Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1YWD8

Protein Details
Accession A0A0D1YWD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-60ITDPVTRRKLQNRLNQRAARRRKAAQKGINNDDPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-50RAARRRKA
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021833  DUF3425  
Pfam View protein in Pfam  
PF11905  DUF3425  
Amino Acid Sequences MPIGAGIKAEWKLHADVQSLDDEWSGITDPVTRRKLQNRLNQRAARRRKAAQKGINNDDPSTPSNASAAGSKSLGRQIGLDDAAFLQAKSLTFPGDKWNRAAESLGATDPSAFVSIRSKHSCQRWYEVLLENRLVHIKDLAGRLQNERDHAWKLTLPADHLISLVFYNVYRGLLANVEILGLDLNLMYTDEYPSPFLPLSSSASSALRHLPPALQPTELQKTIAHHPQWDVFPDPIIRDNILRYGENNIDDYEFCLDLVGNGRFDDLEGCSTQEKNGLICWGEPWELDGWEVTEAFARKYPFFLRGALTFQECSNKWRVKRGEEPLDFERISELE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.27
3 0.26
4 0.28
5 0.29
6 0.26
7 0.24
8 0.19
9 0.15
10 0.13
11 0.12
12 0.11
13 0.09
14 0.08
15 0.13
16 0.17
17 0.26
18 0.31
19 0.34
20 0.4
21 0.49
22 0.59
23 0.62
24 0.69
25 0.71
26 0.76
27 0.83
28 0.82
29 0.83
30 0.84
31 0.85
32 0.84
33 0.8
34 0.78
35 0.78
36 0.82
37 0.82
38 0.81
39 0.8
40 0.8
41 0.81
42 0.8
43 0.72
44 0.62
45 0.54
46 0.47
47 0.4
48 0.36
49 0.29
50 0.21
51 0.2
52 0.19
53 0.18
54 0.17
55 0.16
56 0.13
57 0.13
58 0.14
59 0.15
60 0.18
61 0.19
62 0.16
63 0.15
64 0.14
65 0.17
66 0.17
67 0.15
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.12
72 0.1
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.11
81 0.2
82 0.26
83 0.28
84 0.28
85 0.32
86 0.3
87 0.31
88 0.31
89 0.22
90 0.18
91 0.18
92 0.16
93 0.12
94 0.11
95 0.1
96 0.1
97 0.09
98 0.08
99 0.06
100 0.06
101 0.12
102 0.15
103 0.21
104 0.26
105 0.28
106 0.33
107 0.4
108 0.46
109 0.44
110 0.47
111 0.44
112 0.42
113 0.43
114 0.44
115 0.41
116 0.36
117 0.35
118 0.29
119 0.26
120 0.25
121 0.21
122 0.15
123 0.11
124 0.1
125 0.12
126 0.13
127 0.14
128 0.16
129 0.17
130 0.19
131 0.22
132 0.23
133 0.21
134 0.21
135 0.22
136 0.21
137 0.2
138 0.2
139 0.17
140 0.17
141 0.18
142 0.17
143 0.16
144 0.15
145 0.15
146 0.13
147 0.12
148 0.1
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.05
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.03
169 0.03
170 0.02
171 0.02
172 0.02
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.1
186 0.13
187 0.13
188 0.14
189 0.13
190 0.14
191 0.15
192 0.15
193 0.17
194 0.14
195 0.14
196 0.13
197 0.13
198 0.15
199 0.19
200 0.19
201 0.16
202 0.17
203 0.21
204 0.26
205 0.25
206 0.23
207 0.2
208 0.22
209 0.26
210 0.33
211 0.29
212 0.25
213 0.26
214 0.29
215 0.29
216 0.28
217 0.25
218 0.18
219 0.19
220 0.18
221 0.18
222 0.18
223 0.18
224 0.16
225 0.15
226 0.16
227 0.18
228 0.19
229 0.18
230 0.16
231 0.19
232 0.21
233 0.21
234 0.21
235 0.18
236 0.16
237 0.16
238 0.17
239 0.14
240 0.12
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.13
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.13
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.12
257 0.13
258 0.14
259 0.14
260 0.17
261 0.16
262 0.14
263 0.15
264 0.16
265 0.15
266 0.15
267 0.16
268 0.15
269 0.15
270 0.14
271 0.15
272 0.14
273 0.13
274 0.13
275 0.12
276 0.1
277 0.1
278 0.11
279 0.09
280 0.11
281 0.12
282 0.13
283 0.17
284 0.19
285 0.18
286 0.22
287 0.25
288 0.25
289 0.26
290 0.27
291 0.27
292 0.27
293 0.3
294 0.29
295 0.29
296 0.26
297 0.26
298 0.31
299 0.28
300 0.3
301 0.36
302 0.41
303 0.41
304 0.5
305 0.56
306 0.57
307 0.66
308 0.71
309 0.73
310 0.69
311 0.73
312 0.66
313 0.66
314 0.57
315 0.48