Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1YQQ9

Protein Details
Accession A0A0D1YQQ9    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
281-300RDFAKFKRDKARKPEPRTAEBasic
426-451KANPGGKRKGAKGKRGKNGNERYGLQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
288-293RDKARK
429-443PGGKRKGAKGKRGKN
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 7, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPRKRWIDKKEAQTFHLLYRSQNDPALHNETAGDRALYPISGPGSSSQQDAPGKGLHLDDLEDELDFESVRENEGEAAEHGIYYDDTNYDYMQHLREIGEGGGEAHFVEAPSAKGKGKAKTMKLEDALREVSLDDHDDRSVAGSEMLSTFSTSTRPRTYQKQQEVPDEIAGFQPDMDPRLREVLEALEDDAYVDENDEEDLFGSLSKEGRYGELELAEFEANFVDEDDEGWESDVTEKAATHSSELKLPSHAPVLDGEDPTDRDAGLDAEAAAAEDGDWLRDFAKFKRDKARKPEPRTAESIVAASAVQDKAPSLYTLNGTPLRQKKRKGALTNPSAYSMTSSSLARTDGQQLLDARFDQVEKMYSLDEAEEFDDMDGGASLVSGMTGMTGRSKMSQLSTTSFADEGAVREDFGSMMDDFLGDWNKANPGGKRKGAKGKRGKNGNERYGLQQLEEVRAELGPARIQRTNKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.59
3 0.57
4 0.47
5 0.39
6 0.4
7 0.42
8 0.36
9 0.38
10 0.35
11 0.3
12 0.36
13 0.4
14 0.34
15 0.3
16 0.29
17 0.25
18 0.26
19 0.24
20 0.18
21 0.12
22 0.13
23 0.14
24 0.12
25 0.11
26 0.12
27 0.13
28 0.12
29 0.13
30 0.13
31 0.18
32 0.19
33 0.21
34 0.19
35 0.24
36 0.27
37 0.27
38 0.27
39 0.24
40 0.24
41 0.23
42 0.23
43 0.17
44 0.15
45 0.15
46 0.13
47 0.13
48 0.12
49 0.11
50 0.11
51 0.1
52 0.09
53 0.08
54 0.07
55 0.08
56 0.08
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.11
61 0.11
62 0.12
63 0.1
64 0.12
65 0.11
66 0.1
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.07
73 0.08
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.11
78 0.13
79 0.14
80 0.14
81 0.14
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.12
86 0.1
87 0.09
88 0.09
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.05
93 0.06
94 0.05
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.09
99 0.11
100 0.12
101 0.18
102 0.23
103 0.27
104 0.36
105 0.43
106 0.47
107 0.54
108 0.58
109 0.58
110 0.57
111 0.56
112 0.48
113 0.44
114 0.4
115 0.3
116 0.26
117 0.2
118 0.17
119 0.13
120 0.14
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.12
127 0.12
128 0.09
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.09
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.11
139 0.12
140 0.17
141 0.21
142 0.25
143 0.29
144 0.37
145 0.47
146 0.54
147 0.61
148 0.64
149 0.63
150 0.66
151 0.65
152 0.58
153 0.5
154 0.4
155 0.31
156 0.24
157 0.2
158 0.13
159 0.09
160 0.09
161 0.07
162 0.09
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.14
167 0.14
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.08
175 0.07
176 0.08
177 0.07
178 0.06
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.1
198 0.11
199 0.11
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.11
204 0.09
205 0.08
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.09
227 0.09
228 0.1
229 0.12
230 0.13
231 0.16
232 0.17
233 0.17
234 0.16
235 0.16
236 0.16
237 0.15
238 0.14
239 0.11
240 0.11
241 0.15
242 0.15
243 0.14
244 0.14
245 0.13
246 0.14
247 0.14
248 0.13
249 0.09
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.07
269 0.09
270 0.11
271 0.21
272 0.24
273 0.29
274 0.39
275 0.47
276 0.53
277 0.61
278 0.71
279 0.71
280 0.76
281 0.81
282 0.77
283 0.73
284 0.7
285 0.63
286 0.54
287 0.44
288 0.36
289 0.27
290 0.2
291 0.16
292 0.11
293 0.1
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.07
302 0.09
303 0.1
304 0.11
305 0.16
306 0.17
307 0.17
308 0.25
309 0.32
310 0.41
311 0.46
312 0.5
313 0.55
314 0.63
315 0.71
316 0.72
317 0.73
318 0.73
319 0.75
320 0.75
321 0.67
322 0.59
323 0.5
324 0.42
325 0.34
326 0.25
327 0.18
328 0.14
329 0.13
330 0.12
331 0.12
332 0.14
333 0.12
334 0.13
335 0.17
336 0.18
337 0.18
338 0.21
339 0.21
340 0.22
341 0.23
342 0.21
343 0.17
344 0.15
345 0.15
346 0.12
347 0.12
348 0.12
349 0.11
350 0.12
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.11
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.08
359 0.08
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.06
364 0.05
365 0.04
366 0.04
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.02
373 0.03
374 0.03
375 0.04
376 0.06
377 0.07
378 0.09
379 0.11
380 0.12
381 0.14
382 0.17
383 0.21
384 0.22
385 0.25
386 0.28
387 0.27
388 0.28
389 0.26
390 0.23
391 0.19
392 0.17
393 0.15
394 0.14
395 0.13
396 0.12
397 0.12
398 0.12
399 0.11
400 0.1
401 0.11
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.11
408 0.13
409 0.1
410 0.11
411 0.13
412 0.15
413 0.18
414 0.22
415 0.26
416 0.33
417 0.41
418 0.47
419 0.53
420 0.59
421 0.67
422 0.72
423 0.76
424 0.78
425 0.8
426 0.82
427 0.86
428 0.87
429 0.86
430 0.88
431 0.86
432 0.82
433 0.74
434 0.7
435 0.67
436 0.58
437 0.48
438 0.41
439 0.35
440 0.33
441 0.31
442 0.26
443 0.2
444 0.19
445 0.19
446 0.17
447 0.17
448 0.17
449 0.2
450 0.25
451 0.3