Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1YDJ1

Protein Details
Accession A0A0D1YDJ1    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
265-287LRKAEEARMKKRRDRGRDADEGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
271-279ARMKKRRDR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPAKRRKLSPEVEETPATNEKAEGTTGVPEHEGTSQGAKPTPGNGDSAPVDSREEGSESTNNTSGPSSASADRLARFAALKSRASASAKSNLAEAKAEATRAAIDPSVLASLSRKSAIASHNLLKADTEEEGGTGAFERKRAWDYTIEESEKWDERVERKKAARNNNAFKDYSAEAAKMYDRQMRDLEKSALKDGGKNREEYERQKAEILENAARTGGLEIVEMENGELVAIDKDGRFYADHDSTGFIEQKPKRENVDRLVDDLRKAEEARMKKRRDRGRDADEGDVTYINEKNKQFNNKLARFYDRYTTDIRESFERGTAI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.54
3 0.5
4 0.45
5 0.38
6 0.29
7 0.24
8 0.21
9 0.2
10 0.2
11 0.15
12 0.12
13 0.15
14 0.15
15 0.16
16 0.15
17 0.14
18 0.15
19 0.15
20 0.15
21 0.13
22 0.17
23 0.18
24 0.19
25 0.21
26 0.21
27 0.2
28 0.22
29 0.26
30 0.22
31 0.23
32 0.21
33 0.24
34 0.23
35 0.25
36 0.22
37 0.18
38 0.19
39 0.17
40 0.18
41 0.15
42 0.16
43 0.14
44 0.16
45 0.18
46 0.19
47 0.22
48 0.22
49 0.2
50 0.2
51 0.19
52 0.16
53 0.15
54 0.15
55 0.15
56 0.15
57 0.16
58 0.18
59 0.2
60 0.2
61 0.19
62 0.17
63 0.15
64 0.14
65 0.14
66 0.19
67 0.21
68 0.21
69 0.22
70 0.24
71 0.27
72 0.28
73 0.3
74 0.27
75 0.3
76 0.3
77 0.29
78 0.29
79 0.25
80 0.24
81 0.21
82 0.18
83 0.14
84 0.13
85 0.13
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.1
90 0.11
91 0.08
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.08
101 0.09
102 0.08
103 0.08
104 0.13
105 0.14
106 0.18
107 0.21
108 0.23
109 0.26
110 0.26
111 0.25
112 0.22
113 0.2
114 0.16
115 0.13
116 0.11
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.06
122 0.05
123 0.08
124 0.07
125 0.08
126 0.09
127 0.1
128 0.13
129 0.14
130 0.16
131 0.18
132 0.22
133 0.27
134 0.31
135 0.3
136 0.28
137 0.28
138 0.28
139 0.24
140 0.21
141 0.17
142 0.14
143 0.19
144 0.28
145 0.31
146 0.35
147 0.38
148 0.43
149 0.49
150 0.57
151 0.61
152 0.61
153 0.65
154 0.64
155 0.63
156 0.58
157 0.51
158 0.44
159 0.35
160 0.28
161 0.2
162 0.15
163 0.12
164 0.12
165 0.13
166 0.11
167 0.12
168 0.14
169 0.13
170 0.16
171 0.19
172 0.2
173 0.23
174 0.24
175 0.26
176 0.25
177 0.26
178 0.25
179 0.26
180 0.24
181 0.26
182 0.27
183 0.34
184 0.32
185 0.32
186 0.32
187 0.36
188 0.4
189 0.41
190 0.45
191 0.38
192 0.38
193 0.38
194 0.38
195 0.31
196 0.31
197 0.3
198 0.23
199 0.2
200 0.19
201 0.17
202 0.16
203 0.15
204 0.11
205 0.08
206 0.06
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.04
215 0.04
216 0.03
217 0.03
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.16
228 0.17
229 0.17
230 0.17
231 0.19
232 0.19
233 0.21
234 0.22
235 0.16
236 0.23
237 0.26
238 0.34
239 0.37
240 0.39
241 0.43
242 0.49
243 0.55
244 0.53
245 0.61
246 0.53
247 0.53
248 0.55
249 0.5
250 0.43
251 0.38
252 0.32
253 0.24
254 0.24
255 0.25
256 0.26
257 0.33
258 0.42
259 0.5
260 0.56
261 0.61
262 0.7
263 0.76
264 0.78
265 0.8
266 0.8
267 0.78
268 0.8
269 0.76
270 0.72
271 0.63
272 0.54
273 0.45
274 0.36
275 0.28
276 0.21
277 0.21
278 0.18
279 0.23
280 0.24
281 0.3
282 0.37
283 0.47
284 0.49
285 0.55
286 0.64
287 0.63
288 0.69
289 0.66
290 0.66
291 0.61
292 0.6
293 0.59
294 0.51
295 0.49
296 0.46
297 0.46
298 0.44
299 0.43
300 0.43
301 0.38
302 0.39
303 0.37