Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D0CHN6

Protein Details
Accession A0A0D0CHN6    Localization Confidence Low Confidence Score 8.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-41SPSPAPRRSARIPRNNVQPTSPPRRLRVPNTNSRLSTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 9, cyto_nucl 8, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007187  Nucleoporin_Nup133/Nup155_C  
IPR014908  Nucleoporin_Nup133/Nup155_N  
IPR037624  Nup133-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005643  C:nuclear pore  
GO:0017056  F:structural constituent of nuclear pore  
Pfam View protein in Pfam  
PF03177  Nucleoporin_C  
PF08801  Nucleoporin_N  
Amino Acid Sequences MATFSPSPAPRRSARIPRNNVQPTSPPRRLRVPNTNSRLSTPNRNTDAGSVASMMDIDDRGSSVGSERSHIKSGIEHVFAKSDQLTVSFYANLPLEVSQILRNADFYRDAYSGEIDTLTGFALVASMKTCFVWQHALAVKGIPTCYIFTCPYDYNQTNPPFHSLVPWGSGREPGLILISTAGEVRFWDSVGIGLAGGDRYSTIHLGLASEDIVTGLKRIDTQIYVVSTASGSLFKLILTSTGGKYHLTSHPFSKPSTSLSLSRLIPFFSSSSTVTTQIVFEPGNISSVALGAQTVEGGREIWVLINSRVQRWEMKLEGWEEALQDHDIAELVRTAIRKTFGDAVEKDDARLDLELVDLAVDNANKLIILVSYAGLEEVDMMAMDMTGIRRIYTLVQLSPSGDSFKVDAVRGVPYQSTSSSGAPMHPRIQILPDGLLVSIQFGDAVALCARGSDYQERLELKSATDRTLGVGVMQQDSVVLVLTAATMMKVNIDVDSVLTFDPESGRANLIKSIMTQAILYGSLPNNPLHFSFPPDVDEESLMQAAEQLSLAILQSDPELVRGNQDLSSQLRIRKERLAWLIQFINENTALIKMSQRCRQRLATDAEKLEAAYELWVIHNELLATGPTHSVLNDAVFAHMNEFGDTSHEDFMRAFFKSHVNNLGILIEKIPDITLNAAQQTGRNIGDLLPEANRILLTVLTAAFRHREQNIITYGIDLPMINAWTSTSFIADGITALFETTTRVAAPGAESYNQLPELAEVLFACISQRLEGLAINAGAEASGVERDLHGLRTKFDVLRPEVLETLRKSGHPQAAFSLAEKYQDFSSLAALCHRETIYPPVDNPNFARIQGYIERFKEQFTTKLYEWYIQHGEVRTLFAQGESYSAYMDSFFEKNPATSISWIHDLGKKRYEAAAKALLVESQHAASLEVKHLQLSIGKLANLAHMRKSDGTAENSLHDAFHDALDLVGVHEALIDEFNGVIANIRGRRSLDSQVDTIVKEKASGLAEKPEHTLIFKNLVKDLLQGKVLSIEDTVDVLTLKDNLDTVGDYATALHLLSRCNLPETRKHSAFRTVWRRIYLHDDWKAIQKTVGVGDAELSQRFRETALYFTLLDILSRENQDEPEGYETDPDVALIVPSLEEIASRWPGIPQDQVERVQEDYNLECDRLGELDLEEAYPRVRELAEMELMQGSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.71
3 0.75
4 0.78
5 0.85
6 0.85
7 0.78
8 0.71
9 0.7
10 0.69
11 0.7
12 0.71
13 0.66
14 0.63
15 0.7
16 0.74
17 0.75
18 0.76
19 0.75
20 0.77
21 0.78
22 0.81
23 0.73
24 0.68
25 0.65
26 0.6
27 0.62
28 0.59
29 0.61
30 0.58
31 0.57
32 0.55
33 0.5
34 0.48
35 0.38
36 0.31
37 0.22
38 0.17
39 0.15
40 0.14
41 0.11
42 0.09
43 0.08
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.14
52 0.14
53 0.17
54 0.22
55 0.26
56 0.29
57 0.29
58 0.28
59 0.26
60 0.33
61 0.36
62 0.35
63 0.33
64 0.31
65 0.33
66 0.32
67 0.31
68 0.25
69 0.2
70 0.16
71 0.16
72 0.17
73 0.15
74 0.17
75 0.16
76 0.15
77 0.17
78 0.17
79 0.16
80 0.15
81 0.14
82 0.13
83 0.12
84 0.14
85 0.12
86 0.15
87 0.16
88 0.15
89 0.17
90 0.18
91 0.2
92 0.21
93 0.2
94 0.21
95 0.2
96 0.21
97 0.2
98 0.2
99 0.18
100 0.16
101 0.15
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.08
106 0.06
107 0.05
108 0.04
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.09
117 0.09
118 0.12
119 0.17
120 0.17
121 0.24
122 0.27
123 0.28
124 0.28
125 0.28
126 0.27
127 0.24
128 0.23
129 0.17
130 0.15
131 0.15
132 0.16
133 0.19
134 0.19
135 0.19
136 0.24
137 0.24
138 0.26
139 0.33
140 0.33
141 0.32
142 0.39
143 0.43
144 0.42
145 0.42
146 0.43
147 0.36
148 0.35
149 0.35
150 0.3
151 0.25
152 0.26
153 0.26
154 0.23
155 0.22
156 0.25
157 0.22
158 0.2
159 0.19
160 0.15
161 0.15
162 0.13
163 0.12
164 0.1
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.06
170 0.07
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.09
206 0.11
207 0.12
208 0.13
209 0.16
210 0.17
211 0.17
212 0.16
213 0.15
214 0.13
215 0.12
216 0.11
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.1
226 0.13
227 0.13
228 0.15
229 0.16
230 0.16
231 0.17
232 0.21
233 0.24
234 0.25
235 0.27
236 0.29
237 0.35
238 0.37
239 0.37
240 0.36
241 0.32
242 0.32
243 0.35
244 0.33
245 0.29
246 0.3
247 0.35
248 0.32
249 0.33
250 0.3
251 0.25
252 0.22
253 0.21
254 0.19
255 0.15
256 0.16
257 0.14
258 0.17
259 0.18
260 0.19
261 0.17
262 0.17
263 0.16
264 0.14
265 0.16
266 0.12
267 0.11
268 0.11
269 0.1
270 0.11
271 0.1
272 0.1
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.05
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.08
290 0.1
291 0.11
292 0.16
293 0.17
294 0.19
295 0.2
296 0.21
297 0.23
298 0.25
299 0.29
300 0.25
301 0.25
302 0.27
303 0.26
304 0.25
305 0.23
306 0.2
307 0.15
308 0.13
309 0.13
310 0.1
311 0.09
312 0.08
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.07
320 0.08
321 0.08
322 0.11
323 0.13
324 0.13
325 0.16
326 0.21
327 0.21
328 0.27
329 0.27
330 0.3
331 0.34
332 0.33
333 0.31
334 0.26
335 0.24
336 0.19
337 0.19
338 0.13
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.05
343 0.05
344 0.04
345 0.04
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.03
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.04
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.09
379 0.12
380 0.14
381 0.13
382 0.14
383 0.15
384 0.16
385 0.16
386 0.15
387 0.13
388 0.11
389 0.11
390 0.1
391 0.12
392 0.13
393 0.12
394 0.12
395 0.11
396 0.14
397 0.14
398 0.14
399 0.12
400 0.12
401 0.13
402 0.12
403 0.14
404 0.14
405 0.14
406 0.15
407 0.15
408 0.17
409 0.19
410 0.22
411 0.22
412 0.21
413 0.21
414 0.19
415 0.21
416 0.2
417 0.17
418 0.15
419 0.13
420 0.11
421 0.11
422 0.1
423 0.08
424 0.06
425 0.05
426 0.04
427 0.04
428 0.03
429 0.03
430 0.03
431 0.05
432 0.04
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.06
437 0.06
438 0.09
439 0.11
440 0.13
441 0.14
442 0.17
443 0.19
444 0.19
445 0.22
446 0.2
447 0.17
448 0.22
449 0.22
450 0.2
451 0.2
452 0.19
453 0.16
454 0.17
455 0.16
456 0.09
457 0.1
458 0.1
459 0.1
460 0.09
461 0.08
462 0.07
463 0.07
464 0.06
465 0.04
466 0.03
467 0.02
468 0.02
469 0.02
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.04
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.06
490 0.07
491 0.07
492 0.09
493 0.1
494 0.1
495 0.11
496 0.12
497 0.11
498 0.1
499 0.11
500 0.1
501 0.1
502 0.09
503 0.08
504 0.08
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.08
510 0.1
511 0.1
512 0.1
513 0.11
514 0.12
515 0.13
516 0.14
517 0.16
518 0.16
519 0.16
520 0.17
521 0.18
522 0.17
523 0.14
524 0.14
525 0.11
526 0.1
527 0.1
528 0.08
529 0.06
530 0.07
531 0.06
532 0.05
533 0.05
534 0.04
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.03
539 0.03
540 0.03
541 0.03
542 0.04
543 0.04
544 0.05
545 0.07
546 0.06
547 0.08
548 0.08
549 0.09
550 0.09
551 0.1
552 0.11
553 0.11
554 0.15
555 0.16
556 0.19
557 0.23
558 0.24
559 0.27
560 0.3
561 0.29
562 0.31
563 0.34
564 0.35
565 0.3
566 0.31
567 0.29
568 0.25
569 0.25
570 0.19
571 0.16
572 0.11
573 0.11
574 0.08
575 0.07
576 0.07
577 0.06
578 0.09
579 0.12
580 0.17
581 0.23
582 0.28
583 0.3
584 0.34
585 0.37
586 0.36
587 0.38
588 0.4
589 0.39
590 0.37
591 0.36
592 0.32
593 0.29
594 0.27
595 0.2
596 0.14
597 0.09
598 0.05
599 0.05
600 0.04
601 0.04
602 0.05
603 0.05
604 0.05
605 0.05
606 0.05
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.05
611 0.05
612 0.05
613 0.05
614 0.05
615 0.05
616 0.06
617 0.06
618 0.06
619 0.06
620 0.06
621 0.06
622 0.07
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.06
628 0.07
629 0.06
630 0.07
631 0.08
632 0.08
633 0.09
634 0.09
635 0.09
636 0.09
637 0.1
638 0.11
639 0.11
640 0.1
641 0.1
642 0.14
643 0.16
644 0.18
645 0.21
646 0.19
647 0.19
648 0.19
649 0.18
650 0.15
651 0.13
652 0.11
653 0.07
654 0.06
655 0.06
656 0.06
657 0.05
658 0.04
659 0.06
660 0.07
661 0.07
662 0.07
663 0.08
664 0.08
665 0.09
666 0.1
667 0.11
668 0.1
669 0.1
670 0.1
671 0.09
672 0.11
673 0.1
674 0.1
675 0.08
676 0.08
677 0.08
678 0.08
679 0.07
680 0.06
681 0.06
682 0.05
683 0.04
684 0.04
685 0.05
686 0.05
687 0.06
688 0.06
689 0.08
690 0.09
691 0.12
692 0.11
693 0.14
694 0.14
695 0.18
696 0.19
697 0.19
698 0.19
699 0.17
700 0.17
701 0.14
702 0.13
703 0.09
704 0.08
705 0.06
706 0.07
707 0.05
708 0.05
709 0.05
710 0.05
711 0.07
712 0.07
713 0.06
714 0.06
715 0.06
716 0.06
717 0.06
718 0.05
719 0.04
720 0.04
721 0.04
722 0.03
723 0.03
724 0.03
725 0.05
726 0.05
727 0.05
728 0.05
729 0.06
730 0.06
731 0.06
732 0.07
733 0.08
734 0.09
735 0.09
736 0.1
737 0.11
738 0.12
739 0.12
740 0.11
741 0.09
742 0.08
743 0.08
744 0.07
745 0.07
746 0.05
747 0.06
748 0.06
749 0.06
750 0.06
751 0.06
752 0.06
753 0.06
754 0.06
755 0.06
756 0.06
757 0.07
758 0.08
759 0.07
760 0.07
761 0.06
762 0.06
763 0.06
764 0.05
765 0.04
766 0.04
767 0.03
768 0.03
769 0.04
770 0.04
771 0.04
772 0.06
773 0.07
774 0.09
775 0.13
776 0.14
777 0.15
778 0.18
779 0.21
780 0.2
781 0.22
782 0.27
783 0.25
784 0.29
785 0.29
786 0.28
787 0.27
788 0.26
789 0.28
790 0.23
791 0.24
792 0.2
793 0.2
794 0.22
795 0.27
796 0.32
797 0.29
798 0.28
799 0.26
800 0.29
801 0.29
802 0.26
803 0.23
804 0.17
805 0.18
806 0.18
807 0.17
808 0.13
809 0.15
810 0.14
811 0.11
812 0.14
813 0.13
814 0.13
815 0.14
816 0.15
817 0.13
818 0.15
819 0.15
820 0.13
821 0.13
822 0.19
823 0.2
824 0.2
825 0.21
826 0.27
827 0.28
828 0.29
829 0.29
830 0.28
831 0.25
832 0.24
833 0.24
834 0.16
835 0.2
836 0.24
837 0.27
838 0.27
839 0.28
840 0.31
841 0.3
842 0.31
843 0.31
844 0.27
845 0.27
846 0.26
847 0.3
848 0.27
849 0.33
850 0.33
851 0.34
852 0.32
853 0.34
854 0.32
855 0.27
856 0.29
857 0.24
858 0.25
859 0.21
860 0.23
861 0.17
862 0.16
863 0.15
864 0.12
865 0.12
866 0.1
867 0.11
868 0.08
869 0.08
870 0.07
871 0.07
872 0.07
873 0.07
874 0.07
875 0.09
876 0.1
877 0.1
878 0.12
879 0.13
880 0.13
881 0.14
882 0.16
883 0.14
884 0.15
885 0.16
886 0.17
887 0.19
888 0.2
889 0.21
890 0.23
891 0.27
892 0.31
893 0.35
894 0.32
895 0.31
896 0.35
897 0.37
898 0.34
899 0.34
900 0.35
901 0.3
902 0.3
903 0.29
904 0.25
905 0.21
906 0.2
907 0.15
908 0.09
909 0.1
910 0.09
911 0.09
912 0.1
913 0.12
914 0.13
915 0.15
916 0.15
917 0.15
918 0.15
919 0.14
920 0.15
921 0.15
922 0.17
923 0.16
924 0.16
925 0.17
926 0.17
927 0.22
928 0.24
929 0.24
930 0.22
931 0.22
932 0.25
933 0.25
934 0.27
935 0.27
936 0.27
937 0.29
938 0.29
939 0.29
940 0.27
941 0.28
942 0.26
943 0.2
944 0.16
945 0.14
946 0.11
947 0.1
948 0.1
949 0.08
950 0.08
951 0.08
952 0.08
953 0.06
954 0.05
955 0.05
956 0.04
957 0.05
958 0.05
959 0.05
960 0.05
961 0.05
962 0.05
963 0.05
964 0.05
965 0.05
966 0.04
967 0.05
968 0.06
969 0.11
970 0.14
971 0.15
972 0.17
973 0.19
974 0.23
975 0.27
976 0.34
977 0.35
978 0.36
979 0.35
980 0.37
981 0.37
982 0.34
983 0.31
984 0.26
985 0.19
986 0.16
987 0.16
988 0.16
989 0.17
990 0.19
991 0.19
992 0.25
993 0.27
994 0.28
995 0.3
996 0.28
997 0.27
998 0.26
999 0.27
1000 0.22
1001 0.29
1002 0.29
1003 0.29
1004 0.28
1005 0.29
1006 0.28
1007 0.29
1008 0.29
1009 0.23
1010 0.23
1011 0.21
1012 0.2
1013 0.22
1014 0.22
1015 0.18
1016 0.15
1017 0.13
1018 0.11
1019 0.11
1020 0.11
1021 0.07
1022 0.07
1023 0.07
1024 0.07
1025 0.08
1026 0.08
1027 0.08
1028 0.08
1029 0.08
1030 0.09
1031 0.09
1032 0.09
1033 0.08
1034 0.08
1035 0.08
1036 0.08
1037 0.08
1038 0.07
1039 0.06
1040 0.08
1041 0.08
1042 0.1
1043 0.12
1044 0.15
1045 0.16
1046 0.2
1047 0.24
1048 0.26
1049 0.34
1050 0.4
1051 0.48
1052 0.51
1053 0.53
1054 0.52
1055 0.59
1056 0.6
1057 0.62
1058 0.64
1059 0.64
1060 0.63
1061 0.65
1062 0.63
1063 0.56
1064 0.59
1065 0.56
1066 0.55
1067 0.52
1068 0.5
1069 0.46
1070 0.54
1071 0.54
1072 0.46
1073 0.39
1074 0.31
1075 0.28
1076 0.26
1077 0.28
1078 0.19
1079 0.16
1080 0.17
1081 0.19
1082 0.19
1083 0.19
1084 0.18
1085 0.15
1086 0.16
1087 0.16
1088 0.15
1089 0.17
1090 0.16
1091 0.18
1092 0.21
1093 0.23
1094 0.22
1095 0.22
1096 0.24
1097 0.19
1098 0.18
1099 0.15
1100 0.15
1101 0.16
1102 0.17
1103 0.18
1104 0.17
1105 0.18
1106 0.2
1107 0.21
1108 0.21
1109 0.21
1110 0.21
1111 0.2
1112 0.2
1113 0.19
1114 0.18
1115 0.17
1116 0.14
1117 0.1
1118 0.09
1119 0.09
1120 0.07
1121 0.07
1122 0.05
1123 0.05
1124 0.06
1125 0.05
1126 0.05
1127 0.06
1128 0.11
1129 0.13
1130 0.14
1131 0.14
1132 0.16
1133 0.19
1134 0.22
1135 0.27
1136 0.26
1137 0.32
1138 0.36
1139 0.39
1140 0.4
1141 0.39
1142 0.38
1143 0.34
1144 0.32
1145 0.28
1146 0.25
1147 0.26
1148 0.25
1149 0.23
1150 0.21
1151 0.19
1152 0.19
1153 0.16
1154 0.15
1155 0.11
1156 0.1
1157 0.12
1158 0.13
1159 0.13
1160 0.12
1161 0.12
1162 0.12
1163 0.11
1164 0.11
1165 0.1
1166 0.1
1167 0.11
1168 0.13
1169 0.17
1170 0.2
1171 0.2
1172 0.2