Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1YHE1

Protein Details
Accession A0A0D1YHE1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-109QSGNKISKGRNKGKTVRKWFPNHydrophilic
307-336STSIKEKGATRPQSKQQKSRTLRRKDSTAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
300-331IKKARARSTSIKEKGATRPQSKQQKSRTLRRK
Subcellular Location(s) mito 17.5, cyto_mito 12, cyto 5.5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034704  L28p-like  
IPR026569  Ribo_L28/L24  
IPR037147  Ribo_L28/L24_sf  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00830  Ribosomal_L28  
Amino Acid Sequences MSTTAITRLPIVRRSPATLQYIDYRHKDHNADKPYFKPRFTFKSEDRKETFARSNFRNTDPLMPPYPYGKNHAFQEANFGLYGGTVLQSGNKISKGRNKGKTVRKWFPNVRVETLKSETLEVDFKLPVTARVLRTIRKCGGLDSYVMGTKPARIKELGLLGWKLRWLVMTSPKTLAKHEQERQELGLPESNSLRAAFEDSWNDEEKRAQFVAQQESAWEDLREAASRFENHALKNWVENGEKEPYNIPKLETLQRTSPSLLGLPEYLERVQLGAGGETALHASEKTEVARRGFRVGDEAIKKARARSTSIKEKGATRPQSKQQKSRTLRRKDSTAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.49
3 0.5
4 0.51
5 0.46
6 0.45
7 0.45
8 0.47
9 0.47
10 0.46
11 0.43
12 0.42
13 0.46
14 0.49
15 0.49
16 0.53
17 0.56
18 0.59
19 0.59
20 0.62
21 0.66
22 0.65
23 0.6
24 0.56
25 0.56
26 0.57
27 0.6
28 0.61
29 0.59
30 0.65
31 0.7
32 0.73
33 0.69
34 0.66
35 0.62
36 0.6
37 0.6
38 0.56
39 0.56
40 0.51
41 0.57
42 0.56
43 0.56
44 0.53
45 0.47
46 0.48
47 0.45
48 0.46
49 0.4
50 0.37
51 0.35
52 0.35
53 0.38
54 0.32
55 0.34
56 0.34
57 0.35
58 0.36
59 0.42
60 0.38
61 0.33
62 0.4
63 0.34
64 0.3
65 0.25
66 0.23
67 0.15
68 0.14
69 0.14
70 0.05
71 0.05
72 0.04
73 0.04
74 0.05
75 0.06
76 0.08
77 0.1
78 0.13
79 0.14
80 0.18
81 0.27
82 0.36
83 0.45
84 0.53
85 0.59
86 0.65
87 0.74
88 0.8
89 0.81
90 0.81
91 0.77
92 0.78
93 0.77
94 0.77
95 0.76
96 0.69
97 0.64
98 0.6
99 0.56
100 0.51
101 0.47
102 0.39
103 0.3
104 0.28
105 0.22
106 0.19
107 0.18
108 0.14
109 0.13
110 0.11
111 0.1
112 0.11
113 0.11
114 0.1
115 0.12
116 0.16
117 0.16
118 0.23
119 0.25
120 0.29
121 0.32
122 0.37
123 0.36
124 0.35
125 0.34
126 0.28
127 0.3
128 0.25
129 0.22
130 0.17
131 0.17
132 0.13
133 0.13
134 0.12
135 0.09
136 0.12
137 0.15
138 0.15
139 0.15
140 0.15
141 0.16
142 0.18
143 0.21
144 0.18
145 0.16
146 0.16
147 0.14
148 0.14
149 0.14
150 0.11
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.1
155 0.18
156 0.2
157 0.22
158 0.24
159 0.26
160 0.27
161 0.27
162 0.3
163 0.27
164 0.33
165 0.37
166 0.41
167 0.41
168 0.41
169 0.41
170 0.39
171 0.33
172 0.26
173 0.25
174 0.18
175 0.17
176 0.17
177 0.16
178 0.13
179 0.12
180 0.11
181 0.07
182 0.1
183 0.09
184 0.11
185 0.12
186 0.13
187 0.15
188 0.18
189 0.18
190 0.16
191 0.18
192 0.17
193 0.19
194 0.18
195 0.16
196 0.16
197 0.2
198 0.25
199 0.23
200 0.22
201 0.18
202 0.19
203 0.2
204 0.18
205 0.14
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.13
213 0.14
214 0.16
215 0.21
216 0.23
217 0.22
218 0.28
219 0.29
220 0.27
221 0.28
222 0.28
223 0.26
224 0.25
225 0.25
226 0.23
227 0.25
228 0.25
229 0.24
230 0.26
231 0.25
232 0.28
233 0.28
234 0.25
235 0.23
236 0.27
237 0.34
238 0.34
239 0.34
240 0.36
241 0.37
242 0.38
243 0.35
244 0.32
245 0.26
246 0.23
247 0.19
248 0.15
249 0.14
250 0.13
251 0.12
252 0.14
253 0.13
254 0.12
255 0.11
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.08
271 0.09
272 0.12
273 0.18
274 0.22
275 0.26
276 0.32
277 0.33
278 0.35
279 0.35
280 0.33
281 0.31
282 0.3
283 0.34
284 0.32
285 0.34
286 0.33
287 0.37
288 0.38
289 0.38
290 0.41
291 0.36
292 0.4
293 0.46
294 0.52
295 0.58
296 0.62
297 0.63
298 0.61
299 0.63
300 0.66
301 0.66
302 0.67
303 0.62
304 0.65
305 0.69
306 0.78
307 0.81
308 0.81
309 0.81
310 0.82
311 0.84
312 0.87
313 0.87
314 0.87
315 0.89
316 0.86