Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D0CHL3

Protein Details
Accession A0A0D0CHL3    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
462-492GGGHRDRERDRERNRDRDRPKKTQQELDDELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
258-267KKHGRMAGKE
270-281NGRELPLKRRRR
385-407PRRAGGGRSRRAGGGGGREGGGR
432-483SRRAGGRNERNHNHNRDGRRSGGGGGGGGGGGGHRDRERDRERNRDRDRPKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDISSSASFPAPESSTYEDPPSDSQQELLSYDDSLPYEEQLPTGTEAAALGLASRIGNAKVYLLEESSASVMRGSGGGGGSKRKRDEQETENADEADEDVEMDGDPTLRPNALLLTGTPISNLPTARLFAYATHFDAHPMGLEWIDDNTCIFVFPSKASARTGFRYLSKSPSSSSGIEEPDAEGFVTAKPIPITFWPPEERISSSLGASTTTTATHTNGHAHAHAHSHSAMKNPIKIRWAQISDVKKRGAKSDSEFYKKHGRMAGKELFNGRELPLKRRRRNEHDGGDDYSFDNDDRGRPSLEQLDEELDEFLAEGEAEDAGGLEAEAEAGGGQGDTPAHGEGDADSHDPPSKMRSDYIAADGRTLLEDPVSKLDLASRIMAPLPRRAGGGRSRRAGGGGGREGGGREGGGGTLGDRLWSDKADLSQRIGSSRRAGGRNERNHNHNRDGRRSGGGGGGGGGGGGHRDRERDRERNRDRDRPKKTQQELDDELDAFLREES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.28
3 0.3
4 0.32
5 0.28
6 0.29
7 0.32
8 0.34
9 0.3
10 0.27
11 0.26
12 0.25
13 0.26
14 0.25
15 0.23
16 0.17
17 0.16
18 0.16
19 0.17
20 0.15
21 0.16
22 0.15
23 0.14
24 0.16
25 0.15
26 0.15
27 0.14
28 0.15
29 0.15
30 0.15
31 0.14
32 0.11
33 0.11
34 0.11
35 0.09
36 0.07
37 0.05
38 0.05
39 0.05
40 0.05
41 0.06
42 0.07
43 0.08
44 0.1
45 0.1
46 0.11
47 0.11
48 0.13
49 0.14
50 0.13
51 0.13
52 0.11
53 0.12
54 0.12
55 0.11
56 0.1
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.08
63 0.07
64 0.1
65 0.12
66 0.21
67 0.25
68 0.31
69 0.35
70 0.4
71 0.45
72 0.5
73 0.55
74 0.53
75 0.58
76 0.58
77 0.58
78 0.52
79 0.47
80 0.39
81 0.32
82 0.26
83 0.16
84 0.1
85 0.06
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.07
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.1
101 0.08
102 0.13
103 0.13
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.15
109 0.15
110 0.12
111 0.12
112 0.14
113 0.14
114 0.15
115 0.13
116 0.12
117 0.17
118 0.17
119 0.17
120 0.17
121 0.17
122 0.17
123 0.17
124 0.15
125 0.11
126 0.1
127 0.09
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.06
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.08
141 0.08
142 0.14
143 0.14
144 0.16
145 0.18
146 0.22
147 0.24
148 0.27
149 0.29
150 0.26
151 0.28
152 0.31
153 0.31
154 0.34
155 0.33
156 0.3
157 0.28
158 0.3
159 0.31
160 0.27
161 0.28
162 0.25
163 0.23
164 0.22
165 0.22
166 0.18
167 0.14
168 0.13
169 0.1
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.1
180 0.15
181 0.14
182 0.18
183 0.2
184 0.21
185 0.23
186 0.24
187 0.24
188 0.2
189 0.22
190 0.19
191 0.16
192 0.16
193 0.14
194 0.12
195 0.11
196 0.1
197 0.08
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.1
203 0.11
204 0.12
205 0.13
206 0.14
207 0.14
208 0.14
209 0.14
210 0.14
211 0.14
212 0.13
213 0.12
214 0.14
215 0.14
216 0.15
217 0.2
218 0.19
219 0.23
220 0.24
221 0.25
222 0.26
223 0.26
224 0.27
225 0.28
226 0.28
227 0.26
228 0.3
229 0.36
230 0.39
231 0.41
232 0.41
233 0.37
234 0.36
235 0.38
236 0.34
237 0.29
238 0.28
239 0.33
240 0.36
241 0.39
242 0.39
243 0.38
244 0.46
245 0.43
246 0.42
247 0.38
248 0.35
249 0.32
250 0.39
251 0.43
252 0.34
253 0.35
254 0.33
255 0.3
256 0.28
257 0.26
258 0.19
259 0.19
260 0.19
261 0.25
262 0.34
263 0.43
264 0.49
265 0.58
266 0.66
267 0.69
268 0.76
269 0.77
270 0.75
271 0.71
272 0.67
273 0.6
274 0.52
275 0.44
276 0.35
277 0.26
278 0.19
279 0.12
280 0.1
281 0.08
282 0.09
283 0.11
284 0.12
285 0.13
286 0.13
287 0.15
288 0.19
289 0.19
290 0.18
291 0.17
292 0.17
293 0.16
294 0.16
295 0.14
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.04
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.02
311 0.02
312 0.02
313 0.02
314 0.02
315 0.02
316 0.02
317 0.02
318 0.02
319 0.02
320 0.02
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.04
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.06
331 0.07
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.11
336 0.12
337 0.12
338 0.14
339 0.17
340 0.17
341 0.18
342 0.2
343 0.21
344 0.23
345 0.28
346 0.29
347 0.26
348 0.25
349 0.24
350 0.21
351 0.19
352 0.17
353 0.12
354 0.08
355 0.09
356 0.1
357 0.12
358 0.13
359 0.12
360 0.12
361 0.14
362 0.15
363 0.16
364 0.16
365 0.14
366 0.14
367 0.16
368 0.19
369 0.18
370 0.22
371 0.23
372 0.22
373 0.23
374 0.23
375 0.28
376 0.34
377 0.42
378 0.42
379 0.43
380 0.44
381 0.43
382 0.43
383 0.4
384 0.34
385 0.31
386 0.26
387 0.24
388 0.23
389 0.22
390 0.22
391 0.2
392 0.17
393 0.09
394 0.07
395 0.07
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.05
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.09
405 0.1
406 0.11
407 0.13
408 0.13
409 0.18
410 0.24
411 0.26
412 0.27
413 0.3
414 0.3
415 0.33
416 0.34
417 0.33
418 0.31
419 0.36
420 0.39
421 0.39
422 0.43
423 0.49
424 0.57
425 0.63
426 0.68
427 0.68
428 0.69
429 0.75
430 0.78
431 0.77
432 0.74
433 0.73
434 0.72
435 0.71
436 0.66
437 0.61
438 0.55
439 0.47
440 0.42
441 0.34
442 0.25
443 0.2
444 0.16
445 0.11
446 0.1
447 0.08
448 0.05
449 0.06
450 0.06
451 0.09
452 0.1
453 0.15
454 0.18
455 0.29
456 0.38
457 0.47
458 0.55
459 0.63
460 0.72
461 0.78
462 0.84
463 0.85
464 0.87
465 0.87
466 0.88
467 0.88
468 0.88
469 0.88
470 0.88
471 0.87
472 0.83
473 0.82
474 0.78
475 0.72
476 0.65
477 0.54
478 0.47
479 0.38
480 0.31