Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1YSK3

Protein Details
Accession A0A0D1YSK3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-45PTHTNNATSNKEKRRPKSRGSTTSLQSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-34RRP
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003150  DNA-bd_RFX  
IPR039779  RFX-like  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF02257  RFX_DNA_binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51526  RFX_DBD  
Amino Acid Sequences MPQSPTHNMEEEAQEPQGPTHTNNATSNKEKRRPKSRGSTTSLQSVGVGSAFQPAPHEDDPTMPIDNGFFVHPQAAAIYGHNPEEMLMHYQHNMAAHLRHQSIEHPASIPQHEMRPISQQGFQEMQPFPMQYPHHMPYGVPPQHMQHMRHQSEQFEGSPAPEDSNTENGGAKRRKANASSVANDQELRRLLAQYQGKSLKEVAAEVQKNEGSGGKSEKAKQVFAMLWLQENCQRSSHSVRRDRVFTRYTERCGNERVPTLNPASFGKLVRIIFPNVQTRRLGVRGESKYHYVDLSLIMDDDDRQYGAGPERPATANGHHHERHGSVVEANKVFKTHITPTIERPMSRATMETADFPAPSAAFLSKEIGANDDDVLESDKAHAQKLDCKYINTPTIRLPIKTMPSNVVAALPSIRPNLPASMATYLGMPTMNSLSQVPTSQDPIEFPDIHSYLEGTTYDVSIAKALFHLYRSYCIDVIDAFRKCKEKPFFNHHSAFNGKMTVPVSKLFSMECLAPWIQECDMRMYKQIVRFIAPLVLQNVPDLVWSVFERIGSRLVSHLITAFEEKCPVHVVVAKTVPAARFVNVLKKLKGANAATLQLSRMLDDPQQRTQMWLDLMAMVDPDRLLEDSMPPPESLEKLQGVLRHDLRPLVSPLDGELTRAAEDDPTSAYANFVNDISDSAYGVLLPDTSGELSPLLERWISWLERLPQLFQGHHPQCMVDWHSRLWSSVMMQMGQNGAHSYQSWWFVESFATQMLSWMTQMEGLLLDEEIQKLADEREQEKCKEIEPLSSTSSRGIKRKRSEDDIPDMSRLPKKLEQVPGSMPGLPRMPTGEETTQDIDDDATDADLDELRRGGPLDLPSFHTGLSSPIKRQQANTLDDSGIDLGLDVDIEAEKEARKFNKRDWLLSSDPVDPPIGLGVMV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.22
3 0.21
4 0.22
5 0.2
6 0.2
7 0.25
8 0.28
9 0.31
10 0.37
11 0.43
12 0.46
13 0.52
14 0.6
15 0.62
16 0.68
17 0.73
18 0.77
19 0.82
20 0.83
21 0.86
22 0.87
23 0.87
24 0.88
25 0.86
26 0.85
27 0.78
28 0.76
29 0.67
30 0.56
31 0.45
32 0.36
33 0.28
34 0.19
35 0.16
36 0.08
37 0.13
38 0.13
39 0.12
40 0.14
41 0.15
42 0.22
43 0.22
44 0.26
45 0.2
46 0.23
47 0.25
48 0.26
49 0.26
50 0.19
51 0.19
52 0.16
53 0.16
54 0.15
55 0.14
56 0.11
57 0.11
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.1
62 0.11
63 0.1
64 0.11
65 0.13
66 0.14
67 0.15
68 0.14
69 0.14
70 0.12
71 0.13
72 0.13
73 0.14
74 0.14
75 0.15
76 0.16
77 0.17
78 0.19
79 0.18
80 0.18
81 0.17
82 0.17
83 0.19
84 0.24
85 0.24
86 0.24
87 0.24
88 0.25
89 0.31
90 0.31
91 0.3
92 0.25
93 0.26
94 0.3
95 0.3
96 0.31
97 0.25
98 0.27
99 0.29
100 0.3
101 0.29
102 0.32
103 0.35
104 0.34
105 0.36
106 0.33
107 0.34
108 0.35
109 0.34
110 0.34
111 0.29
112 0.29
113 0.27
114 0.26
115 0.22
116 0.26
117 0.27
118 0.25
119 0.32
120 0.32
121 0.32
122 0.31
123 0.31
124 0.31
125 0.41
126 0.39
127 0.33
128 0.32
129 0.32
130 0.41
131 0.47
132 0.43
133 0.42
134 0.5
135 0.52
136 0.57
137 0.57
138 0.5
139 0.48
140 0.48
141 0.39
142 0.31
143 0.27
144 0.21
145 0.22
146 0.21
147 0.18
148 0.15
149 0.17
150 0.16
151 0.2
152 0.2
153 0.17
154 0.2
155 0.2
156 0.3
157 0.32
158 0.34
159 0.38
160 0.43
161 0.48
162 0.48
163 0.54
164 0.54
165 0.56
166 0.55
167 0.53
168 0.49
169 0.44
170 0.42
171 0.36
172 0.31
173 0.25
174 0.24
175 0.2
176 0.18
177 0.18
178 0.24
179 0.3
180 0.26
181 0.33
182 0.36
183 0.35
184 0.36
185 0.36
186 0.31
187 0.25
188 0.24
189 0.21
190 0.25
191 0.26
192 0.25
193 0.27
194 0.25
195 0.24
196 0.24
197 0.23
198 0.15
199 0.16
200 0.2
201 0.21
202 0.25
203 0.29
204 0.34
205 0.34
206 0.34
207 0.31
208 0.31
209 0.28
210 0.26
211 0.27
212 0.21
213 0.23
214 0.23
215 0.24
216 0.24
217 0.26
218 0.24
219 0.21
220 0.22
221 0.23
222 0.31
223 0.37
224 0.43
225 0.5
226 0.55
227 0.58
228 0.63
229 0.61
230 0.59
231 0.54
232 0.48
233 0.48
234 0.47
235 0.46
236 0.48
237 0.48
238 0.44
239 0.46
240 0.46
241 0.41
242 0.39
243 0.38
244 0.32
245 0.33
246 0.33
247 0.29
248 0.27
249 0.24
250 0.24
251 0.23
252 0.21
253 0.2
254 0.21
255 0.21
256 0.22
257 0.24
258 0.23
259 0.23
260 0.27
261 0.34
262 0.31
263 0.34
264 0.31
265 0.31
266 0.32
267 0.32
268 0.28
269 0.22
270 0.3
271 0.31
272 0.35
273 0.36
274 0.34
275 0.33
276 0.33
277 0.3
278 0.2
279 0.17
280 0.14
281 0.13
282 0.1
283 0.09
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.08
293 0.1
294 0.14
295 0.14
296 0.14
297 0.17
298 0.17
299 0.19
300 0.19
301 0.2
302 0.24
303 0.26
304 0.32
305 0.31
306 0.31
307 0.32
308 0.3
309 0.29
310 0.22
311 0.2
312 0.15
313 0.18
314 0.21
315 0.2
316 0.21
317 0.18
318 0.18
319 0.17
320 0.16
321 0.17
322 0.16
323 0.22
324 0.27
325 0.28
326 0.32
327 0.41
328 0.42
329 0.38
330 0.36
331 0.32
332 0.28
333 0.26
334 0.23
335 0.15
336 0.16
337 0.17
338 0.16
339 0.15
340 0.14
341 0.13
342 0.13
343 0.12
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.09
351 0.09
352 0.11
353 0.11
354 0.11
355 0.11
356 0.11
357 0.1
358 0.09
359 0.07
360 0.06
361 0.09
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.1
366 0.11
367 0.11
368 0.13
369 0.11
370 0.19
371 0.23
372 0.3
373 0.28
374 0.29
375 0.31
376 0.34
377 0.4
378 0.34
379 0.32
380 0.26
381 0.32
382 0.32
383 0.3
384 0.28
385 0.26
386 0.29
387 0.29
388 0.28
389 0.23
390 0.23
391 0.23
392 0.2
393 0.17
394 0.12
395 0.1
396 0.1
397 0.08
398 0.08
399 0.09
400 0.09
401 0.09
402 0.1
403 0.11
404 0.11
405 0.11
406 0.11
407 0.11
408 0.11
409 0.1
410 0.1
411 0.09
412 0.08
413 0.07
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.06
419 0.06
420 0.07
421 0.07
422 0.08
423 0.09
424 0.09
425 0.11
426 0.11
427 0.11
428 0.1
429 0.13
430 0.16
431 0.14
432 0.14
433 0.16
434 0.16
435 0.16
436 0.16
437 0.13
438 0.09
439 0.1
440 0.1
441 0.06
442 0.05
443 0.05
444 0.06
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.05
450 0.05
451 0.06
452 0.06
453 0.07
454 0.09
455 0.09
456 0.11
457 0.13
458 0.14
459 0.14
460 0.13
461 0.13
462 0.11
463 0.13
464 0.16
465 0.16
466 0.15
467 0.18
468 0.2
469 0.2
470 0.29
471 0.32
472 0.34
473 0.4
474 0.48
475 0.54
476 0.58
477 0.61
478 0.53
479 0.51
480 0.45
481 0.4
482 0.32
483 0.25
484 0.19
485 0.17
486 0.17
487 0.14
488 0.13
489 0.13
490 0.14
491 0.13
492 0.14
493 0.11
494 0.11
495 0.11
496 0.1
497 0.09
498 0.09
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.1
503 0.09
504 0.1
505 0.11
506 0.14
507 0.16
508 0.16
509 0.18
510 0.19
511 0.22
512 0.25
513 0.28
514 0.23
515 0.23
516 0.23
517 0.22
518 0.21
519 0.18
520 0.16
521 0.14
522 0.14
523 0.12
524 0.11
525 0.11
526 0.08
527 0.08
528 0.08
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.08
533 0.08
534 0.09
535 0.1
536 0.1
537 0.12
538 0.11
539 0.11
540 0.1
541 0.11
542 0.11
543 0.1
544 0.1
545 0.09
546 0.09
547 0.11
548 0.11
549 0.1
550 0.12
551 0.11
552 0.11
553 0.13
554 0.12
555 0.11
556 0.15
557 0.16
558 0.17
559 0.19
560 0.18
561 0.16
562 0.18
563 0.17
564 0.17
565 0.16
566 0.13
567 0.15
568 0.16
569 0.23
570 0.28
571 0.31
572 0.28
573 0.3
574 0.31
575 0.29
576 0.35
577 0.28
578 0.25
579 0.24
580 0.26
581 0.24
582 0.23
583 0.21
584 0.17
585 0.16
586 0.13
587 0.11
588 0.11
589 0.14
590 0.21
591 0.24
592 0.25
593 0.29
594 0.29
595 0.3
596 0.29
597 0.28
598 0.22
599 0.19
600 0.16
601 0.12
602 0.12
603 0.1
604 0.09
605 0.06
606 0.06
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.05
611 0.05
612 0.06
613 0.09
614 0.11
615 0.13
616 0.14
617 0.14
618 0.14
619 0.15
620 0.16
621 0.14
622 0.16
623 0.14
624 0.14
625 0.16
626 0.18
627 0.2
628 0.25
629 0.26
630 0.25
631 0.25
632 0.25
633 0.24
634 0.24
635 0.23
636 0.19
637 0.16
638 0.14
639 0.14
640 0.17
641 0.16
642 0.14
643 0.13
644 0.12
645 0.12
646 0.12
647 0.12
648 0.08
649 0.08
650 0.08
651 0.09
652 0.09
653 0.1
654 0.1
655 0.1
656 0.1
657 0.11
658 0.11
659 0.1
660 0.08
661 0.07
662 0.08
663 0.09
664 0.08
665 0.08
666 0.07
667 0.07
668 0.06
669 0.07
670 0.06
671 0.04
672 0.04
673 0.04
674 0.05
675 0.06
676 0.06
677 0.06
678 0.06
679 0.07
680 0.07
681 0.07
682 0.08
683 0.07
684 0.07
685 0.1
686 0.14
687 0.14
688 0.15
689 0.2
690 0.22
691 0.27
692 0.29
693 0.27
694 0.28
695 0.31
696 0.31
697 0.29
698 0.36
699 0.33
700 0.34
701 0.33
702 0.27
703 0.25
704 0.29
705 0.3
706 0.24
707 0.24
708 0.24
709 0.27
710 0.27
711 0.27
712 0.23
713 0.21
714 0.16
715 0.18
716 0.18
717 0.16
718 0.15
719 0.16
720 0.15
721 0.14
722 0.13
723 0.1
724 0.09
725 0.09
726 0.1
727 0.11
728 0.13
729 0.17
730 0.17
731 0.17
732 0.17
733 0.17
734 0.17
735 0.16
736 0.14
737 0.11
738 0.11
739 0.1
740 0.1
741 0.11
742 0.1
743 0.1
744 0.09
745 0.08
746 0.08
747 0.08
748 0.07
749 0.07
750 0.07
751 0.07
752 0.06
753 0.07
754 0.07
755 0.08
756 0.08
757 0.07
758 0.07
759 0.08
760 0.09
761 0.11
762 0.14
763 0.17
764 0.26
765 0.31
766 0.33
767 0.36
768 0.36
769 0.35
770 0.39
771 0.37
772 0.34
773 0.33
774 0.35
775 0.35
776 0.36
777 0.36
778 0.32
779 0.38
780 0.36
781 0.41
782 0.46
783 0.52
784 0.6
785 0.69
786 0.72
787 0.73
788 0.76
789 0.75
790 0.75
791 0.73
792 0.65
793 0.58
794 0.52
795 0.49
796 0.46
797 0.4
798 0.37
799 0.34
800 0.38
801 0.44
802 0.51
803 0.5
804 0.5
805 0.51
806 0.5
807 0.47
808 0.44
809 0.36
810 0.3
811 0.29
812 0.25
813 0.23
814 0.21
815 0.22
816 0.21
817 0.27
818 0.27
819 0.26
820 0.29
821 0.31
822 0.29
823 0.26
824 0.23
825 0.17
826 0.14
827 0.14
828 0.09
829 0.07
830 0.06
831 0.06
832 0.07
833 0.09
834 0.09
835 0.1
836 0.1
837 0.1
838 0.11
839 0.12
840 0.12
841 0.15
842 0.19
843 0.22
844 0.23
845 0.29
846 0.3
847 0.3
848 0.28
849 0.25
850 0.2
851 0.21
852 0.28
853 0.27
854 0.29
855 0.36
856 0.44
857 0.46
858 0.48
859 0.53
860 0.52
861 0.54
862 0.53
863 0.5
864 0.42
865 0.4
866 0.39
867 0.3
868 0.21
869 0.15
870 0.1
871 0.07
872 0.07
873 0.06
874 0.04
875 0.04
876 0.05
877 0.05
878 0.06
879 0.07
880 0.1
881 0.12
882 0.19
883 0.26
884 0.35
885 0.4
886 0.47
887 0.56
888 0.59
889 0.63
890 0.62
891 0.62
892 0.58
893 0.59
894 0.55
895 0.49
896 0.45
897 0.41
898 0.35
899 0.28
900 0.23
901 0.19