Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0D0D133

Protein Details
Accession A0A0D0D133    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
260-280IEKGRGTGKSKKNARERAAREBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
264-276RGTGKSKKNARER
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 6.5, cyto_mito 6.5, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014720  dsRBD_dom  
IPR000999  RNase_III_dom  
IPR036389  RNase_III_sf  
Gene Ontology GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00035  dsrm  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50137  DS_RBD  
PS50142  RNASE_3_2  
CDD cd10845  DSRM_RNAse_III_family  
Amino Acid Sequences MILKDGLAPSLPTIGGRNVDVKDLALALYTHRPSSTYRRDRLAELGKMALGLVVTDHLFISQTSFDGEQIESKRDSVVADETILQWLDLYPDEKQRFLERDGVSASSSDIPKELCAFFLSYMGAVYLSQGRSIRPVLEDWVLELVNLERDEPSDEPSTESSSVDPPPPSYASAPPLATPPSSPVQRREPFSSSTSINHTSPGLHSPDGPSPRSEPVPKFTLELANQLQGQNRAYLTYQDVREGGSAHQPEWLAQCLVNGIEKGRGTGKSKKNARERAAREASIQLGWIKESDWS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.17
4 0.21
5 0.2
6 0.22
7 0.21
8 0.19
9 0.17
10 0.16
11 0.14
12 0.1
13 0.1
14 0.1
15 0.18
16 0.19
17 0.19
18 0.18
19 0.2
20 0.24
21 0.34
22 0.42
23 0.45
24 0.48
25 0.54
26 0.56
27 0.58
28 0.62
29 0.6
30 0.52
31 0.44
32 0.4
33 0.34
34 0.31
35 0.28
36 0.19
37 0.11
38 0.07
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.06
43 0.06
44 0.05
45 0.06
46 0.06
47 0.08
48 0.07
49 0.07
50 0.09
51 0.09
52 0.1
53 0.11
54 0.11
55 0.14
56 0.16
57 0.19
58 0.18
59 0.18
60 0.18
61 0.16
62 0.16
63 0.13
64 0.14
65 0.12
66 0.12
67 0.12
68 0.12
69 0.13
70 0.13
71 0.1
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.09
78 0.17
79 0.19
80 0.19
81 0.21
82 0.25
83 0.27
84 0.28
85 0.35
86 0.27
87 0.28
88 0.29
89 0.28
90 0.23
91 0.2
92 0.19
93 0.14
94 0.13
95 0.11
96 0.11
97 0.1
98 0.1
99 0.12
100 0.11
101 0.08
102 0.09
103 0.1
104 0.09
105 0.1
106 0.09
107 0.07
108 0.07
109 0.06
110 0.05
111 0.04
112 0.05
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.09
117 0.09
118 0.11
119 0.12
120 0.12
121 0.1
122 0.11
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.1
127 0.11
128 0.1
129 0.09
130 0.08
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.05
136 0.06
137 0.08
138 0.08
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.13
143 0.14
144 0.16
145 0.15
146 0.15
147 0.12
148 0.12
149 0.13
150 0.14
151 0.14
152 0.12
153 0.14
154 0.15
155 0.15
156 0.15
157 0.16
158 0.16
159 0.18
160 0.18
161 0.16
162 0.16
163 0.16
164 0.14
165 0.13
166 0.14
167 0.16
168 0.2
169 0.21
170 0.25
171 0.34
172 0.38
173 0.42
174 0.44
175 0.42
176 0.42
177 0.42
178 0.4
179 0.32
180 0.3
181 0.3
182 0.28
183 0.26
184 0.23
185 0.21
186 0.19
187 0.18
188 0.2
189 0.18
190 0.15
191 0.15
192 0.17
193 0.23
194 0.26
195 0.26
196 0.24
197 0.24
198 0.27
199 0.31
200 0.34
201 0.3
202 0.32
203 0.34
204 0.33
205 0.32
206 0.3
207 0.32
208 0.27
209 0.29
210 0.26
211 0.25
212 0.26
213 0.26
214 0.27
215 0.24
216 0.23
217 0.2
218 0.18
219 0.17
220 0.17
221 0.17
222 0.19
223 0.23
224 0.23
225 0.23
226 0.23
227 0.22
228 0.22
229 0.21
230 0.18
231 0.19
232 0.2
233 0.18
234 0.21
235 0.2
236 0.21
237 0.22
238 0.23
239 0.16
240 0.15
241 0.15
242 0.14
243 0.14
244 0.15
245 0.13
246 0.12
247 0.15
248 0.15
249 0.17
250 0.2
251 0.24
252 0.27
253 0.37
254 0.44
255 0.5
256 0.59
257 0.66
258 0.73
259 0.78
260 0.81
261 0.82
262 0.79
263 0.79
264 0.78
265 0.7
266 0.62
267 0.56
268 0.5
269 0.39
270 0.35
271 0.26
272 0.2
273 0.19
274 0.17