Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D0CFI2

Protein Details
Accession A0A0D0CFI2    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-257INKDIEKKGKFHRKRLNEDEGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
130-137KLARKKRR
243-245KGK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MAPSKQPEEKTVPAEGTSESPEREEEDQPMEDAESGSGSSTPKLTMEERKAKMDQLRKRLAASSRANRQSLIEESTKLKVTARDAARLERQRKLAETLRQKADAEERGEDVDRAKNWEYTIEENDEWEKKLARKKRRADFEFHDDAHAARRRYKKDLDLIKPVLVAYNKQKELAMGLAPGTLTSFDPNAGPSSLQVAPSTLEQQLAAENLYRDANTLMYGDNKPSEEAIDRMVSKINKDIEKKGKFHRKRLNEDEGDITYINEHNRVFNKKIARYYDKYTAEIRASFERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.3
3 0.26
4 0.25
5 0.23
6 0.2
7 0.2
8 0.2
9 0.22
10 0.25
11 0.24
12 0.23
13 0.25
14 0.25
15 0.24
16 0.24
17 0.21
18 0.17
19 0.16
20 0.12
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.09
26 0.09
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.14
31 0.17
32 0.25
33 0.34
34 0.43
35 0.45
36 0.5
37 0.5
38 0.52
39 0.56
40 0.57
41 0.56
42 0.56
43 0.61
44 0.57
45 0.58
46 0.58
47 0.55
48 0.54
49 0.55
50 0.54
51 0.56
52 0.6
53 0.59
54 0.53
55 0.5
56 0.45
57 0.38
58 0.34
59 0.26
60 0.23
61 0.25
62 0.27
63 0.26
64 0.23
65 0.22
66 0.2
67 0.22
68 0.28
69 0.27
70 0.31
71 0.32
72 0.36
73 0.43
74 0.48
75 0.49
76 0.46
77 0.48
78 0.43
79 0.44
80 0.45
81 0.43
82 0.43
83 0.49
84 0.51
85 0.5
86 0.5
87 0.48
88 0.44
89 0.42
90 0.39
91 0.32
92 0.26
93 0.23
94 0.23
95 0.23
96 0.21
97 0.17
98 0.16
99 0.14
100 0.17
101 0.18
102 0.17
103 0.17
104 0.19
105 0.2
106 0.19
107 0.21
108 0.2
109 0.19
110 0.18
111 0.21
112 0.19
113 0.18
114 0.16
115 0.16
116 0.16
117 0.24
118 0.32
119 0.4
120 0.49
121 0.57
122 0.64
123 0.73
124 0.72
125 0.71
126 0.69
127 0.66
128 0.61
129 0.52
130 0.44
131 0.34
132 0.31
133 0.3
134 0.29
135 0.22
136 0.24
137 0.3
138 0.33
139 0.38
140 0.42
141 0.4
142 0.44
143 0.52
144 0.51
145 0.52
146 0.5
147 0.45
148 0.42
149 0.36
150 0.31
151 0.22
152 0.2
153 0.19
154 0.24
155 0.24
156 0.25
157 0.25
158 0.22
159 0.23
160 0.22
161 0.15
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.11
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.11
184 0.11
185 0.12
186 0.14
187 0.1
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.11
206 0.12
207 0.13
208 0.15
209 0.15
210 0.15
211 0.15
212 0.16
213 0.14
214 0.14
215 0.15
216 0.17
217 0.17
218 0.17
219 0.22
220 0.21
221 0.2
222 0.25
223 0.29
224 0.32
225 0.35
226 0.44
227 0.49
228 0.55
229 0.59
230 0.64
231 0.69
232 0.71
233 0.77
234 0.79
235 0.79
236 0.82
237 0.85
238 0.85
239 0.77
240 0.72
241 0.66
242 0.57
243 0.49
244 0.39
245 0.3
246 0.22
247 0.21
248 0.19
249 0.18
250 0.16
251 0.2
252 0.26
253 0.32
254 0.34
255 0.38
256 0.46
257 0.49
258 0.56
259 0.6
260 0.62
261 0.61
262 0.65
263 0.69
264 0.63
265 0.6
266 0.55
267 0.52
268 0.47
269 0.44
270 0.4
271 0.36
272 0.36
273 0.33