Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B5RV24

Protein Details
Accession B5RV24    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-42LCNGRKAVMKRPKNLQKLCKECFYHydrophilic
279-308EHLALAPKKKRTQQYKNKKKTQVDNEHEINHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito_nucl 11, mito 9.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032442  CTU1_C  
IPR000541  Ncs6/Tuc1/Ctu1  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR011063  TilS/TtcA_N  
IPR035107  tRNA_thiolation_TtcA_Ctu1  
IPR020554  UPF0021_CS  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0016779  F:nucleotidyltransferase activity  
GO:0000049  F:tRNA binding  
GO:0032447  P:protein urmylation  
GO:0034227  P:tRNA thio-modification  
GO:0002098  P:tRNA wobble uridine modification  
KEGG dha:DEHA2G02728g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01171  ATP_bind_3  
PF16503  zn-ribbon_14  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01263  UPF0021  
CDD cd01993  Alpha_ANH_like_II  
Amino Acid Sequences MPEEKVATKKIKLSALCELCNGRKAVMKRPKNLQKLCKECFYNVFETEIHNTIADANLFQPGDKVAIGASGGKDSTVLASVLKTLNERYDYRLELVLLSIDEGIKGYRDDSLATVKRNQAQYNMALEIISYKDLYNWSMDEIVSCAGIRSSCTYCGVLRRQALDRGAAKLGINHVVTGHNADDMAETVLMNLLRGDTARLEKSCTILTQSTGSPIKRSKPFKYSYQKEIVLYAHYKKLDYFSTECSYAPEAFRGTARELLKSLEAIRPSCIMDIIYSGEHLALAPKKKRTQQYKNKKKTQVDNEHEINADGSITIGTREFKDGNRCENCGYLTSNKICKACVLLAGLEMNRAKVSVDNNTAVDGAAKLTKTLEQLSF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.53
3 0.5
4 0.48
5 0.48
6 0.44
7 0.46
8 0.42
9 0.33
10 0.34
11 0.36
12 0.42
13 0.48
14 0.53
15 0.55
16 0.66
17 0.74
18 0.78
19 0.84
20 0.84
21 0.84
22 0.85
23 0.82
24 0.79
25 0.73
26 0.66
27 0.63
28 0.58
29 0.53
30 0.44
31 0.42
32 0.34
33 0.33
34 0.34
35 0.29
36 0.24
37 0.19
38 0.18
39 0.16
40 0.17
41 0.14
42 0.1
43 0.09
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.11
49 0.12
50 0.11
51 0.1
52 0.07
53 0.07
54 0.08
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.08
60 0.09
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.09
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.12
72 0.16
73 0.2
74 0.21
75 0.23
76 0.27
77 0.28
78 0.28
79 0.28
80 0.25
81 0.21
82 0.2
83 0.15
84 0.11
85 0.09
86 0.08
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.08
96 0.08
97 0.1
98 0.18
99 0.2
100 0.23
101 0.27
102 0.29
103 0.34
104 0.37
105 0.37
106 0.32
107 0.32
108 0.33
109 0.31
110 0.28
111 0.23
112 0.18
113 0.17
114 0.15
115 0.12
116 0.09
117 0.07
118 0.06
119 0.07
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.09
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.09
137 0.1
138 0.11
139 0.13
140 0.14
141 0.15
142 0.21
143 0.24
144 0.25
145 0.26
146 0.28
147 0.28
148 0.31
149 0.31
150 0.29
151 0.27
152 0.24
153 0.22
154 0.2
155 0.18
156 0.15
157 0.15
158 0.14
159 0.13
160 0.1
161 0.11
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.07
185 0.1
186 0.1
187 0.12
188 0.13
189 0.14
190 0.15
191 0.13
192 0.14
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.13
197 0.16
198 0.18
199 0.18
200 0.19
201 0.22
202 0.27
203 0.33
204 0.4
205 0.41
206 0.45
207 0.49
208 0.56
209 0.64
210 0.62
211 0.62
212 0.62
213 0.59
214 0.52
215 0.5
216 0.41
217 0.33
218 0.31
219 0.26
220 0.24
221 0.22
222 0.22
223 0.2
224 0.22
225 0.2
226 0.21
227 0.21
228 0.21
229 0.24
230 0.24
231 0.24
232 0.23
233 0.24
234 0.21
235 0.2
236 0.16
237 0.14
238 0.14
239 0.15
240 0.15
241 0.15
242 0.2
243 0.2
244 0.19
245 0.19
246 0.2
247 0.19
248 0.18
249 0.19
250 0.16
251 0.17
252 0.17
253 0.18
254 0.18
255 0.18
256 0.17
257 0.15
258 0.12
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.1
269 0.13
270 0.2
271 0.25
272 0.32
273 0.39
274 0.47
275 0.56
276 0.63
277 0.7
278 0.74
279 0.8
280 0.85
281 0.89
282 0.92
283 0.92
284 0.9
285 0.89
286 0.89
287 0.88
288 0.84
289 0.82
290 0.74
291 0.67
292 0.59
293 0.48
294 0.37
295 0.26
296 0.19
297 0.1
298 0.07
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.08
304 0.09
305 0.14
306 0.15
307 0.19
308 0.29
309 0.33
310 0.42
311 0.44
312 0.45
313 0.43
314 0.44
315 0.42
316 0.34
317 0.34
318 0.29
319 0.32
320 0.36
321 0.4
322 0.42
323 0.41
324 0.39
325 0.37
326 0.37
327 0.31
328 0.28
329 0.25
330 0.2
331 0.21
332 0.24
333 0.22
334 0.22
335 0.21
336 0.19
337 0.16
338 0.16
339 0.15
340 0.15
341 0.19
342 0.22
343 0.27
344 0.29
345 0.3
346 0.31
347 0.3
348 0.26
349 0.23
350 0.16
351 0.13
352 0.13
353 0.13
354 0.12
355 0.13
356 0.16
357 0.18