Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1VVJ0

Protein Details
Accession A0A0D1VVJ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
538-560EAFAEVGSRRKRRKLSHESLEGVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
546-551RRKRRK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR039601  Rrn5  
Gene Ontology GO:0000500  C:RNA polymerase I upstream activating factor complex  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
Amino Acid Sequences MDGHENIDLADKQGQASLTARNDALPHDVRRKSSTPMLAHERKWSRLREQYSDQYLDLFKNTFEVEDQEYSVDDFDSFQLGAVIWGPAEKLRFFDAISRRGQHDLRAISKAVESKSEIEVKAYIDYLREQQTDRQLFEAQTKNVSHAEIPAAFEIGRDCEVVLDQAAEALAAFQEQFDFAVGQRMNPLWLIDAAKASELDQSTDEQGVASNTAEKATETEITSSVEACQFFRLSTFLTLSERFFMNQSASKANTRHQHVEDDQVPAMTMEVVLDYYNLVTSFTRRLVQTCIFLAKSRLRSLGSNHYKHGGLVKHEDVSAALAVLGVKSSSADYWVKLARRNGLSVVDGGHTKGSSTKAAMPYDEVEERLSNPRRGRSRSMESQVSSADSLAAEDSEDDDEDSYSDDEAHEEVEEQSSEGSRSDEEDSTGSDTDSRDRYELDPPTEKRSSIPLSRQQKIELLDQEQDDYMERLDREAGRQEEARLLQFLGLPVEKESKEEELELGHRPKVLRRSVEECMGWSGVYQAEWELEGGIVPAEAFAEVGSRRKRRKLSHESLEGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.18
3 0.19
4 0.24
5 0.22
6 0.25
7 0.24
8 0.23
9 0.24
10 0.23
11 0.29
12 0.28
13 0.32
14 0.39
15 0.43
16 0.45
17 0.51
18 0.52
19 0.51
20 0.53
21 0.55
22 0.5
23 0.54
24 0.6
25 0.6
26 0.6
27 0.64
28 0.61
29 0.6
30 0.63
31 0.61
32 0.6
33 0.63
34 0.67
35 0.65
36 0.67
37 0.69
38 0.69
39 0.66
40 0.57
41 0.5
42 0.45
43 0.39
44 0.33
45 0.25
46 0.17
47 0.17
48 0.17
49 0.14
50 0.13
51 0.15
52 0.17
53 0.18
54 0.19
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.16
59 0.13
60 0.09
61 0.08
62 0.08
63 0.09
64 0.09
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.07
71 0.05
72 0.06
73 0.06
74 0.08
75 0.1
76 0.1
77 0.11
78 0.14
79 0.15
80 0.15
81 0.23
82 0.28
83 0.31
84 0.36
85 0.38
86 0.37
87 0.42
88 0.42
89 0.38
90 0.39
91 0.39
92 0.38
93 0.38
94 0.36
95 0.32
96 0.34
97 0.34
98 0.27
99 0.24
100 0.23
101 0.22
102 0.26
103 0.29
104 0.27
105 0.24
106 0.24
107 0.23
108 0.22
109 0.2
110 0.16
111 0.12
112 0.14
113 0.17
114 0.2
115 0.21
116 0.21
117 0.25
118 0.35
119 0.37
120 0.36
121 0.34
122 0.32
123 0.31
124 0.37
125 0.39
126 0.3
127 0.32
128 0.31
129 0.31
130 0.3
131 0.29
132 0.22
133 0.18
134 0.2
135 0.15
136 0.16
137 0.14
138 0.13
139 0.12
140 0.12
141 0.11
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.14
171 0.14
172 0.14
173 0.14
174 0.14
175 0.08
176 0.1
177 0.11
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.11
189 0.12
190 0.12
191 0.12
192 0.08
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.09
204 0.11
205 0.1
206 0.11
207 0.11
208 0.12
209 0.12
210 0.11
211 0.1
212 0.11
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.09
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.12
225 0.13
226 0.13
227 0.14
228 0.13
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.11
233 0.14
234 0.15
235 0.16
236 0.18
237 0.2
238 0.21
239 0.25
240 0.29
241 0.31
242 0.34
243 0.33
244 0.36
245 0.34
246 0.38
247 0.35
248 0.31
249 0.27
250 0.21
251 0.2
252 0.15
253 0.14
254 0.08
255 0.05
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.07
269 0.09
270 0.11
271 0.11
272 0.12
273 0.16
274 0.17
275 0.18
276 0.17
277 0.18
278 0.16
279 0.16
280 0.19
281 0.2
282 0.21
283 0.21
284 0.22
285 0.21
286 0.23
287 0.26
288 0.33
289 0.37
290 0.36
291 0.35
292 0.36
293 0.34
294 0.33
295 0.34
296 0.25
297 0.19
298 0.22
299 0.22
300 0.21
301 0.21
302 0.2
303 0.15
304 0.14
305 0.11
306 0.06
307 0.05
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.04
316 0.03
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.11
321 0.15
322 0.17
323 0.21
324 0.23
325 0.26
326 0.27
327 0.28
328 0.26
329 0.24
330 0.23
331 0.19
332 0.18
333 0.13
334 0.12
335 0.11
336 0.1
337 0.08
338 0.08
339 0.1
340 0.1
341 0.11
342 0.12
343 0.17
344 0.21
345 0.22
346 0.22
347 0.21
348 0.2
349 0.23
350 0.21
351 0.17
352 0.14
353 0.14
354 0.15
355 0.22
356 0.26
357 0.28
358 0.31
359 0.38
360 0.44
361 0.49
362 0.54
363 0.53
364 0.57
365 0.6
366 0.63
367 0.6
368 0.54
369 0.5
370 0.44
371 0.37
372 0.29
373 0.2
374 0.15
375 0.09
376 0.08
377 0.07
378 0.06
379 0.05
380 0.04
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.08
389 0.07
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.07
394 0.07
395 0.07
396 0.06
397 0.07
398 0.07
399 0.08
400 0.08
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.07
408 0.1
409 0.13
410 0.13
411 0.14
412 0.14
413 0.15
414 0.16
415 0.17
416 0.14
417 0.13
418 0.13
419 0.16
420 0.18
421 0.18
422 0.17
423 0.18
424 0.21
425 0.26
426 0.31
427 0.32
428 0.38
429 0.39
430 0.46
431 0.45
432 0.44
433 0.38
434 0.4
435 0.4
436 0.39
437 0.45
438 0.47
439 0.54
440 0.58
441 0.59
442 0.54
443 0.52
444 0.48
445 0.46
446 0.41
447 0.36
448 0.35
449 0.33
450 0.32
451 0.28
452 0.25
453 0.2
454 0.16
455 0.13
456 0.13
457 0.13
458 0.12
459 0.17
460 0.17
461 0.19
462 0.26
463 0.28
464 0.28
465 0.29
466 0.3
467 0.31
468 0.32
469 0.31
470 0.24
471 0.23
472 0.2
473 0.2
474 0.19
475 0.17
476 0.15
477 0.14
478 0.15
479 0.2
480 0.19
481 0.2
482 0.22
483 0.21
484 0.22
485 0.22
486 0.2
487 0.18
488 0.21
489 0.26
490 0.27
491 0.25
492 0.27
493 0.27
494 0.33
495 0.39
496 0.44
497 0.44
498 0.47
499 0.52
500 0.54
501 0.59
502 0.53
503 0.47
504 0.43
505 0.36
506 0.29
507 0.23
508 0.2
509 0.14
510 0.13
511 0.12
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.1
516 0.08
517 0.07
518 0.07
519 0.07
520 0.06
521 0.05
522 0.05
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.04
527 0.04
528 0.07
529 0.09
530 0.17
531 0.26
532 0.35
533 0.43
534 0.52
535 0.62
536 0.69
537 0.79
538 0.82
539 0.84
540 0.85