Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D0BQM8

Protein Details
Accession A0A0D0BQM8    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-167NKKPASSAKTKSPTKRKRAAEDSEEHydrophilic
171-196EQGSKSKSAKAKRPVKRKKEAWETEDHydrophilic
202-224EEKSQKPQSKSKGKKPSSSKGRTHydrophilic
250-269TSKSKKPPSSKGKVSAKRSRHydrophilic
280-310EEEEKPKSKFKSKKPPSSKGKTPAKRSRKDVBasic
316-338ETESKKPSKKPASKPASKRRKAEBasic
459-481AALRSSKKTSSRKGKKSNDDTGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-100GPPPKGLPVRKSKS
137-162KKKPTLNKKPASSAKTKSPTKRKRAA
174-189SKSKSAKAKRPVKRKK
207-231KPQSKSKGKKPSSSKGRTPAQRSKK
252-270KSKKPPSSKGKVSAKRSRR
284-312KPKSKFKSKKPPSSKGKTPAKRSRKDVSE
316-336ETESKKPSKKPASKPASKRRK
463-474SSKKTSSRKGKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR016059  DNA_ligase_ATP-dep_CS  
IPR029319  DNA_ligase_OB  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR007527  Znf_SWIM  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF14743  DNA_ligase_OB_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00333  DNA_LIGASE_A2  
PS50966  ZF_SWIM  
CDD cd07896  Adenylation_kDNA_ligase_like  
cd08041  OBF_kDNA_ligase_like  
Amino Acid Sequences MENDELAEFNGIKPNYLLKEGEAKEVQSKTSDVKYDVKRTSDHFYCTCPAWRNQSGVPVNARSCKHLLSLLGEAYEEARLEAKNPGGPPPKGLPVRKSKSKVTGRVPEVSKLVSTTTKKEEADDRMDVDEDEDGEVKKKPTLNKKPASSAKTKSPTKRKRAAEDSEEDEGEQGSKSKSAKAKRPVKRKKEAWETEDEDDDEEEKSQKPQSKSKGKKPSSSKGRTPAQRSKKDASETEEEDEEEEEKPNSTSKSKKPPSSKGKVSAKRSRRDASETEEEDEEEEKPKSKFKSKKPPSSKGKTPAKRSRKDVSESEEETESKKPSKKPASKPASKRRKAEEDEPEDEPEDEQANSNDDTEGNGDKSEDEEDDSGSGDELASIKGIRPLVFLQDGEEKEIQSQSSSSTYKVKRTNDHYYCTCPAWRNQGGVPVNARSCKHLVALLGEKYEAARIKLKDPDGAALRSSKKTSSRKGKKSNDDTGASGSSAKSEVNVLLANTWDVDKGPDPTGWFISEKLDGVRTYYDGKRMYSRLGNPFTPPQWFLDKLPKDVTLDGELFGGRGQFQDTVSIVKTMNSPHWKDITFHVFDIPSIGTQPFESRIERLEKFFGLGGSHASDKVVLVEQEKAKSRQHVLDKLKEVESLGGEGLMLRQPGSQYEGKRSSTLLKIKSFYDAEAMVTGYKPGKGRNAGVTGALKCKMASGKTFDVGSGLNDKQRKNPPKIGTIIVYRFQELTKDGVPRFPTFLGEAADKMEPKDAIVPDHRKGAATKKSEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.28
4 0.27
5 0.23
6 0.33
7 0.34
8 0.4
9 0.35
10 0.34
11 0.38
12 0.38
13 0.37
14 0.3
15 0.3
16 0.28
17 0.32
18 0.34
19 0.31
20 0.39
21 0.45
22 0.53
23 0.56
24 0.54
25 0.52
26 0.52
27 0.57
28 0.53
29 0.51
30 0.43
31 0.43
32 0.43
33 0.43
34 0.46
35 0.43
36 0.43
37 0.46
38 0.49
39 0.48
40 0.47
41 0.53
42 0.5
43 0.49
44 0.49
45 0.46
46 0.46
47 0.48
48 0.47
49 0.42
50 0.41
51 0.38
52 0.34
53 0.32
54 0.3
55 0.27
56 0.3
57 0.26
58 0.23
59 0.22
60 0.19
61 0.17
62 0.16
63 0.11
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.11
68 0.14
69 0.16
70 0.19
71 0.2
72 0.29
73 0.35
74 0.35
75 0.39
76 0.4
77 0.46
78 0.5
79 0.54
80 0.54
81 0.57
82 0.65
83 0.7
84 0.71
85 0.69
86 0.72
87 0.76
88 0.77
89 0.76
90 0.77
91 0.72
92 0.75
93 0.7
94 0.63
95 0.56
96 0.48
97 0.38
98 0.29
99 0.27
100 0.26
101 0.27
102 0.28
103 0.32
104 0.37
105 0.36
106 0.39
107 0.43
108 0.42
109 0.44
110 0.41
111 0.37
112 0.33
113 0.33
114 0.3
115 0.24
116 0.18
117 0.13
118 0.11
119 0.11
120 0.1
121 0.11
122 0.14
123 0.14
124 0.18
125 0.21
126 0.29
127 0.39
128 0.49
129 0.58
130 0.64
131 0.69
132 0.75
133 0.79
134 0.77
135 0.74
136 0.68
137 0.68
138 0.68
139 0.71
140 0.71
141 0.74
142 0.78
143 0.8
144 0.84
145 0.82
146 0.82
147 0.83
148 0.81
149 0.77
150 0.72
151 0.68
152 0.61
153 0.53
154 0.43
155 0.35
156 0.27
157 0.2
158 0.14
159 0.11
160 0.08
161 0.12
162 0.12
163 0.19
164 0.25
165 0.33
166 0.42
167 0.51
168 0.61
169 0.67
170 0.77
171 0.82
172 0.86
173 0.88
174 0.87
175 0.87
176 0.87
177 0.86
178 0.8
179 0.77
180 0.72
181 0.64
182 0.58
183 0.48
184 0.37
185 0.3
186 0.25
187 0.17
188 0.13
189 0.12
190 0.11
191 0.13
192 0.17
193 0.24
194 0.28
195 0.36
196 0.45
197 0.55
198 0.63
199 0.71
200 0.77
201 0.76
202 0.8
203 0.81
204 0.81
205 0.81
206 0.8
207 0.77
208 0.74
209 0.77
210 0.76
211 0.76
212 0.76
213 0.76
214 0.76
215 0.76
216 0.72
217 0.7
218 0.67
219 0.61
220 0.57
221 0.52
222 0.46
223 0.42
224 0.37
225 0.31
226 0.26
227 0.23
228 0.19
229 0.13
230 0.12
231 0.09
232 0.09
233 0.1
234 0.12
235 0.14
236 0.17
237 0.24
238 0.31
239 0.42
240 0.49
241 0.57
242 0.63
243 0.71
244 0.76
245 0.78
246 0.77
247 0.76
248 0.79
249 0.79
250 0.8
251 0.8
252 0.78
253 0.77
254 0.77
255 0.71
256 0.64
257 0.62
258 0.56
259 0.53
260 0.53
261 0.47
262 0.42
263 0.38
264 0.34
265 0.29
266 0.26
267 0.2
268 0.14
269 0.12
270 0.13
271 0.13
272 0.18
273 0.22
274 0.31
275 0.39
276 0.47
277 0.58
278 0.65
279 0.76
280 0.8
281 0.86
282 0.87
283 0.87
284 0.84
285 0.83
286 0.84
287 0.8
288 0.81
289 0.81
290 0.82
291 0.8
292 0.79
293 0.76
294 0.72
295 0.69
296 0.63
297 0.59
298 0.55
299 0.5
300 0.45
301 0.39
302 0.33
303 0.3
304 0.28
305 0.23
306 0.21
307 0.25
308 0.27
309 0.35
310 0.45
311 0.53
312 0.6
313 0.69
314 0.74
315 0.77
316 0.84
317 0.85
318 0.86
319 0.83
320 0.79
321 0.75
322 0.75
323 0.71
324 0.69
325 0.68
326 0.64
327 0.61
328 0.57
329 0.51
330 0.42
331 0.37
332 0.28
333 0.19
334 0.13
335 0.09
336 0.08
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.09
346 0.08
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.06
360 0.05
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.07
369 0.08
370 0.08
371 0.09
372 0.09
373 0.11
374 0.12
375 0.11
376 0.11
377 0.15
378 0.15
379 0.17
380 0.17
381 0.14
382 0.14
383 0.15
384 0.13
385 0.08
386 0.09
387 0.07
388 0.1
389 0.11
390 0.12
391 0.19
392 0.21
393 0.28
394 0.34
395 0.37
396 0.39
397 0.46
398 0.56
399 0.52
400 0.55
401 0.5
402 0.49
403 0.47
404 0.43
405 0.38
406 0.3
407 0.28
408 0.31
409 0.31
410 0.28
411 0.26
412 0.33
413 0.31
414 0.31
415 0.3
416 0.24
417 0.23
418 0.24
419 0.24
420 0.19
421 0.19
422 0.18
423 0.17
424 0.16
425 0.15
426 0.15
427 0.19
428 0.17
429 0.16
430 0.15
431 0.14
432 0.13
433 0.15
434 0.12
435 0.1
436 0.15
437 0.16
438 0.19
439 0.24
440 0.25
441 0.25
442 0.25
443 0.27
444 0.24
445 0.24
446 0.21
447 0.21
448 0.24
449 0.23
450 0.24
451 0.23
452 0.29
453 0.36
454 0.44
455 0.51
456 0.59
457 0.67
458 0.76
459 0.83
460 0.84
461 0.85
462 0.85
463 0.79
464 0.7
465 0.61
466 0.53
467 0.44
468 0.34
469 0.26
470 0.17
471 0.12
472 0.11
473 0.09
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.08
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.06
486 0.05
487 0.07
488 0.07
489 0.1
490 0.12
491 0.12
492 0.13
493 0.15
494 0.16
495 0.16
496 0.16
497 0.14
498 0.14
499 0.14
500 0.13
501 0.12
502 0.14
503 0.12
504 0.13
505 0.13
506 0.13
507 0.17
508 0.18
509 0.23
510 0.22
511 0.24
512 0.27
513 0.28
514 0.3
515 0.31
516 0.36
517 0.39
518 0.41
519 0.41
520 0.39
521 0.43
522 0.4
523 0.37
524 0.32
525 0.27
526 0.27
527 0.28
528 0.27
529 0.33
530 0.34
531 0.34
532 0.36
533 0.34
534 0.31
535 0.3
536 0.3
537 0.23
538 0.21
539 0.18
540 0.16
541 0.14
542 0.12
543 0.11
544 0.09
545 0.06
546 0.06
547 0.07
548 0.07
549 0.08
550 0.1
551 0.1
552 0.12
553 0.13
554 0.14
555 0.12
556 0.13
557 0.14
558 0.14
559 0.22
560 0.27
561 0.29
562 0.31
563 0.35
564 0.35
565 0.35
566 0.39
567 0.39
568 0.34
569 0.31
570 0.3
571 0.26
572 0.24
573 0.25
574 0.19
575 0.12
576 0.11
577 0.11
578 0.09
579 0.1
580 0.12
581 0.13
582 0.15
583 0.16
584 0.16
585 0.2
586 0.26
587 0.27
588 0.29
589 0.28
590 0.26
591 0.26
592 0.26
593 0.22
594 0.16
595 0.15
596 0.14
597 0.13
598 0.13
599 0.12
600 0.11
601 0.11
602 0.1
603 0.11
604 0.11
605 0.1
606 0.11
607 0.17
608 0.2
609 0.24
610 0.3
611 0.31
612 0.33
613 0.38
614 0.41
615 0.43
616 0.49
617 0.54
618 0.56
619 0.62
620 0.64
621 0.62
622 0.58
623 0.51
624 0.43
625 0.35
626 0.28
627 0.21
628 0.15
629 0.11
630 0.09
631 0.09
632 0.09
633 0.09
634 0.08
635 0.07
636 0.09
637 0.09
638 0.11
639 0.16
640 0.2
641 0.21
642 0.3
643 0.36
644 0.37
645 0.37
646 0.38
647 0.38
648 0.42
649 0.46
650 0.44
651 0.43
652 0.43
653 0.43
654 0.48
655 0.43
656 0.35
657 0.31
658 0.25
659 0.2
660 0.19
661 0.19
662 0.13
663 0.12
664 0.14
665 0.12
666 0.15
667 0.16
668 0.18
669 0.25
670 0.29
671 0.33
672 0.38
673 0.4
674 0.38
675 0.4
676 0.42
677 0.37
678 0.37
679 0.34
680 0.27
681 0.23
682 0.26
683 0.27
684 0.25
685 0.27
686 0.3
687 0.33
688 0.36
689 0.36
690 0.32
691 0.29
692 0.26
693 0.24
694 0.23
695 0.2
696 0.24
697 0.29
698 0.31
699 0.38
700 0.48
701 0.56
702 0.58
703 0.66
704 0.66
705 0.69
706 0.72
707 0.68
708 0.62
709 0.61
710 0.57
711 0.53
712 0.48
713 0.41
714 0.38
715 0.33
716 0.31
717 0.24
718 0.24
719 0.23
720 0.28
721 0.28
722 0.33
723 0.36
724 0.36
725 0.39
726 0.34
727 0.32
728 0.27
729 0.29
730 0.26
731 0.24
732 0.22
733 0.21
734 0.23
735 0.22
736 0.21
737 0.22
738 0.19
739 0.19
740 0.25
741 0.23
742 0.26
743 0.35
744 0.41
745 0.4
746 0.47
747 0.46
748 0.41
749 0.44
750 0.47
751 0.47