FuNGI

A0A0D0CBH5

Protein Details

Accession

A0A0D0CBH5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
273-316	TQDAQEKPKGKRKRDARKQGSGIDSGKRREFKKREPKASVHWPW	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
279-309	KPKGKRKRDARKQGSGIDSGKRREFKKREPK

Subcellular Location(s)

nucl 9.5, mito 9, cyto_nucl 9, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MPTRIASTFHPASSVISSVKCSLLSGELEHLVIAKLNSLQVYSILESKLQLECNLEIRGKVRLVRAIPIKKHSRCNLFVLLDHPDPEVLILSYTESEEPGSGKLNLKHQISLEERGSRPAEFCTDALVHPSGEFAVVSCYAGKLKAISIDDGQVYNLQIFEYNLLSFAFLPLLHEDNYAVALLYLNHDEHIHIVARNLLISSEGGAELDNEISGSFQPTYVPSKYLPSPDESLPQLIPIPADDPFGMSDNDDSFLGGILVVGGTKVLLYELETQDAQEKPKGKRKRDARKQGSGIDSGKRREFKKREPKASVHWPWSRISTWSAIDNPLKKILIGDVFGRLAMLSLTNLENLGLVLVPLGETSPATTISYLTNQVAFVGSHLGDSQVVRISDVPVSSTETPTLPISNTIKTVSPESLNQLDDKGKGPSLDDTDNTNKGCIIATKGSYLNAIQTFKNIAPIRDAVLADLDGSDQAHIVTCSGGGNTGSVNVVRIGTDFEELASIPGPENTTNLWPVRLTYNSSEHSFFIITSLIETHVFQITHPNEVQLADRFHEFILNEQTLHIGTMVVKRNSSYDEDTSLVAQVTPSGAHLFQYDEILQKWTRVHTVLSKTVNLKGNFVAASGNASQLLIAQVHGWMVSYTIQGEADVYKLTVTSNSKLDYSTGFSQQGSSPELISPDAPRDWYNTEISAINCPVLDPAKLFSTFVAAAFWHTNQIKVYQFNSGNMEYLCQSPPLSSPIRSVILNYMTKDSYRIKDRDSHLCVFAGLADGTVVAFEMVYNEDTKLLELKNMNMTSLGHLPVAFTVHEVEGKRVVIAAGSRAVIFSWERSHLRVSPVMLKDITTVRAFNTKSYPNSLILTNASGISIGRVRSLDKMHIRSTSLGLDNPRQIVHEPTYKVFGVTCLRTQPSRIGEDERVASSFKLVDDTNLKVLAQVDFDHNEHVMSSVVINIIVNDQAKPLFCVGTMIFHPEELETTSGRIHLYEAYQPSPSMMQLRRVASENVGGCVYNLAVIEGMLAAAVNSSINLHRVTHEMKDSDSTVPEYSIKKIADWNHNYMVTSISSYDDHLMVADQFSSVSLLKLNGKQKLTTVARDYSPLWPVTVQAFDKETIIGADQALNLFIFSLAQNAGRAILRRDGYFHLGDLVTKFIRGSLASPDAAAGRGLKSTHIFCTLSGQIGVIIDVENEAASSALSDALTLLTSLEDEFPEKVNTMGGISHARYRAPRSSRSRSDADEPAHGILDGDLLEPLLAHMDASPQLVEQIFTANEFAYSLTELKKDLEALQNMH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.2
3	0.18
4	0.21
5	0.21
6	0.22
7	0.2
8	0.18
9	0.17
10	0.18
11	0.18
12	0.17
13	0.19
14	0.18
15	0.18
16	0.18
17	0.17
18	0.13
19	0.14
20	0.12
21	0.1
22	0.11
23	0.12
24	0.13
25	0.13
26	0.13
27	0.12
28	0.15
29	0.15
30	0.17
31	0.16
32	0.16
33	0.17
34	0.19
35	0.21
36	0.2
37	0.19
38	0.2
39	0.21
40	0.25
41	0.28
42	0.26
43	0.25
44	0.25
45	0.29
46	0.29
47	0.31
48	0.31
49	0.34
50	0.35
51	0.41
52	0.49
53	0.53
54	0.56
55	0.61
56	0.67
57	0.67
58	0.75
59	0.75
60	0.74
61	0.69
62	0.7
63	0.69
64	0.61
65	0.56
66	0.49
67	0.47
68	0.4
69	0.36
70	0.3
71	0.22
72	0.19
73	0.18
74	0.16
75	0.1
76	0.09
77	0.08
78	0.09
79	0.09
80	0.11
81	0.11
82	0.1
83	0.1
84	0.1
85	0.11
86	0.11
87	0.14
88	0.15
89	0.21
90	0.25
91	0.31
92	0.38
93	0.39
94	0.4
95	0.38
96	0.43
97	0.42
98	0.44
99	0.42
100	0.42
101	0.41
102	0.44
103	0.44
104	0.37
105	0.34
106	0.3
107	0.29
108	0.25
109	0.24
110	0.23
111	0.23
112	0.22
113	0.25
114	0.23
115	0.19
116	0.16
117	0.17
118	0.12
119	0.11
120	0.11
121	0.07
122	0.09
123	0.09
124	0.1
125	0.09
126	0.1
127	0.11
128	0.11
129	0.12
130	0.1
131	0.11
132	0.16
133	0.18
134	0.19
135	0.2
136	0.22
137	0.23
138	0.22
139	0.21
140	0.17
141	0.16
142	0.14
143	0.13
144	0.1
145	0.09
146	0.09
147	0.1
148	0.1
149	0.1
150	0.1
151	0.1
152	0.1
153	0.1
154	0.1
155	0.09
156	0.07
157	0.09
158	0.11
159	0.13
160	0.13
161	0.14
162	0.13
163	0.13
164	0.14
165	0.12
166	0.09
167	0.07
168	0.06
169	0.06
170	0.08
171	0.1
172	0.09
173	0.1
174	0.1
175	0.11
176	0.11
177	0.13
178	0.13
179	0.12
180	0.12
181	0.15
182	0.15
183	0.15
184	0.14
185	0.11
186	0.1
187	0.1
188	0.1
189	0.08
190	0.08
191	0.07
192	0.07
193	0.08
194	0.07
195	0.07
196	0.06
197	0.05
198	0.05
199	0.06
200	0.06
201	0.08
202	0.08
203	0.08
204	0.09
205	0.11
206	0.17
207	0.18
208	0.2
209	0.18
210	0.23
211	0.26
212	0.31
213	0.3
214	0.3
215	0.32
216	0.32
217	0.35
218	0.32
219	0.31
220	0.25
221	0.25
222	0.21
223	0.17
224	0.16
225	0.12
226	0.12
227	0.1
228	0.11
229	0.1
230	0.1
231	0.11
232	0.12
233	0.12
234	0.11
235	0.12
236	0.11
237	0.12
238	0.11
239	0.1
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.06
244	0.05
245	0.04
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.06
256	0.12
257	0.13
258	0.16
259	0.16
260	0.16
261	0.21
262	0.22
263	0.22
264	0.2
265	0.27
266	0.32
267	0.42
268	0.51
269	0.54
270	0.62
271	0.71
272	0.78
273	0.82
274	0.86
275	0.86
276	0.87
277	0.85
278	0.82
279	0.75
280	0.69
281	0.61
282	0.56
283	0.53
284	0.47
285	0.47
286	0.46
287	0.46
288	0.51
289	0.56
290	0.6
291	0.66
292	0.72
293	0.76
294	0.78
295	0.8
296	0.77
297	0.8
298	0.76
299	0.74
300	0.68
301	0.6
302	0.55
303	0.53
304	0.46
305	0.37
306	0.32
307	0.27
308	0.24
309	0.24
310	0.24
311	0.26
312	0.3
313	0.31
314	0.31
315	0.3
316	0.29
317	0.25
318	0.24
319	0.22
320	0.19
321	0.17
322	0.16
323	0.14
324	0.14
325	0.14
326	0.14
327	0.1
328	0.08
329	0.07
330	0.06
331	0.04
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.07
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.04
341	0.03
342	0.03
343	0.03
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.04
350	0.05
351	0.06
352	0.07
353	0.07
354	0.08
355	0.09
356	0.11
357	0.13
358	0.12
359	0.12
360	0.12
361	0.12
362	0.12
363	0.1
364	0.08
365	0.09
366	0.08
367	0.07
368	0.08
369	0.08
370	0.08
371	0.08
372	0.09
373	0.1
374	0.1
375	0.1
376	0.11
377	0.12
378	0.12
379	0.12
380	0.12
381	0.09
382	0.14
383	0.15
384	0.15
385	0.15
386	0.14
387	0.15
388	0.15
389	0.15
390	0.11
391	0.15
392	0.17
393	0.17
394	0.18
395	0.18
396	0.18
397	0.19
398	0.21
399	0.18
400	0.17
401	0.17
402	0.2
403	0.21
404	0.2
405	0.19
406	0.19
407	0.19
408	0.18
409	0.19
410	0.16
411	0.14
412	0.14
413	0.15
414	0.15
415	0.18
416	0.18
417	0.17
418	0.21
419	0.24
420	0.27
421	0.27
422	0.24
423	0.2
424	0.18
425	0.18
426	0.14
427	0.14
428	0.13
429	0.14
430	0.16
431	0.17
432	0.17
433	0.17
434	0.16
435	0.16
436	0.16
437	0.17
438	0.14
439	0.15
440	0.17
441	0.16
442	0.25
443	0.22
444	0.19
445	0.2
446	0.21
447	0.22
448	0.22
449	0.22
450	0.14
451	0.13
452	0.13
453	0.1
454	0.09
455	0.07
456	0.04
457	0.05
458	0.04
459	0.04
460	0.04
461	0.04
462	0.04
463	0.04
464	0.04
465	0.04
466	0.05
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.05
474	0.05
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.06
479	0.06
480	0.07
481	0.07
482	0.08
483	0.07
484	0.06
485	0.07
486	0.07
487	0.07
488	0.06
489	0.05
490	0.05
491	0.06
492	0.07
493	0.07
494	0.08
495	0.08
496	0.1
497	0.12
498	0.12
499	0.12
500	0.11
501	0.12
502	0.14
503	0.14
504	0.16
505	0.16
506	0.21
507	0.22
508	0.24
509	0.25
510	0.22
511	0.22
512	0.19
513	0.16
514	0.12
515	0.1
516	0.08
517	0.07
518	0.07
519	0.07
520	0.07
521	0.07
522	0.08
523	0.09
524	0.09
525	0.09
526	0.17
527	0.17
528	0.19
529	0.19
530	0.18
531	0.17
532	0.17
533	0.19
534	0.13
535	0.14
536	0.12
537	0.12
538	0.12
539	0.12
540	0.13
541	0.12
542	0.11
543	0.15
544	0.14
545	0.14
546	0.13
547	0.14
548	0.12
549	0.12
550	0.1
551	0.05
552	0.05
553	0.11
554	0.17
555	0.17
556	0.17
557	0.17
558	0.18
559	0.2
560	0.22
561	0.2
562	0.15
563	0.17
564	0.18
565	0.18
566	0.17
567	0.16
568	0.12
569	0.09
570	0.07
571	0.05
572	0.05
573	0.04
574	0.04
575	0.05
576	0.05
577	0.05
578	0.06
579	0.07
580	0.07
581	0.08
582	0.08
583	0.08
584	0.09
585	0.11
586	0.11
587	0.12
588	0.13
589	0.12
590	0.13
591	0.13
592	0.14
593	0.17
594	0.21
595	0.25
596	0.26
597	0.27
598	0.27
599	0.31
600	0.36
601	0.31
602	0.28
603	0.23
604	0.23
605	0.2
606	0.19
607	0.14
608	0.07
609	0.09
610	0.08
611	0.08
612	0.06
613	0.06
614	0.06
615	0.06
616	0.06
617	0.04
618	0.04
619	0.04
620	0.04
621	0.04
622	0.04
623	0.04
624	0.03
625	0.04
626	0.04
627	0.04
628	0.05
629	0.05
630	0.05
631	0.05
632	0.05
633	0.05
634	0.05
635	0.05
636	0.04
637	0.04
638	0.04
639	0.04
640	0.07
641	0.09
642	0.1
643	0.12
644	0.13
645	0.14
646	0.14
647	0.14
648	0.12
649	0.14
650	0.14
651	0.15
652	0.15
653	0.15
654	0.16
655	0.16
656	0.17
657	0.14
658	0.13
659	0.11
660	0.1
661	0.11
662	0.1
663	0.1
664	0.09
665	0.09
666	0.09
667	0.1
668	0.1
669	0.12
670	0.13
671	0.15
672	0.15
673	0.14
674	0.15
675	0.15
676	0.15
677	0.15
678	0.13
679	0.11
680	0.1
681	0.09
682	0.09
683	0.08
684	0.08
685	0.06
686	0.07
687	0.09
688	0.09
689	0.1
690	0.09
691	0.1
692	0.1
693	0.1
694	0.09
695	0.07
696	0.08
697	0.09
698	0.09
699	0.12
700	0.12
701	0.13
702	0.13
703	0.16
704	0.16
705	0.18
706	0.18
707	0.2
708	0.21
709	0.21
710	0.24
711	0.22
712	0.21
713	0.18
714	0.18
715	0.12
716	0.14
717	0.12
718	0.1
719	0.09
720	0.09
721	0.1
722	0.13
723	0.14
724	0.14
725	0.15
726	0.17
727	0.19
728	0.18
729	0.18
730	0.17
731	0.2
732	0.21
733	0.2
734	0.19
735	0.18
736	0.18
737	0.21
738	0.21
739	0.21
740	0.26
741	0.27
742	0.27
743	0.34
744	0.38
745	0.44
746	0.46
747	0.44
748	0.38
749	0.36
750	0.34
751	0.26
752	0.22
753	0.14
754	0.08
755	0.06
756	0.04
757	0.04
758	0.04
759	0.04
760	0.03
761	0.02
762	0.02
763	0.02
764	0.03
765	0.04
766	0.05
767	0.05
768	0.06
769	0.06
770	0.07
771	0.07
772	0.09
773	0.08
774	0.11
775	0.11
776	0.13
777	0.19
778	0.19
779	0.19
780	0.17
781	0.17
782	0.16
783	0.17
784	0.16
785	0.1
786	0.1
787	0.1
788	0.1
789	0.1
790	0.08
791	0.06
792	0.07
793	0.07
794	0.1
795	0.1
796	0.11
797	0.12
798	0.12
799	0.12
800	0.11
801	0.1
802	0.08
803	0.08
804	0.08
805	0.07
806	0.08
807	0.08
808	0.07
809	0.07
810	0.08
811	0.08
812	0.08
813	0.1
814	0.13
815	0.14
816	0.16
817	0.19
818	0.2
819	0.23
820	0.23
821	0.23
822	0.27
823	0.27
824	0.28
825	0.25
826	0.23
827	0.22
828	0.21
829	0.22
830	0.15
831	0.14
832	0.13
833	0.19
834	0.19
835	0.19
836	0.23
837	0.25
838	0.26
839	0.31
840	0.32
841	0.28
842	0.29
843	0.27
844	0.24
845	0.2
846	0.19
847	0.14
848	0.12
849	0.1
850	0.08
851	0.08
852	0.07
853	0.09
854	0.08
855	0.09
856	0.09
857	0.1
858	0.14
859	0.16
860	0.22
861	0.27
862	0.31
863	0.32
864	0.33
865	0.34
866	0.32
867	0.32
868	0.28
869	0.23
870	0.21
871	0.22
872	0.24
873	0.24
874	0.24
875	0.22
876	0.19
877	0.19
878	0.21
879	0.22
880	0.25
881	0.25
882	0.25
883	0.28
884	0.27
885	0.26
886	0.22
887	0.21
888	0.19
889	0.2
890	0.2
891	0.21
892	0.23
893	0.23
894	0.25
895	0.27
896	0.27
897	0.28
898	0.28
899	0.29
900	0.29
901	0.31
902	0.31
903	0.26
904	0.23
905	0.21
906	0.18
907	0.14
908	0.13
909	0.11
910	0.11
911	0.1
912	0.12
913	0.14
914	0.16
915	0.17
916	0.17
917	0.16
918	0.15
919	0.16
920	0.14
921	0.12
922	0.11
923	0.12
924	0.14
925	0.15
926	0.15
927	0.14
928	0.13
929	0.12
930	0.11
931	0.09
932	0.07
933	0.06
934	0.06
935	0.06
936	0.06
937	0.06
938	0.05
939	0.06
940	0.07
941	0.08
942	0.07
943	0.08
944	0.09
945	0.1
946	0.11
947	0.11
948	0.09
949	0.09
950	0.11
951	0.1
952	0.13
953	0.13
954	0.16
955	0.15
956	0.15
957	0.15
958	0.13
959	0.14
960	0.12
961	0.13
962	0.09
963	0.09
964	0.1
965	0.1
966	0.1
967	0.1
968	0.09
969	0.09
970	0.11
971	0.16
972	0.18
973	0.19
974	0.2
975	0.19
976	0.19
977	0.18
978	0.18
979	0.2
980	0.19
981	0.24
982	0.29
983	0.31
984	0.32
985	0.34
986	0.34
987	0.28
988	0.32
989	0.25
990	0.21
991	0.2
992	0.18
993	0.15
994	0.14
995	0.12
996	0.08
997	0.07
998	0.06
999	0.05
1000	0.05
1001	0.05
1002	0.05
1003	0.04
1004	0.03
1005	0.03
1006	0.02
1007	0.02
1008	0.03
1009	0.03
1010	0.03
1011	0.04
1012	0.05
1013	0.07
1014	0.09
1015	0.1
1016	0.11
1017	0.15
1018	0.18
1019	0.2
1020	0.24
1021	0.23
1022	0.23
1023	0.26
1024	0.27
1025	0.24
1026	0.23
1027	0.22
1028	0.18
1029	0.19
1030	0.21
1031	0.2
1032	0.21
1033	0.25
1034	0.23
1035	0.22
1036	0.27
1037	0.33
1038	0.4
1039	0.44
1040	0.47
1041	0.46
1042	0.47
1043	0.46
1044	0.41
1045	0.35
1046	0.25
1047	0.21
1048	0.16
1049	0.12
1050	0.12
1051	0.13
1052	0.14
1053	0.12
1054	0.11
1055	0.1
1056	0.11
1057	0.09
1058	0.09
1059	0.08
1060	0.06
1061	0.06
1062	0.06
1063	0.08
1064	0.07
1065	0.07
1066	0.08
1067	0.1
1068	0.15
1069	0.22
1070	0.28
1071	0.33
1072	0.34
1073	0.35
1074	0.35
1075	0.43
1076	0.43
1077	0.42
1078	0.41
1079	0.38
1080	0.37
1081	0.39
1082	0.4
1083	0.34
1084	0.34
1085	0.28
1086	0.24
1087	0.2
1088	0.21
1089	0.21
1090	0.23
1091	0.2
1092	0.18
1093	0.2
1094	0.19
1095	0.2
1096	0.18
1097	0.16
1098	0.12
1099	0.12
1100	0.1
1101	0.09
1102	0.1
1103	0.09
1104	0.09
1105	0.1
1106	0.09
1107	0.07
1108	0.07
1109	0.06
1110	0.06
1111	0.05
1112	0.07
1113	0.07
1114	0.08
1115	0.09
1116	0.09
1117	0.11
1118	0.12
1119	0.14
1120	0.15
1121	0.21
1122	0.22
1123	0.22
1124	0.25
1125	0.27
1126	0.3
1127	0.29
1128	0.26
1129	0.23
1130	0.22
1131	0.22
1132	0.2
1133	0.2
1134	0.16
1135	0.15
1136	0.15
1137	0.12
1138	0.14
1139	0.13
1140	0.14
1141	0.16
1142	0.19
1143	0.19
1144	0.19
1145	0.19
1146	0.18
1147	0.18
1148	0.17
1149	0.12
1150	0.1
1151	0.12
1152	0.12
1153	0.14
1154	0.17
1155	0.19
1156	0.21
1157	0.25
1158	0.24
1159	0.23
1160	0.29
1161	0.28
1162	0.26
1163	0.24
1164	0.21
1165	0.16
1166	0.16
1167	0.16
1168	0.09
1169	0.08
1170	0.06
1171	0.06
1172	0.06
1173	0.05
1174	0.05
1175	0.05
1176	0.04
1177	0.04
1178	0.04
1179	0.05
1180	0.05
1181	0.05
1182	0.05
1183	0.06
1184	0.06
1185	0.06
1186	0.06
1187	0.06
1188	0.05
1189	0.06
1190	0.06
1191	0.07
1192	0.08
1193	0.09
1194	0.11
1195	0.13
1196	0.14
1197	0.14
1198	0.14
1199	0.14
1200	0.13
1201	0.12
1202	0.12
1203	0.12
1204	0.16
1205	0.17
1206	0.23
1207	0.23
1208	0.26
1209	0.29
1210	0.35
1211	0.42
1212	0.43
1213	0.51
1214	0.55
1215	0.64
1216	0.7
1217	0.73
1218	0.72
1219	0.68
1220	0.68
1221	0.66
1222	0.6
1223	0.54
1224	0.48
1225	0.42
1226	0.37
1227	0.32
1228	0.25
1229	0.17
1230	0.15
1231	0.1
1232	0.08
1233	0.07
1234	0.06
1235	0.06
1236	0.06
1237	0.06
1238	0.07
1239	0.06
1240	0.06
1241	0.06
1242	0.09
1243	0.1
1244	0.11
1245	0.11
1246	0.1
1247	0.12
1248	0.12
1249	0.12
1250	0.1
1251	0.13
1252	0.12
1253	0.13
1254	0.14
1255	0.11
1256	0.11
1257	0.11
1258	0.11
1259	0.09
1260	0.11
1261	0.12
1262	0.14
1263	0.15
1264	0.16
1265	0.18
1266	0.19
1267	0.2
1268	0.22
1269	0.28

A0A0D0CBH5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer