Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1YTM9

Protein Details
Accession A0A0D1YTM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
64-83PRTRSFSSLRQQQQSRRPPLHydrophilic
651-671TSTARKPKYARPNKGVCRGCSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037987  FHL2/3/5  
IPR001781  Znf_LIM  
IPR001510  Znf_PARP  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0030695  F:GTPase regulator activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00412  LIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00478  LIM_DOMAIN_1  
PS50023  LIM_DOMAIN_2  
PS50064  ZF_PARP_2  
CDD cd08368  LIM  
cd09397  LIM1_UF1  
Amino Acid Sequences MEPPVRDVHALPVIKCSSCDEDVDMMAMGDHTCSTTTQGKHSDLARQSAMLKLSSAATVPPTLPRTRSFSSLRQQQQSRRPPLPKIDPSAACMSIPLIHCCAHRIDIDLVRPPVWRGELTPASSGHSSLVSPASATSSSRPPWPSSRKGSMPEVRRPPSPELTNLDCAFPPFPLPSKTATTRKRDRAASQRSATHRSRSKDTPTSVRADNLSRKGSANDSLQSTSEGRLVGKRSRPSTPSSRNGSVSTRSDSRQQSVDTVPQAHIQPIDELATVPILEVDPPIESSKPSLLARTFPEPLPLRSPSIDPGLSAFDFGTTEITPSPPTKPNNEVISNASEIEDKTRSETHPSYKAKRPPPLAAQQSEPIINRTKSPISPQPPSAGVFATTFGKLFGRRPSNSRNPSREVVRQALSDEPETYEEGAERSYLLSPDSEKEQSYLLSPDSDKNFLSAEPSPISSNPGISPQPSPLHEESLKALEGVIPAPAAIPVVVIEPIPEMESSETAVVTQPDEPLRFPRISRIVEEPPSFISETSTRDSIDSASSYGSIGFSERTTSSSSSSSQPELLPSKQLSNSSVADMPAPLRPRIPALSPDSPTDPNLRHGRLSPIPDMPGVPNVPTDSLQPLCFDFDVTPTPPPAPVLARASTEPDTSTARKPKYARPNKGVCRGCSQVILASQKSVSSADGLLTGRYHKECFVCRTCKVIFPTAEFYVHDDKPYCAQHYHEVANSLCATCGKGIEGLYMETANVAGRGKEKHHPECLKCTTCRIRLDHDYFELSGKVYCERDAFRLASVPKARENAPSRPSPLVREYISSGQDGLVKGRNFPERRTTRLLAMTKT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.34
3 0.33
4 0.31
5 0.3
6 0.31
7 0.27
8 0.26
9 0.26
10 0.26
11 0.21
12 0.15
13 0.13
14 0.12
15 0.09
16 0.07
17 0.07
18 0.06
19 0.07
20 0.08
21 0.12
22 0.19
23 0.21
24 0.28
25 0.34
26 0.36
27 0.39
28 0.41
29 0.46
30 0.42
31 0.46
32 0.4
33 0.36
34 0.35
35 0.35
36 0.34
37 0.26
38 0.22
39 0.18
40 0.18
41 0.16
42 0.15
43 0.12
44 0.12
45 0.14
46 0.14
47 0.19
48 0.22
49 0.25
50 0.28
51 0.31
52 0.36
53 0.38
54 0.44
55 0.43
56 0.47
57 0.54
58 0.61
59 0.65
60 0.67
61 0.72
62 0.74
63 0.79
64 0.81
65 0.8
66 0.79
67 0.76
68 0.74
69 0.77
70 0.78
71 0.75
72 0.72
73 0.72
74 0.64
75 0.62
76 0.6
77 0.51
78 0.4
79 0.33
80 0.26
81 0.23
82 0.23
83 0.21
84 0.18
85 0.2
86 0.2
87 0.22
88 0.24
89 0.22
90 0.2
91 0.22
92 0.25
93 0.28
94 0.31
95 0.35
96 0.35
97 0.33
98 0.33
99 0.3
100 0.28
101 0.26
102 0.23
103 0.19
104 0.26
105 0.29
106 0.31
107 0.33
108 0.29
109 0.31
110 0.3
111 0.28
112 0.2
113 0.17
114 0.14
115 0.13
116 0.14
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.11
121 0.11
122 0.13
123 0.14
124 0.19
125 0.21
126 0.27
127 0.29
128 0.31
129 0.41
130 0.48
131 0.53
132 0.55
133 0.61
134 0.61
135 0.63
136 0.68
137 0.66
138 0.65
139 0.66
140 0.68
141 0.64
142 0.63
143 0.63
144 0.59
145 0.59
146 0.55
147 0.5
148 0.47
149 0.48
150 0.51
151 0.46
152 0.42
153 0.34
154 0.32
155 0.27
156 0.21
157 0.18
158 0.14
159 0.17
160 0.18
161 0.2
162 0.22
163 0.27
164 0.34
165 0.42
166 0.48
167 0.54
168 0.61
169 0.68
170 0.72
171 0.71
172 0.72
173 0.73
174 0.75
175 0.74
176 0.69
177 0.68
178 0.66
179 0.68
180 0.63
181 0.62
182 0.59
183 0.55
184 0.57
185 0.56
186 0.59
187 0.6
188 0.61
189 0.6
190 0.57
191 0.57
192 0.52
193 0.48
194 0.42
195 0.4
196 0.42
197 0.39
198 0.38
199 0.35
200 0.34
201 0.34
202 0.34
203 0.32
204 0.28
205 0.25
206 0.25
207 0.25
208 0.24
209 0.25
210 0.23
211 0.2
212 0.18
213 0.16
214 0.14
215 0.16
216 0.2
217 0.24
218 0.3
219 0.35
220 0.37
221 0.42
222 0.44
223 0.47
224 0.53
225 0.55
226 0.57
227 0.58
228 0.58
229 0.55
230 0.55
231 0.52
232 0.47
233 0.42
234 0.38
235 0.34
236 0.31
237 0.36
238 0.36
239 0.36
240 0.34
241 0.31
242 0.3
243 0.3
244 0.33
245 0.27
246 0.26
247 0.24
248 0.24
249 0.24
250 0.21
251 0.19
252 0.15
253 0.13
254 0.12
255 0.12
256 0.1
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.1
273 0.11
274 0.14
275 0.14
276 0.17
277 0.16
278 0.19
279 0.22
280 0.25
281 0.26
282 0.22
283 0.29
284 0.28
285 0.29
286 0.3
287 0.29
288 0.27
289 0.26
290 0.27
291 0.22
292 0.23
293 0.21
294 0.16
295 0.16
296 0.16
297 0.15
298 0.14
299 0.12
300 0.08
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.09
309 0.1
310 0.14
311 0.19
312 0.21
313 0.25
314 0.28
315 0.34
316 0.38
317 0.38
318 0.36
319 0.32
320 0.32
321 0.28
322 0.25
323 0.19
324 0.14
325 0.13
326 0.14
327 0.13
328 0.1
329 0.12
330 0.15
331 0.15
332 0.21
333 0.24
334 0.26
335 0.34
336 0.4
337 0.43
338 0.49
339 0.57
340 0.57
341 0.61
342 0.6
343 0.56
344 0.57
345 0.59
346 0.57
347 0.5
348 0.45
349 0.4
350 0.37
351 0.34
352 0.28
353 0.21
354 0.21
355 0.19
356 0.18
357 0.19
358 0.21
359 0.19
360 0.24
361 0.3
362 0.31
363 0.33
364 0.34
365 0.33
366 0.32
367 0.33
368 0.28
369 0.2
370 0.16
371 0.13
372 0.12
373 0.11
374 0.1
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.09
379 0.11
380 0.17
381 0.22
382 0.24
383 0.29
384 0.36
385 0.46
386 0.53
387 0.58
388 0.57
389 0.55
390 0.57
391 0.56
392 0.53
393 0.47
394 0.42
395 0.36
396 0.31
397 0.27
398 0.26
399 0.23
400 0.19
401 0.15
402 0.12
403 0.11
404 0.11
405 0.1
406 0.08
407 0.07
408 0.07
409 0.06
410 0.06
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.06
416 0.06
417 0.07
418 0.08
419 0.11
420 0.11
421 0.11
422 0.11
423 0.11
424 0.11
425 0.12
426 0.12
427 0.09
428 0.09
429 0.1
430 0.13
431 0.14
432 0.15
433 0.14
434 0.14
435 0.14
436 0.12
437 0.15
438 0.12
439 0.13
440 0.12
441 0.13
442 0.13
443 0.13
444 0.16
445 0.13
446 0.13
447 0.11
448 0.13
449 0.13
450 0.13
451 0.14
452 0.15
453 0.17
454 0.17
455 0.22
456 0.2
457 0.24
458 0.23
459 0.23
460 0.21
461 0.21
462 0.2
463 0.14
464 0.13
465 0.09
466 0.09
467 0.08
468 0.07
469 0.05
470 0.04
471 0.05
472 0.05
473 0.04
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.05
484 0.05
485 0.05
486 0.05
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.07
493 0.06
494 0.07
495 0.07
496 0.08
497 0.1
498 0.11
499 0.12
500 0.14
501 0.18
502 0.18
503 0.18
504 0.23
505 0.28
506 0.29
507 0.3
508 0.33
509 0.34
510 0.38
511 0.39
512 0.33
513 0.27
514 0.27
515 0.25
516 0.19
517 0.17
518 0.14
519 0.16
520 0.18
521 0.17
522 0.16
523 0.16
524 0.16
525 0.14
526 0.14
527 0.11
528 0.09
529 0.09
530 0.08
531 0.08
532 0.08
533 0.07
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.06
538 0.08
539 0.08
540 0.1
541 0.12
542 0.13
543 0.14
544 0.16
545 0.17
546 0.19
547 0.21
548 0.2
549 0.2
550 0.19
551 0.21
552 0.23
553 0.22
554 0.23
555 0.21
556 0.24
557 0.24
558 0.25
559 0.23
560 0.23
561 0.23
562 0.21
563 0.22
564 0.18
565 0.16
566 0.15
567 0.15
568 0.15
569 0.16
570 0.14
571 0.14
572 0.14
573 0.17
574 0.19
575 0.2
576 0.22
577 0.27
578 0.32
579 0.33
580 0.34
581 0.35
582 0.34
583 0.33
584 0.32
585 0.26
586 0.28
587 0.33
588 0.32
589 0.3
590 0.31
591 0.36
592 0.36
593 0.39
594 0.35
595 0.31
596 0.31
597 0.3
598 0.29
599 0.23
600 0.22
601 0.19
602 0.16
603 0.14
604 0.14
605 0.15
606 0.14
607 0.15
608 0.15
609 0.15
610 0.15
611 0.15
612 0.15
613 0.16
614 0.15
615 0.15
616 0.11
617 0.12
618 0.15
619 0.16
620 0.16
621 0.16
622 0.16
623 0.16
624 0.16
625 0.16
626 0.14
627 0.17
628 0.2
629 0.2
630 0.22
631 0.22
632 0.26
633 0.26
634 0.24
635 0.21
636 0.18
637 0.22
638 0.23
639 0.3
640 0.34
641 0.34
642 0.41
643 0.44
644 0.51
645 0.58
646 0.66
647 0.68
648 0.69
649 0.77
650 0.79
651 0.85
652 0.82
653 0.73
654 0.69
655 0.63
656 0.55
657 0.46
658 0.39
659 0.31
660 0.3
661 0.32
662 0.26
663 0.24
664 0.22
665 0.21
666 0.21
667 0.18
668 0.14
669 0.1
670 0.1
671 0.09
672 0.12
673 0.13
674 0.12
675 0.12
676 0.14
677 0.16
678 0.18
679 0.19
680 0.19
681 0.23
682 0.28
683 0.35
684 0.42
685 0.45
686 0.44
687 0.49
688 0.47
689 0.49
690 0.48
691 0.48
692 0.42
693 0.4
694 0.44
695 0.4
696 0.4
697 0.34
698 0.34
699 0.33
700 0.31
701 0.3
702 0.25
703 0.25
704 0.29
705 0.33
706 0.31
707 0.26
708 0.29
709 0.33
710 0.37
711 0.39
712 0.35
713 0.35
714 0.32
715 0.34
716 0.32
717 0.25
718 0.2
719 0.17
720 0.16
721 0.13
722 0.14
723 0.11
724 0.12
725 0.12
726 0.13
727 0.14
728 0.13
729 0.13
730 0.13
731 0.12
732 0.09
733 0.09
734 0.08
735 0.08
736 0.08
737 0.08
738 0.12
739 0.15
740 0.19
741 0.27
742 0.36
743 0.42
744 0.52
745 0.6
746 0.61
747 0.68
748 0.73
749 0.72
750 0.65
751 0.68
752 0.67
753 0.65
754 0.68
755 0.62
756 0.61
757 0.64
758 0.68
759 0.63
760 0.57
761 0.53
762 0.47
763 0.44
764 0.36
765 0.27
766 0.23
767 0.19
768 0.19
769 0.17
770 0.19
771 0.21
772 0.23
773 0.26
774 0.29
775 0.29
776 0.26
777 0.32
778 0.31
779 0.36
780 0.4
781 0.39
782 0.39
783 0.42
784 0.42
785 0.45
786 0.5
787 0.5
788 0.5
789 0.53
790 0.52
791 0.56
792 0.57
793 0.53
794 0.52
795 0.5
796 0.45
797 0.43
798 0.43
799 0.42
800 0.41
801 0.36
802 0.31
803 0.26
804 0.28
805 0.25
806 0.24
807 0.25
808 0.24
809 0.26
810 0.32
811 0.41
812 0.4
813 0.44
814 0.51
815 0.5
816 0.57
817 0.62
818 0.59
819 0.56
820 0.63