FuNGI

A0A0D1XGZ3

Protein Details

Accession

A0A0D1XGZ3

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-38	ASKPSAAKPGPKPKPRAGVQRKTKAEREQFA	Hydrophilic
483-502	TNDGEEKKSKPKPKGTAFAL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
10-79	KPSAAKPGPKPKPRAGVQRKTKAEREQFAKEEAERQKARAAEEAAKNAATRGGRGGGRGGRGGRGAPTSG
198-249	KGKEKETKLAHRPKRVRGLRPSRAARYLTEAEKKEKEEKAAKLGKKPRTVKK
283-293	RRRSLKKVRSR
490-496	KSKPKPK

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MADSNPTASKPSAAKPGPKPKPRAGVQRKTKAEREQFAKEEAERQKARAAEEAAKNAATRGGRGGGRGGRGGRGAPTSGRDERRDHSFGGGGVFGAGSAARPTARRALGEGYAELLEGQQAAKPDEFGGTPGAIEIEGDMPSSSGGGRTAGAKKNEIYDLDESDDEPKELMRDMDAIAISSSDEAEPEPEPEEPNDSKGKEKETKLAHRPKRVRGLRPSRAARYLTEAEKKEKEEKAAKLGKKPRTVKKVEPDVQDVADDGEAMDLDEPVFVKEQPSSPELGRRRSLKKVRSRDAKPGSAVETIEEAAERERVTLDMNKLRELILRSQTHEHPATVSDGIPTDEEFEDRATRDGKLLLFQLPPLTPFLFDASIPDEPDVKTEPGVDNTAATKEETDGGAQPKRPRLQTDKLLTATEPQPLPAGMVGKLRVHKSGKVSMDWGGTDMEVRYGAEVDYLQDVVLVQPPIKKEDDEDVEMKDGNNETNDGEEKKSKPKPKGTAFALGQIRKKMVLIPDWAKLYD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.55
3	0.65
4	0.71
5	0.76
6	0.79
7	0.77
8	0.82
9	0.81
10	0.82
11	0.82
12	0.82
13	0.84
14	0.87
15	0.88
16	0.85
17	0.85
18	0.83
19	0.82
20	0.8
21	0.76
22	0.74
23	0.68
24	0.64
25	0.6
26	0.51
27	0.51
28	0.48
29	0.51
30	0.45
31	0.43
32	0.45
33	0.43
34	0.44
35	0.41
36	0.39
37	0.38
38	0.42
39	0.44
40	0.41
41	0.39
42	0.36
43	0.3
44	0.3
45	0.22
46	0.18
47	0.17
48	0.21
49	0.2
50	0.21
51	0.27
52	0.26
53	0.28
54	0.31
55	0.29
56	0.26
57	0.27
58	0.27
59	0.23
60	0.22
61	0.21
62	0.19
63	0.22
64	0.26
65	0.32
66	0.37
67	0.39
68	0.41
69	0.43
70	0.49
71	0.48
72	0.42
73	0.37
74	0.33
75	0.3
76	0.27
77	0.24
78	0.15
79	0.13
80	0.11
81	0.08
82	0.06
83	0.05
84	0.04
85	0.04
86	0.05
87	0.07
88	0.08
89	0.11
90	0.18
91	0.2
92	0.2
93	0.22
94	0.25
95	0.26
96	0.27
97	0.24
98	0.19
99	0.17
100	0.16
101	0.14
102	0.1
103	0.07
104	0.06
105	0.06
106	0.06
107	0.07
108	0.09
109	0.09
110	0.1
111	0.1
112	0.11
113	0.11
114	0.11
115	0.11
116	0.09
117	0.09
118	0.08
119	0.08
120	0.07
121	0.06
122	0.06
123	0.05
124	0.05
125	0.06
126	0.06
127	0.05
128	0.06
129	0.06
130	0.05
131	0.05
132	0.05
133	0.05
134	0.06
135	0.1
136	0.17
137	0.22
138	0.24
139	0.26
140	0.26
141	0.29
142	0.3
143	0.27
144	0.25
145	0.21
146	0.21
147	0.21
148	0.2
149	0.18
150	0.18
151	0.18
152	0.14
153	0.12
154	0.1
155	0.09
156	0.09
157	0.09
158	0.07
159	0.07
160	0.08
161	0.1
162	0.09
163	0.09
164	0.08
165	0.08
166	0.07
167	0.06
168	0.06
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.06
173	0.06
174	0.07
175	0.09
176	0.09
177	0.1
178	0.1
179	0.16
180	0.14
181	0.17
182	0.21
183	0.2
184	0.24
185	0.25
186	0.32
187	0.33
188	0.34
189	0.38
190	0.42
191	0.5
192	0.56
193	0.64
194	0.64
195	0.68
196	0.72
197	0.73
198	0.76
199	0.74
200	0.72
201	0.73
202	0.76
203	0.74
204	0.77
205	0.75
206	0.68
207	0.65
208	0.59
209	0.48
210	0.44
211	0.4
212	0.35
213	0.36
214	0.34
215	0.34
216	0.35
217	0.37
218	0.37
219	0.35
220	0.36
221	0.36
222	0.36
223	0.41
224	0.46
225	0.46
226	0.48
227	0.55
228	0.56
229	0.59
230	0.65
231	0.64
232	0.66
233	0.69
234	0.68
235	0.68
236	0.72
237	0.69
238	0.64
239	0.59
240	0.51
241	0.45
242	0.38
243	0.29
244	0.19
245	0.12
246	0.09
247	0.05
248	0.04
249	0.03
250	0.03
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.04
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.06
261	0.08
262	0.1
263	0.11
264	0.13
265	0.13
266	0.21
267	0.24
268	0.28
269	0.31
270	0.35
271	0.38
272	0.46
273	0.54
274	0.55
275	0.61
276	0.66
277	0.71
278	0.75
279	0.74
280	0.75
281	0.73
282	0.68
283	0.59
284	0.51
285	0.45
286	0.36
287	0.32
288	0.22
289	0.17
290	0.13
291	0.11
292	0.09
293	0.07
294	0.06
295	0.07
296	0.07
297	0.06
298	0.06
299	0.06
300	0.09
301	0.12
302	0.16
303	0.2
304	0.21
305	0.22
306	0.22
307	0.22
308	0.23
309	0.22
310	0.23
311	0.26
312	0.27
313	0.29
314	0.32
315	0.33
316	0.36
317	0.34
318	0.29
319	0.22
320	0.21
321	0.2
322	0.17
323	0.16
324	0.11
325	0.1
326	0.11
327	0.1
328	0.09
329	0.1
330	0.09
331	0.09
332	0.09
333	0.1
334	0.11
335	0.11
336	0.13
337	0.12
338	0.12
339	0.13
340	0.14
341	0.13
342	0.14
343	0.15
344	0.16
345	0.15
346	0.15
347	0.17
348	0.14
349	0.15
350	0.15
351	0.14
352	0.12
353	0.12
354	0.14
355	0.12
356	0.12
357	0.13
358	0.14
359	0.15
360	0.15
361	0.14
362	0.14
363	0.13
364	0.16
365	0.17
366	0.14
367	0.13
368	0.15
369	0.16
370	0.17
371	0.19
372	0.17
373	0.14
374	0.15
375	0.16
376	0.14
377	0.13
378	0.11
379	0.1
380	0.11
381	0.11
382	0.11
383	0.13
384	0.18
385	0.22
386	0.26
387	0.3
388	0.37
389	0.42
390	0.44
391	0.47
392	0.5
393	0.55
394	0.6
395	0.62
396	0.61
397	0.57
398	0.55
399	0.48
400	0.46
401	0.38
402	0.34
403	0.27
404	0.21
405	0.2
406	0.19
407	0.19
408	0.15
409	0.15
410	0.12
411	0.15
412	0.17
413	0.2
414	0.24
415	0.25
416	0.3
417	0.31
418	0.34
419	0.37
420	0.43
421	0.43
422	0.4
423	0.41
424	0.37
425	0.36
426	0.32
427	0.27
428	0.2
429	0.16
430	0.15
431	0.13
432	0.11
433	0.09
434	0.09
435	0.08
436	0.08
437	0.08
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.09
442	0.09
443	0.08
444	0.08
445	0.08
446	0.08
447	0.12
448	0.12
449	0.12
450	0.15
451	0.17
452	0.21
453	0.22
454	0.22
455	0.21
456	0.29
457	0.33
458	0.36
459	0.36
460	0.34
461	0.34
462	0.34
463	0.31
464	0.26
465	0.21
466	0.18
467	0.18
468	0.17
469	0.15
470	0.18
471	0.22
472	0.21
473	0.24
474	0.28
475	0.31
476	0.4
477	0.49
478	0.54
479	0.6
480	0.68
481	0.74
482	0.77
483	0.83
484	0.79
485	0.79
486	0.72
487	0.71
488	0.7
489	0.65
490	0.61
491	0.55
492	0.51
493	0.42
494	0.41
495	0.37
496	0.34
497	0.34
498	0.37
499	0.37
500	0.42

A0A0D1XGZ3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer