Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D0CED0

Protein Details
Accession A0A0D0CED0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
391-411DLALKKPPPGNKRQKNRGEFVHydrophilic
481-504EPQPSPRPPHPPKKSKEPIPLVRIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
387-406RPPRDLALKKPPPGNKRQKN
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.333, cyto 11.5, nucl 11, cyto_mito 7.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR006225  PsdUridine_synth_RluC/D  
IPR006145  PsdUridine_synth_RsuA/RluA  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF00849  PseudoU_synth_2  
CDD cd02557  PseudoU_synth_ScRIB2  
Amino Acid Sequences MSSLGGEPSPVPAAISGLKKTPPYWYPYTTYAKERWLGRELLEVVSTEFRDRSMEYYRYALESGVTTINGQVAKPDHVMQNGDRMENVVHRHEPPVTATPIKILLEDKEREFIVVDKPGSIPVHASGRYHRNTLVAILMSDFGYEKIYTVNRLDRLTSGLMILPTSLECARRLTNEFVSGTVRKEYVARVNGKFPEAEVVCEEPLLTVDRQMGLNIVHPEGKPAKTIFSLIRYDENTDTSVVLCKPMTGRSHQLRVHLQYLAHPISNDPVYGNPKIWGEKIGKGGIDTIPSDDRSAPVPPPHLANTNGNPESLGKVDAADPSTSIASSARATKLLPRETGEDIGMGSPVPLSSEAVGVITRLRNQKDEAEDWSRWRDVIFRAKGTMRPPRDLALKKPPPGNKRQKNRGEFVDDQLNAAMKGASIDDSAAITAESEIEPTGGADPSLSQLTSEVSTPLEGVEATPLVAPGASSTDIQSTSAEPQPSPRPPHPPKKSKEPIPLVRIPDPSEPIQISTSEALSLSRDILSSSSDRDANAAPDQFPQGPAANADEKQLYCPECYLPLHPDPDPETLYIFLHALRYTIGLGTFETEMPEWSREGYVWKRGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.21
3 0.21
4 0.23
5 0.26
6 0.28
7 0.29
8 0.35
9 0.34
10 0.38
11 0.42
12 0.43
13 0.45
14 0.51
15 0.58
16 0.54
17 0.56
18 0.52
19 0.52
20 0.52
21 0.52
22 0.5
23 0.46
24 0.44
25 0.39
26 0.42
27 0.38
28 0.34
29 0.3
30 0.25
31 0.22
32 0.24
33 0.23
34 0.18
35 0.16
36 0.15
37 0.17
38 0.17
39 0.2
40 0.24
41 0.26
42 0.26
43 0.29
44 0.3
45 0.3
46 0.29
47 0.25
48 0.18
49 0.16
50 0.16
51 0.14
52 0.13
53 0.12
54 0.12
55 0.15
56 0.14
57 0.13
58 0.14
59 0.15
60 0.18
61 0.2
62 0.23
63 0.23
64 0.25
65 0.29
66 0.26
67 0.32
68 0.31
69 0.3
70 0.26
71 0.24
72 0.23
73 0.24
74 0.27
75 0.23
76 0.24
77 0.25
78 0.28
79 0.28
80 0.28
81 0.28
82 0.31
83 0.3
84 0.29
85 0.27
86 0.26
87 0.28
88 0.27
89 0.24
90 0.2
91 0.19
92 0.24
93 0.27
94 0.27
95 0.26
96 0.26
97 0.25
98 0.24
99 0.22
100 0.2
101 0.22
102 0.21
103 0.19
104 0.2
105 0.23
106 0.23
107 0.21
108 0.18
109 0.15
110 0.2
111 0.2
112 0.22
113 0.24
114 0.32
115 0.34
116 0.35
117 0.33
118 0.29
119 0.29
120 0.28
121 0.25
122 0.17
123 0.15
124 0.13
125 0.13
126 0.11
127 0.11
128 0.1
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.07
133 0.1
134 0.11
135 0.14
136 0.17
137 0.22
138 0.24
139 0.25
140 0.26
141 0.23
142 0.26
143 0.24
144 0.21
145 0.16
146 0.14
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.08
151 0.07
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.1
156 0.13
157 0.15
158 0.18
159 0.22
160 0.24
161 0.25
162 0.27
163 0.27
164 0.25
165 0.28
166 0.26
167 0.24
168 0.21
169 0.19
170 0.15
171 0.16
172 0.18
173 0.21
174 0.27
175 0.31
176 0.31
177 0.36
178 0.37
179 0.37
180 0.34
181 0.27
182 0.27
183 0.21
184 0.21
185 0.17
186 0.17
187 0.16
188 0.16
189 0.16
190 0.09
191 0.09
192 0.1
193 0.08
194 0.08
195 0.09
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.08
201 0.12
202 0.12
203 0.13
204 0.14
205 0.14
206 0.18
207 0.2
208 0.2
209 0.19
210 0.18
211 0.19
212 0.17
213 0.2
214 0.18
215 0.19
216 0.21
217 0.2
218 0.23
219 0.21
220 0.24
221 0.22
222 0.22
223 0.18
224 0.16
225 0.15
226 0.12
227 0.13
228 0.1
229 0.11
230 0.1
231 0.09
232 0.1
233 0.14
234 0.16
235 0.17
236 0.25
237 0.28
238 0.36
239 0.37
240 0.41
241 0.41
242 0.42
243 0.41
244 0.35
245 0.3
246 0.25
247 0.29
248 0.25
249 0.21
250 0.17
251 0.15
252 0.16
253 0.16
254 0.13
255 0.08
256 0.1
257 0.14
258 0.14
259 0.15
260 0.14
261 0.15
262 0.16
263 0.16
264 0.17
265 0.16
266 0.19
267 0.21
268 0.21
269 0.2
270 0.19
271 0.2
272 0.16
273 0.15
274 0.11
275 0.1
276 0.1
277 0.11
278 0.12
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.14
286 0.13
287 0.15
288 0.16
289 0.17
290 0.18
291 0.2
292 0.21
293 0.26
294 0.26
295 0.23
296 0.22
297 0.2
298 0.19
299 0.16
300 0.13
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.07
311 0.07
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.09
316 0.09
317 0.1
318 0.1
319 0.14
320 0.21
321 0.22
322 0.23
323 0.22
324 0.25
325 0.26
326 0.27
327 0.22
328 0.16
329 0.13
330 0.12
331 0.1
332 0.07
333 0.05
334 0.04
335 0.03
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.06
344 0.05
345 0.07
346 0.07
347 0.11
348 0.16
349 0.17
350 0.19
351 0.21
352 0.25
353 0.28
354 0.28
355 0.3
356 0.31
357 0.3
358 0.31
359 0.33
360 0.29
361 0.24
362 0.23
363 0.2
364 0.2
365 0.29
366 0.29
367 0.27
368 0.3
369 0.32
370 0.35
371 0.38
372 0.42
373 0.36
374 0.36
375 0.37
376 0.37
377 0.44
378 0.43
379 0.44
380 0.46
381 0.49
382 0.49
383 0.55
384 0.59
385 0.57
386 0.65
387 0.7
388 0.68
389 0.72
390 0.79
391 0.82
392 0.81
393 0.79
394 0.74
395 0.71
396 0.63
397 0.56
398 0.54
399 0.44
400 0.38
401 0.33
402 0.28
403 0.2
404 0.18
405 0.14
406 0.05
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.06
414 0.06
415 0.05
416 0.05
417 0.04
418 0.04
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.05
430 0.05
431 0.07
432 0.08
433 0.08
434 0.06
435 0.07
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.07
445 0.06
446 0.05
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.05
455 0.04
456 0.07
457 0.07
458 0.08
459 0.09
460 0.11
461 0.11
462 0.12
463 0.12
464 0.12
465 0.15
466 0.19
467 0.19
468 0.18
469 0.23
470 0.3
471 0.36
472 0.42
473 0.43
474 0.5
475 0.58
476 0.69
477 0.74
478 0.76
479 0.76
480 0.8
481 0.85
482 0.84
483 0.85
484 0.84
485 0.82
486 0.8
487 0.79
488 0.74
489 0.69
490 0.63
491 0.56
492 0.5
493 0.45
494 0.39
495 0.37
496 0.32
497 0.29
498 0.27
499 0.24
500 0.22
501 0.19
502 0.17
503 0.13
504 0.13
505 0.11
506 0.11
507 0.12
508 0.1
509 0.1
510 0.09
511 0.09
512 0.1
513 0.13
514 0.13
515 0.15
516 0.17
517 0.18
518 0.18
519 0.2
520 0.21
521 0.21
522 0.24
523 0.23
524 0.21
525 0.22
526 0.26
527 0.25
528 0.24
529 0.23
530 0.2
531 0.19
532 0.19
533 0.21
534 0.22
535 0.21
536 0.23
537 0.24
538 0.23
539 0.25
540 0.28
541 0.25
542 0.22
543 0.24
544 0.23
545 0.24
546 0.26
547 0.27
548 0.29
549 0.32
550 0.35
551 0.34
552 0.37
553 0.36
554 0.38
555 0.36
556 0.3
557 0.27
558 0.24
559 0.24
560 0.21
561 0.17
562 0.14
563 0.15
564 0.14
565 0.13
566 0.12
567 0.12
568 0.12
569 0.12
570 0.12
571 0.1
572 0.11
573 0.12
574 0.13
575 0.12
576 0.14
577 0.13
578 0.14
579 0.17
580 0.18
581 0.16
582 0.16
583 0.17
584 0.16
585 0.24
586 0.28