Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1YYY3

Protein Details
Accession A0A0D1YYY3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
366-399AASRSTTSRGPKKIDKKRPPPKPAQPFKECKVDGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
374-388RGPKKIDKKRPPPKP
Subcellular Location(s) nucl 16.5, mito_nucl 12.5, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038886  E3_SLX5/Rfp1  
CDD cd16449  RING-HC  
Amino Acid Sequences MPQAPNLSLSSFLNPASSSSSRKRSHAEITRSESRSASPDLPSKRPRISPPYALVPTSGLFSGSPTPAPPVARFERDGFDYRRPIMSTRTQQSSHAPDDVTIDLTADSDVSTVSDVSPRPALRRHTRPQSAENRSLRAPPFTRRQQQEDLEVIDLSEEDSDFHIDEFEVHSDTESERSVHTLASSPEVQFLHERPASPGSRRPEPPRPSIHAGTLGADRQGSFNLIPDLFRRGTQFMFGNMQQAYDEMFADRFEQTRPRGNNARPNVGTQGNDTDPELVINLNYRRPAFALGGLEMFDRTSETPQVVQEPYKAPPAAKEGFIRTFGEEDVILCPRCGDELAVGNDDTKKQVWVVKACGHVFCGECAASRSTTSRGPKKIDKKRPPPKPAQPFKECKVDGCSSKLTGKHAMFPIYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.22
4 0.23
5 0.27
6 0.34
7 0.43
8 0.46
9 0.5
10 0.54
11 0.53
12 0.6
13 0.63
14 0.64
15 0.63
16 0.68
17 0.73
18 0.7
19 0.66
20 0.56
21 0.48
22 0.44
23 0.4
24 0.35
25 0.3
26 0.36
27 0.4
28 0.48
29 0.53
30 0.55
31 0.57
32 0.6
33 0.63
34 0.65
35 0.66
36 0.65
37 0.63
38 0.66
39 0.62
40 0.56
41 0.48
42 0.4
43 0.33
44 0.27
45 0.21
46 0.13
47 0.1
48 0.12
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.13
53 0.16
54 0.19
55 0.21
56 0.21
57 0.25
58 0.29
59 0.32
60 0.35
61 0.34
62 0.35
63 0.37
64 0.41
65 0.38
66 0.4
67 0.4
68 0.39
69 0.4
70 0.38
71 0.36
72 0.36
73 0.41
74 0.43
75 0.44
76 0.48
77 0.46
78 0.47
79 0.51
80 0.52
81 0.45
82 0.39
83 0.33
84 0.28
85 0.29
86 0.28
87 0.22
88 0.16
89 0.13
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.07
94 0.06
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.08
102 0.09
103 0.11
104 0.15
105 0.16
106 0.19
107 0.24
108 0.32
109 0.38
110 0.47
111 0.54
112 0.6
113 0.67
114 0.68
115 0.72
116 0.75
117 0.73
118 0.73
119 0.67
120 0.6
121 0.54
122 0.54
123 0.46
124 0.43
125 0.38
126 0.34
127 0.41
128 0.46
129 0.53
130 0.53
131 0.58
132 0.59
133 0.58
134 0.57
135 0.5
136 0.43
137 0.35
138 0.3
139 0.23
140 0.16
141 0.13
142 0.08
143 0.06
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.12
171 0.13
172 0.12
173 0.15
174 0.15
175 0.15
176 0.14
177 0.14
178 0.17
179 0.17
180 0.18
181 0.17
182 0.22
183 0.23
184 0.23
185 0.29
186 0.27
187 0.33
188 0.36
189 0.41
190 0.46
191 0.49
192 0.53
193 0.53
194 0.54
195 0.54
196 0.51
197 0.45
198 0.38
199 0.33
200 0.28
201 0.23
202 0.18
203 0.12
204 0.11
205 0.1
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.06
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.14
216 0.13
217 0.14
218 0.15
219 0.15
220 0.15
221 0.17
222 0.17
223 0.14
224 0.17
225 0.16
226 0.17
227 0.16
228 0.16
229 0.13
230 0.12
231 0.12
232 0.09
233 0.09
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.14
242 0.16
243 0.24
244 0.26
245 0.32
246 0.39
247 0.44
248 0.52
249 0.51
250 0.56
251 0.49
252 0.49
253 0.46
254 0.41
255 0.36
256 0.28
257 0.28
258 0.21
259 0.2
260 0.18
261 0.15
262 0.13
263 0.12
264 0.11
265 0.07
266 0.06
267 0.1
268 0.12
269 0.13
270 0.16
271 0.16
272 0.17
273 0.17
274 0.2
275 0.16
276 0.17
277 0.16
278 0.15
279 0.15
280 0.14
281 0.14
282 0.11
283 0.1
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.09
288 0.1
289 0.11
290 0.13
291 0.14
292 0.18
293 0.18
294 0.18
295 0.2
296 0.21
297 0.22
298 0.26
299 0.26
300 0.22
301 0.23
302 0.29
303 0.27
304 0.27
305 0.29
306 0.28
307 0.3
308 0.32
309 0.31
310 0.25
311 0.24
312 0.21
313 0.19
314 0.14
315 0.13
316 0.13
317 0.15
318 0.14
319 0.13
320 0.13
321 0.12
322 0.13
323 0.12
324 0.1
325 0.1
326 0.15
327 0.18
328 0.2
329 0.2
330 0.21
331 0.22
332 0.22
333 0.21
334 0.16
335 0.14
336 0.15
337 0.19
338 0.24
339 0.27
340 0.32
341 0.36
342 0.42
343 0.43
344 0.41
345 0.38
346 0.35
347 0.3
348 0.25
349 0.23
350 0.16
351 0.15
352 0.17
353 0.18
354 0.17
355 0.17
356 0.2
357 0.2
358 0.27
359 0.36
360 0.42
361 0.47
362 0.53
363 0.62
364 0.7
365 0.78
366 0.82
367 0.84
368 0.86
369 0.9
370 0.93
371 0.93
372 0.93
373 0.93
374 0.93
375 0.92
376 0.91
377 0.9
378 0.88
379 0.83
380 0.83
381 0.72
382 0.65
383 0.62
384 0.59
385 0.53
386 0.5
387 0.49
388 0.42
389 0.47
390 0.46
391 0.43
392 0.45
393 0.43
394 0.45
395 0.46