Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2JFP9

Protein Details
Accession A0A0D2JFP9    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-34AADPPLKKSKKSKHTENNSAAVPHydrophilic
44-63VSTITSKRSRKRAADFMNDNHydrophilic
88-114DDADEPAPKKSKKNKNKDRKGSHDEVLBasic
206-230TTLALPKSKKVRKKLDKVKAKGDDEHydrophilic
344-370SEEHWQKKVDKEKRKRGKKAEQMKAIGBasic
419-444EAAAKESKRSKNKEEKKDKKRIAVAIHydrophilic
468-492KESKSKLTKVERKAQKKTAKKLAKEBasic
544-580SNSPKASRGPPGKKLKKEKKKKERKNLVKARGPKSNLBasic
598-625LPLMGKDKYNKAKRQAHKELKNKILARRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-24RRKESSGAADPPLKKSKKSK
95-107PKKSKKNKNKDRK
212-226KSKKVRKKLDKVKAK
322-363ANKKFRKIPHEKLERAALAAPKSEEHWQKKVDKEKRKRGKKA
422-439AKESKRSKNKEEKKDKKR
468-490KESKSKLTKVERKAQKKTAKKLA
547-631PKASRGPPGKKLKKEKKKKERKNLVKARGPKSNLIASKPKSDPNATGKIPGLPLMGKDKYNKAKRQAHKELKNKILARRATGASR
Subcellular Location(s) nucl 27
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MGDKRRKESSGAADPPLKKSKKSKHTENNSAAVPPVPSLSSDNVSTITSKRSRKRAADFMNDNEDAPTKPETHAKVTENKTAISVPPDDADEPAPKKSKKNKNKDRKGSHDEVLSADGINGVVEHDGDGNLDTVTTHKPVSTSMQAEAERTVDQELEVGFGGFASDDDYDRAEEVETEDNAAALLAGFDSDSEDKQEDEGGLDLTTTLALPKSKKVRKKLDKVKAKGDDEGPGTVYVGRIPHGFYEKQMNEYFSQFGDITRLRLSRNKRTGQSKHFAFIEFSSKEVAKIVANTMDNYLLFGHILKCKYAEPDSLHPDVWKGANKKFRKIPHEKLERAALAAPKSEEHWQKKVDKEKRKRGKKAEQMKAIGYDMPTSTLANPSEAVKQKPAGKDEARKIESEEAGPAGSMEPTKVPPQGEAAAKESKRSKNKEEKKDKKRIAVAISAVEPPVAEPVNAVEEKAKDDGEKESKSKLTKVERKAQKKTAKKLAKESDAVIAPGTKSDPVQETKTVEAPETDSKRNPENEADFISFGDINFEKESRSSNSPKASRGPPGKKLKKEKKKKERKNLVKARGPKSNLIASKPKSDPNATGKIPGLPLMGKDKYNKAKRQAHKELKNKILARRATGASRGSSAGSRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.62
3 0.64
4 0.57
5 0.53
6 0.59
7 0.65
8 0.67
9 0.75
10 0.78
11 0.79
12 0.87
13 0.91
14 0.88
15 0.83
16 0.74
17 0.65
18 0.55
19 0.45
20 0.35
21 0.25
22 0.19
23 0.14
24 0.14
25 0.16
26 0.19
27 0.2
28 0.2
29 0.2
30 0.2
31 0.2
32 0.21
33 0.19
34 0.24
35 0.29
36 0.37
37 0.45
38 0.54
39 0.62
40 0.69
41 0.76
42 0.78
43 0.79
44 0.81
45 0.79
46 0.74
47 0.73
48 0.64
49 0.56
50 0.46
51 0.39
52 0.29
53 0.25
54 0.22
55 0.16
56 0.18
57 0.24
58 0.27
59 0.32
60 0.38
61 0.39
62 0.46
63 0.5
64 0.55
65 0.5
66 0.47
67 0.42
68 0.37
69 0.35
70 0.29
71 0.26
72 0.19
73 0.19
74 0.2
75 0.19
76 0.19
77 0.2
78 0.23
79 0.23
80 0.28
81 0.34
82 0.35
83 0.44
84 0.53
85 0.62
86 0.66
87 0.75
88 0.81
89 0.84
90 0.93
91 0.95
92 0.94
93 0.93
94 0.92
95 0.86
96 0.8
97 0.72
98 0.61
99 0.52
100 0.44
101 0.34
102 0.24
103 0.18
104 0.14
105 0.1
106 0.08
107 0.06
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.05
120 0.07
121 0.09
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.13
127 0.19
128 0.22
129 0.22
130 0.23
131 0.28
132 0.27
133 0.28
134 0.27
135 0.23
136 0.17
137 0.16
138 0.15
139 0.1
140 0.09
141 0.1
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.09
159 0.07
160 0.07
161 0.09
162 0.12
163 0.11
164 0.12
165 0.12
166 0.11
167 0.11
168 0.1
169 0.07
170 0.04
171 0.04
172 0.02
173 0.03
174 0.02
175 0.03
176 0.05
177 0.06
178 0.06
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.1
183 0.11
184 0.09
185 0.08
186 0.09
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.08
197 0.09
198 0.16
199 0.26
200 0.33
201 0.41
202 0.51
203 0.61
204 0.69
205 0.79
206 0.83
207 0.84
208 0.87
209 0.85
210 0.85
211 0.82
212 0.73
213 0.66
214 0.56
215 0.5
216 0.41
217 0.36
218 0.27
219 0.19
220 0.17
221 0.14
222 0.12
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.1
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.23
233 0.23
234 0.26
235 0.27
236 0.27
237 0.25
238 0.26
239 0.25
240 0.16
241 0.17
242 0.13
243 0.12
244 0.14
245 0.13
246 0.13
247 0.15
248 0.16
249 0.16
250 0.22
251 0.29
252 0.35
253 0.43
254 0.47
255 0.51
256 0.6
257 0.66
258 0.67
259 0.69
260 0.6
261 0.54
262 0.5
263 0.44
264 0.36
265 0.29
266 0.28
267 0.2
268 0.19
269 0.17
270 0.16
271 0.16
272 0.15
273 0.14
274 0.08
275 0.09
276 0.09
277 0.11
278 0.11
279 0.12
280 0.12
281 0.11
282 0.11
283 0.1
284 0.1
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.1
290 0.11
291 0.1
292 0.11
293 0.12
294 0.15
295 0.16
296 0.18
297 0.18
298 0.23
299 0.28
300 0.28
301 0.28
302 0.25
303 0.24
304 0.21
305 0.19
306 0.19
307 0.17
308 0.21
309 0.3
310 0.32
311 0.38
312 0.43
313 0.48
314 0.52
315 0.58
316 0.62
317 0.63
318 0.71
319 0.66
320 0.62
321 0.59
322 0.5
323 0.42
324 0.35
325 0.27
326 0.18
327 0.17
328 0.15
329 0.12
330 0.13
331 0.18
332 0.23
333 0.26
334 0.29
335 0.33
336 0.38
337 0.44
338 0.52
339 0.56
340 0.59
341 0.66
342 0.72
343 0.79
344 0.84
345 0.87
346 0.87
347 0.88
348 0.88
349 0.88
350 0.86
351 0.83
352 0.75
353 0.67
354 0.58
355 0.48
356 0.39
357 0.28
358 0.2
359 0.13
360 0.12
361 0.11
362 0.1
363 0.09
364 0.12
365 0.12
366 0.11
367 0.11
368 0.11
369 0.17
370 0.2
371 0.21
372 0.19
373 0.23
374 0.27
375 0.3
376 0.31
377 0.32
378 0.34
379 0.41
380 0.46
381 0.51
382 0.48
383 0.45
384 0.45
385 0.42
386 0.38
387 0.3
388 0.24
389 0.15
390 0.14
391 0.13
392 0.11
393 0.07
394 0.06
395 0.06
396 0.05
397 0.06
398 0.08
399 0.1
400 0.13
401 0.13
402 0.13
403 0.16
404 0.19
405 0.2
406 0.21
407 0.22
408 0.27
409 0.27
410 0.31
411 0.35
412 0.39
413 0.46
414 0.5
415 0.56
416 0.6
417 0.71
418 0.77
419 0.82
420 0.85
421 0.86
422 0.91
423 0.87
424 0.84
425 0.81
426 0.75
427 0.68
428 0.62
429 0.53
430 0.44
431 0.4
432 0.32
433 0.25
434 0.19
435 0.15
436 0.1
437 0.11
438 0.09
439 0.07
440 0.06
441 0.07
442 0.12
443 0.12
444 0.12
445 0.12
446 0.12
447 0.15
448 0.16
449 0.15
450 0.11
451 0.13
452 0.19
453 0.24
454 0.27
455 0.26
456 0.3
457 0.34
458 0.36
459 0.38
460 0.39
461 0.44
462 0.49
463 0.55
464 0.61
465 0.67
466 0.74
467 0.79
468 0.81
469 0.8
470 0.81
471 0.83
472 0.83
473 0.82
474 0.78
475 0.79
476 0.78
477 0.74
478 0.67
479 0.59
480 0.54
481 0.46
482 0.4
483 0.3
484 0.23
485 0.17
486 0.15
487 0.15
488 0.1
489 0.09
490 0.12
491 0.16
492 0.18
493 0.22
494 0.25
495 0.26
496 0.28
497 0.32
498 0.3
499 0.26
500 0.23
501 0.24
502 0.29
503 0.31
504 0.33
505 0.33
506 0.36
507 0.41
508 0.44
509 0.43
510 0.41
511 0.4
512 0.4
513 0.4
514 0.39
515 0.33
516 0.3
517 0.28
518 0.21
519 0.17
520 0.18
521 0.14
522 0.14
523 0.16
524 0.16
525 0.15
526 0.16
527 0.2
528 0.2
529 0.27
530 0.31
531 0.36
532 0.45
533 0.48
534 0.51
535 0.54
536 0.54
537 0.56
538 0.61
539 0.63
540 0.63
541 0.71
542 0.77
543 0.79
544 0.86
545 0.88
546 0.88
547 0.92
548 0.93
549 0.93
550 0.95
551 0.96
552 0.96
553 0.97
554 0.97
555 0.97
556 0.96
557 0.95
558 0.93
559 0.91
560 0.87
561 0.85
562 0.78
563 0.72
564 0.66
565 0.65
566 0.59
567 0.56
568 0.58
569 0.52
570 0.57
571 0.55
572 0.55
573 0.52
574 0.52
575 0.53
576 0.51
577 0.56
578 0.49
579 0.5
580 0.46
581 0.43
582 0.4
583 0.34
584 0.29
585 0.21
586 0.23
587 0.26
588 0.27
589 0.28
590 0.32
591 0.4
592 0.48
593 0.57
594 0.62
595 0.65
596 0.73
597 0.79
598 0.85
599 0.87
600 0.87
601 0.88
602 0.89
603 0.89
604 0.87
605 0.87
606 0.82
607 0.78
608 0.77
609 0.71
610 0.66
611 0.63
612 0.58
613 0.53
614 0.52
615 0.48
616 0.41
617 0.39
618 0.35
619 0.3