Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D0CJV3

Protein Details
Accession A0A0D0CJV3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
286-306FGGGSKKKRKKDGPGVTAKNMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
290-297SKKKRKKD
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MSQSVKAEETPTPAATTAATPAPTQQPAYSWAIDPALQAQPAPTQAGQTVYHQYPAYSHYYPYQSQYTATPQTAQTTTTPAPVVAQTSTSAPAQSAAIDTSDINTLRDALGSTGVDLRAEEESLQRTSDSHLSYRSYEDRTRKQPPKPNFNTVFLTNTILQITTAHKLPSHPSADTVNYLALALRARLQDLVTDMITAAHHRTDTQFDRPPSVYEDGSPMWSILVRSDVAKQLSALEKVEREEETRIRRERKERADLAAATAAALAAQSSAVNGGSANLDDDLDGFGGGSKKKRKKDGPGVTAKNMSADVQKKMSNAAASHAAGLSGRYAWMTSAASSSAPKKPAAATSSSTTAGPTASGFTTTSAASTSIPGTTATLATAGSSWARPYVPTAKKVEEAPQEPVEEDTRTTITMRDAMFVIQKERGHGGGRGAAKGWT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.21
3 0.19
4 0.17
5 0.16
6 0.16
7 0.15
8 0.19
9 0.24
10 0.25
11 0.26
12 0.24
13 0.23
14 0.27
15 0.31
16 0.29
17 0.25
18 0.24
19 0.24
20 0.24
21 0.22
22 0.21
23 0.2
24 0.18
25 0.17
26 0.16
27 0.17
28 0.18
29 0.21
30 0.16
31 0.15
32 0.16
33 0.2
34 0.2
35 0.21
36 0.26
37 0.24
38 0.28
39 0.26
40 0.25
41 0.23
42 0.25
43 0.28
44 0.23
45 0.23
46 0.25
47 0.3
48 0.31
49 0.34
50 0.35
51 0.29
52 0.29
53 0.31
54 0.32
55 0.32
56 0.31
57 0.29
58 0.26
59 0.3
60 0.29
61 0.28
62 0.22
63 0.24
64 0.24
65 0.23
66 0.23
67 0.18
68 0.19
69 0.18
70 0.19
71 0.13
72 0.13
73 0.12
74 0.13
75 0.15
76 0.13
77 0.13
78 0.11
79 0.11
80 0.1
81 0.1
82 0.09
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.1
94 0.11
95 0.1
96 0.07
97 0.09
98 0.08
99 0.09
100 0.11
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.12
110 0.13
111 0.13
112 0.12
113 0.12
114 0.15
115 0.19
116 0.19
117 0.18
118 0.2
119 0.22
120 0.23
121 0.27
122 0.28
123 0.28
124 0.33
125 0.39
126 0.44
127 0.5
128 0.59
129 0.63
130 0.68
131 0.72
132 0.75
133 0.78
134 0.77
135 0.79
136 0.73
137 0.69
138 0.64
139 0.56
140 0.5
141 0.39
142 0.36
143 0.26
144 0.22
145 0.18
146 0.14
147 0.12
148 0.11
149 0.12
150 0.11
151 0.12
152 0.11
153 0.12
154 0.13
155 0.16
156 0.21
157 0.21
158 0.2
159 0.2
160 0.22
161 0.23
162 0.23
163 0.2
164 0.14
165 0.11
166 0.11
167 0.09
168 0.08
169 0.07
170 0.06
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.1
178 0.11
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.08
190 0.13
191 0.15
192 0.2
193 0.25
194 0.25
195 0.29
196 0.29
197 0.29
198 0.28
199 0.27
200 0.21
201 0.16
202 0.18
203 0.15
204 0.15
205 0.14
206 0.1
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.08
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.12
220 0.14
221 0.14
222 0.13
223 0.12
224 0.12
225 0.13
226 0.14
227 0.13
228 0.12
229 0.15
230 0.19
231 0.24
232 0.3
233 0.35
234 0.4
235 0.45
236 0.51
237 0.57
238 0.61
239 0.64
240 0.59
241 0.57
242 0.56
243 0.5
244 0.44
245 0.36
246 0.27
247 0.18
248 0.15
249 0.11
250 0.06
251 0.05
252 0.03
253 0.02
254 0.02
255 0.02
256 0.02
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.04
273 0.05
274 0.08
275 0.1
276 0.16
277 0.25
278 0.33
279 0.39
280 0.49
281 0.55
282 0.64
283 0.74
284 0.78
285 0.78
286 0.81
287 0.8
288 0.74
289 0.69
290 0.58
291 0.48
292 0.38
293 0.29
294 0.25
295 0.23
296 0.22
297 0.22
298 0.24
299 0.23
300 0.25
301 0.26
302 0.22
303 0.19
304 0.19
305 0.2
306 0.18
307 0.19
308 0.17
309 0.15
310 0.12
311 0.12
312 0.1
313 0.06
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.06
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.1
324 0.12
325 0.16
326 0.19
327 0.21
328 0.21
329 0.22
330 0.23
331 0.28
332 0.29
333 0.29
334 0.27
335 0.28
336 0.31
337 0.3
338 0.28
339 0.23
340 0.2
341 0.16
342 0.13
343 0.1
344 0.09
345 0.08
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.12
350 0.11
351 0.11
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.11
356 0.1
357 0.09
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.1
363 0.09
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.07
368 0.08
369 0.08
370 0.09
371 0.09
372 0.11
373 0.11
374 0.12
375 0.17
376 0.26
377 0.31
378 0.37
379 0.42
380 0.43
381 0.46
382 0.48
383 0.51
384 0.5
385 0.47
386 0.47
387 0.45
388 0.42
389 0.4
390 0.39
391 0.34
392 0.26
393 0.23
394 0.2
395 0.18
396 0.18
397 0.18
398 0.17
399 0.17
400 0.21
401 0.21
402 0.2
403 0.19
404 0.2
405 0.25
406 0.25
407 0.26
408 0.26
409 0.26
410 0.28
411 0.3
412 0.3
413 0.28
414 0.29
415 0.29
416 0.3
417 0.32
418 0.31