Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D0C342

Protein Details
Accession A0A0D0C342    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-272TGTVEEKKKVRMRRVPKGVVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-26GKAFRGKGK
260-266KKVRMRR
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 9, cyto_nucl 8.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026270  SRP72  
IPR031545  SRP_TPR-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF17004  SRP_TPR_like  
Amino Acid Sequences MPPKASSAASKAKYSSPGKAFRGKGKKTSDTLPSAERVKRLYSSLVAQIDGGHWKGAEKTCDKILRIDPNDSDARQTKLFILLQREDYVKALELTDDASSTLSDSEAVSVQDKLFEKAYTLYRMKQESEAQRVLEQIKESARGVEEERGVLHLEAQLNYRQGNYQQAYDLYQQLFDTSDPSSEESHDVQNNLYASQTYLDFINSGYLQAIDVARTADSSTVNTLRDIENLPPPTIASTSAVTVSLSTAKGAPTGTVEEKKKVRMRRVPKGVVPGVTPPPDPERWIKKVTCFRYDGWPYNQSTDYPCSSSSEPTKYPTDIWKERR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.49
3 0.48
4 0.53
5 0.56
6 0.62
7 0.63
8 0.65
9 0.72
10 0.69
11 0.69
12 0.69
13 0.71
14 0.66
15 0.68
16 0.65
17 0.6
18 0.57
19 0.52
20 0.48
21 0.47
22 0.46
23 0.43
24 0.38
25 0.36
26 0.35
27 0.34
28 0.32
29 0.28
30 0.29
31 0.32
32 0.31
33 0.27
34 0.25
35 0.23
36 0.21
37 0.21
38 0.18
39 0.12
40 0.11
41 0.11
42 0.16
43 0.19
44 0.24
45 0.23
46 0.26
47 0.33
48 0.38
49 0.38
50 0.39
51 0.42
52 0.46
53 0.47
54 0.49
55 0.42
56 0.42
57 0.45
58 0.39
59 0.38
60 0.31
61 0.31
62 0.27
63 0.27
64 0.23
65 0.25
66 0.27
67 0.25
68 0.29
69 0.28
70 0.29
71 0.31
72 0.31
73 0.26
74 0.24
75 0.22
76 0.16
77 0.14
78 0.12
79 0.1
80 0.09
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.08
96 0.09
97 0.08
98 0.12
99 0.13
100 0.14
101 0.14
102 0.13
103 0.14
104 0.16
105 0.19
106 0.21
107 0.22
108 0.24
109 0.27
110 0.29
111 0.29
112 0.3
113 0.34
114 0.33
115 0.38
116 0.36
117 0.33
118 0.31
119 0.32
120 0.29
121 0.24
122 0.19
123 0.14
124 0.13
125 0.14
126 0.14
127 0.13
128 0.12
129 0.12
130 0.13
131 0.14
132 0.13
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.12
137 0.1
138 0.09
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.1
148 0.1
149 0.16
150 0.15
151 0.14
152 0.14
153 0.15
154 0.17
155 0.18
156 0.19
157 0.13
158 0.12
159 0.12
160 0.11
161 0.11
162 0.09
163 0.09
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.12
171 0.12
172 0.15
173 0.15
174 0.15
175 0.14
176 0.15
177 0.15
178 0.13
179 0.11
180 0.08
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.08
206 0.11
207 0.12
208 0.13
209 0.13
210 0.14
211 0.14
212 0.15
213 0.16
214 0.15
215 0.2
216 0.22
217 0.22
218 0.2
219 0.2
220 0.19
221 0.18
222 0.17
223 0.12
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.12
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.13
241 0.18
242 0.24
243 0.26
244 0.32
245 0.35
246 0.43
247 0.48
248 0.52
249 0.58
250 0.61
251 0.69
252 0.73
253 0.8
254 0.79
255 0.77
256 0.78
257 0.71
258 0.63
259 0.55
260 0.49
261 0.44
262 0.39
263 0.35
264 0.29
265 0.31
266 0.31
267 0.33
268 0.36
269 0.39
270 0.42
271 0.49
272 0.49
273 0.53
274 0.62
275 0.65
276 0.63
277 0.58
278 0.55
279 0.58
280 0.63
281 0.61
282 0.58
283 0.57
284 0.53
285 0.54
286 0.53
287 0.44
288 0.41
289 0.39
290 0.35
291 0.31
292 0.29
293 0.3
294 0.3
295 0.36
296 0.38
297 0.4
298 0.38
299 0.41
300 0.44
301 0.42
302 0.43
303 0.45
304 0.48