Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1Z3E6

Protein Details
Accession A0A0D1Z3E6    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
522-562QNTPKRRLGRLGARKNQDKEESPSSNKKTTPKTNRANQDDEHydrophilic
568-590PSPSPTTRKKLASQRTKPSQIAKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
337-353PPKRKPHKIGGLGRRSA
493-494GR
526-536KRRLGRLGARK
631-646KRTIASNAGAKKKRRF
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MPDSANEGWQELQVPSRRQCPKLFYSFATQDESLTLLITDLISIWECELDKYDILSHAARQHASIDPSVSSDQFDILLSKIGKSLKDGDNVLLRQDVRNSSLLMLRTKSDLPKPLRPLEWTFKLTPRDVSELAERILRPSLHEVAVSGEKIKSLLRVIKEKDHVISRLLDRVGSASIDLGLIFPGITGMASRKSGQVSVADAKKHVPGMAGFDEKSWIRQFSNDEGYEGADCTGLSNLVRGNEKCFAHTKSEHEDWIRELSTTDKASPELDRSSARLNEDPSKHSARETSRRQANSDDDSTDADNDFERQPTPPALQLKSPSKNKTIADDDRDETPPPKRKPHKIGGLGRRSATKSFGTSNSKSKSPTPAEKNNGSPPQRRTPDISDATATASEDGDDDDKIISDTRSSQRNRTNEAPTPNRKLGGLRKKPTTNQSPSPSPAPTSRPATRQHPSPTPDENEDEDSDLDLDHDHPPIRSPSAPTPSRHRLGRVGRKATASPSKSDAPSPAKPAQDRTSEAPSQNTPKRRLGRLGARKNQDKEESPSSNKKTTPKTNRANQDDEDDTSSPSPSPTTRKKLASQRTKPSQIAKSEPQSSPPMPDSATAPPAKESEPEKEETAEETANRRRMELKRTIASNAGAKKKRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.35
3 0.44
4 0.51
5 0.53
6 0.59
7 0.6
8 0.61
9 0.64
10 0.64
11 0.58
12 0.59
13 0.59
14 0.56
15 0.53
16 0.45
17 0.36
18 0.32
19 0.3
20 0.21
21 0.16
22 0.13
23 0.07
24 0.08
25 0.07
26 0.06
27 0.05
28 0.06
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.09
33 0.09
34 0.1
35 0.14
36 0.15
37 0.15
38 0.16
39 0.18
40 0.17
41 0.2
42 0.21
43 0.21
44 0.24
45 0.27
46 0.26
47 0.25
48 0.26
49 0.27
50 0.29
51 0.26
52 0.23
53 0.19
54 0.23
55 0.24
56 0.21
57 0.18
58 0.16
59 0.15
60 0.14
61 0.14
62 0.11
63 0.1
64 0.15
65 0.14
66 0.14
67 0.18
68 0.2
69 0.2
70 0.22
71 0.29
72 0.28
73 0.32
74 0.33
75 0.33
76 0.38
77 0.38
78 0.36
79 0.33
80 0.29
81 0.26
82 0.29
83 0.28
84 0.24
85 0.25
86 0.25
87 0.22
88 0.25
89 0.26
90 0.25
91 0.24
92 0.22
93 0.24
94 0.26
95 0.3
96 0.32
97 0.37
98 0.41
99 0.48
100 0.54
101 0.57
102 0.56
103 0.56
104 0.57
105 0.57
106 0.57
107 0.54
108 0.5
109 0.51
110 0.52
111 0.49
112 0.46
113 0.41
114 0.4
115 0.36
116 0.35
117 0.33
118 0.31
119 0.3
120 0.29
121 0.25
122 0.21
123 0.24
124 0.22
125 0.2
126 0.23
127 0.25
128 0.22
129 0.22
130 0.2
131 0.2
132 0.22
133 0.2
134 0.17
135 0.14
136 0.13
137 0.14
138 0.14
139 0.12
140 0.14
141 0.19
142 0.22
143 0.3
144 0.33
145 0.4
146 0.43
147 0.44
148 0.43
149 0.42
150 0.39
151 0.33
152 0.35
153 0.29
154 0.3
155 0.28
156 0.24
157 0.2
158 0.2
159 0.18
160 0.14
161 0.12
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.05
176 0.07
177 0.09
178 0.1
179 0.12
180 0.13
181 0.14
182 0.15
183 0.14
184 0.17
185 0.22
186 0.25
187 0.23
188 0.23
189 0.24
190 0.24
191 0.23
192 0.2
193 0.14
194 0.11
195 0.16
196 0.19
197 0.19
198 0.18
199 0.17
200 0.19
201 0.18
202 0.21
203 0.18
204 0.16
205 0.14
206 0.17
207 0.21
208 0.23
209 0.3
210 0.27
211 0.26
212 0.24
213 0.25
214 0.22
215 0.19
216 0.13
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.06
224 0.07
225 0.09
226 0.13
227 0.13
228 0.16
229 0.21
230 0.22
231 0.23
232 0.26
233 0.26
234 0.29
235 0.31
236 0.31
237 0.33
238 0.34
239 0.35
240 0.32
241 0.31
242 0.27
243 0.27
244 0.23
245 0.17
246 0.15
247 0.14
248 0.16
249 0.17
250 0.16
251 0.13
252 0.13
253 0.15
254 0.15
255 0.16
256 0.14
257 0.14
258 0.14
259 0.15
260 0.19
261 0.19
262 0.21
263 0.2
264 0.22
265 0.27
266 0.28
267 0.29
268 0.3
269 0.32
270 0.3
271 0.28
272 0.3
273 0.3
274 0.37
275 0.42
276 0.46
277 0.49
278 0.5
279 0.51
280 0.49
281 0.47
282 0.42
283 0.37
284 0.29
285 0.23
286 0.23
287 0.21
288 0.18
289 0.14
290 0.09
291 0.08
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.1
298 0.11
299 0.12
300 0.14
301 0.18
302 0.18
303 0.2
304 0.25
305 0.3
306 0.36
307 0.41
308 0.4
309 0.39
310 0.43
311 0.42
312 0.41
313 0.41
314 0.38
315 0.37
316 0.37
317 0.35
318 0.33
319 0.33
320 0.29
321 0.24
322 0.27
323 0.32
324 0.32
325 0.41
326 0.46
327 0.54
328 0.61
329 0.68
330 0.7
331 0.7
332 0.76
333 0.76
334 0.76
335 0.68
336 0.61
337 0.55
338 0.48
339 0.39
340 0.33
341 0.24
342 0.19
343 0.19
344 0.24
345 0.28
346 0.29
347 0.36
348 0.36
349 0.36
350 0.36
351 0.36
352 0.38
353 0.37
354 0.43
355 0.43
356 0.49
357 0.53
358 0.55
359 0.56
360 0.55
361 0.58
362 0.54
363 0.52
364 0.49
365 0.53
366 0.52
367 0.5
368 0.48
369 0.46
370 0.5
371 0.46
372 0.42
373 0.33
374 0.3
375 0.29
376 0.24
377 0.19
378 0.11
379 0.08
380 0.07
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.07
390 0.06
391 0.06
392 0.11
393 0.15
394 0.23
395 0.25
396 0.32
397 0.39
398 0.44
399 0.49
400 0.5
401 0.53
402 0.5
403 0.57
404 0.58
405 0.58
406 0.6
407 0.56
408 0.5
409 0.45
410 0.44
411 0.46
412 0.48
413 0.51
414 0.5
415 0.56
416 0.6
417 0.64
418 0.67
419 0.67
420 0.63
421 0.61
422 0.62
423 0.59
424 0.57
425 0.56
426 0.48
427 0.41
428 0.38
429 0.34
430 0.33
431 0.35
432 0.36
433 0.38
434 0.42
435 0.47
436 0.47
437 0.5
438 0.51
439 0.51
440 0.51
441 0.51
442 0.51
443 0.48
444 0.47
445 0.43
446 0.39
447 0.36
448 0.33
449 0.29
450 0.23
451 0.2
452 0.16
453 0.13
454 0.1
455 0.07
456 0.08
457 0.08
458 0.1
459 0.11
460 0.11
461 0.13
462 0.16
463 0.19
464 0.19
465 0.22
466 0.28
467 0.36
468 0.41
469 0.41
470 0.48
471 0.52
472 0.56
473 0.54
474 0.5
475 0.5
476 0.56
477 0.64
478 0.64
479 0.63
480 0.6
481 0.61
482 0.59
483 0.57
484 0.56
485 0.47
486 0.4
487 0.39
488 0.4
489 0.39
490 0.39
491 0.39
492 0.37
493 0.38
494 0.42
495 0.43
496 0.44
497 0.44
498 0.49
499 0.48
500 0.46
501 0.46
502 0.43
503 0.46
504 0.44
505 0.44
506 0.41
507 0.41
508 0.45
509 0.48
510 0.51
511 0.5
512 0.55
513 0.6
514 0.61
515 0.63
516 0.63
517 0.67
518 0.7
519 0.76
520 0.75
521 0.77
522 0.8
523 0.78
524 0.76
525 0.71
526 0.64
527 0.61
528 0.61
529 0.58
530 0.57
531 0.63
532 0.62
533 0.61
534 0.61
535 0.62
536 0.62
537 0.67
538 0.7
539 0.71
540 0.75
541 0.79
542 0.84
543 0.84
544 0.8
545 0.71
546 0.66
547 0.59
548 0.52
549 0.47
550 0.38
551 0.33
552 0.28
553 0.27
554 0.2
555 0.18
556 0.18
557 0.17
558 0.26
559 0.33
560 0.41
561 0.48
562 0.53
563 0.61
564 0.69
565 0.76
566 0.78
567 0.78
568 0.8
569 0.83
570 0.85
571 0.81
572 0.79
573 0.76
574 0.71
575 0.7
576 0.67
577 0.65
578 0.65
579 0.61
580 0.57
581 0.57
582 0.51
583 0.49
584 0.43
585 0.37
586 0.31
587 0.31
588 0.3
589 0.28
590 0.33
591 0.29
592 0.28
593 0.28
594 0.29
595 0.29
596 0.3
597 0.29
598 0.31
599 0.33
600 0.36
601 0.35
602 0.35
603 0.35
604 0.33
605 0.32
606 0.26
607 0.24
608 0.28
609 0.35
610 0.39
611 0.39
612 0.38
613 0.43
614 0.47
615 0.53
616 0.56
617 0.57
618 0.57
619 0.6
620 0.61
621 0.57
622 0.54
623 0.52
624 0.51
625 0.53
626 0.53