FuNGI

A0A0D1ZA23

Protein Details

Accession

A0A0D1ZA23

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
16-41	GAAPVLKRKKPPSDPFFKGPRRNPVA	Hydrophilic
529-550	TDASTRRKKLKSKHMSSTQPTP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-37	KRKKPPSDPFFKGPRR
420-440	KKEAEARKRNFKELRKALEKR
496-501	RKEKKA
534-539	RRKKLK

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MNGSAPAGGPPSHTGGAAPVLKRKKPPSDPFFKGPRRNPVARPQLNGHATPPVNGHLPLKAPALQSSTPNSQRASSPAKPAIPDNERVSGFSDPRVTAEGIPYKDYKLVTTKRDLLNGLRYHILQLAGDKVVDIRNEAEFSKPARLHRRDPRAPPPGQHQHKEEEGDLPDLKDGLNVAEREELGRRKEIRQREREANLAQIAPSQNAARRMNAFKKKTQQVFRPDLSAEDKRRIQTNYEEKLPWHLEDFDNKHCLIGHHQIGSMNSNAALVFEPAVDASTGKFRLIPIEKAYQFKPKRELAQQMTIEEVEAAMKKRGSDPEWLIRQREARVAEASKELVAKRAKGIFTGAQTQNVAGRTGEDADLDFEDDFADDEEGDLFVDKDEDEKIAEKRIKEDQLQANFLDFKDIKEYDEAEEREKKEAEARKRNFKELRKALEKRERNYNHGSDSEYESSTEDEEERERIERERQENLKKEEEEGKKSTLPSSGNNTPSGRKEKKAGTGSDRERVTSRSLKRPGSPNLSEGSGTDASTRRKKLKSKHMSSTQPTPGPSRPMSPANAPPSSSAPGILDPKIRKRTGGAGSDTDAGMSDRDGGAMSDGSRTARRLKLKMSASPPGTNPPSRTASPAPGGPRGALSPGASSPTAFPSVQEIKNAIPTQGIAIKDLMKIVAHPKERRAEFVNLVKEVARMDKERGVLVLK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.18
3	0.24
4	0.27
5	0.26
6	0.3
7	0.37
8	0.42
9	0.5
10	0.57
11	0.61
12	0.67
13	0.75
14	0.77
15	0.79
16	0.82
17	0.82
18	0.84
19	0.83
20	0.83
21	0.8
22	0.81
23	0.8
24	0.79
25	0.77
26	0.77
27	0.79
28	0.74
29	0.72
30	0.66
31	0.67
32	0.64
33	0.59
34	0.5
35	0.47
36	0.42
37	0.38
38	0.35
39	0.28
40	0.26
41	0.26
42	0.26
43	0.2
44	0.22
45	0.23
46	0.24
47	0.26
48	0.24
49	0.26
50	0.3
51	0.29
52	0.3
53	0.33
54	0.39
55	0.4
56	0.42
57	0.41
58	0.37
59	0.37
60	0.4
61	0.43
62	0.38
63	0.42
64	0.45
65	0.46
66	0.46
67	0.47
68	0.5
69	0.46
70	0.48
71	0.44
72	0.44
73	0.41
74	0.41
75	0.4
76	0.36
77	0.32
78	0.3
79	0.3
80	0.24
81	0.25
82	0.27
83	0.25
84	0.21
85	0.26
86	0.3
87	0.27
88	0.3
89	0.29
90	0.28
91	0.3
92	0.29
93	0.26
94	0.28
95	0.33
96	0.36
97	0.42
98	0.48
99	0.48
100	0.51
101	0.5
102	0.45
103	0.48
104	0.45
105	0.4
106	0.35
107	0.32
108	0.3
109	0.29
110	0.25
111	0.16
112	0.16
113	0.16
114	0.14
115	0.14
116	0.12
117	0.11
118	0.13
119	0.13
120	0.13
121	0.12
122	0.13
123	0.15
124	0.15
125	0.16
126	0.17
127	0.19
128	0.26
129	0.27
130	0.33
131	0.42
132	0.47
133	0.55
134	0.62
135	0.71
136	0.71
137	0.76
138	0.79
139	0.77
140	0.74
141	0.69
142	0.69
143	0.69
144	0.68
145	0.65
146	0.59
147	0.54
148	0.55
149	0.54
150	0.45
151	0.39
152	0.33
153	0.31
154	0.28
155	0.24
156	0.2
157	0.17
158	0.16
159	0.12
160	0.1
161	0.08
162	0.11
163	0.11
164	0.12
165	0.13
166	0.14
167	0.15
168	0.2
169	0.22
170	0.21
171	0.27
172	0.29
173	0.34
174	0.42
175	0.51
176	0.56
177	0.61
178	0.66
179	0.68
180	0.68
181	0.67
182	0.61
183	0.55
184	0.47
185	0.38
186	0.31
187	0.25
188	0.23
189	0.17
190	0.17
191	0.15
192	0.15
193	0.22
194	0.23
195	0.22
196	0.26
197	0.33
198	0.41
199	0.49
200	0.51
201	0.5
202	0.58
203	0.65
204	0.69
205	0.7
206	0.68
207	0.68
208	0.71
209	0.65
210	0.59
211	0.5
212	0.45
213	0.43
214	0.42
215	0.36
216	0.35
217	0.37
218	0.36
219	0.4
220	0.39
221	0.36
222	0.38
223	0.45
224	0.43
225	0.44
226	0.43
227	0.38
228	0.43
229	0.42
230	0.33
231	0.25
232	0.23
233	0.2
234	0.26
235	0.3
236	0.28
237	0.28
238	0.28
239	0.26
240	0.24
241	0.24
242	0.22
243	0.25
244	0.24
245	0.22
246	0.23
247	0.24
248	0.24
249	0.25
250	0.2
251	0.13
252	0.1
253	0.09
254	0.08
255	0.07
256	0.07
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.04
262	0.05
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.08
267	0.08
268	0.08
269	0.09
270	0.09
271	0.16
272	0.19
273	0.21
274	0.21
275	0.28
276	0.3
277	0.32
278	0.34
279	0.37
280	0.38
281	0.39
282	0.42
283	0.38
284	0.41
285	0.44
286	0.51
287	0.45
288	0.51
289	0.48
290	0.42
291	0.39
292	0.33
293	0.28
294	0.19
295	0.14
296	0.06
297	0.07
298	0.07
299	0.08
300	0.08
301	0.09
302	0.12
303	0.15
304	0.16
305	0.21
306	0.24
307	0.3
308	0.37
309	0.39
310	0.37
311	0.36
312	0.37
313	0.33
314	0.33
315	0.27
316	0.21
317	0.22
318	0.22
319	0.21
320	0.19
321	0.18
322	0.14
323	0.15
324	0.13
325	0.16
326	0.16
327	0.15
328	0.17
329	0.2
330	0.2
331	0.18
332	0.2
333	0.17
334	0.17
335	0.24
336	0.22
337	0.19
338	0.19
339	0.19
340	0.19
341	0.17
342	0.16
343	0.08
344	0.09
345	0.08
346	0.09
347	0.09
348	0.07
349	0.06
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.06
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.04
359	0.04
360	0.03
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.03
367	0.03
368	0.04
369	0.03
370	0.04
371	0.05
372	0.05
373	0.06
374	0.08
375	0.09
376	0.15
377	0.18
378	0.17
379	0.2
380	0.26
381	0.29
382	0.28
383	0.35
384	0.36
385	0.37
386	0.38
387	0.35
388	0.31
389	0.28
390	0.26
391	0.24
392	0.17
393	0.14
394	0.17
395	0.17
396	0.16
397	0.17
398	0.18
399	0.15
400	0.21
401	0.21
402	0.21
403	0.26
404	0.26
405	0.28
406	0.27
407	0.26
408	0.27
409	0.33
410	0.39
411	0.44
412	0.48
413	0.56
414	0.59
415	0.67
416	0.68
417	0.68
418	0.69
419	0.66
420	0.7
421	0.68
422	0.7
423	0.71
424	0.73
425	0.72
426	0.65
427	0.68
428	0.62
429	0.58
430	0.61
431	0.55
432	0.48
433	0.42
434	0.41
435	0.32
436	0.34
437	0.3
438	0.23
439	0.21
440	0.18
441	0.17
442	0.16
443	0.14
444	0.1
445	0.09
446	0.09
447	0.1
448	0.1
449	0.12
450	0.12
451	0.14
452	0.21
453	0.26
454	0.29
455	0.37
456	0.43
457	0.5
458	0.57
459	0.6
460	0.6
461	0.53
462	0.53
463	0.54
464	0.52
465	0.49
466	0.44
467	0.42
468	0.38
469	0.38
470	0.37
471	0.31
472	0.28
473	0.26
474	0.3
475	0.33
476	0.33
477	0.36
478	0.36
479	0.35
480	0.39
481	0.45
482	0.42
483	0.38
484	0.42
485	0.44
486	0.51
487	0.54
488	0.53
489	0.51
490	0.56
491	0.58
492	0.58
493	0.54
494	0.46
495	0.41
496	0.38
497	0.37
498	0.37
499	0.39
500	0.41
501	0.48
502	0.5
503	0.54
504	0.6
505	0.62
506	0.62
507	0.58
508	0.5
509	0.45
510	0.43
511	0.37
512	0.29
513	0.27
514	0.19
515	0.17
516	0.18
517	0.2
518	0.25
519	0.32
520	0.38
521	0.4
522	0.46
523	0.54
524	0.62
525	0.69
526	0.73
527	0.75
528	0.79
529	0.81
530	0.83
531	0.8
532	0.79
533	0.75
534	0.67
535	0.6
536	0.55
537	0.49
538	0.47
539	0.43
540	0.38
541	0.35
542	0.36
543	0.37
544	0.37
545	0.41
546	0.41
547	0.41
548	0.38
549	0.36
550	0.35
551	0.35
552	0.3
553	0.23
554	0.18
555	0.2
556	0.22
557	0.22
558	0.26
559	0.28
560	0.37
561	0.45
562	0.44
563	0.41
564	0.41
565	0.48
566	0.49
567	0.51
568	0.45
569	0.4
570	0.42
571	0.42
572	0.38
573	0.29
574	0.22
575	0.16
576	0.12
577	0.09
578	0.09
579	0.07
580	0.07
581	0.08
582	0.07
583	0.08
584	0.09
585	0.09
586	0.09
587	0.1
588	0.12
589	0.14
590	0.16
591	0.21
592	0.28
593	0.35
594	0.38
595	0.42
596	0.49
597	0.52
598	0.58
599	0.58
600	0.6
601	0.57
602	0.56
603	0.53
604	0.53
605	0.53
606	0.49
607	0.46
608	0.43
609	0.44
610	0.42
611	0.46
612	0.42
613	0.42
614	0.41
615	0.42
616	0.41
617	0.4
618	0.4
619	0.34
620	0.31
621	0.27
622	0.25
623	0.22
624	0.19
625	0.16
626	0.16
627	0.19
628	0.17
629	0.17
630	0.17
631	0.18
632	0.21
633	0.18
634	0.18
635	0.23
636	0.3
637	0.31
638	0.32
639	0.3
640	0.29
641	0.37
642	0.38
643	0.3
644	0.23
645	0.22
646	0.23
647	0.26
648	0.25
649	0.18
650	0.19
651	0.21
652	0.2
653	0.21
654	0.18
655	0.14
656	0.16
657	0.22
658	0.29
659	0.35
660	0.39
661	0.45
662	0.54
663	0.55
664	0.59
665	0.56
666	0.55
667	0.54
668	0.58
669	0.58
670	0.49
671	0.48
672	0.43
673	0.39
674	0.34
675	0.32
676	0.28
677	0.25
678	0.28
679	0.32
680	0.33
681	0.33

A0A0D1ZA23

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer