Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D0B4D9

Protein Details
Accession A0A0D0B4D9    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
99-122DSDAEKRKDKKELKSRPKPPTSSSBasic
419-446IVTRGAGFRKEKNKKKKGSYKGGTITMQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
104-117KRKDKKELKSRPKP
425-437GFRKEKNKKKKGS
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 1, cyto 1, pero 1, cysk 1, cyto_mito 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MDPNLATTYTLIHAFLKKNSHSKAAEALKKAAKDIVVLKDGVNVEGPQLDEIIKEWKRLSAAEKAKGTVDSSDSSSSDDSDSESSSSSSSSSSGDSDPDSDAEKRKDKKELKSRPKPPTSSSSSSSSSDSDSDSDSSKTTIQKAPSNGAKSVKKASAGSSSDDSDSSSSSDDSDSSSDSDSDSDSDSSDSEAKSKSKDVKKPDNAKHRESSATLSTESDSQKKADAAKQPKLARGAKAKSTNSSSSSSSSSSSSDSSDSESEAASKKQKQPTKVSTTKSSSDSSSDSSSDSSSDSDSDADTSTNQKGISTSKASADRTKPAKQPASVKQTTSADDNQVKITKKRRTSENGTAIATAVVQETKNNPPADGPNLGKRRTTNERFQRINPDKVSAHLIRDNRYENKAGPENDYGAKAHADLIVTRGAGFRKEKNKKKKGSYKGGTITMQSHSYKFPDTDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.29
3 0.34
4 0.38
5 0.46
6 0.49
7 0.53
8 0.49
9 0.48
10 0.53
11 0.55
12 0.56
13 0.52
14 0.55
15 0.52
16 0.51
17 0.5
18 0.43
19 0.34
20 0.31
21 0.33
22 0.32
23 0.3
24 0.29
25 0.28
26 0.3
27 0.3
28 0.27
29 0.23
30 0.17
31 0.15
32 0.16
33 0.16
34 0.11
35 0.11
36 0.11
37 0.09
38 0.1
39 0.19
40 0.18
41 0.21
42 0.21
43 0.23
44 0.25
45 0.27
46 0.3
47 0.31
48 0.37
49 0.42
50 0.44
51 0.42
52 0.43
53 0.41
54 0.38
55 0.3
56 0.25
57 0.2
58 0.2
59 0.21
60 0.2
61 0.21
62 0.2
63 0.19
64 0.16
65 0.15
66 0.14
67 0.13
68 0.14
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.11
73 0.11
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.11
80 0.12
81 0.13
82 0.13
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.16
87 0.17
88 0.22
89 0.27
90 0.34
91 0.39
92 0.43
93 0.52
94 0.57
95 0.65
96 0.7
97 0.75
98 0.78
99 0.83
100 0.88
101 0.88
102 0.9
103 0.84
104 0.78
105 0.75
106 0.72
107 0.66
108 0.6
109 0.55
110 0.49
111 0.46
112 0.42
113 0.35
114 0.28
115 0.23
116 0.21
117 0.17
118 0.15
119 0.15
120 0.14
121 0.14
122 0.13
123 0.14
124 0.16
125 0.17
126 0.2
127 0.23
128 0.25
129 0.3
130 0.32
131 0.37
132 0.4
133 0.41
134 0.39
135 0.42
136 0.41
137 0.39
138 0.41
139 0.37
140 0.33
141 0.31
142 0.3
143 0.31
144 0.3
145 0.3
146 0.27
147 0.26
148 0.24
149 0.23
150 0.21
151 0.14
152 0.13
153 0.11
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.1
176 0.09
177 0.1
178 0.12
179 0.13
180 0.14
181 0.18
182 0.26
183 0.33
184 0.39
185 0.46
186 0.54
187 0.63
188 0.72
189 0.76
190 0.78
191 0.75
192 0.74
193 0.68
194 0.6
195 0.52
196 0.43
197 0.38
198 0.3
199 0.26
200 0.22
201 0.19
202 0.17
203 0.19
204 0.19
205 0.18
206 0.16
207 0.14
208 0.15
209 0.16
210 0.18
211 0.2
212 0.27
213 0.32
214 0.37
215 0.43
216 0.44
217 0.45
218 0.49
219 0.46
220 0.42
221 0.43
222 0.41
223 0.4
224 0.45
225 0.43
226 0.4
227 0.42
228 0.4
229 0.35
230 0.34
231 0.29
232 0.24
233 0.25
234 0.23
235 0.19
236 0.18
237 0.16
238 0.14
239 0.14
240 0.13
241 0.12
242 0.11
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.09
248 0.1
249 0.11
250 0.12
251 0.15
252 0.21
253 0.27
254 0.35
255 0.39
256 0.44
257 0.52
258 0.58
259 0.63
260 0.64
261 0.62
262 0.62
263 0.62
264 0.59
265 0.53
266 0.46
267 0.37
268 0.32
269 0.3
270 0.25
271 0.22
272 0.19
273 0.17
274 0.16
275 0.15
276 0.13
277 0.12
278 0.1
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.11
289 0.11
290 0.12
291 0.12
292 0.11
293 0.12
294 0.14
295 0.18
296 0.19
297 0.19
298 0.22
299 0.27
300 0.29
301 0.35
302 0.36
303 0.4
304 0.42
305 0.47
306 0.48
307 0.52
308 0.55
309 0.53
310 0.58
311 0.59
312 0.62
313 0.58
314 0.54
315 0.51
316 0.47
317 0.45
318 0.4
319 0.34
320 0.31
321 0.31
322 0.31
323 0.3
324 0.32
325 0.34
326 0.36
327 0.43
328 0.45
329 0.5
330 0.55
331 0.6
332 0.64
333 0.7
334 0.74
335 0.74
336 0.69
337 0.62
338 0.56
339 0.47
340 0.38
341 0.29
342 0.19
343 0.11
344 0.08
345 0.07
346 0.09
347 0.12
348 0.18
349 0.24
350 0.24
351 0.24
352 0.25
353 0.29
354 0.32
355 0.34
356 0.31
357 0.35
358 0.41
359 0.42
360 0.42
361 0.4
362 0.44
363 0.49
364 0.53
365 0.54
366 0.58
367 0.66
368 0.68
369 0.7
370 0.74
371 0.7
372 0.72
373 0.64
374 0.59
375 0.5
376 0.47
377 0.51
378 0.41
379 0.39
380 0.37
381 0.38
382 0.37
383 0.42
384 0.46
385 0.44
386 0.46
387 0.44
388 0.41
389 0.45
390 0.48
391 0.44
392 0.43
393 0.41
394 0.4
395 0.39
396 0.38
397 0.31
398 0.25
399 0.24
400 0.19
401 0.17
402 0.15
403 0.14
404 0.12
405 0.14
406 0.14
407 0.14
408 0.14
409 0.15
410 0.15
411 0.2
412 0.24
413 0.3
414 0.39
415 0.5
416 0.6
417 0.69
418 0.78
419 0.83
420 0.9
421 0.92
422 0.91
423 0.92
424 0.89
425 0.88
426 0.85
427 0.82
428 0.73
429 0.65
430 0.57
431 0.49
432 0.47
433 0.39
434 0.33
435 0.3
436 0.31
437 0.32
438 0.3