FuNGI

A0A0D1Y2H8

Protein Details

Accession

A0A0D1Y2H8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-56	NTPTVTKRTRTPSRKLRLRLGTAKLIKQLNQKRKTVRQKKKEAKANSGQTDP	Hydrophilic
819-841	MPPPPKGAKLKGKGKAERKDTRA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
12-48	RTRTPSRKLRLRLGTAKLIKQLNQKRKTVRQKKKEAK
819-838	MPPPPKGAKLKGKGKAERKD

Subcellular Location(s)

mito 13.5, cyto_mito 9.5, nucl 7, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039182 Pop1 IPR009723 Pop1_N IPR012590 POPLD_dom
Gene Ontology	GO:0005655 C:nucleolar ribonuclease P complex GO:0000172 C:ribonuclease MRP complex GO:0001682 P:tRNA 5'-leader removal
Pfam	View protein in Pfam PF06978 POP1 PF08170 POPLD

Amino Acid Sequences

MRDDNTPTVTKRTRTPSRKLRLRLGTAKLIKQLNQKRKTVRQKKKEAKANSGQTDPENHVSISKVPRLKRNTLAEPPRATVIYKRRQVNKTWLPTHLWHTKRAHMTRPTEPLWRIAVPLSPTEKSYRPSHRAAGAHGCVAWDTSYMSTVACRGTQGALESMLKALGFSPQGLNPAMHKKWKAGTRFAEGWVYERVDAKQAIAPVKVIWCIQSKAEASTAAISKGDDQMDVDANNQPPTVASTKRKAKLDHQILFRIHPSAFQRFWQELLMVAKMQRPQVLLEDLRFEVGSIDIQGPGSTESLLGILRPLLTEGGQADTTVYTWMSLAGLNNPGGVPLNAMLALDVMDPRLNHPPKQIKFPSADMSRLDEILVSWPPDKNSSSSRLLSHKERWLVSNSLPSQKAINRRRALAPPGQTPAVTAKDPRLPVLLLASRAEVSKTAKSANAQGTWTVLLPWTCVDPMWRSLMYYPLSSGGTPRFGGLKQLQQLAFEHGSPWFPGDFPGTEAGKAWERTESERRFDEWIRRPPKNRIAWDKLDLGLGRCGEVGSGWACDWECLFECAERTFNKSAAATSEQAKKGPAEKLAQVLTQRQRKAAKARVDASATDEDTARRRNTSSPESDIGEDRITAPPSVQHTQLAHAVILSLLKKPAVAALASTPALMTIRITLLDKGTPGPAARIYRLPSITKPAAGRTTTTNEAVSLNQTQPQSWSSEPPPAQHPPATSTTDSSVLSKDMAARDLRARWLALDLTPHGQNQLKPHLPKEKTNKFNLTRQQHIYPRESLANVNVLPKNAPQEIIDKFGPNSAFGRGDGEIPKEMPPPPKGAKLKGKGKAERKDTRATDDKGNAELRLKGNNQRGYLDPDDDEPPSAPIADFQDLLNTSPPEDEWSKHPPCPDVHDLIGFVTSGGYNLAEGRGTAVGSIWAQRVVQGWIDHAEDNASEREKRLCIVRNAGESVGRLGLWEVCGT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.73
3	0.75
4	0.8
5	0.86
6	0.85
7	0.86
8	0.84
9	0.85
10	0.83
11	0.79
12	0.78
13	0.75
14	0.72
15	0.68
16	0.63
17	0.58
18	0.6
19	0.64
20	0.64
21	0.66
22	0.7
23	0.73
24	0.79
25	0.85
26	0.86
27	0.87
28	0.87
29	0.9
30	0.93
31	0.94
32	0.93
33	0.9
34	0.89
35	0.88
36	0.87
37	0.81
38	0.73
39	0.65
40	0.58
41	0.54
42	0.49
43	0.43
44	0.35
45	0.3
46	0.28
47	0.27
48	0.31
49	0.33
50	0.35
51	0.38
52	0.4
53	0.49
54	0.56
55	0.61
56	0.64
57	0.66
58	0.67
59	0.71
60	0.75
61	0.74
62	0.7
63	0.65
64	0.59
65	0.51
66	0.44
67	0.42
68	0.44
69	0.46
70	0.49
71	0.56
72	0.62
73	0.66
74	0.71
75	0.74
76	0.74
77	0.74
78	0.71
79	0.67
80	0.63
81	0.62
82	0.63
83	0.61
84	0.53
85	0.51
86	0.51
87	0.56
88	0.6
89	0.62
90	0.63
91	0.62
92	0.66
93	0.65
94	0.68
95	0.63
96	0.61
97	0.56
98	0.51
99	0.47
100	0.41
101	0.35
102	0.29
103	0.3
104	0.24
105	0.28
106	0.29
107	0.25
108	0.27
109	0.3
110	0.33
111	0.33
112	0.4
113	0.44
114	0.45
115	0.49
116	0.53
117	0.55
118	0.53
119	0.54
120	0.54
121	0.46
122	0.42
123	0.37
124	0.32
125	0.24
126	0.23
127	0.18
128	0.1
129	0.09
130	0.08
131	0.09
132	0.09
133	0.09
134	0.09
135	0.1
136	0.11
137	0.1
138	0.1
139	0.1
140	0.11
141	0.12
142	0.14
143	0.13
144	0.14
145	0.14
146	0.14
147	0.13
148	0.13
149	0.11
150	0.09
151	0.08
152	0.09
153	0.09
154	0.1
155	0.12
156	0.13
157	0.16
158	0.17
159	0.17
160	0.18
161	0.26
162	0.28
163	0.33
164	0.33
165	0.35
166	0.41
167	0.47
168	0.49
169	0.49
170	0.51
171	0.52
172	0.53
173	0.51
174	0.48
175	0.41
176	0.38
177	0.33
178	0.29
179	0.22
180	0.22
181	0.21
182	0.21
183	0.21
184	0.2
185	0.18
186	0.21
187	0.22
188	0.2
189	0.2
190	0.17
191	0.18
192	0.18
193	0.16
194	0.16
195	0.17
196	0.18
197	0.18
198	0.22
199	0.22
200	0.22
201	0.23
202	0.2
203	0.17
204	0.2
205	0.2
206	0.15
207	0.14
208	0.13
209	0.13
210	0.16
211	0.16
212	0.12
213	0.11
214	0.13
215	0.14
216	0.14
217	0.14
218	0.15
219	0.16
220	0.17
221	0.16
222	0.14
223	0.13
224	0.16
225	0.19
226	0.21
227	0.25
228	0.33
229	0.42
230	0.49
231	0.54
232	0.54
233	0.58
234	0.62
235	0.67
236	0.65
237	0.61
238	0.62
239	0.58
240	0.56
241	0.49
242	0.41
243	0.3
244	0.28
245	0.28
246	0.27
247	0.27
248	0.27
249	0.31
250	0.29
251	0.31
252	0.27
253	0.23
254	0.19
255	0.2
256	0.19
257	0.14
258	0.14
259	0.17
260	0.18
261	0.2
262	0.18
263	0.17
264	0.17
265	0.19
266	0.23
267	0.21
268	0.2
269	0.21
270	0.2
271	0.19
272	0.18
273	0.15
274	0.1
275	0.09
276	0.09
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.08
284	0.08
285	0.06
286	0.06
287	0.05
288	0.06
289	0.06
290	0.06
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.05
296	0.05
297	0.05
298	0.06
299	0.07
300	0.09
301	0.08
302	0.08
303	0.08
304	0.08
305	0.08
306	0.08
307	0.07
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.06
313	0.06
314	0.07
315	0.09
316	0.09
317	0.09
318	0.09
319	0.09
320	0.09
321	0.08
322	0.07
323	0.05
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.05
328	0.04
329	0.05
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.05
334	0.06
335	0.08
336	0.18
337	0.2
338	0.21
339	0.29
340	0.38
341	0.39
342	0.49
343	0.5
344	0.44
345	0.45
346	0.47
347	0.46
348	0.39
349	0.39
350	0.31
351	0.32
352	0.28
353	0.25
354	0.22
355	0.14
356	0.13
357	0.13
358	0.12
359	0.1
360	0.1
361	0.11
362	0.12
363	0.14
364	0.15
365	0.16
366	0.18
367	0.22
368	0.26
369	0.27
370	0.29
371	0.31
372	0.34
373	0.37
374	0.39
375	0.39
376	0.39
377	0.38
378	0.37
379	0.36
380	0.35
381	0.31
382	0.33
383	0.3
384	0.31
385	0.3
386	0.29
387	0.28
388	0.29
389	0.38
390	0.37
391	0.44
392	0.41
393	0.43
394	0.47
395	0.48
396	0.49
397	0.45
398	0.42
399	0.35
400	0.36
401	0.33
402	0.29
403	0.26
404	0.24
405	0.21
406	0.17
407	0.15
408	0.15
409	0.19
410	0.2
411	0.2
412	0.18
413	0.15
414	0.15
415	0.18
416	0.16
417	0.13
418	0.13
419	0.13
420	0.12
421	0.12
422	0.12
423	0.09
424	0.11
425	0.11
426	0.12
427	0.12
428	0.13
429	0.14
430	0.19
431	0.21
432	0.2
433	0.19
434	0.18
435	0.18
436	0.17
437	0.16
438	0.11
439	0.08
440	0.06
441	0.06
442	0.06
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.07
447	0.08
448	0.1
449	0.12
450	0.12
451	0.11
452	0.12
453	0.16
454	0.16
455	0.14
456	0.13
457	0.12
458	0.12
459	0.12
460	0.13
461	0.1
462	0.1
463	0.1
464	0.1
465	0.1
466	0.09
467	0.14
468	0.14
469	0.18
470	0.18
471	0.22
472	0.21
473	0.21
474	0.22
475	0.21
476	0.2
477	0.15
478	0.14
479	0.11
480	0.11
481	0.1
482	0.1
483	0.06
484	0.06
485	0.07
486	0.08
487	0.08
488	0.08
489	0.12
490	0.11
491	0.11
492	0.11
493	0.12
494	0.14
495	0.14
496	0.13
497	0.12
498	0.13
499	0.18
500	0.27
501	0.28
502	0.29
503	0.3
504	0.31
505	0.32
506	0.34
507	0.38
508	0.38
509	0.45
510	0.48
511	0.52
512	0.54
513	0.59
514	0.66
515	0.64
516	0.63
517	0.62
518	0.62
519	0.61
520	0.6
521	0.54
522	0.45
523	0.39
524	0.32
525	0.24
526	0.19
527	0.15
528	0.12
529	0.1
530	0.09
531	0.07
532	0.07
533	0.07
534	0.05
535	0.06
536	0.05
537	0.06
538	0.06
539	0.06
540	0.06
541	0.07
542	0.07
543	0.07
544	0.08
545	0.08
546	0.09
547	0.1
548	0.13
549	0.12
550	0.16
551	0.17
552	0.17
553	0.18
554	0.17
555	0.17
556	0.17
557	0.19
558	0.16
559	0.18
560	0.25
561	0.24
562	0.24
563	0.25
564	0.22
565	0.24
566	0.25
567	0.25
568	0.21
569	0.21
570	0.24
571	0.24
572	0.25
573	0.22
574	0.26
575	0.3
576	0.34
577	0.34
578	0.36
579	0.38
580	0.41
581	0.49
582	0.5
583	0.5
584	0.5
585	0.52
586	0.5
587	0.48
588	0.43
589	0.39
590	0.34
591	0.25
592	0.19
593	0.17
594	0.15
595	0.17
596	0.21
597	0.18
598	0.17
599	0.18
600	0.22
601	0.28
602	0.33
603	0.34
604	0.34
605	0.36
606	0.36
607	0.36
608	0.33
609	0.28
610	0.21
611	0.17
612	0.14
613	0.14
614	0.14
615	0.13
616	0.11
617	0.13
618	0.18
619	0.2
620	0.19
621	0.19
622	0.19
623	0.21
624	0.24
625	0.21
626	0.16
627	0.14
628	0.13
629	0.1
630	0.11
631	0.1
632	0.08
633	0.08
634	0.08
635	0.08
636	0.08
637	0.09
638	0.08
639	0.08
640	0.07
641	0.08
642	0.11
643	0.11
644	0.1
645	0.09
646	0.08
647	0.08
648	0.07
649	0.06
650	0.05
651	0.05
652	0.07
653	0.08
654	0.08
655	0.09
656	0.1
657	0.1
658	0.1
659	0.11
660	0.11
661	0.1
662	0.11
663	0.15
664	0.16
665	0.18
666	0.2
667	0.23
668	0.26
669	0.29
670	0.29
671	0.27
672	0.32
673	0.31
674	0.31
675	0.3
676	0.29
677	0.31
678	0.29
679	0.29
680	0.26
681	0.3
682	0.29
683	0.29
684	0.25
685	0.21
686	0.21
687	0.21
688	0.19
689	0.17
690	0.15
691	0.18
692	0.18
693	0.17
694	0.18
695	0.19
696	0.2
697	0.18
698	0.22
699	0.2
700	0.28
701	0.29
702	0.29
703	0.34
704	0.34
705	0.36
706	0.34
707	0.33
708	0.29
709	0.33
710	0.35
711	0.3
712	0.28
713	0.26
714	0.26
715	0.25
716	0.22
717	0.19
718	0.15
719	0.14
720	0.13
721	0.14
722	0.13
723	0.16
724	0.15
725	0.17
726	0.2
727	0.22
728	0.24
729	0.22
730	0.21
731	0.19
732	0.2
733	0.19
734	0.16
735	0.17
736	0.16
737	0.18
738	0.19
739	0.18
740	0.19
741	0.21
742	0.23
743	0.25
744	0.33
745	0.36
746	0.37
747	0.44
748	0.51
749	0.51
750	0.58
751	0.63
752	0.64
753	0.65
754	0.7
755	0.74
756	0.69
757	0.74
758	0.75
759	0.71
760	0.68
761	0.66
762	0.66
763	0.63
764	0.64
765	0.6
766	0.53
767	0.49
768	0.45
769	0.41
770	0.34
771	0.3
772	0.28
773	0.24
774	0.28
775	0.26
776	0.23
777	0.23
778	0.24
779	0.26
780	0.23
781	0.23
782	0.18
783	0.22
784	0.23
785	0.27
786	0.26
787	0.23
788	0.23
789	0.25
790	0.24
791	0.21
792	0.2
793	0.18
794	0.18
795	0.17
796	0.2
797	0.16
798	0.2
799	0.2
800	0.22
801	0.2
802	0.2
803	0.22
804	0.22
805	0.25
806	0.28
807	0.28
808	0.33
809	0.36
810	0.44
811	0.47
812	0.53
813	0.6
814	0.63
815	0.7
816	0.71
817	0.77
818	0.76
819	0.81
820	0.81
821	0.81
822	0.8
823	0.76
824	0.78
825	0.71
826	0.7
827	0.69
828	0.64
829	0.62
830	0.58
831	0.55
832	0.5
833	0.49
834	0.42
835	0.36
836	0.38
837	0.32
838	0.33
839	0.35
840	0.38
841	0.45
842	0.5
843	0.49
844	0.46
845	0.47
846	0.48
847	0.47
848	0.41
849	0.33
850	0.31
851	0.31
852	0.29
853	0.28
854	0.21
855	0.18
856	0.16
857	0.15
858	0.12
859	0.12
860	0.16
861	0.17
862	0.16
863	0.15
864	0.2
865	0.2
866	0.22
867	0.24
868	0.19
869	0.18
870	0.19
871	0.19
872	0.19
873	0.21
874	0.22
875	0.22
876	0.31
877	0.35
878	0.37
879	0.4
880	0.39
881	0.4
882	0.46
883	0.47
884	0.43
885	0.41
886	0.4
887	0.37
888	0.33
889	0.3
890	0.22
891	0.15
892	0.11
893	0.08
894	0.07
895	0.07
896	0.06
897	0.06
898	0.07
899	0.08
900	0.07
901	0.07
902	0.09
903	0.09
904	0.09
905	0.09
906	0.08
907	0.09
908	0.1
909	0.13
910	0.12
911	0.13
912	0.13
913	0.14
914	0.16
915	0.16
916	0.2
917	0.17
918	0.18
919	0.2
920	0.22
921	0.21
922	0.19
923	0.18
924	0.15
925	0.17
926	0.19
927	0.2
928	0.19
929	0.21
930	0.25
931	0.25
932	0.28
933	0.33
934	0.37
935	0.4
936	0.48
937	0.52
938	0.53
939	0.54
940	0.53
941	0.47
942	0.4
943	0.36
944	0.28
945	0.21
946	0.16
947	0.15
948	0.15

A0A0D1Y2H8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer