FuNGI

A0A0D0BZK7

Protein Details

Accession

A0A0D0BZK7

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-44	NITVPPAASKSKKKDREKEKKEKAASHLER	Hydrophilic
355-375	GAGVERKSRREREREREREAA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
23-41	SKSKKKDREKEKKEKAASH
207-279	REKPAMKEKVAIMRNAAHDAARKEEAAKKKGGKAASEAIPPAASGKKAPGKKAASGPASGTKSSGPPAKSSKA
360-383	RKSRREREREREREAAAMGKEKEK
410-423	SPNRERGHPNSRRK
504-529	FRGGRRGRGRGGRGGGGPAAGIARPG

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto_nucl 10, mito 9, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MASTTTTSATISPTNITVPPAASKSKKKDREKEKKEKAASHLERLKTVVRKLPPNLPEEIFWQSVQTWVTEQTVTWKAYYPGKLRNSPNKENVPSRAYIAFKNEEQLALFSREYDGHLFRDKAGNESQAVVEFAPYQKVPQDKKKPDARTGTIEKDENYISFIESLAAATNPEPVSIETLIASTQPVPQPKTTPLLEALKAEKTAAREKPAMKEKVAIMRNAAHDAARKEEAAKKKGGKAASEAIPPAASGKKAPGKKAASGPASGTKSSGPPAKSSKAAARQASSSQAPAKLLANPPAPSASLSAAAPAAPASTTTYSEIPSQAEPSTPTTPASRRSRPIIGLASRQFEAALNGAGVERKSRREREREREREAAAMGKEKEKAPGGATTNVAAGSTSTSTSNPSRPARSPNRERGHPNSRRKNSVGAGAAGAAPANPPKILQRPSTAPGTEGSTPVVPPMILQRGPGAGVGDEPNGSGTGSASASTNMSSEGGVGGSVGGPGFRGGRRGRGRGGRGGGGPAAGIARPG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.19
3	0.2
4	0.19
5	0.18
6	0.21
7	0.23
8	0.29
9	0.34
10	0.42
11	0.51
12	0.6
13	0.69
14	0.76
15	0.82
16	0.86
17	0.91
18	0.92
19	0.93
20	0.93
21	0.94
22	0.91
23	0.88
24	0.84
25	0.84
26	0.78
27	0.77
28	0.74
29	0.66
30	0.59
31	0.54
32	0.55
33	0.49
34	0.49
35	0.46
36	0.46
37	0.52
38	0.55
39	0.61
40	0.59
41	0.56
42	0.55
43	0.49
44	0.44
45	0.39
46	0.4
47	0.32
48	0.27
49	0.25
50	0.2
51	0.22
52	0.21
53	0.18
54	0.14
55	0.14
56	0.16
57	0.15
58	0.15
59	0.19
60	0.24
61	0.24
62	0.23
63	0.24
64	0.25
65	0.31
66	0.39
67	0.37
68	0.41
69	0.47
70	0.55
71	0.61
72	0.69
73	0.71
74	0.72
75	0.75
76	0.75
77	0.74
78	0.72
79	0.69
80	0.62
81	0.54
82	0.49
83	0.45
84	0.38
85	0.34
86	0.34
87	0.33
88	0.29
89	0.31
90	0.28
91	0.24
92	0.23
93	0.22
94	0.19
95	0.18
96	0.18
97	0.15
98	0.16
99	0.16
100	0.17
101	0.19
102	0.18
103	0.18
104	0.23
105	0.23
106	0.23
107	0.29
108	0.27
109	0.27
110	0.28
111	0.27
112	0.23
113	0.24
114	0.23
115	0.17
116	0.18
117	0.14
118	0.11
119	0.1
120	0.1
121	0.11
122	0.11
123	0.11
124	0.14
125	0.22
126	0.27
127	0.37
128	0.47
129	0.52
130	0.61
131	0.69
132	0.72
133	0.73
134	0.75
135	0.69
136	0.66
137	0.65
138	0.62
139	0.57
140	0.51
141	0.44
142	0.38
143	0.34
144	0.26
145	0.21
146	0.16
147	0.12
148	0.11
149	0.1
150	0.08
151	0.07
152	0.07
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.09
158	0.09
159	0.09
160	0.1
161	0.09
162	0.12
163	0.12
164	0.12
165	0.08
166	0.09
167	0.09
168	0.08
169	0.08
170	0.06
171	0.09
172	0.12
173	0.16
174	0.18
175	0.19
176	0.22
177	0.24
178	0.28
179	0.26
180	0.24
181	0.25
182	0.26
183	0.26
184	0.25
185	0.25
186	0.21
187	0.21
188	0.19
189	0.17
190	0.16
191	0.22
192	0.23
193	0.25
194	0.28
195	0.3
196	0.38
197	0.45
198	0.44
199	0.38
200	0.39
201	0.37
202	0.41
203	0.41
204	0.33
205	0.26
206	0.27
207	0.28
208	0.26
209	0.24
210	0.16
211	0.17
212	0.18
213	0.19
214	0.16
215	0.15
216	0.16
217	0.22
218	0.28
219	0.28
220	0.32
221	0.32
222	0.36
223	0.39
224	0.39
225	0.34
226	0.31
227	0.32
228	0.3
229	0.28
230	0.23
231	0.19
232	0.18
233	0.16
234	0.14
235	0.1
236	0.08
237	0.07
238	0.11
239	0.18
240	0.2
241	0.22
242	0.29
243	0.3
244	0.33
245	0.38
246	0.39
247	0.35
248	0.33
249	0.32
250	0.3
251	0.3
252	0.26
253	0.22
254	0.17
255	0.16
256	0.18
257	0.21
258	0.15
259	0.17
260	0.22
261	0.23
262	0.24
263	0.25
264	0.28
265	0.32
266	0.37
267	0.35
268	0.32
269	0.31
270	0.31
271	0.32
272	0.27
273	0.21
274	0.17
275	0.17
276	0.16
277	0.15
278	0.15
279	0.15
280	0.17
281	0.2
282	0.2
283	0.2
284	0.2
285	0.2
286	0.19
287	0.16
288	0.15
289	0.11
290	0.1
291	0.09
292	0.09
293	0.08
294	0.08
295	0.07
296	0.05
297	0.05
298	0.03
299	0.04
300	0.06
301	0.07
302	0.08
303	0.1
304	0.11
305	0.12
306	0.13
307	0.14
308	0.13
309	0.12
310	0.13
311	0.12
312	0.12
313	0.12
314	0.16
315	0.17
316	0.16
317	0.17
318	0.19
319	0.21
320	0.29
321	0.35
322	0.36
323	0.38
324	0.43
325	0.45
326	0.43
327	0.45
328	0.43
329	0.38
330	0.4
331	0.38
332	0.36
333	0.32
334	0.31
335	0.26
336	0.2
337	0.18
338	0.12
339	0.09
340	0.07
341	0.07
342	0.07
343	0.08
344	0.07
345	0.11
346	0.12
347	0.19
348	0.26
349	0.35
350	0.43
351	0.53
352	0.63
353	0.69
354	0.79
355	0.8
356	0.8
357	0.77
358	0.7
359	0.62
360	0.53
361	0.47
362	0.36
363	0.34
364	0.29
365	0.25
366	0.27
367	0.25
368	0.27
369	0.24
370	0.24
371	0.19
372	0.24
373	0.24
374	0.25
375	0.25
376	0.22
377	0.21
378	0.2
379	0.18
380	0.12
381	0.09
382	0.08
383	0.08
384	0.08
385	0.08
386	0.09
387	0.13
388	0.16
389	0.2
390	0.25
391	0.29
392	0.34
393	0.37
394	0.47
395	0.54
396	0.61
397	0.67
398	0.7
399	0.73
400	0.74
401	0.78
402	0.77
403	0.77
404	0.77
405	0.78
406	0.79
407	0.78
408	0.79
409	0.75
410	0.73
411	0.64
412	0.62
413	0.53
414	0.43
415	0.36
416	0.3
417	0.27
418	0.2
419	0.17
420	0.09
421	0.07
422	0.08
423	0.08
424	0.08
425	0.08
426	0.14
427	0.22
428	0.27
429	0.29
430	0.34
431	0.38
432	0.42
433	0.47
434	0.42
435	0.35
436	0.32
437	0.33
438	0.29
439	0.24
440	0.23
441	0.18
442	0.17
443	0.17
444	0.16
445	0.11
446	0.1
447	0.16
448	0.2
449	0.19
450	0.2
451	0.21
452	0.21
453	0.22
454	0.22
455	0.17
456	0.1
457	0.12
458	0.13
459	0.12
460	0.12
461	0.11
462	0.11
463	0.1
464	0.1
465	0.08
466	0.07
467	0.08
468	0.09
469	0.09
470	0.09
471	0.1
472	0.1
473	0.11
474	0.1
475	0.09
476	0.09
477	0.09
478	0.08
479	0.08
480	0.07
481	0.07
482	0.06
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.04
488	0.05
489	0.06
490	0.09
491	0.1
492	0.17
493	0.19
494	0.3
495	0.38
496	0.44
497	0.51
498	0.58
499	0.63
500	0.64
501	0.67
502	0.61
503	0.55
504	0.52
505	0.44
506	0.35
507	0.29
508	0.21
509	0.17

A0A0D0BZK7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer