Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D0B3D6

Protein Details
Accession A0A0D0B3D6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-75EELNRAKQAKRAQIREKRALKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
61-74QAKRAQIREKRALK
558-562KRKRK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13.333, cyto 10, mito_nucl 8.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR002905  Trm1  
IPR042296  tRNA_met_Trm1_C  
Gene Ontology GO:0004809  F:tRNA (guanine-N2-)-methyltransferase activity  
GO:0000049  F:tRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF02005  TRM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51626  SAM_MT_TRM1  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
Amino Acid Sequences MSSVPAPPIPVPDGFRLHTENNAHILISENEAFLNPVQEFNRDLSVACIRTWSEELNRAKQAKRAQIREKRALKTQGGSAAKRQKVSEVDDIKLEVRGSEDSKPESGSGPSTDPVEPKFEYRITILEALSATGLRSIRYAKEIPLVKYVLANDLSPTAVAAMKRNVELNGLGPETKAEVESSTKKEKPNLGKVRVNEGDACAFMYSHRTDKVDVVDLDPYGTAAPFIDAAVQAVKDEGLLCVTCTDVSILATNNYPEKCFSNYGGLPMKAEYSHEAALRLVLHAVSTSASRYGRYIEPLLSLSIDFYVRLFIRINSSPFQVKKALTKTSSYYVCTSCQSFYEQPMGRVVEKMGAKDNINSIFKTQPGPPVGNKCPECDSNLHIAGPMWSGPIHNTEFVSQVLAHTETRKDQYGTAVRMQGMLTVAKEELHTPFYFTPTKVASFFHCQTPSLDDTASALLHAGHKVSRSHAIPGSLKTTASCQDIMDVFRSWVKTHPIKNVSETSPALRLLAKDPRVEANFEKHPGCVTLSSKVKITRYQETPANWGPGSRPVTDGGNKRKRKHDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.35
3 0.36
4 0.34
5 0.38
6 0.38
7 0.35
8 0.35
9 0.34
10 0.3
11 0.25
12 0.27
13 0.21
14 0.22
15 0.19
16 0.15
17 0.15
18 0.15
19 0.17
20 0.13
21 0.16
22 0.12
23 0.15
24 0.16
25 0.18
26 0.2
27 0.21
28 0.23
29 0.2
30 0.2
31 0.2
32 0.25
33 0.25
34 0.23
35 0.23
36 0.21
37 0.24
38 0.26
39 0.26
40 0.24
41 0.31
42 0.38
43 0.42
44 0.49
45 0.5
46 0.51
47 0.53
48 0.57
49 0.58
50 0.62
51 0.65
52 0.68
53 0.73
54 0.8
55 0.84
56 0.84
57 0.79
58 0.78
59 0.76
60 0.7
61 0.63
62 0.58
63 0.56
64 0.54
65 0.51
66 0.51
67 0.53
68 0.53
69 0.52
70 0.48
71 0.45
72 0.44
73 0.48
74 0.48
75 0.43
76 0.4
77 0.39
78 0.39
79 0.34
80 0.31
81 0.25
82 0.16
83 0.13
84 0.15
85 0.17
86 0.19
87 0.22
88 0.23
89 0.24
90 0.25
91 0.24
92 0.22
93 0.21
94 0.19
95 0.18
96 0.18
97 0.18
98 0.19
99 0.2
100 0.2
101 0.2
102 0.23
103 0.21
104 0.21
105 0.24
106 0.22
107 0.23
108 0.22
109 0.22
110 0.21
111 0.22
112 0.2
113 0.17
114 0.16
115 0.15
116 0.14
117 0.12
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.1
123 0.12
124 0.13
125 0.18
126 0.2
127 0.18
128 0.25
129 0.3
130 0.31
131 0.33
132 0.33
133 0.28
134 0.29
135 0.28
136 0.24
137 0.2
138 0.18
139 0.14
140 0.13
141 0.13
142 0.11
143 0.1
144 0.07
145 0.08
146 0.09
147 0.11
148 0.13
149 0.14
150 0.15
151 0.17
152 0.16
153 0.16
154 0.15
155 0.15
156 0.14
157 0.14
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.1
164 0.07
165 0.07
166 0.12
167 0.17
168 0.22
169 0.28
170 0.32
171 0.34
172 0.39
173 0.45
174 0.5
175 0.56
176 0.61
177 0.61
178 0.62
179 0.62
180 0.65
181 0.59
182 0.51
183 0.41
184 0.33
185 0.26
186 0.21
187 0.2
188 0.11
189 0.09
190 0.08
191 0.11
192 0.11
193 0.13
194 0.14
195 0.15
196 0.16
197 0.18
198 0.2
199 0.21
200 0.2
201 0.19
202 0.18
203 0.17
204 0.16
205 0.14
206 0.12
207 0.07
208 0.06
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.11
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.13
245 0.15
246 0.16
247 0.17
248 0.19
249 0.19
250 0.23
251 0.26
252 0.24
253 0.21
254 0.2
255 0.19
256 0.13
257 0.14
258 0.11
259 0.1
260 0.12
261 0.11
262 0.12
263 0.11
264 0.12
265 0.11
266 0.09
267 0.07
268 0.05
269 0.05
270 0.04
271 0.05
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.08
279 0.11
280 0.11
281 0.14
282 0.15
283 0.13
284 0.14
285 0.14
286 0.14
287 0.11
288 0.1
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.05
293 0.05
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.09
298 0.09
299 0.13
300 0.16
301 0.18
302 0.17
303 0.19
304 0.22
305 0.22
306 0.25
307 0.24
308 0.22
309 0.26
310 0.29
311 0.33
312 0.3
313 0.31
314 0.31
315 0.33
316 0.34
317 0.3
318 0.28
319 0.24
320 0.24
321 0.24
322 0.22
323 0.17
324 0.17
325 0.19
326 0.18
327 0.18
328 0.25
329 0.24
330 0.24
331 0.27
332 0.27
333 0.23
334 0.22
335 0.21
336 0.17
337 0.17
338 0.18
339 0.18
340 0.19
341 0.19
342 0.19
343 0.22
344 0.22
345 0.23
346 0.22
347 0.21
348 0.2
349 0.2
350 0.22
351 0.2
352 0.21
353 0.23
354 0.26
355 0.27
356 0.34
357 0.36
358 0.42
359 0.41
360 0.37
361 0.38
362 0.36
363 0.35
364 0.3
365 0.3
366 0.28
367 0.28
368 0.25
369 0.22
370 0.21
371 0.19
372 0.17
373 0.13
374 0.08
375 0.07
376 0.07
377 0.08
378 0.11
379 0.12
380 0.13
381 0.13
382 0.13
383 0.15
384 0.14
385 0.15
386 0.11
387 0.1
388 0.11
389 0.12
390 0.12
391 0.12
392 0.14
393 0.16
394 0.19
395 0.22
396 0.21
397 0.2
398 0.27
399 0.32
400 0.34
401 0.34
402 0.34
403 0.32
404 0.32
405 0.31
406 0.24
407 0.18
408 0.15
409 0.12
410 0.1
411 0.1
412 0.1
413 0.1
414 0.1
415 0.11
416 0.14
417 0.14
418 0.16
419 0.17
420 0.21
421 0.23
422 0.22
423 0.24
424 0.23
425 0.25
426 0.22
427 0.23
428 0.23
429 0.29
430 0.3
431 0.33
432 0.32
433 0.31
434 0.31
435 0.35
436 0.32
437 0.26
438 0.24
439 0.17
440 0.17
441 0.18
442 0.16
443 0.11
444 0.09
445 0.08
446 0.1
447 0.1
448 0.1
449 0.1
450 0.13
451 0.14
452 0.17
453 0.23
454 0.23
455 0.27
456 0.29
457 0.33
458 0.33
459 0.35
460 0.36
461 0.31
462 0.29
463 0.25
464 0.26
465 0.24
466 0.23
467 0.21
468 0.17
469 0.19
470 0.21
471 0.23
472 0.22
473 0.19
474 0.18
475 0.2
476 0.21
477 0.19
478 0.22
479 0.29
480 0.34
481 0.39
482 0.48
483 0.51
484 0.52
485 0.57
486 0.58
487 0.52
488 0.5
489 0.46
490 0.39
491 0.36
492 0.34
493 0.29
494 0.25
495 0.24
496 0.24
497 0.31
498 0.32
499 0.31
500 0.33
501 0.39
502 0.4
503 0.43
504 0.4
505 0.39
506 0.42
507 0.44
508 0.42
509 0.35
510 0.35
511 0.32
512 0.31
513 0.28
514 0.24
515 0.29
516 0.35
517 0.36
518 0.39
519 0.43
520 0.44
521 0.47
522 0.5
523 0.51
524 0.49
525 0.54
526 0.55
527 0.53
528 0.56
529 0.54
530 0.53
531 0.44
532 0.4
533 0.36
534 0.39
535 0.4
536 0.33
537 0.29
538 0.26
539 0.33
540 0.39
541 0.46
542 0.49
543 0.55
544 0.63
545 0.68