Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2IF39

Protein Details
Accession A0A0D2IF39    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
219-241APVSGKKKEKAPKQPKPPKAAPPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
223-239GKKKEKAPKQPKPPKAA
Subcellular Location(s) cyto_nucl 15.333, nucl 13, cyto 12.5, mito_nucl 8.165
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR002547  tRNA-bd_dom  
Gene Ontology GO:0000049  F:tRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01588  tRNA_bind  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50886  TRBD  
Amino Acid Sequences MSQILRSAQCPVMNDSHHCDPFASIDIFRHPHHCLNRVQGTDKRYNLRRRSTESPSPVTETVLRPGVTPQHDIVQVQNQEQEESATTTVRTEVKFPISENLPGRVSVVDDTSRQSASARAPLLANLGIEISSRSTLCSPQDPSNEEDQPMTSETSSAPAQHKSLVVGRTKPRPEIPPSSTTTMESPTDQTPSTEAKETLDHGIPENLKSNSSTDRPADAPVSGKKKEKAPKQPKPPKAAPPTAPLSPALIDLRVGHILRAIHHPNADSLYVSTIAMGDPEGTEHTEIDEATGKVVRTVCSGLNGLVALEEMQDRKVVVVANLKPVNMRSIKSAAMVLAASPPAEEGADPHATDRVVELVTPPSGAEAGDPVFFEGWPYGEGRGPEKQLNPKKKQWEAIQPGFYTSDDCVVGFDAGKSEVEGDQKGTLVVEGKGKCTVKSLKGAVVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.41
3 0.45
4 0.44
5 0.42
6 0.37
7 0.32
8 0.31
9 0.32
10 0.27
11 0.2
12 0.21
13 0.27
14 0.29
15 0.3
16 0.31
17 0.31
18 0.37
19 0.42
20 0.46
21 0.45
22 0.51
23 0.57
24 0.57
25 0.59
26 0.56
27 0.57
28 0.59
29 0.6
30 0.59
31 0.61
32 0.67
33 0.7
34 0.75
35 0.76
36 0.75
37 0.77
38 0.77
39 0.77
40 0.75
41 0.71
42 0.64
43 0.62
44 0.55
45 0.5
46 0.45
47 0.38
48 0.34
49 0.33
50 0.29
51 0.24
52 0.27
53 0.31
54 0.29
55 0.3
56 0.27
57 0.27
58 0.29
59 0.29
60 0.29
61 0.3
62 0.29
63 0.27
64 0.3
65 0.26
66 0.25
67 0.24
68 0.23
69 0.16
70 0.16
71 0.15
72 0.12
73 0.12
74 0.12
75 0.15
76 0.17
77 0.16
78 0.17
79 0.2
80 0.23
81 0.25
82 0.25
83 0.28
84 0.27
85 0.32
86 0.32
87 0.32
88 0.28
89 0.27
90 0.27
91 0.21
92 0.2
93 0.15
94 0.15
95 0.13
96 0.13
97 0.16
98 0.17
99 0.16
100 0.15
101 0.15
102 0.16
103 0.17
104 0.21
105 0.2
106 0.19
107 0.19
108 0.19
109 0.21
110 0.18
111 0.15
112 0.09
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.09
122 0.12
123 0.14
124 0.18
125 0.21
126 0.26
127 0.31
128 0.32
129 0.34
130 0.38
131 0.37
132 0.33
133 0.29
134 0.24
135 0.21
136 0.2
137 0.18
138 0.11
139 0.1
140 0.1
141 0.12
142 0.12
143 0.13
144 0.14
145 0.15
146 0.16
147 0.17
148 0.17
149 0.16
150 0.2
151 0.22
152 0.23
153 0.27
154 0.32
155 0.38
156 0.4
157 0.41
158 0.41
159 0.42
160 0.45
161 0.47
162 0.46
163 0.43
164 0.45
165 0.45
166 0.42
167 0.38
168 0.32
169 0.27
170 0.23
171 0.18
172 0.17
173 0.14
174 0.16
175 0.15
176 0.14
177 0.14
178 0.15
179 0.16
180 0.16
181 0.15
182 0.14
183 0.15
184 0.16
185 0.17
186 0.15
187 0.14
188 0.13
189 0.15
190 0.15
191 0.15
192 0.17
193 0.15
194 0.14
195 0.15
196 0.16
197 0.16
198 0.17
199 0.19
200 0.16
201 0.18
202 0.18
203 0.19
204 0.18
205 0.15
206 0.16
207 0.18
208 0.23
209 0.23
210 0.26
211 0.27
212 0.33
213 0.41
214 0.47
215 0.53
216 0.59
217 0.66
218 0.74
219 0.82
220 0.82
221 0.83
222 0.8
223 0.78
224 0.75
225 0.72
226 0.63
227 0.58
228 0.54
229 0.46
230 0.41
231 0.32
232 0.25
233 0.19
234 0.17
235 0.13
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.09
240 0.11
241 0.1
242 0.08
243 0.1
244 0.11
245 0.12
246 0.18
247 0.19
248 0.18
249 0.19
250 0.19
251 0.18
252 0.19
253 0.18
254 0.12
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.04
265 0.03
266 0.04
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.1
276 0.09
277 0.1
278 0.12
279 0.11
280 0.13
281 0.15
282 0.14
283 0.13
284 0.15
285 0.14
286 0.14
287 0.15
288 0.13
289 0.12
290 0.11
291 0.09
292 0.07
293 0.07
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.09
304 0.1
305 0.17
306 0.19
307 0.27
308 0.28
309 0.27
310 0.27
311 0.27
312 0.31
313 0.26
314 0.25
315 0.21
316 0.23
317 0.23
318 0.23
319 0.23
320 0.17
321 0.15
322 0.14
323 0.1
324 0.09
325 0.09
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.05
333 0.1
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.14
338 0.14
339 0.14
340 0.13
341 0.11
342 0.09
343 0.09
344 0.1
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.08
353 0.07
354 0.08
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.1
361 0.09
362 0.08
363 0.09
364 0.1
365 0.1
366 0.12
367 0.14
368 0.17
369 0.22
370 0.25
371 0.29
372 0.34
373 0.43
374 0.52
375 0.61
376 0.65
377 0.68
378 0.74
379 0.77
380 0.79
381 0.76
382 0.77
383 0.76
384 0.77
385 0.74
386 0.65
387 0.6
388 0.53
389 0.45
390 0.36
391 0.27
392 0.21
393 0.16
394 0.15
395 0.14
396 0.13
397 0.14
398 0.12
399 0.12
400 0.1
401 0.11
402 0.11
403 0.11
404 0.11
405 0.13
406 0.15
407 0.16
408 0.16
409 0.16
410 0.17
411 0.17
412 0.15
413 0.14
414 0.13
415 0.14
416 0.2
417 0.2
418 0.22
419 0.29
420 0.3
421 0.29
422 0.34
423 0.4
424 0.39
425 0.46
426 0.48