Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1YSX4

Protein Details
Accession A0A0D1YSX4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-78ATTSRVATKGKNKAKPTRRKITYISRHFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-70KGKNKAKPTRRK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 9.5, cyto 6.5, pero 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR045138  MeCP2/MBD4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003824  F:catalytic activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
Amino Acid Sequences MTSSTPKLQHPFSDHGSISPPPSPFSDSEWPVIPTDELGMIADDESTTAKATTSRVATKGKNKAKPTRRKITYISRHFADRDGTTQDKTASRRAVAHDANTMIPSSAERLLPITPPVTPARPHHRVYYGINIDELSSDSDLTDVPDDIGPDPFLQREKPSSAKVQAIKTKTTKARRPTKSPYFPHPHKHRPTFLSTLPFPPLSHEHFGLMQERLAHDPFRLLIATIFLNKTPGERAMPVFYQLMSRYPTPLDLANAEVSDITTIIYGLGFQNQRARKCVAMAKVWIERPPQCGRRYKKLNYPLKGDGKDVGNDEFIKDIDGRVAWEISHLPGLGPYSHDSWRMFCRDKLRGVAESWNGEGTAEKQNFEPEWKRVIPLDKELRAWLTWMWMKEGWVWNKETGHRTKASEEMMEMARDGGVVVEEKDSNYLVVKQIEEERVADLKAEKKVDRTAGDYLPANSGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.42
3 0.43
4 0.38
5 0.35
6 0.34
7 0.29
8 0.25
9 0.27
10 0.3
11 0.27
12 0.33
13 0.38
14 0.36
15 0.38
16 0.39
17 0.37
18 0.34
19 0.34
20 0.26
21 0.18
22 0.16
23 0.14
24 0.11
25 0.1
26 0.09
27 0.08
28 0.08
29 0.08
30 0.06
31 0.06
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.08
37 0.1
38 0.12
39 0.17
40 0.21
41 0.25
42 0.29
43 0.36
44 0.42
45 0.5
46 0.59
47 0.63
48 0.66
49 0.71
50 0.77
51 0.81
52 0.85
53 0.85
54 0.86
55 0.82
56 0.81
57 0.79
58 0.8
59 0.8
60 0.79
61 0.75
62 0.66
63 0.64
64 0.58
65 0.53
66 0.46
67 0.37
68 0.31
69 0.31
70 0.31
71 0.28
72 0.29
73 0.3
74 0.3
75 0.32
76 0.35
77 0.33
78 0.32
79 0.35
80 0.38
81 0.43
82 0.41
83 0.4
84 0.36
85 0.34
86 0.33
87 0.29
88 0.25
89 0.16
90 0.13
91 0.12
92 0.11
93 0.12
94 0.11
95 0.11
96 0.12
97 0.13
98 0.14
99 0.15
100 0.13
101 0.11
102 0.15
103 0.17
104 0.19
105 0.21
106 0.27
107 0.35
108 0.4
109 0.42
110 0.44
111 0.44
112 0.45
113 0.45
114 0.49
115 0.43
116 0.36
117 0.35
118 0.3
119 0.26
120 0.23
121 0.2
122 0.11
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.08
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.12
142 0.14
143 0.17
144 0.2
145 0.23
146 0.26
147 0.3
148 0.32
149 0.37
150 0.39
151 0.42
152 0.44
153 0.44
154 0.46
155 0.43
156 0.48
157 0.5
158 0.54
159 0.55
160 0.58
161 0.66
162 0.67
163 0.73
164 0.75
165 0.78
166 0.79
167 0.76
168 0.76
169 0.75
170 0.73
171 0.75
172 0.74
173 0.74
174 0.73
175 0.75
176 0.71
177 0.66
178 0.66
179 0.6
180 0.54
181 0.49
182 0.41
183 0.38
184 0.34
185 0.3
186 0.24
187 0.23
188 0.23
189 0.22
190 0.23
191 0.21
192 0.19
193 0.19
194 0.2
195 0.19
196 0.16
197 0.12
198 0.11
199 0.11
200 0.12
201 0.12
202 0.12
203 0.09
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.07
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.12
223 0.13
224 0.13
225 0.14
226 0.13
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.13
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.12
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.09
240 0.1
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.07
245 0.07
246 0.06
247 0.05
248 0.04
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.04
254 0.04
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.16
259 0.21
260 0.22
261 0.25
262 0.27
263 0.23
264 0.26
265 0.31
266 0.28
267 0.27
268 0.28
269 0.29
270 0.31
271 0.32
272 0.32
273 0.3
274 0.29
275 0.31
276 0.37
277 0.39
278 0.4
279 0.48
280 0.52
281 0.59
282 0.66
283 0.66
284 0.68
285 0.72
286 0.75
287 0.71
288 0.71
289 0.68
290 0.67
291 0.63
292 0.54
293 0.48
294 0.4
295 0.37
296 0.32
297 0.25
298 0.19
299 0.18
300 0.17
301 0.14
302 0.12
303 0.11
304 0.1
305 0.09
306 0.08
307 0.08
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.08
312 0.09
313 0.1
314 0.09
315 0.1
316 0.09
317 0.08
318 0.09
319 0.1
320 0.09
321 0.1
322 0.12
323 0.14
324 0.15
325 0.19
326 0.19
327 0.21
328 0.26
329 0.31
330 0.32
331 0.33
332 0.39
333 0.42
334 0.45
335 0.48
336 0.46
337 0.42
338 0.41
339 0.43
340 0.38
341 0.34
342 0.31
343 0.25
344 0.21
345 0.19
346 0.17
347 0.14
348 0.2
349 0.19
350 0.19
351 0.19
352 0.23
353 0.24
354 0.3
355 0.32
356 0.26
357 0.32
358 0.32
359 0.34
360 0.34
361 0.41
362 0.39
363 0.43
364 0.48
365 0.44
366 0.45
367 0.45
368 0.43
369 0.36
370 0.33
371 0.24
372 0.22
373 0.23
374 0.23
375 0.25
376 0.23
377 0.24
378 0.29
379 0.36
380 0.35
381 0.35
382 0.37
383 0.37
384 0.4
385 0.45
386 0.47
387 0.45
388 0.46
389 0.47
390 0.47
391 0.46
392 0.47
393 0.45
394 0.38
395 0.32
396 0.3
397 0.27
398 0.25
399 0.22
400 0.17
401 0.13
402 0.12
403 0.11
404 0.07
405 0.06
406 0.07
407 0.07
408 0.09
409 0.1
410 0.11
411 0.12
412 0.12
413 0.12
414 0.13
415 0.15
416 0.16
417 0.18
418 0.19
419 0.2
420 0.26
421 0.28
422 0.28
423 0.26
424 0.26
425 0.25
426 0.25
427 0.24
428 0.22
429 0.25
430 0.3
431 0.34
432 0.33
433 0.36
434 0.42
435 0.46
436 0.45
437 0.44
438 0.44
439 0.4
440 0.42
441 0.41
442 0.36