Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1VMQ7

Protein Details
Accession A0A0D1VMQ7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
603-632AQQPKVVTGKGRKPRQKKSKKNGANAQRQAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
611-626GKGRKPRQKKSKKNGA
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Amino Acid Sequences MLGNAGASDEEGESRTASIGLRRTRLNRQGQVNETSFVPHLAPQPQSSSAVMGNSASHAAADPNSLNQTQVSTSNVPSTLAATMPPHPSPGFGKNRLAVGFRKPTAPVSQDPAGNESATSATGASPGVSADDAIEISSDEEDDSSEGGGMVINLEHDTPENDHEHMVIDTDEEEHREVIRHAAGQVSKNHDTSRSSASADQAVDMQLQAEISQSATGRSNPFTAIEPPESHPVLRLADLTQDELDLQLKYALFDVDSDQIDLTWPAICLACLKPGHSEGVCPEKQCVHCAAVGQHSSRLCPLIGRCSKCRERGHTVESCNADLKVTTVPCDLCGGLNHVEASCPGRFFPANTETVASSHELWISCCVCASKSHLVGDCPDTNSTAKARWSLKLFTAGQVTNLSLEAGTKQRELEAANRGLRPEGMRIKGRAGLHNAGTSRSKQPSDDETDNQFFGPRVTKRGNDNRANFTFRQPHALPDRPPVAAHGDRYDRYNAPSDMRAAPVRSRNDWYATDSFGRRRSRSPGRSDESRDVRQRSSGPSPYNSHPSANSKTVDVPRDSQRRGETDRSSQGVSIQLPLRRGSNPISNKHAMSDQAPISGQPAQQPKVVTGKGRKPRQKKSKKNGANAQRQA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.1
4 0.11
5 0.16
6 0.23
7 0.28
8 0.32
9 0.38
10 0.44
11 0.53
12 0.61
13 0.66
14 0.66
15 0.7
16 0.74
17 0.72
18 0.74
19 0.66
20 0.58
21 0.48
22 0.43
23 0.34
24 0.27
25 0.22
26 0.18
27 0.21
28 0.24
29 0.27
30 0.26
31 0.3
32 0.31
33 0.33
34 0.3
35 0.27
36 0.23
37 0.21
38 0.2
39 0.16
40 0.14
41 0.13
42 0.13
43 0.1
44 0.09
45 0.08
46 0.09
47 0.09
48 0.12
49 0.11
50 0.13
51 0.17
52 0.17
53 0.17
54 0.16
55 0.17
56 0.16
57 0.17
58 0.19
59 0.19
60 0.2
61 0.23
62 0.23
63 0.22
64 0.2
65 0.2
66 0.16
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.17
71 0.2
72 0.2
73 0.22
74 0.21
75 0.23
76 0.27
77 0.34
78 0.38
79 0.39
80 0.44
81 0.43
82 0.47
83 0.46
84 0.45
85 0.38
86 0.38
87 0.41
88 0.38
89 0.38
90 0.35
91 0.37
92 0.39
93 0.4
94 0.35
95 0.33
96 0.36
97 0.35
98 0.35
99 0.35
100 0.3
101 0.25
102 0.22
103 0.16
104 0.13
105 0.11
106 0.1
107 0.08
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.05
121 0.06
122 0.05
123 0.06
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.07
145 0.09
146 0.12
147 0.13
148 0.14
149 0.14
150 0.14
151 0.14
152 0.13
153 0.12
154 0.09
155 0.07
156 0.07
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.09
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.12
166 0.13
167 0.13
168 0.12
169 0.16
170 0.18
171 0.2
172 0.24
173 0.29
174 0.3
175 0.3
176 0.31
177 0.3
178 0.29
179 0.29
180 0.3
181 0.25
182 0.24
183 0.24
184 0.25
185 0.26
186 0.24
187 0.2
188 0.15
189 0.14
190 0.12
191 0.1
192 0.09
193 0.06
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.09
203 0.11
204 0.12
205 0.14
206 0.14
207 0.14
208 0.15
209 0.16
210 0.17
211 0.19
212 0.19
213 0.2
214 0.22
215 0.26
216 0.25
217 0.23
218 0.21
219 0.19
220 0.18
221 0.16
222 0.14
223 0.1
224 0.13
225 0.14
226 0.13
227 0.11
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.1
232 0.07
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.07
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.1
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.07
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.07
256 0.08
257 0.13
258 0.12
259 0.13
260 0.14
261 0.15
262 0.18
263 0.16
264 0.16
265 0.13
266 0.21
267 0.21
268 0.2
269 0.2
270 0.22
271 0.23
272 0.24
273 0.24
274 0.17
275 0.17
276 0.18
277 0.19
278 0.18
279 0.19
280 0.18
281 0.19
282 0.17
283 0.17
284 0.16
285 0.16
286 0.11
287 0.11
288 0.12
289 0.18
290 0.24
291 0.27
292 0.3
293 0.36
294 0.41
295 0.48
296 0.52
297 0.49
298 0.51
299 0.53
300 0.56
301 0.53
302 0.5
303 0.47
304 0.43
305 0.37
306 0.3
307 0.25
308 0.19
309 0.13
310 0.13
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.1
319 0.08
320 0.08
321 0.1
322 0.1
323 0.11
324 0.1
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.12
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.1
333 0.1
334 0.11
335 0.15
336 0.16
337 0.17
338 0.17
339 0.18
340 0.16
341 0.16
342 0.17
343 0.13
344 0.1
345 0.09
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.13
350 0.12
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.11
356 0.16
357 0.18
358 0.19
359 0.22
360 0.23
361 0.23
362 0.25
363 0.28
364 0.24
365 0.2
366 0.19
367 0.18
368 0.17
369 0.18
370 0.17
371 0.15
372 0.15
373 0.19
374 0.21
375 0.22
376 0.26
377 0.26
378 0.26
379 0.31
380 0.3
381 0.26
382 0.28
383 0.25
384 0.22
385 0.21
386 0.2
387 0.13
388 0.13
389 0.11
390 0.06
391 0.07
392 0.07
393 0.09
394 0.11
395 0.11
396 0.11
397 0.11
398 0.13
399 0.14
400 0.16
401 0.2
402 0.24
403 0.27
404 0.28
405 0.28
406 0.27
407 0.27
408 0.24
409 0.24
410 0.25
411 0.26
412 0.29
413 0.3
414 0.31
415 0.35
416 0.36
417 0.33
418 0.32
419 0.31
420 0.29
421 0.31
422 0.29
423 0.27
424 0.27
425 0.26
426 0.26
427 0.27
428 0.27
429 0.25
430 0.29
431 0.32
432 0.38
433 0.4
434 0.37
435 0.39
436 0.4
437 0.39
438 0.35
439 0.3
440 0.22
441 0.19
442 0.23
443 0.18
444 0.22
445 0.26
446 0.3
447 0.38
448 0.48
449 0.56
450 0.58
451 0.62
452 0.64
453 0.64
454 0.67
455 0.59
456 0.55
457 0.55
458 0.46
459 0.49
460 0.41
461 0.44
462 0.46
463 0.51
464 0.46
465 0.44
466 0.46
467 0.39
468 0.38
469 0.34
470 0.33
471 0.29
472 0.29
473 0.28
474 0.3
475 0.3
476 0.33
477 0.35
478 0.29
479 0.3
480 0.33
481 0.3
482 0.28
483 0.29
484 0.3
485 0.27
486 0.29
487 0.29
488 0.26
489 0.3
490 0.34
491 0.37
492 0.37
493 0.4
494 0.4
495 0.42
496 0.41
497 0.41
498 0.36
499 0.34
500 0.36
501 0.35
502 0.37
503 0.4
504 0.46
505 0.42
506 0.45
507 0.51
508 0.57
509 0.62
510 0.65
511 0.68
512 0.67
513 0.73
514 0.75
515 0.76
516 0.72
517 0.72
518 0.71
519 0.66
520 0.6
521 0.57
522 0.54
523 0.51
524 0.52
525 0.51
526 0.47
527 0.49
528 0.52
529 0.53
530 0.57
531 0.52
532 0.46
533 0.43
534 0.45
535 0.45
536 0.45
537 0.41
538 0.35
539 0.41
540 0.44
541 0.45
542 0.41
543 0.41
544 0.45
545 0.54
546 0.54
547 0.52
548 0.52
549 0.53
550 0.57
551 0.6
552 0.56
553 0.55
554 0.6
555 0.57
556 0.53
557 0.46
558 0.42
559 0.38
560 0.33
561 0.3
562 0.28
563 0.28
564 0.29
565 0.3
566 0.31
567 0.27
568 0.3
569 0.3
570 0.35
571 0.4
572 0.43
573 0.5
574 0.51
575 0.51
576 0.5
577 0.47
578 0.4
579 0.34
580 0.35
581 0.28
582 0.26
583 0.26
584 0.23
585 0.23
586 0.24
587 0.24
588 0.24
589 0.3
590 0.3
591 0.33
592 0.34
593 0.35
594 0.39
595 0.41
596 0.43
597 0.45
598 0.53
599 0.6
600 0.7
601 0.77
602 0.79
603 0.87
604 0.9
605 0.91
606 0.93
607 0.94
608 0.94
609 0.94
610 0.94
611 0.94
612 0.93