Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D0BDN2

Protein Details
Accession A0A0D0BDN2    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-53REAEARKQKLEQEKKEKEREAMBasic
56-82LRHFEEQKKEEERKKKREEERKALEAABasic
95-116LYGPPKKSSSNKPRQQKVPVAAHydrophilic
330-357MSSAKKRARSPSRSESPRPKRRAVSRSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-91RKRREAEARKQKLEQEKKEKEREAMLRLRHFEEQKKEEERKKKREEERKALEAAVERRKAAER
248-250KEK
290-352SKPAVMSKPIPKMSVRPNEKKLATSKPKAASATSSRPSSSMSSAKKRARSPSRSESPRPKRRA
430-443RHEEEKRRRKMMRG
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSSFAALMAISATQTKASENQAQAILVERKRREAEARKQKLEQEKKEKEREAMLRLRHFEEQKKEEERKKKREEERKALEAAVERRKAAERDALLYGPPKKSSSNKPRQQKVPVAADEEEDLGSRSEPLTREELRERKLQAQLRRQFTSAKRSTTTGGYQKHGRQLPGGAVDVTTNGPLGASSSSSGNQSVKARLAALPNTLTKLNTVKRDTRTIDEILQDRAREKEMKTLDGDEALAFDDWFGSKKKEKSRPGSVAPASGENTPKSVPGSRVAGTPPIPSATKKPSTASKPAVMSKPIPKMSVRPNEKKLATSKPKAASATSSRPSSSMSSAKKRARSPSRSESPRPKRRAVSRSSEELDDDLDDDGVVDMKGLIWGLMGKKRSDYVNRDVFSDDEDMEADASALEREEKRSARFAKQEDLAAQEAERRHEEEKRRRKMMRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.11
3 0.15
4 0.2
5 0.28
6 0.28
7 0.32
8 0.32
9 0.31
10 0.3
11 0.33
12 0.35
13 0.31
14 0.38
15 0.36
16 0.41
17 0.44
18 0.48
19 0.51
20 0.54
21 0.61
22 0.64
23 0.72
24 0.72
25 0.73
26 0.76
27 0.77
28 0.78
29 0.77
30 0.77
31 0.78
32 0.81
33 0.86
34 0.83
35 0.76
36 0.74
37 0.7
38 0.67
39 0.64
40 0.62
41 0.6
42 0.59
43 0.59
44 0.57
45 0.56
46 0.56
47 0.58
48 0.55
49 0.56
50 0.61
51 0.66
52 0.68
53 0.73
54 0.76
55 0.77
56 0.83
57 0.85
58 0.87
59 0.89
60 0.9
61 0.9
62 0.88
63 0.83
64 0.74
65 0.65
66 0.57
67 0.52
68 0.49
69 0.47
70 0.4
71 0.35
72 0.35
73 0.39
74 0.37
75 0.34
76 0.34
77 0.27
78 0.28
79 0.3
80 0.28
81 0.25
82 0.3
83 0.31
84 0.27
85 0.27
86 0.26
87 0.28
88 0.34
89 0.44
90 0.5
91 0.56
92 0.63
93 0.71
94 0.78
95 0.81
96 0.83
97 0.8
98 0.76
99 0.74
100 0.67
101 0.61
102 0.53
103 0.46
104 0.38
105 0.3
106 0.23
107 0.14
108 0.12
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.07
113 0.09
114 0.1
115 0.13
116 0.18
117 0.19
118 0.24
119 0.32
120 0.38
121 0.38
122 0.43
123 0.43
124 0.43
125 0.49
126 0.51
127 0.51
128 0.56
129 0.61
130 0.61
131 0.61
132 0.56
133 0.56
134 0.53
135 0.55
136 0.5
137 0.46
138 0.41
139 0.4
140 0.41
141 0.38
142 0.39
143 0.36
144 0.34
145 0.34
146 0.38
147 0.4
148 0.45
149 0.44
150 0.39
151 0.33
152 0.31
153 0.3
154 0.26
155 0.24
156 0.16
157 0.13
158 0.12
159 0.12
160 0.1
161 0.08
162 0.06
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.07
172 0.08
173 0.1
174 0.09
175 0.12
176 0.14
177 0.15
178 0.15
179 0.15
180 0.15
181 0.16
182 0.18
183 0.16
184 0.16
185 0.16
186 0.15
187 0.16
188 0.16
189 0.14
190 0.13
191 0.17
192 0.19
193 0.24
194 0.27
195 0.32
196 0.34
197 0.4
198 0.41
199 0.38
200 0.38
201 0.34
202 0.32
203 0.29
204 0.27
205 0.24
206 0.23
207 0.2
208 0.18
209 0.17
210 0.17
211 0.17
212 0.16
213 0.2
214 0.2
215 0.22
216 0.22
217 0.23
218 0.21
219 0.18
220 0.18
221 0.1
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.06
230 0.07
231 0.09
232 0.15
233 0.21
234 0.31
235 0.4
236 0.49
237 0.55
238 0.64
239 0.67
240 0.66
241 0.68
242 0.59
243 0.52
244 0.45
245 0.38
246 0.3
247 0.26
248 0.24
249 0.16
250 0.17
251 0.14
252 0.14
253 0.14
254 0.15
255 0.15
256 0.16
257 0.19
258 0.18
259 0.2
260 0.2
261 0.21
262 0.2
263 0.19
264 0.16
265 0.15
266 0.15
267 0.15
268 0.19
269 0.23
270 0.27
271 0.27
272 0.29
273 0.35
274 0.4
275 0.46
276 0.46
277 0.43
278 0.43
279 0.46
280 0.46
281 0.42
282 0.4
283 0.39
284 0.42
285 0.39
286 0.37
287 0.34
288 0.37
289 0.43
290 0.49
291 0.52
292 0.52
293 0.56
294 0.62
295 0.62
296 0.6
297 0.56
298 0.57
299 0.57
300 0.54
301 0.56
302 0.53
303 0.56
304 0.53
305 0.48
306 0.44
307 0.42
308 0.44
309 0.41
310 0.39
311 0.35
312 0.34
313 0.36
314 0.32
315 0.3
316 0.3
317 0.33
318 0.39
319 0.48
320 0.54
321 0.58
322 0.61
323 0.67
324 0.69
325 0.7
326 0.71
327 0.72
328 0.76
329 0.77
330 0.81
331 0.82
332 0.82
333 0.84
334 0.82
335 0.79
336 0.78
337 0.8
338 0.81
339 0.77
340 0.76
341 0.72
342 0.72
343 0.68
344 0.6
345 0.51
346 0.42
347 0.35
348 0.25
349 0.2
350 0.13
351 0.1
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.05
358 0.04
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.07
365 0.11
366 0.16
367 0.19
368 0.19
369 0.21
370 0.24
371 0.31
372 0.37
373 0.4
374 0.44
375 0.51
376 0.51
377 0.51
378 0.49
379 0.43
380 0.37
381 0.33
382 0.24
383 0.15
384 0.15
385 0.14
386 0.12
387 0.12
388 0.09
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.1
394 0.11
395 0.15
396 0.22
397 0.26
398 0.29
399 0.38
400 0.44
401 0.48
402 0.55
403 0.56
404 0.57
405 0.57
406 0.57
407 0.5
408 0.49
409 0.42
410 0.34
411 0.3
412 0.27
413 0.26
414 0.26
415 0.27
416 0.26
417 0.28
418 0.36
419 0.47
420 0.53
421 0.62
422 0.68
423 0.74