FuNGI

A0A0D1VTR4

Protein Details

Accession

A0A0D1VTR4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
424-448	LRAVPKKKTSHSKKRHRQLAGKALK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
428-445	PKKKTSHSKKRHRQLAGK

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 12.833, cyto 12.5, nucl 11, cyto_mito 7.166

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002677 Ribosomal_L32p IPR011332 Ribosomal_zn-bd IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0015934 C:large ribosomal subunit GO:0003735 F:structural constituent of ribosome GO:0006412 P:translation
Pfam	View protein in Pfam PF01783 Ribosomal_L32p PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MSTLPDQEDGSMGSDILDIVSDGDTIMRVSFGEDHRLLRVSSQALKTTSSYFAALLSSRWRSSSQKAFTVSEPLVVQEHYDTAYFLLMIISHQLNFRRGNTIAAIKLEHLRGLATLVDKYMFTGPIPASIKDSLAQYFSTSPQADYTDIAASPEILFISYFLNLPDLFAKASHQMMWFFSKANMHKHASSALVPLLPIDIFEEFEKEGKRLRSYLLGELPPVFYPDPHGGDSADDEVDKWWCQKCAAFPHKERWLMEVVRQNGLWKWEEANGVTFSLREIFSSYITDMQQLDYCGHRDSDSSASACGKFKSGENLTLSSTIELLIGAEIQLDKLAKHKLEKYRGLKDSFVLHSLRFPSLNISHLSTMALPTTTATSVLSSLFLRRTATTLSSLSSRTLVSASIAIPAISISIPGLVSDIWEGILRAVPKKKTSHSKKRHRQLAGKALKDVKAINECPGCGRAKKMHTLCPYCVAAHASDVFALAVTSTQILSGSGEPSIKVHSTTEEDFPIAQVWQEAHKLGCHHIVTDGSGTKAVSVGFDGKVKAWKHEEGKWSEDGEIIDNDAPKKAGQVWAVSMSDDGQYLAGTTHDGRVKVWDLNNGKQKIREFETKGSFGMCVDMSSDGRFLASGHESGNIYVFSTATSRLLHSLPGLSKPVRSVKFSPASTLLAAGGDARIISLYDPSSGEQVANLSGHAAWITSLDWSNTGQYLLSGSLDGKVKVWDIERRTCVATHSESDKGLWCVKWLPKGSSQTHKAERFATSGSSKAIAIYREATGG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.1
3	0.09
4	0.08
5	0.05
6	0.06
7	0.06
8	0.06
9	0.05
10	0.06
11	0.06
12	0.07
13	0.07
14	0.06
15	0.06
16	0.08
17	0.14
18	0.15
19	0.23
20	0.24
21	0.26
22	0.29
23	0.31
24	0.29
25	0.25
26	0.28
27	0.24
28	0.3
29	0.32
30	0.34
31	0.34
32	0.36
33	0.36
34	0.35
35	0.33
36	0.27
37	0.24
38	0.2
39	0.19
40	0.18
41	0.17
42	0.16
43	0.19
44	0.22
45	0.22
46	0.24
47	0.27
48	0.31
49	0.39
50	0.47
51	0.46
52	0.48
53	0.52
54	0.53
55	0.5
56	0.52
57	0.44
58	0.37
59	0.31
60	0.26
61	0.23
62	0.2
63	0.19
64	0.13
65	0.14
66	0.11
67	0.11
68	0.1
69	0.09
70	0.1
71	0.08
72	0.08
73	0.07
74	0.06
75	0.06
76	0.09
77	0.1
78	0.1
79	0.14
80	0.17
81	0.22
82	0.25
83	0.26
84	0.28
85	0.28
86	0.3
87	0.3
88	0.32
89	0.29
90	0.28
91	0.27
92	0.24
93	0.27
94	0.25
95	0.22
96	0.17
97	0.15
98	0.13
99	0.14
100	0.14
101	0.11
102	0.11
103	0.11
104	0.12
105	0.11
106	0.13
107	0.14
108	0.12
109	0.11
110	0.15
111	0.15
112	0.21
113	0.24
114	0.23
115	0.25
116	0.25
117	0.26
118	0.22
119	0.24
120	0.18
121	0.17
122	0.17
123	0.15
124	0.16
125	0.17
126	0.21
127	0.19
128	0.19
129	0.19
130	0.21
131	0.2
132	0.19
133	0.19
134	0.15
135	0.14
136	0.14
137	0.12
138	0.11
139	0.1
140	0.1
141	0.08
142	0.06
143	0.06
144	0.06
145	0.07
146	0.07
147	0.07
148	0.07
149	0.09
150	0.09
151	0.1
152	0.1
153	0.1
154	0.1
155	0.1
156	0.11
157	0.12
158	0.14
159	0.15
160	0.15
161	0.16
162	0.17
163	0.21
164	0.2
165	0.18
166	0.19
167	0.24
168	0.26
169	0.32
170	0.36
171	0.35
172	0.35
173	0.36
174	0.36
175	0.31
176	0.28
177	0.24
178	0.19
179	0.15
180	0.14
181	0.13
182	0.12
183	0.09
184	0.08
185	0.07
186	0.06
187	0.07
188	0.08
189	0.09
190	0.09
191	0.12
192	0.13
193	0.13
194	0.18
195	0.21
196	0.23
197	0.23
198	0.24
199	0.28
200	0.3
201	0.35
202	0.35
203	0.32
204	0.3
205	0.3
206	0.29
207	0.22
208	0.22
209	0.17
210	0.11
211	0.14
212	0.17
213	0.19
214	0.19
215	0.19
216	0.17
217	0.17
218	0.19
219	0.16
220	0.12
221	0.09
222	0.09
223	0.09
224	0.11
225	0.11
226	0.13
227	0.13
228	0.14
229	0.15
230	0.17
231	0.22
232	0.31
233	0.39
234	0.44
235	0.46
236	0.54
237	0.6
238	0.62
239	0.57
240	0.49
241	0.46
242	0.39
243	0.41
244	0.39
245	0.34
246	0.31
247	0.31
248	0.29
249	0.25
250	0.26
251	0.22
252	0.16
253	0.15
254	0.16
255	0.18
256	0.17
257	0.18
258	0.16
259	0.15
260	0.14
261	0.13
262	0.1
263	0.11
264	0.1
265	0.08
266	0.09
267	0.09
268	0.1
269	0.11
270	0.11
271	0.12
272	0.12
273	0.14
274	0.12
275	0.12
276	0.13
277	0.12
278	0.13
279	0.11
280	0.12
281	0.12
282	0.12
283	0.11
284	0.1
285	0.13
286	0.15
287	0.15
288	0.14
289	0.14
290	0.16
291	0.17
292	0.18
293	0.15
294	0.14
295	0.13
296	0.13
297	0.2
298	0.2
299	0.23
300	0.24
301	0.25
302	0.24
303	0.24
304	0.24
305	0.16
306	0.14
307	0.1
308	0.08
309	0.06
310	0.05
311	0.04
312	0.04
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.03
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.07
321	0.11
322	0.12
323	0.15
324	0.22
325	0.29
326	0.37
327	0.46
328	0.5
329	0.55
330	0.59
331	0.58
332	0.52
333	0.46
334	0.42
335	0.35
336	0.31
337	0.23
338	0.18
339	0.18
340	0.19
341	0.18
342	0.14
343	0.13
344	0.14
345	0.14
346	0.16
347	0.15
348	0.15
349	0.14
350	0.14
351	0.15
352	0.11
353	0.1
354	0.08
355	0.07
356	0.05
357	0.05
358	0.06
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.06
364	0.06
365	0.07
366	0.06
367	0.07
368	0.08
369	0.08
370	0.09
371	0.09
372	0.1
373	0.1
374	0.11
375	0.12
376	0.12
377	0.12
378	0.12
379	0.13
380	0.12
381	0.12
382	0.1
383	0.09
384	0.08
385	0.08
386	0.07
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.06
395	0.04
396	0.04
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.03
401	0.04
402	0.03
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.06
411	0.07
412	0.1
413	0.15
414	0.17
415	0.21
416	0.24
417	0.3
418	0.4
419	0.5
420	0.57
421	0.64
422	0.73
423	0.79
424	0.86
425	0.89
426	0.85
427	0.83
428	0.8
429	0.81
430	0.77
431	0.68
432	0.62
433	0.56
434	0.5
435	0.43
436	0.34
437	0.26
438	0.24
439	0.23
440	0.24
441	0.22
442	0.21
443	0.21
444	0.23
445	0.22
446	0.17
447	0.2
448	0.22
449	0.24
450	0.33
451	0.35
452	0.4
453	0.46
454	0.5
455	0.47
456	0.46
457	0.44
458	0.35
459	0.33
460	0.26
461	0.18
462	0.15
463	0.15
464	0.1
465	0.08
466	0.08
467	0.07
468	0.06
469	0.05
470	0.04
471	0.03
472	0.03
473	0.04
474	0.03
475	0.03
476	0.04
477	0.04
478	0.05
479	0.06
480	0.06
481	0.07
482	0.07
483	0.07
484	0.08
485	0.1
486	0.09
487	0.09
488	0.09
489	0.11
490	0.14
491	0.16
492	0.18
493	0.16
494	0.16
495	0.16
496	0.15
497	0.14
498	0.1
499	0.08
500	0.07
501	0.07
502	0.08
503	0.09
504	0.1
505	0.1
506	0.11
507	0.13
508	0.14
509	0.18
510	0.17
511	0.16
512	0.16
513	0.16
514	0.16
515	0.17
516	0.16
517	0.11
518	0.12
519	0.11
520	0.1
521	0.1
522	0.09
523	0.07
524	0.07
525	0.09
526	0.09
527	0.11
528	0.12
529	0.12
530	0.19
531	0.19
532	0.22
533	0.24
534	0.29
535	0.32
536	0.38
537	0.45
538	0.42
539	0.45
540	0.43
541	0.4
542	0.34
543	0.32
544	0.26
545	0.21
546	0.17
547	0.14
548	0.13
549	0.14
550	0.14
551	0.13
552	0.13
553	0.11
554	0.12
555	0.13
556	0.16
557	0.16
558	0.17
559	0.18
560	0.21
561	0.21
562	0.2
563	0.18
564	0.14
565	0.13
566	0.11
567	0.09
568	0.06
569	0.06
570	0.06
571	0.06
572	0.05
573	0.06
574	0.07
575	0.11
576	0.14
577	0.15
578	0.15
579	0.18
580	0.21
581	0.24
582	0.25
583	0.29
584	0.32
585	0.39
586	0.48
587	0.48
588	0.47
589	0.47
590	0.49
591	0.47
592	0.48
593	0.49
594	0.45
595	0.5
596	0.54
597	0.51
598	0.48
599	0.42
600	0.36
601	0.27
602	0.24
603	0.16
604	0.1
605	0.09
606	0.11
607	0.11
608	0.12
609	0.12
610	0.09
611	0.09
612	0.09
613	0.08
614	0.1
615	0.11
616	0.11
617	0.11
618	0.14
619	0.15
620	0.15
621	0.16
622	0.12
623	0.11
624	0.1
625	0.1
626	0.08
627	0.09
628	0.1
629	0.1
630	0.11
631	0.11
632	0.14
633	0.14
634	0.14
635	0.14
636	0.18
637	0.18
638	0.2
639	0.24
640	0.23
641	0.24
642	0.28
643	0.36
644	0.34
645	0.38
646	0.39
647	0.43
648	0.51
649	0.5
650	0.49
651	0.44
652	0.43
653	0.37
654	0.34
655	0.25
656	0.16
657	0.16
658	0.12
659	0.08
660	0.06
661	0.05
662	0.05
663	0.04
664	0.05
665	0.05
666	0.07
667	0.08
668	0.09
669	0.1
670	0.11
671	0.13
672	0.13
673	0.13
674	0.11
675	0.11
676	0.12
677	0.11
678	0.1
679	0.09
680	0.08
681	0.09
682	0.08
683	0.07
684	0.05
685	0.06
686	0.07
687	0.08
688	0.09
689	0.1
690	0.11
691	0.12
692	0.14
693	0.13
694	0.14
695	0.11
696	0.1
697	0.11
698	0.11
699	0.1
700	0.09
701	0.09
702	0.13
703	0.15
704	0.15
705	0.15
706	0.15
707	0.16
708	0.19
709	0.23
710	0.27
711	0.31
712	0.39
713	0.42
714	0.44
715	0.45
716	0.42
717	0.41
718	0.39
719	0.37
720	0.33
721	0.34
722	0.34
723	0.32
724	0.33
725	0.35
726	0.32
727	0.32
728	0.27
729	0.25
730	0.3
731	0.35
732	0.42
733	0.43
734	0.44
735	0.48
736	0.57
737	0.61
738	0.64
739	0.65
740	0.66
741	0.71
742	0.71
743	0.66
744	0.61
745	0.56
746	0.49
747	0.44
748	0.4
749	0.33
750	0.3
751	0.29
752	0.27
753	0.24
754	0.23
755	0.25
756	0.21
757	0.21
758	0.21

A0A0D1VTR4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer