Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1Z0W6

Protein Details
Accession A0A0D1Z0W6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-214IAPYFPQKRKPAKRAAAPVKKIHydrophilic
247-268RPEARRVKSGGRPKSRGKPETTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
200-209KRKPAKRAAA
249-264EARRVKSGGRPKSRGK
Subcellular Location(s) extr 10, cyto 8, cyto_nucl 5.5, E.R. 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005595  TRAP_alpha  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF03896  TRAP_alpha  
Amino Acid Sequences MVRFLDLALLLLGSQAAGVFAQAADAEIDEELESPSTSPALAVTVEASFPDAEIFGIKLVNGKPTEAVLSFMNQEPEPVVVQFVGGSLWSPDLANPVIVRNLTTAQYAVELPAGEKQSLPYRFQTNMHPQDLRLNLAAVVSSHNTFYTLQAFNGTVSIVEPNASIFDPQLLFLYFFLLACALGVGYFFYNIWIAPYFPQKRKPAKRAAAPVKKIDVGTVTSDSAGPVVSTGSQKYNEEWIPSHHIQRPEARRVKSGGRPKSRGKPETTI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.03
3 0.03
4 0.03
5 0.03
6 0.04
7 0.04
8 0.04
9 0.04
10 0.05
11 0.05
12 0.05
13 0.06
14 0.05
15 0.06
16 0.06
17 0.06
18 0.06
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.08
23 0.07
24 0.07
25 0.06
26 0.06
27 0.07
28 0.07
29 0.06
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.08
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.06
39 0.05
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.06
45 0.1
46 0.1
47 0.15
48 0.15
49 0.15
50 0.16
51 0.16
52 0.18
53 0.15
54 0.16
55 0.11
56 0.12
57 0.13
58 0.14
59 0.16
60 0.13
61 0.13
62 0.12
63 0.13
64 0.12
65 0.1
66 0.09
67 0.07
68 0.07
69 0.06
70 0.06
71 0.05
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.09
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.09
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.09
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.17
105 0.2
106 0.22
107 0.21
108 0.23
109 0.25
110 0.26
111 0.32
112 0.34
113 0.38
114 0.38
115 0.36
116 0.33
117 0.37
118 0.36
119 0.31
120 0.21
121 0.16
122 0.13
123 0.12
124 0.12
125 0.06
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.12
135 0.11
136 0.11
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.11
141 0.1
142 0.06
143 0.05
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.07
160 0.09
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.09
182 0.19
183 0.26
184 0.3
185 0.39
186 0.46
187 0.57
188 0.66
189 0.73
190 0.74
191 0.76
192 0.8
193 0.82
194 0.84
195 0.84
196 0.78
197 0.75
198 0.68
199 0.61
200 0.53
201 0.43
202 0.34
203 0.26
204 0.24
205 0.21
206 0.18
207 0.16
208 0.16
209 0.15
210 0.13
211 0.11
212 0.07
213 0.05
214 0.05
215 0.07
216 0.09
217 0.11
218 0.14
219 0.17
220 0.18
221 0.2
222 0.26
223 0.26
224 0.28
225 0.27
226 0.29
227 0.35
228 0.37
229 0.42
230 0.41
231 0.44
232 0.45
233 0.54
234 0.57
235 0.59
236 0.64
237 0.61
238 0.6
239 0.6
240 0.64
241 0.64
242 0.66
243 0.66
244 0.68
245 0.72
246 0.76
247 0.82
248 0.84
249 0.81