9.5, mito 9, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039745  Vps54  
IPR012501  Vps54_C  
IPR019515  VPS54_N  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000938  C:GARP complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Pfam View protein in Pfam  
PF07928  Vps54  
PF10475  Vps54_N  
Amino Acid Sequences MASPIRSGSQRTFTPPIATSPTTGYPFPDVVQRQHGGPRGDLRRGSTTSSITSIGGSLDTGPINNNTITEISQNAISILLQHPIVRTGLQASTAVPTSGYKVPTPRDIPPVALTNIPHVEPKAFQPYLAQVGSLYEAFQKAKNEGEGEGETSLFHRDKKDTKNEEWEAIMNQRLQRPGHSRAGSVSPAVSAPIEPPQPKRRQSGQRRQAVTPLSTIPSVYSEEDFHLENPRTFDIVSEHSEIVRDPSGAPNGRKSLATNAILQEKLSWYMDTVEVHLINSISTASKSFFSALGSLRELHREAADSVDRIQKLRKDLAKLDKEMALDGLKVVNLKQRRDNVRQLAQAIMQLEDIVKAVQNCEEMVEKGEIDEALDDLDHVEALMAGRDGKTSSLKEIPRYQKRDLRRIKALAGAFDDLNQLRYRAGRGYEARFHGSLLNDIRRHVEQTEVGVTLQRWGTAYTRPKPGQRRAPSAFPGYMNIGPELRAELEAEMKGLSRARCTTPAATSFRATVLREMKSMIRKQLPSANDDDNVSTISASTTGGRHMSQQDKSSILARNLRALDADDWYQMLATIYTNISEGLRRLSVQVKILLDITSNLPDHMVKSPPRSPDPGSVERVMSPPTGRPRSTSSVQAEMQQVLDLSSLLGEGVDLAQAQITKVVKVRSQQNVELPLSDFLKYFTLNKLFTDECEAISGRSGTALKNVVDTQIKDFVARFGDSQKHEIIRVMDSDKWDAKDFGDRENEILSRVMEGSTNDALPWIESTMIWQSMTNGSKTSNRTATNGADGATAKVRSAVIDEQKYILPESGLAMLQSMETFQHLAAGIPSMSHEVAILLLESLKLFNSRSSQLILGAGATRSAGLKNITTKHLALSSQALSFIIALIPYVREFFRRHLSSSTGPPVMNEFDKVKRLFQEHQNGIHEKLVDIMSGRASMHVKSMKNIDWEEVAKNKAVQVSPYMETLTKETATLQKVLAKHLPEPVVAGIMIPVFASYREQWTAAYQDVTIKSTAAKERLLADAEWFNSRISKIDGSGDLGERIVRVVQAKTVMNTAPSQPSAAPTTGDDTQEKMEVNEKDTAKDAGGLGKEEEAKT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.43
3 0.42
4 0.42
5 0.4
6 0.35
7 0.34
8 0.37
9 0.35
10 0.34
11 0.31
12 0.28
13 0.28
14 0.27
15 0.31
16 0.3
17 0.31
18 0.38
19 0.37
20 0.35
21 0.41
22 0.46
23 0.4
24 0.41
25 0.46
26 0.46
27 0.51
28 0.51
29 0.5
30 0.5
31 0.5
32 0.5
33 0.45
34 0.41
35 0.37
36 0.37
37 0.33
38 0.26
39 0.24
40 0.2
41 0.16
42 0.13
43 0.11
44 0.09
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.11
49 0.12
50 0.15
51 0.15
52 0.14
53 0.14
54 0.15
55 0.16
56 0.15
57 0.15
58 0.13
59 0.14
60 0.14
61 0.12
62 0.11
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.12
67 0.12
68 0.13
69 0.13
70 0.15
71 0.16
72 0.14
73 0.13
74 0.14
75 0.15
76 0.15
77 0.15
78 0.14
79 0.16
80 0.16
81 0.15
82 0.12
83 0.12
84 0.15
85 0.19
86 0.2
87 0.21
88 0.26
89 0.3
90 0.38
91 0.41
92 0.41
93 0.45
94 0.44
95 0.44
96 0.42
97 0.43
98 0.36
99 0.35
100 0.31
101 0.29
102 0.3
103 0.28
104 0.26
105 0.22
106 0.22
107 0.21
108 0.25
109 0.29
110 0.26
111 0.26
112 0.26
113 0.29
114 0.33
115 0.31
116 0.26
117 0.17
118 0.18
119 0.2
120 0.17
121 0.14
122 0.1
123 0.13
124 0.14
125 0.17
126 0.19
127 0.19
128 0.22
129 0.24
130 0.23
131 0.22
132 0.25
133 0.23
134 0.22
135 0.21
136 0.17
137 0.15
138 0.14
139 0.18
140 0.15
141 0.16
142 0.19
143 0.24
144 0.33
145 0.42
146 0.52
147 0.55
148 0.6
149 0.68
150 0.67
151 0.63
152 0.57
153 0.5
154 0.42
155 0.38
156 0.35
157 0.28
158 0.28
159 0.3
160 0.32
161 0.31
162 0.36
163 0.39
164 0.42
165 0.48
166 0.46
167 0.43
168 0.41
169 0.45
170 0.39
171 0.33
172 0.27
173 0.18
174 0.16
175 0.16
176 0.13
177 0.09
178 0.09
179 0.13
180 0.19
181 0.21
182 0.28
183 0.38
184 0.46
185 0.51
186 0.57
187 0.62
188 0.68
189 0.76
190 0.8
191 0.8
192 0.81
193 0.81
194 0.75
195 0.71
196 0.65
197 0.55
198 0.46
199 0.39
200 0.32
201 0.27
202 0.25
203 0.19
204 0.17
205 0.17
206 0.16
207 0.15
208 0.14
209 0.15
210 0.17
211 0.17
212 0.16
213 0.21
214 0.21
215 0.22
216 0.23
217 0.23
218 0.23
219 0.22
220 0.22
221 0.18
222 0.2
223 0.22
224 0.22
225 0.21
226 0.2
227 0.21
228 0.2
229 0.19
230 0.17
231 0.13
232 0.11
233 0.15
234 0.21
235 0.26
236 0.28
237 0.3
238 0.32
239 0.33
240 0.33
241 0.31
242 0.31
243 0.33
244 0.33
245 0.3
246 0.3
247 0.33
248 0.32
249 0.3
250 0.25
251 0.19
252 0.19
253 0.17
254 0.15
255 0.11
256 0.13
257 0.15
258 0.14
259 0.14
260 0.15
261 0.14
262 0.14
263 0.14
264 0.12
265 0.1
266 0.1
267 0.08
268 0.06
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.1
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.13
278 0.14
279 0.16
280 0.16
281 0.17
282 0.16
283 0.19
284 0.19
285 0.17
286 0.16
287 0.15
288 0.14
289 0.17
290 0.18
291 0.16
292 0.17
293 0.22
294 0.22
295 0.21
296 0.25
297 0.25
298 0.28
299 0.35
300 0.37
301 0.37
302 0.44
303 0.53
304 0.55
305 0.54
306 0.51
307 0.46
308 0.42
309 0.37
310 0.3
311 0.21
312 0.14
313 0.12
314 0.1
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.13
319 0.18
320 0.21
321 0.27
322 0.35
323 0.43
324 0.49
325 0.57
326 0.59
327 0.61
328 0.61
329 0.56
330 0.49
331 0.41
332 0.36
333 0.28
334 0.2
335 0.14
336 0.11
337 0.09
338 0.08
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.1
349 0.09
350 0.11
351 0.11
352 0.1
353 0.09
354 0.1
355 0.09
356 0.07
357 0.07
358 0.05
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.05
374 0.05
375 0.07
376 0.1
377 0.1
378 0.14
379 0.2
380 0.22
381 0.27
382 0.36
383 0.44
384 0.51
385 0.56
386 0.59
387 0.59
388 0.64
389 0.7
390 0.7
391 0.68
392 0.66
393 0.63
394 0.58
395 0.57
396 0.5
397 0.41
398 0.34
399 0.28
400 0.2
401 0.18
402 0.18
403 0.12
404 0.13
405 0.12
406 0.1
407 0.09
408 0.1
409 0.11
410 0.12
411 0.13
412 0.17
413 0.21
414 0.25
415 0.29
416 0.31
417 0.32
418 0.3
419 0.29
420 0.26
421 0.22
422 0.22
423 0.21
424 0.24
425 0.22
426 0.22
427 0.25
428 0.23
429 0.24
430 0.2
431 0.19
432 0.13
433 0.15
434 0.16
435 0.14
436 0.13
437 0.12
438 0.12
439 0.12
440 0.11
441 0.1
442 0.08
443 0.09
444 0.11
445 0.16
446 0.24
447 0.26
448 0.34
449 0.36
450 0.43
451 0.5
452 0.58
453 0.61
454 0.6
455 0.65
456 0.6
457 0.63
458 0.59
459 0.54
460 0.47
461 0.37
462 0.32
463 0.26
464 0.23
465 0.19
466 0.16
467 0.13
468 0.11
469 0.11
470 0.1
471 0.08
472 0.07
473 0.06
474 0.06
475 0.08
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.06
480 0.07
481 0.09
482 0.09
483 0.1
484 0.12
485 0.14
486 0.17
487 0.19
488 0.2
489 0.2
490 0.25
491 0.27
492 0.26
493 0.25
494 0.23
495 0.22
496 0.22
497 0.2
498 0.19
499 0.2
500 0.19
501 0.19
502 0.2
503 0.22
504 0.27
505 0.28
506 0.29
507 0.29
508 0.29
509 0.31
510 0.35
511 0.33
512 0.29
513 0.3
514 0.27
515 0.22
516 0.22
517 0.2
518 0.15
519 0.14
520 0.12
521 0.07
522 0.06
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.05
528 0.06
529 0.07
530 0.07
531 0.09
532 0.13
533 0.18
534 0.19
535 0.21
536 0.22
537 0.21
538 0.22
539 0.24
540 0.22
541 0.21
542 0.23
543 0.22
544 0.25
545 0.24
546 0.24
547 0.2
548 0.19
549 0.17
550 0.13
551 0.13
552 0.09
553 0.08
554 0.08
555 0.08
556 0.06
557 0.06
558 0.04
559 0.03
560 0.04
561 0.04
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.06
567 0.06
568 0.07
569 0.07
570 0.07
571 0.09
572 0.12
573 0.13
574 0.15
575 0.17
576 0.16
577 0.16
578 0.17
579 0.15
580 0.12
581 0.11
582 0.1
583 0.09
584 0.09
585 0.09
586 0.08
587 0.09
588 0.1
589 0.11
590 0.14
591 0.14
592 0.2
593 0.24
594 0.27
595 0.3
596 0.32
597 0.33
598 0.36
599 0.42
600 0.41
601 0.4
602 0.38
603 0.36
604 0.33
605 0.31
606 0.24
607 0.18
608 0.14
609 0.15
610 0.22
611 0.26
612 0.26
613 0.27
614 0.32
615 0.37
616 0.38
617 0.41
618 0.35
619 0.35
620 0.36
621 0.36
622 0.32
623 0.27
624 0.25
625 0.18
626 0.15
627 0.1
628 0.09
629 0.06
630 0.04
631 0.04
632 0.03
633 0.03
634 0.03
635 0.02
636 0.02
637 0.02
638 0.03
639 0.02
640 0.02
641 0.03
642 0.03
643 0.04
644 0.07
645 0.07
646 0.08
647 0.11
648 0.13
649 0.15
650 0.2
651 0.27
652 0.31
653 0.35
654 0.37
655 0.38
656 0.42
657 0.4
658 0.36
659 0.3
660 0.24
661 0.21
662 0.19
663 0.15
664 0.11
665 0.12
666 0.11
667 0.12
668 0.14
669 0.17
670 0.17
671 0.18
672 0.2
673 0.19
674 0.19
675 0.24
676 0.2
677 0.16
678 0.17
679 0.17
680 0.14
681 0.15
682 0.14
683 0.08
684 0.09
685 0.1
686 0.08
687 0.11
688 0.13
689 0.12
690 0.14
691 0.14
692 0.16
693 0.17
694 0.18
695 0.18
696 0.2
697 0.2
698 0.19
699 0.19
700 0.18
701 0.18
702 0.17
703 0.15
704 0.15
705 0.2
706 0.22
707 0.24
708 0.26
709 0.24
710 0.24
711 0.26
712 0.23
713 0.19
714 0.19
715 0.19
716 0.18
717 0.18
718 0.21
719 0.22
720 0.22
721 0.22
722 0.2
723 0.19
724 0.25
725 0.24
726 0.25
727 0.27
728 0.26
729 0.25
730 0.27
731 0.26
732 0.19
733 0.19
734 0.14
735 0.11
736 0.11
737 0.1
738 0.09
739 0.09
740 0.12
741 0.12
742 0.12
743 0.1
744 0.11
745 0.1
746 0.1
747 0.1
748 0.06
749 0.06
750 0.06
751 0.08
752 0.1
753 0.11
754 0.11
755 0.1
756 0.11
757 0.17
758 0.18
759 0.17
760 0.15
761 0.17
762 0.22
763 0.25
764 0.29
765 0.29
766 0.3
767 0.31
768 0.34
769 0.34
770 0.32
771 0.29
772 0.24
773 0.19
774 0.18
775 0.17
776 0.16
777 0.15
778 0.11
779 0.12
780 0.12
781 0.1
782 0.13
783 0.17
784 0.21
785 0.23
786 0.24
787 0.24
788 0.25
789 0.26
790 0.24
791 0.18
792 0.12
793 0.1
794 0.1
795 0.1
796 0.09
797 0.08
798 0.08
799 0.07
800 0.07
801 0.07
802 0.06
803 0.05
804 0.05
805 0.06
806 0.05
807 0.07
808 0.07
809 0.08
810 0.07
811 0.08
812 0.08
813 0.07
814 0.08
815 0.08
816 0.08
817 0.08
818 0.07
819 0.06
820 0.06
821 0.06
822 0.06
823 0.04
824 0.04
825 0.04
826 0.05
827 0.05
828 0.05
829 0.06
830 0.07
831 0.09
832 0.13
833 0.15
834 0.17
835 0.19
836 0.19
837 0.19
838 0.19
839 0.16
840 0.13
841 0.12
842 0.11
843 0.08
844 0.08
845 0.07
846 0.07
847 0.07
848 0.09
849 0.09
850 0.12
851 0.18
852 0.21
853 0.24
854 0.26
855 0.26
856 0.26
857 0.27
858 0.24
859 0.2
860 0.21
861 0.2
862 0.18
863 0.18
864 0.16
865 0.13
866 0.13
867 0.11
868 0.07
869 0.05
870 0.05
871 0.05
872 0.06
873 0.06
874 0.08
875 0.08
876 0.12
877 0.14
878 0.19
879 0.28
880 0.3
881 0.33
882 0.35
883 0.4
884 0.4
885 0.45
886 0.46
887 0.39
888 0.36
889 0.34
890 0.34
891 0.32
892 0.29
893 0.25
894 0.22
895 0.23
896 0.3
897 0.31
898 0.31
899 0.33
900 0.37
901 0.41
902 0.46
903 0.53
904 0.52
905 0.56
906 0.59
907 0.57
908 0.53
909 0.49
910 0.41
911 0.3
912 0.28
913 0.22
914 0.16
915 0.14
916 0.13
917 0.11
918 0.12
919 0.12
920 0.12
921 0.13
922 0.13
923 0.19
924 0.24
925 0.24
926 0.27
927 0.32
928 0.33
929 0.37
930 0.38
931 0.33
932 0.31
933 0.32
934 0.33
935 0.32
936 0.3
937 0.26
938 0.26
939 0.26
940 0.27
941 0.25
942 0.23
943 0.23
944 0.26
945 0.26
946 0.26
947 0.26
948 0.22
949 0.23
950 0.24
951 0.23
952 0.18
953 0.17
954 0.18
955 0.23
956 0.24
957 0.25
958 0.24
959 0.25
960 0.26
961 0.31
962 0.33
963 0.3
964 0.3
965 0.34
966 0.34
967 0.3
968 0.3
969 0.26
970 0.22
971 0.19
972 0.16
973 0.11
974 0.09
975 0.09
976 0.06
977 0.06
978 0.05
979 0.06
980 0.1
981 0.1
982 0.16
983 0.17
984 0.18
985 0.19
986 0.21
987 0.24
988 0.23
989 0.22
990 0.18
991 0.22
992 0.23
993 0.24
994 0.21
995 0.19
996 0.18
997 0.23
998 0.28
999 0.26
1000 0.25
1001 0.25
1002 0.28
1003 0.31
1004 0.32
1005 0.26
1006 0.24
1007 0.25
1008 0.26
1009 0.26
1010 0.25
1011 0.22
1012 0.22
1013 0.22
1014 0.21
1015 0.21
1016 0.21
1017 0.2
1018 0.24
1019 0.25
1020 0.26
1021 0.29
1022 0.27
1023 0.24
1024 0.22
1025 0.2
1026 0.16
1027 0.16
1028 0.13
1029 0.12
1030 0.13
1031 0.14
1032 0.16
1033 0.21
1034 0.23
1035 0.23
1036 0.26
1037 0.25
1038 0.24
1039 0.25
1040 0.26
1041 0.27
1042 0.25
1043 0.26
1044 0.23
1045 0.26
1046 0.27
1047 0.26
1048 0.23
1049 0.2
1050 0.24
1051 0.25
1052 0.28
1053 0.25
1054 0.23
1055 0.25
1056 0.26
1057 0.25
1058 0.21
1059 0.26
1060 0.25
1061 0.28
1062 0.33
1063 0.32
1064 0.31
1065 0.33
1066 0.33
1067 0.26
1068 0.26
1069 0.24
1070 0.22
1071 0.22
1072 0.22
1073 0.21
1074 0.23