Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1Z5F2

Protein Details
Accession A0A0D1Z5F2    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
91-113AEVDGKKKRKRTPHDPNAPKRALBasic
227-254PEPVKEPSPPKSNKRRKTKDAEPTPVKPBasic
258-282AEPAAKSPEKKVKKGKKEAAAAPAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
96-105KKKRKRTPHD
233-294PSPPKSNKRRKTKDAEPTPVKPTPKAEPAAKSPEKKVKKGKKEAAAAPAPAAKVEKGRKSKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, mito_nucl 13.166, cyto_nucl 12.833, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MAKKSLDPESATTQVNVAEFQRTRDSVIVALATLQSSVQDLSRAYIQHANTVLTPGKHGLNPIDANLTSILTESGLLTGRPAEAAPAAAEAEVDGKKKRKRTPHDPNAPKRALTPYFLYMQSARAQIAKELGDSAKPKEVADEGTRRWTEMSPGEKSTWDDKYQKNLAAYRVKMAAYKAGQPVPSDEEATRLVELGKAPEHVAGVDAEAETEEDPAVAEESEEEESPEPVKEPSPPKSNKRRKTKDAEPTPVKPTPKAEPAAKSPEKKVKKGKKEAAAAPAPAAKVEKGRKSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.25
3 0.21
4 0.16
5 0.2
6 0.19
7 0.23
8 0.28
9 0.27
10 0.29
11 0.29
12 0.3
13 0.23
14 0.24
15 0.2
16 0.14
17 0.14
18 0.12
19 0.1
20 0.09
21 0.08
22 0.06
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.08
27 0.09
28 0.11
29 0.14
30 0.14
31 0.16
32 0.21
33 0.21
34 0.24
35 0.25
36 0.24
37 0.21
38 0.24
39 0.24
40 0.19
41 0.21
42 0.18
43 0.19
44 0.18
45 0.2
46 0.18
47 0.21
48 0.22
49 0.21
50 0.23
51 0.2
52 0.21
53 0.19
54 0.18
55 0.11
56 0.11
57 0.1
58 0.06
59 0.07
60 0.05
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.05
78 0.07
79 0.08
80 0.1
81 0.13
82 0.2
83 0.25
84 0.33
85 0.4
86 0.48
87 0.57
88 0.66
89 0.74
90 0.78
91 0.85
92 0.87
93 0.89
94 0.88
95 0.8
96 0.69
97 0.59
98 0.55
99 0.46
100 0.38
101 0.32
102 0.24
103 0.26
104 0.25
105 0.25
106 0.18
107 0.19
108 0.18
109 0.16
110 0.15
111 0.13
112 0.13
113 0.12
114 0.14
115 0.12
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.11
120 0.13
121 0.13
122 0.15
123 0.15
124 0.15
125 0.14
126 0.15
127 0.15
128 0.17
129 0.2
130 0.17
131 0.23
132 0.23
133 0.22
134 0.23
135 0.2
136 0.19
137 0.2
138 0.23
139 0.2
140 0.22
141 0.22
142 0.22
143 0.24
144 0.25
145 0.23
146 0.23
147 0.26
148 0.26
149 0.33
150 0.35
151 0.36
152 0.35
153 0.34
154 0.36
155 0.37
156 0.35
157 0.3
158 0.29
159 0.26
160 0.25
161 0.23
162 0.22
163 0.17
164 0.2
165 0.21
166 0.22
167 0.22
168 0.21
169 0.23
170 0.22
171 0.21
172 0.19
173 0.16
174 0.16
175 0.17
176 0.17
177 0.15
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.06
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.11
214 0.11
215 0.1
216 0.1
217 0.11
218 0.16
219 0.22
220 0.29
221 0.38
222 0.45
223 0.54
224 0.64
225 0.74
226 0.78
227 0.83
228 0.86
229 0.86
230 0.88
231 0.88
232 0.88
233 0.88
234 0.88
235 0.85
236 0.79
237 0.77
238 0.73
239 0.65
240 0.57
241 0.52
242 0.48
243 0.48
244 0.49
245 0.47
246 0.47
247 0.51
248 0.58
249 0.61
250 0.58
251 0.59
252 0.64
253 0.66
254 0.69
255 0.74
256 0.75
257 0.78
258 0.85
259 0.86
260 0.85
261 0.86
262 0.83
263 0.81
264 0.75
265 0.65
266 0.57
267 0.5
268 0.41
269 0.34
270 0.29
271 0.22
272 0.26
273 0.33
274 0.4