Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D0CHG3

Protein Details
Accession A0A0D0CHG3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
360-386PIKQESYRRTRRSSSSRRRGGRSPSTGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
368-381RTRRSSSSRRRGGR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13.333, cyto 7.5, cyto_mito 5.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018618  Vacuolar_import/degrad_Vid24  
Pfam View protein in Pfam  
PF09783  Vac_ImportDeg  
Amino Acid Sequences MPSEYTVIPEESPLDIVPQVKLCSQCHCAVDANIVFLPDAGSLVTCAGCQNQFPAFTTPQRPAASPDSFPTSIAPDYTLSTPISPARRNLYDHVKVELDSSIPLLSDPTSNDFLCCNPVDASPSYTSKPAVINITHAPPRVTTLSTGYSDVRGKSFIAPSPLTDITRLRVRSQGNHCLYPGAVFQGTQKSGRSSYDVNVTIVDVDFANSSLCGYLRIRGLTEDWPDLTTYFDAEIIGSRYGFLTENWGANEQQDLVHWQRFPAFKHVKNEMKKPHLTISDRDRGAVFMRWKEKFLVPDHRVQDICGASFAGFYYVCVDFNPSHNSKSCEVMPLTEETGELAGDGSEVPVHEEPTASSPLPIKQESYRRTRRSSSSRRRGGRSPSTGPRQGAPVASMSGFYFHQNSEPYQQLSLSHIPERATSSFEFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.15
4 0.17
5 0.18
6 0.19
7 0.22
8 0.27
9 0.27
10 0.31
11 0.35
12 0.37
13 0.35
14 0.36
15 0.35
16 0.31
17 0.37
18 0.32
19 0.3
20 0.25
21 0.24
22 0.21
23 0.18
24 0.17
25 0.09
26 0.09
27 0.06
28 0.06
29 0.06
30 0.07
31 0.07
32 0.06
33 0.07
34 0.1
35 0.11
36 0.11
37 0.14
38 0.16
39 0.17
40 0.2
41 0.25
42 0.27
43 0.32
44 0.36
45 0.37
46 0.41
47 0.41
48 0.39
49 0.39
50 0.42
51 0.4
52 0.37
53 0.36
54 0.36
55 0.35
56 0.34
57 0.3
58 0.26
59 0.23
60 0.21
61 0.2
62 0.14
63 0.16
64 0.17
65 0.17
66 0.15
67 0.14
68 0.16
69 0.2
70 0.25
71 0.25
72 0.28
73 0.32
74 0.35
75 0.38
76 0.42
77 0.47
78 0.48
79 0.47
80 0.47
81 0.41
82 0.37
83 0.35
84 0.3
85 0.21
86 0.13
87 0.12
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.09
95 0.13
96 0.16
97 0.16
98 0.17
99 0.16
100 0.16
101 0.19
102 0.18
103 0.15
104 0.13
105 0.14
106 0.17
107 0.17
108 0.2
109 0.2
110 0.22
111 0.21
112 0.21
113 0.21
114 0.2
115 0.2
116 0.19
117 0.19
118 0.17
119 0.2
120 0.21
121 0.26
122 0.26
123 0.25
124 0.24
125 0.2
126 0.23
127 0.21
128 0.19
129 0.16
130 0.16
131 0.18
132 0.19
133 0.21
134 0.18
135 0.19
136 0.2
137 0.2
138 0.17
139 0.15
140 0.15
141 0.16
142 0.18
143 0.17
144 0.2
145 0.19
146 0.19
147 0.23
148 0.23
149 0.21
150 0.2
151 0.19
152 0.18
153 0.23
154 0.24
155 0.2
156 0.25
157 0.26
158 0.33
159 0.39
160 0.46
161 0.43
162 0.43
163 0.42
164 0.37
165 0.35
166 0.27
167 0.21
168 0.12
169 0.09
170 0.08
171 0.09
172 0.13
173 0.14
174 0.14
175 0.15
176 0.15
177 0.16
178 0.17
179 0.18
180 0.15
181 0.16
182 0.21
183 0.21
184 0.2
185 0.18
186 0.17
187 0.15
188 0.13
189 0.12
190 0.05
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.06
200 0.06
201 0.08
202 0.1
203 0.1
204 0.11
205 0.11
206 0.13
207 0.14
208 0.16
209 0.14
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.13
214 0.12
215 0.09
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.08
229 0.07
230 0.11
231 0.12
232 0.13
233 0.14
234 0.15
235 0.14
236 0.14
237 0.15
238 0.09
239 0.08
240 0.07
241 0.1
242 0.12
243 0.15
244 0.15
245 0.14
246 0.19
247 0.21
248 0.23
249 0.3
250 0.34
251 0.36
252 0.42
253 0.5
254 0.54
255 0.57
256 0.63
257 0.62
258 0.61
259 0.59
260 0.56
261 0.53
262 0.52
263 0.5
264 0.47
265 0.47
266 0.48
267 0.46
268 0.44
269 0.38
270 0.32
271 0.31
272 0.31
273 0.26
274 0.24
275 0.31
276 0.32
277 0.33
278 0.35
279 0.36
280 0.35
281 0.37
282 0.42
283 0.38
284 0.45
285 0.46
286 0.47
287 0.44
288 0.39
289 0.38
290 0.28
291 0.26
292 0.18
293 0.16
294 0.12
295 0.12
296 0.12
297 0.08
298 0.07
299 0.06
300 0.09
301 0.09
302 0.1
303 0.09
304 0.13
305 0.12
306 0.16
307 0.23
308 0.22
309 0.25
310 0.28
311 0.32
312 0.3
313 0.33
314 0.31
315 0.29
316 0.28
317 0.26
318 0.25
319 0.23
320 0.23
321 0.19
322 0.17
323 0.12
324 0.12
325 0.1
326 0.08
327 0.06
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.05
334 0.08
335 0.09
336 0.1
337 0.1
338 0.11
339 0.12
340 0.15
341 0.18
342 0.15
343 0.16
344 0.17
345 0.21
346 0.26
347 0.26
348 0.25
349 0.29
350 0.39
351 0.44
352 0.52
353 0.59
354 0.61
355 0.67
356 0.7
357 0.73
358 0.74
359 0.79
360 0.8
361 0.81
362 0.84
363 0.85
364 0.84
365 0.83
366 0.81
367 0.8
368 0.77
369 0.75
370 0.75
371 0.76
372 0.75
373 0.69
374 0.61
375 0.55
376 0.49
377 0.42
378 0.34
379 0.27
380 0.22
381 0.2
382 0.19
383 0.15
384 0.15
385 0.14
386 0.15
387 0.15
388 0.14
389 0.18
390 0.2
391 0.23
392 0.26
393 0.31
394 0.3
395 0.29
396 0.3
397 0.27
398 0.31
399 0.33
400 0.31
401 0.3
402 0.3
403 0.3
404 0.32
405 0.36
406 0.31
407 0.29