Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1YPF0

Protein Details
Accession A0A0D1YPF0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
61-83GSRAQRRKAIVARHKPKRPLNAFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
61-78GSRAQRRKAIVARHKPKR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 8.5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR006856  MATalpha_HMGbox  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008301  F:DNA binding, bending  
GO:0045895  P:positive regulation of mating-type specific transcription, DNA-templated  
Pfam View protein in Pfam  
PF04769  MATalpha_HMGbox  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51325  ALPHA_BOX  
Amino Acid Sequences MAASNDFKSAFAELFNTLSSDQLKALSGSLALAAQLKTSVANMSSGDDVSVASTSASYPKGSRAQRRKAIVARHKPKRPLNAFMAYRTYYSPLFKGLPQKQKSGLMREMWCAEAKKTMWTLLGGAYSDLRDHHQETFPVDKFLSIAVPLLPIVPADKYLSKMGWTLSSDAAGEPVLFRNPAFNADILAAEYAPRTNLSLEDIVEHCYNQGLMPRDERRNPMEVLRENLRAEGLMDALPPADQTPPPACGSLILAVTPQSTSTMTTQPSSIETTPEPSDDGNVDGPVCENEENDALSMDAIINSDAYLSVASVTAEQQDAFDSNALALHFHPDVSPPILGFDPRVIQDDFDPFNLDLSELINFDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.14
4 0.13
5 0.15
6 0.15
7 0.14
8 0.14
9 0.14
10 0.14
11 0.13
12 0.14
13 0.12
14 0.11
15 0.1
16 0.1
17 0.08
18 0.08
19 0.1
20 0.09
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.09
25 0.09
26 0.11
27 0.08
28 0.1
29 0.1
30 0.12
31 0.13
32 0.13
33 0.12
34 0.1
35 0.1
36 0.09
37 0.09
38 0.07
39 0.05
40 0.06
41 0.06
42 0.09
43 0.11
44 0.11
45 0.12
46 0.18
47 0.26
48 0.34
49 0.44
50 0.51
51 0.6
52 0.67
53 0.72
54 0.74
55 0.73
56 0.76
57 0.76
58 0.77
59 0.77
60 0.79
61 0.81
62 0.82
63 0.83
64 0.83
65 0.78
66 0.74
67 0.71
68 0.7
69 0.64
70 0.58
71 0.56
72 0.46
73 0.41
74 0.35
75 0.3
76 0.23
77 0.23
78 0.2
79 0.19
80 0.2
81 0.22
82 0.31
83 0.37
84 0.45
85 0.46
86 0.49
87 0.49
88 0.55
89 0.57
90 0.53
91 0.5
92 0.46
93 0.45
94 0.44
95 0.41
96 0.35
97 0.33
98 0.27
99 0.23
100 0.22
101 0.2
102 0.21
103 0.2
104 0.2
105 0.18
106 0.17
107 0.17
108 0.13
109 0.14
110 0.1
111 0.1
112 0.09
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.11
118 0.12
119 0.15
120 0.17
121 0.18
122 0.21
123 0.27
124 0.25
125 0.24
126 0.22
127 0.19
128 0.17
129 0.17
130 0.14
131 0.07
132 0.07
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.07
143 0.08
144 0.1
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.12
149 0.12
150 0.13
151 0.13
152 0.13
153 0.12
154 0.12
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.07
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.07
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.07
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.1
188 0.1
189 0.12
190 0.12
191 0.12
192 0.1
193 0.09
194 0.09
195 0.07
196 0.11
197 0.12
198 0.13
199 0.19
200 0.25
201 0.3
202 0.33
203 0.36
204 0.35
205 0.35
206 0.35
207 0.33
208 0.35
209 0.32
210 0.33
211 0.33
212 0.33
213 0.29
214 0.28
215 0.25
216 0.17
217 0.16
218 0.12
219 0.09
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.09
230 0.11
231 0.14
232 0.15
233 0.16
234 0.15
235 0.14
236 0.15
237 0.14
238 0.12
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.08
244 0.07
245 0.06
246 0.07
247 0.09
248 0.11
249 0.15
250 0.16
251 0.16
252 0.17
253 0.16
254 0.18
255 0.2
256 0.18
257 0.17
258 0.16
259 0.2
260 0.2
261 0.2
262 0.19
263 0.15
264 0.16
265 0.14
266 0.15
267 0.12
268 0.11
269 0.11
270 0.1
271 0.1
272 0.09
273 0.11
274 0.09
275 0.08
276 0.1
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.1
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.07
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.12
319 0.16
320 0.18
321 0.18
322 0.14
323 0.17
324 0.18
325 0.18
326 0.17
327 0.17
328 0.18
329 0.19
330 0.22
331 0.2
332 0.2
333 0.22
334 0.27
335 0.26
336 0.24
337 0.26
338 0.23
339 0.23
340 0.22
341 0.2
342 0.14
343 0.13
344 0.13