Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1VSI6

Protein Details
Accession A0A0D1VSI6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
615-642DIEKIEKQMPRKVKKRRKIEEDRFEEYIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
623-632MPRKVKKRRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12.833, cyto 9, cyto_mito 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
Amino Acid Sequences MDSSRGPPRVKNKAAAPVQISAEQLLREAVDRQEPGLQAPTQRFADLEELHEFQGRKRKEFEDYVCRNRINMNNWMRYAQWELEQKEYRRARSVFERALDVDSTSVVLWIRYIEAEMKTRNINHARNLLDRAVTILPRIDKLWYKYVYMEETLGNVPGTRQVFERWMSWEPDEAAWLAYIKLEKRYGEYDRARAIYERFTVVHPEPRNWIRWAKFEEENGTSQLVRDVFGVAIETLGDDFMDEKLFIAYARYEAKLKEYERARSIFKYALDRLPRSQSVVLHKSYTQFEKQFGNREGVEDVILAKRRVQYEEQLKANPRNYDVWFDLARLEEAGGDFERVRDVYERAIAQIPPSQEKRHWRRYIYLWIFYALWEEITTKEVDRARQVYQECLKLIPHKKWTFAKIWILKAQFEVRQMQLQAARKTLGQALGMCPKGKLFRGYIELEKQLFEFVRCRTLFEKQIEWNSSNGQAWIQFAELERGLDDLERARAIYELAIEQPTLDMPELVWKAYIDFEEYEEQYDRARALYERLLRKTDHVKVWINYARFEINVPDPDEPEAADGEEQKVSEEAKVRARKVFERAHDVFKSKEMKEERVDLLHAWRSFEQTHGSPDDIEKIEKQMPRKVKKRRKIEEDRFEEYIDYVFPADDESAAKMSKLLQVAHQWKAKQQENGTAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.67
3 0.61
4 0.55
5 0.52
6 0.47
7 0.41
8 0.32
9 0.29
10 0.22
11 0.19
12 0.16
13 0.13
14 0.12
15 0.14
16 0.15
17 0.19
18 0.2
19 0.21
20 0.25
21 0.25
22 0.26
23 0.28
24 0.28
25 0.27
26 0.3
27 0.34
28 0.31
29 0.31
30 0.28
31 0.26
32 0.3
33 0.26
34 0.27
35 0.25
36 0.25
37 0.26
38 0.3
39 0.28
40 0.26
41 0.34
42 0.35
43 0.35
44 0.39
45 0.42
46 0.45
47 0.53
48 0.57
49 0.58
50 0.63
51 0.68
52 0.69
53 0.65
54 0.59
55 0.57
56 0.56
57 0.5
58 0.51
59 0.52
60 0.52
61 0.53
62 0.54
63 0.47
64 0.43
65 0.43
66 0.35
67 0.32
68 0.33
69 0.34
70 0.42
71 0.48
72 0.47
73 0.52
74 0.56
75 0.54
76 0.54
77 0.53
78 0.5
79 0.53
80 0.59
81 0.55
82 0.51
83 0.5
84 0.43
85 0.45
86 0.39
87 0.3
88 0.21
89 0.15
90 0.14
91 0.11
92 0.1
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.07
99 0.08
100 0.11
101 0.13
102 0.18
103 0.2
104 0.22
105 0.25
106 0.26
107 0.34
108 0.38
109 0.4
110 0.41
111 0.46
112 0.47
113 0.47
114 0.5
115 0.43
116 0.35
117 0.31
118 0.28
119 0.24
120 0.21
121 0.18
122 0.17
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.19
127 0.22
128 0.26
129 0.33
130 0.31
131 0.32
132 0.33
133 0.35
134 0.34
135 0.3
136 0.27
137 0.19
138 0.19
139 0.18
140 0.17
141 0.14
142 0.11
143 0.1
144 0.14
145 0.14
146 0.13
147 0.14
148 0.15
149 0.19
150 0.21
151 0.22
152 0.22
153 0.24
154 0.26
155 0.26
156 0.26
157 0.24
158 0.22
159 0.21
160 0.17
161 0.14
162 0.11
163 0.11
164 0.08
165 0.08
166 0.1
167 0.1
168 0.14
169 0.17
170 0.17
171 0.2
172 0.25
173 0.28
174 0.35
175 0.38
176 0.39
177 0.4
178 0.41
179 0.39
180 0.35
181 0.33
182 0.28
183 0.26
184 0.23
185 0.2
186 0.19
187 0.24
188 0.24
189 0.3
190 0.27
191 0.27
192 0.32
193 0.34
194 0.37
195 0.35
196 0.4
197 0.35
198 0.4
199 0.42
200 0.41
201 0.41
202 0.4
203 0.41
204 0.36
205 0.35
206 0.29
207 0.26
208 0.21
209 0.18
210 0.18
211 0.14
212 0.12
213 0.1
214 0.1
215 0.08
216 0.08
217 0.09
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.04
228 0.05
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.1
238 0.1
239 0.12
240 0.12
241 0.16
242 0.2
243 0.21
244 0.26
245 0.28
246 0.31
247 0.34
248 0.36
249 0.36
250 0.32
251 0.33
252 0.29
253 0.27
254 0.28
255 0.27
256 0.31
257 0.33
258 0.33
259 0.34
260 0.36
261 0.34
262 0.31
263 0.31
264 0.28
265 0.31
266 0.33
267 0.32
268 0.28
269 0.29
270 0.29
271 0.29
272 0.29
273 0.26
274 0.23
275 0.24
276 0.28
277 0.3
278 0.34
279 0.33
280 0.33
281 0.28
282 0.28
283 0.26
284 0.2
285 0.18
286 0.11
287 0.1
288 0.1
289 0.12
290 0.11
291 0.12
292 0.15
293 0.16
294 0.19
295 0.2
296 0.24
297 0.31
298 0.36
299 0.37
300 0.37
301 0.39
302 0.41
303 0.43
304 0.37
305 0.31
306 0.29
307 0.27
308 0.28
309 0.25
310 0.24
311 0.2
312 0.19
313 0.18
314 0.15
315 0.13
316 0.09
317 0.08
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.13
335 0.12
336 0.12
337 0.14
338 0.14
339 0.16
340 0.19
341 0.19
342 0.22
343 0.32
344 0.39
345 0.47
346 0.52
347 0.5
348 0.53
349 0.56
350 0.63
351 0.56
352 0.51
353 0.41
354 0.37
355 0.34
356 0.29
357 0.25
358 0.14
359 0.1
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.08
364 0.08
365 0.07
366 0.11
367 0.13
368 0.14
369 0.17
370 0.2
371 0.2
372 0.25
373 0.25
374 0.27
375 0.29
376 0.3
377 0.27
378 0.25
379 0.25
380 0.28
381 0.32
382 0.32
383 0.38
384 0.37
385 0.42
386 0.46
387 0.49
388 0.45
389 0.45
390 0.49
391 0.44
392 0.46
393 0.45
394 0.42
395 0.38
396 0.36
397 0.34
398 0.27
399 0.24
400 0.24
401 0.2
402 0.21
403 0.21
404 0.21
405 0.23
406 0.27
407 0.26
408 0.25
409 0.24
410 0.22
411 0.23
412 0.23
413 0.19
414 0.14
415 0.13
416 0.15
417 0.2
418 0.21
419 0.2
420 0.18
421 0.18
422 0.19
423 0.2
424 0.2
425 0.17
426 0.19
427 0.23
428 0.26
429 0.28
430 0.29
431 0.3
432 0.28
433 0.26
434 0.23
435 0.2
436 0.18
437 0.15
438 0.16
439 0.14
440 0.21
441 0.21
442 0.24
443 0.24
444 0.29
445 0.35
446 0.34
447 0.38
448 0.34
449 0.41
450 0.42
451 0.4
452 0.36
453 0.31
454 0.31
455 0.26
456 0.22
457 0.16
458 0.13
459 0.13
460 0.12
461 0.1
462 0.09
463 0.09
464 0.11
465 0.1
466 0.1
467 0.09
468 0.09
469 0.09
470 0.08
471 0.08
472 0.07
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.09
479 0.08
480 0.08
481 0.07
482 0.09
483 0.09
484 0.09
485 0.08
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.07
490 0.06
491 0.05
492 0.13
493 0.13
494 0.13
495 0.13
496 0.12
497 0.13
498 0.14
499 0.15
500 0.1
501 0.1
502 0.12
503 0.15
504 0.16
505 0.18
506 0.17
507 0.17
508 0.16
509 0.16
510 0.14
511 0.11
512 0.13
513 0.11
514 0.13
515 0.2
516 0.27
517 0.33
518 0.37
519 0.39
520 0.38
521 0.43
522 0.48
523 0.48
524 0.46
525 0.45
526 0.48
527 0.46
528 0.54
529 0.54
530 0.47
531 0.41
532 0.38
533 0.33
534 0.27
535 0.27
536 0.21
537 0.2
538 0.23
539 0.25
540 0.23
541 0.23
542 0.25
543 0.24
544 0.2
545 0.17
546 0.13
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.11
551 0.12
552 0.12
553 0.11
554 0.12
555 0.12
556 0.14
557 0.18
558 0.2
559 0.28
560 0.35
561 0.37
562 0.41
563 0.45
564 0.47
565 0.5
566 0.55
567 0.51
568 0.54
569 0.55
570 0.58
571 0.57
572 0.55
573 0.48
574 0.47
575 0.49
576 0.4
577 0.45
578 0.42
579 0.44
580 0.45
581 0.5
582 0.46
583 0.41
584 0.42
585 0.35
586 0.36
587 0.37
588 0.33
589 0.31
590 0.29
591 0.31
592 0.3
593 0.31
594 0.3
595 0.25
596 0.29
597 0.28
598 0.28
599 0.26
600 0.26
601 0.31
602 0.27
603 0.27
604 0.23
605 0.26
606 0.31
607 0.33
608 0.37
609 0.39
610 0.48
611 0.56
612 0.65
613 0.71
614 0.76
615 0.82
616 0.88
617 0.9
618 0.91
619 0.92
620 0.93
621 0.93
622 0.9
623 0.86
624 0.77
625 0.67
626 0.57
627 0.46
628 0.36
629 0.25
630 0.18
631 0.12
632 0.1
633 0.09
634 0.1
635 0.1
636 0.09
637 0.1
638 0.11
639 0.13
640 0.14
641 0.14
642 0.13
643 0.15
644 0.19
645 0.21
646 0.2
647 0.22
648 0.33
649 0.39
650 0.46
651 0.49
652 0.46
653 0.48
654 0.56
655 0.57
656 0.56
657 0.54