Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B5RTK7

Protein Details
Accession B5RTK7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MSDRSSKPHRSHKRQKSSLTNIGYYHydrophilic
53-79MQQPQQQQTRQQQQSRQQHPGHNRQLSHydrophilic
902-926SLKYIFIKYQKQQNNQHKDENQNSFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 11.5, mito 4, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003150  DNA-bd_RFX  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG dha:DEHA2D17930g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02257  RFX_DNA_binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51526  RFX_DBD  
Amino Acid Sequences MSDRSSKPHRSHKRQKSSLTNIGYYFPDQQATQQPSQQPSLQPFQQFPHQRQMQQPQQQQTRQQQQSRQQHPGHNRQLSQSSQLSPHQYQSASISSQSSQPSQQSQAQSSFYDYDPYNTMNYNFSSATAPSSSTGTGHNIIQGIPPTKAIPSPGRGQFGPTPFLPYQSPTQYTIPGSVDQNFGTIPQMQLQSGQYNSEAPNVYEQFTYPKSVAEFNDVPQSETNTSVQEKQPTKHNKNLSVSTRFNLFNLNENEDQGERETDAKPTAINPLFNDFLQSLVNVDGSNINNYLLQILEKLGSPLPIDDFYNFLYNNDKQASPTPVIPTHKIDKTMVNFSIQSSAFSLLDQLLNIFKIPNSLIEYFPNIANRENKLFGINYHELLRTFLAIKILYDVLIQLPSNNDPQNYTIPRLSIYKTYYIICQKLIRQYPSPTNTSSEQQKLILGQSKLGKLLKLVYPDLLIKRLGSRGDSKYNYLGVIWNQNIIDDEIKKLCDENELVHLHRIFDTKDKNLSFPRRRNHSTNSYTSIPGHKIKLKTRSKSEPQIQLTRPHTEPYSNENIIAPSFSFIKPHLKFPESDNFTILEEKDKDNWFITIKHRAYEWLKRCNLSFSIPEAIQSVFLNNDNLVEKHLLCNGLINKIVKPLSSDLAYVENADLYLYLIAILELLPYLLFLKSYPQVNYLKNLRLNLLYLIDNFNDELATINTNNHFKIEHLRRFLILMKKLININDLLITFIKLVNKDDSSNSSVMVLDIENYLNLSDESPSDIGIDEDSESRLSFKNDILSKDLIYALNAYNLDPTLDQHSRSVLSTDFIWDEVNLIGNFFRIDLLNFLNDQDLGEKYESVTSTEPNDETDSILSKKEGIKLASLLTLIHDKLLTKHFKAKYPILVYTNILSLILNDSLKYIFIKYQKQQNNQHKDENQNSFGNWWVFNSFVQEYSSLMGEIVGLYDSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.91
2 0.92
3 0.92
4 0.9
5 0.89
6 0.84
7 0.77
8 0.66
9 0.6
10 0.53
11 0.45
12 0.4
13 0.31
14 0.27
15 0.23
16 0.27
17 0.33
18 0.38
19 0.38
20 0.39
21 0.44
22 0.46
23 0.5
24 0.5
25 0.46
26 0.45
27 0.49
28 0.49
29 0.47
30 0.45
31 0.45
32 0.5
33 0.53
34 0.51
35 0.54
36 0.55
37 0.57
38 0.63
39 0.69
40 0.69
41 0.72
42 0.75
43 0.74
44 0.78
45 0.78
46 0.79
47 0.79
48 0.8
49 0.79
50 0.79
51 0.78
52 0.79
53 0.83
54 0.82
55 0.82
56 0.77
57 0.77
58 0.79
59 0.81
60 0.81
61 0.78
62 0.72
63 0.67
64 0.67
65 0.61
66 0.57
67 0.51
68 0.43
69 0.4
70 0.43
71 0.45
72 0.41
73 0.41
74 0.39
75 0.35
76 0.33
77 0.33
78 0.32
79 0.26
80 0.25
81 0.24
82 0.21
83 0.25
84 0.27
85 0.25
86 0.25
87 0.27
88 0.31
89 0.33
90 0.38
91 0.39
92 0.4
93 0.41
94 0.4
95 0.37
96 0.36
97 0.34
98 0.28
99 0.27
100 0.23
101 0.22
102 0.22
103 0.23
104 0.21
105 0.2
106 0.21
107 0.19
108 0.2
109 0.2
110 0.18
111 0.18
112 0.19
113 0.17
114 0.19
115 0.17
116 0.17
117 0.14
118 0.16
119 0.15
120 0.14
121 0.15
122 0.16
123 0.17
124 0.17
125 0.18
126 0.17
127 0.17
128 0.18
129 0.21
130 0.19
131 0.18
132 0.19
133 0.18
134 0.18
135 0.19
136 0.22
137 0.22
138 0.24
139 0.31
140 0.35
141 0.38
142 0.37
143 0.41
144 0.42
145 0.4
146 0.4
147 0.32
148 0.34
149 0.3
150 0.33
151 0.29
152 0.26
153 0.29
154 0.31
155 0.33
156 0.3
157 0.32
158 0.32
159 0.32
160 0.33
161 0.29
162 0.26
163 0.25
164 0.23
165 0.23
166 0.2
167 0.19
168 0.16
169 0.14
170 0.13
171 0.13
172 0.11
173 0.13
174 0.15
175 0.14
176 0.17
177 0.18
178 0.2
179 0.19
180 0.2
181 0.16
182 0.18
183 0.18
184 0.2
185 0.19
186 0.16
187 0.23
188 0.23
189 0.23
190 0.21
191 0.21
192 0.21
193 0.21
194 0.24
195 0.17
196 0.18
197 0.18
198 0.21
199 0.22
200 0.25
201 0.24
202 0.23
203 0.31
204 0.29
205 0.29
206 0.27
207 0.3
208 0.23
209 0.24
210 0.24
211 0.19
212 0.21
213 0.23
214 0.26
215 0.3
216 0.33
217 0.33
218 0.42
219 0.5
220 0.54
221 0.58
222 0.63
223 0.62
224 0.65
225 0.71
226 0.68
227 0.65
228 0.61
229 0.54
230 0.51
231 0.43
232 0.37
233 0.34
234 0.28
235 0.28
236 0.29
237 0.33
238 0.29
239 0.29
240 0.31
241 0.25
242 0.25
243 0.18
244 0.16
245 0.11
246 0.13
247 0.13
248 0.14
249 0.14
250 0.14
251 0.13
252 0.13
253 0.2
254 0.2
255 0.21
256 0.2
257 0.23
258 0.24
259 0.24
260 0.25
261 0.16
262 0.15
263 0.14
264 0.13
265 0.09
266 0.08
267 0.09
268 0.07
269 0.07
270 0.1
271 0.1
272 0.12
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.08
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.06
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.14
296 0.14
297 0.12
298 0.17
299 0.16
300 0.2
301 0.21
302 0.19
303 0.18
304 0.23
305 0.26
306 0.23
307 0.24
308 0.24
309 0.27
310 0.3
311 0.31
312 0.32
313 0.34
314 0.34
315 0.34
316 0.32
317 0.33
318 0.33
319 0.36
320 0.32
321 0.28
322 0.26
323 0.24
324 0.27
325 0.22
326 0.19
327 0.15
328 0.16
329 0.14
330 0.13
331 0.13
332 0.09
333 0.09
334 0.08
335 0.07
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.06
340 0.05
341 0.07
342 0.07
343 0.09
344 0.12
345 0.14
346 0.14
347 0.15
348 0.18
349 0.17
350 0.18
351 0.19
352 0.16
353 0.18
354 0.2
355 0.22
356 0.22
357 0.22
358 0.22
359 0.2
360 0.2
361 0.17
362 0.22
363 0.2
364 0.19
365 0.19
366 0.2
367 0.18
368 0.19
369 0.18
370 0.11
371 0.11
372 0.11
373 0.11
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.09
379 0.08
380 0.07
381 0.06
382 0.07
383 0.07
384 0.06
385 0.07
386 0.08
387 0.12
388 0.13
389 0.12
390 0.12
391 0.15
392 0.21
393 0.21
394 0.23
395 0.2
396 0.19
397 0.21
398 0.22
399 0.21
400 0.19
401 0.19
402 0.19
403 0.2
404 0.2
405 0.23
406 0.25
407 0.24
408 0.22
409 0.23
410 0.23
411 0.29
412 0.33
413 0.32
414 0.31
415 0.34
416 0.39
417 0.4
418 0.4
419 0.34
420 0.32
421 0.31
422 0.31
423 0.32
424 0.27
425 0.24
426 0.22
427 0.21
428 0.19
429 0.19
430 0.22
431 0.17
432 0.18
433 0.2
434 0.2
435 0.22
436 0.22
437 0.19
438 0.14
439 0.17
440 0.16
441 0.16
442 0.16
443 0.13
444 0.14
445 0.16
446 0.16
447 0.15
448 0.13
449 0.1
450 0.11
451 0.13
452 0.12
453 0.12
454 0.17
455 0.19
456 0.26
457 0.27
458 0.27
459 0.27
460 0.27
461 0.25
462 0.2
463 0.17
464 0.11
465 0.14
466 0.13
467 0.13
468 0.12
469 0.12
470 0.12
471 0.11
472 0.12
473 0.08
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.09
481 0.09
482 0.09
483 0.14
484 0.15
485 0.16
486 0.18
487 0.18
488 0.17
489 0.17
490 0.17
491 0.12
492 0.16
493 0.19
494 0.19
495 0.25
496 0.25
497 0.26
498 0.32
499 0.42
500 0.46
501 0.5
502 0.55
503 0.58
504 0.62
505 0.65
506 0.65
507 0.64
508 0.61
509 0.58
510 0.55
511 0.49
512 0.45
513 0.41
514 0.37
515 0.31
516 0.28
517 0.27
518 0.26
519 0.29
520 0.34
521 0.44
522 0.49
523 0.51
524 0.56
525 0.61
526 0.63
527 0.67
528 0.68
529 0.67
530 0.64
531 0.65
532 0.6
533 0.59
534 0.56
535 0.51
536 0.45
537 0.37
538 0.33
539 0.27
540 0.27
541 0.26
542 0.3
543 0.25
544 0.25
545 0.24
546 0.23
547 0.21
548 0.2
549 0.13
550 0.07
551 0.09
552 0.09
553 0.09
554 0.1
555 0.2
556 0.21
557 0.27
558 0.31
559 0.3
560 0.31
561 0.34
562 0.43
563 0.38
564 0.38
565 0.32
566 0.28
567 0.28
568 0.28
569 0.24
570 0.19
571 0.16
572 0.17
573 0.2
574 0.21
575 0.21
576 0.2
577 0.22
578 0.18
579 0.2
580 0.23
581 0.29
582 0.28
583 0.27
584 0.27
585 0.31
586 0.34
587 0.4
588 0.43
589 0.42
590 0.44
591 0.45
592 0.45
593 0.44
594 0.4
595 0.34
596 0.29
597 0.23
598 0.24
599 0.22
600 0.22
601 0.19
602 0.17
603 0.15
604 0.13
605 0.11
606 0.08
607 0.09
608 0.09
609 0.08
610 0.09
611 0.1
612 0.1
613 0.11
614 0.12
615 0.11
616 0.12
617 0.14
618 0.13
619 0.11
620 0.16
621 0.16
622 0.17
623 0.19
624 0.19
625 0.18
626 0.22
627 0.22
628 0.17
629 0.19
630 0.18
631 0.18
632 0.17
633 0.17
634 0.14
635 0.16
636 0.16
637 0.14
638 0.11
639 0.09
640 0.08
641 0.08
642 0.06
643 0.05
644 0.04
645 0.04
646 0.04
647 0.03
648 0.03
649 0.04
650 0.03
651 0.03
652 0.03
653 0.03
654 0.03
655 0.03
656 0.04
657 0.04
658 0.04
659 0.04
660 0.08
661 0.12
662 0.15
663 0.16
664 0.2
665 0.25
666 0.27
667 0.33
668 0.34
669 0.37
670 0.37
671 0.37
672 0.34
673 0.3
674 0.3
675 0.25
676 0.22
677 0.17
678 0.15
679 0.16
680 0.14
681 0.14
682 0.12
683 0.11
684 0.09
685 0.07
686 0.08
687 0.07
688 0.09
689 0.08
690 0.1
691 0.14
692 0.16
693 0.16
694 0.15
695 0.15
696 0.14
697 0.24
698 0.32
699 0.36
700 0.39
701 0.4
702 0.4
703 0.41
704 0.47
705 0.44
706 0.38
707 0.35
708 0.32
709 0.34
710 0.36
711 0.35
712 0.31
713 0.23
714 0.2
715 0.18
716 0.16
717 0.14
718 0.12
719 0.12
720 0.11
721 0.12
722 0.14
723 0.13
724 0.15
725 0.18
726 0.19
727 0.2
728 0.22
729 0.25
730 0.26
731 0.26
732 0.23
733 0.2
734 0.18
735 0.16
736 0.15
737 0.1
738 0.07
739 0.08
740 0.08
741 0.07
742 0.07
743 0.07
744 0.07
745 0.07
746 0.07
747 0.06
748 0.07
749 0.1
750 0.1
751 0.1
752 0.1
753 0.09
754 0.09
755 0.09
756 0.09
757 0.07
758 0.08
759 0.09
760 0.09
761 0.09
762 0.11
763 0.12
764 0.14
765 0.15
766 0.16
767 0.22
768 0.26
769 0.28
770 0.31
771 0.3
772 0.28
773 0.28
774 0.29
775 0.21
776 0.18
777 0.18
778 0.14
779 0.16
780 0.16
781 0.14
782 0.13
783 0.13
784 0.14
785 0.11
786 0.12
787 0.17
788 0.18
789 0.19
790 0.19
791 0.21
792 0.22
793 0.22
794 0.22
795 0.15
796 0.15
797 0.14
798 0.16
799 0.14
800 0.13
801 0.13
802 0.11
803 0.12
804 0.1
805 0.14
806 0.11
807 0.11
808 0.1
809 0.1
810 0.11
811 0.09
812 0.1
813 0.07
814 0.08
815 0.1
816 0.12
817 0.13
818 0.13
819 0.14
820 0.14
821 0.13
822 0.13
823 0.12
824 0.11
825 0.13
826 0.13
827 0.13
828 0.13
829 0.16
830 0.17
831 0.17
832 0.18
833 0.17
834 0.19
835 0.22
836 0.22
837 0.21
838 0.23
839 0.21
840 0.21
841 0.21
842 0.21
843 0.19
844 0.2
845 0.18
846 0.19
847 0.22
848 0.26
849 0.29
850 0.27
851 0.29
852 0.29
853 0.3
854 0.28
855 0.25
856 0.19
857 0.17
858 0.19
859 0.16
860 0.16
861 0.15
862 0.14
863 0.18
864 0.27
865 0.31
866 0.31
867 0.4
868 0.44
869 0.5
870 0.57
871 0.59
872 0.6
873 0.59
874 0.61
875 0.55
876 0.53
877 0.48
878 0.42
879 0.37
880 0.27
881 0.22
882 0.16
883 0.13
884 0.14
885 0.14
886 0.13
887 0.12
888 0.13
889 0.13
890 0.14
891 0.14
892 0.13
893 0.17
894 0.23
895 0.32
896 0.38
897 0.48
898 0.56
899 0.65
900 0.74
901 0.79
902 0.83
903 0.8
904 0.83
905 0.8
906 0.8
907 0.8
908 0.77
909 0.72
910 0.63
911 0.58
912 0.49
913 0.48
914 0.41
915 0.32
916 0.26
917 0.22
918 0.21
919 0.21
920 0.25
921 0.21
922 0.19
923 0.2
924 0.19
925 0.18
926 0.18
927 0.18
928 0.13
929 0.11
930 0.1
931 0.08
932 0.08
933 0.08