FuNGI

A0A0H2RAF1

Protein Details

Accession

A0A0H2RAF1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
246-273	LLVPRFRQPSGKRKRGRPLRKLLTRDDL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
253-266	QPSGKRKRGRPLRK

Subcellular Location(s)

cyto 10.5, cyto_mito 9, nucl 7, mito 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002562 3'-5'_exonuclease_dom IPR005824 KOW IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0008408 F:3'-5' exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006139 P:nucleobase-containing compound metabolic process GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF01612 DNA_pol_A_exo1 PF03439 Spt5-NGN

Amino Acid Sequences

MAITTLPSACRDLDNRSVTQWTRLSGDRQRLTTRLRNFPIPQRSGEVLLLPPCLLFSVPLKAWVRGLLSKDNDFINDSDEEDASYDSQGPVALDPAGDFEAFCDSLAQKRVQANEVEEDLNELPLWGLRVKAGREFQLAKQIRRAARATYVFFEIKDAFAVRKSPGWIYIRSKSESLVLKLCERMVGIFKTSIILIPTEEHSSLFAEFGDKELEVATWVKIVRGIYKYNFGIVLSSSKSKSTTTVLLVPRFRQPSGKRKRGRPLRKLLTRDDLRISLFNHLATSSLSSADKETNQKRFMASIEDTSGGFKFDGEYYTTLGFIVRDYAPSELQVTQPRPGDVQEFIDAGIPFSARFLNVGDIVRVLSGKHARNLARVLTKGRDGTVRVALVDEYLQTGSIFTVLNELDVIREFKEGDGVVARLGSNTGKSGIVIRTIGSMLLVKEYETNEEFELQSAFAETDLPSVPSSAPTRVLAEPKGVVAGGTLVYVFDGSLAGKLGFLREIKEMSALVDMGADGLHWLWRDILITEDNRNLCNESSPKFDDDKVRSAFELYQAAPPTDVIALEMVNETVYVLRGPHKGKLGVVKGVAAKDALVAFESVLAGARPQQIARSDLLSKTIFDLNGDRPEGYTDEKKEEFSCLFERTVFQRERTPPTQVDEVEESDETEENTPFHDPIKEGMWVFDPLVAAHRSTHKLSVELLGHPDPKVKYGWICRAEGEIPMHPLASSFPPKLPIEYKTSHGASCVEEYAVKLIRPRTKTNALHLAVKGNKKGQFFRHIRTKDGKARVYPKGSENRKDVTEIDANHLCEVDEILKRNRGVSSARDKKKVDKIWQTVLDRLLVPRAYRFNAFPSLPRLIVLLSEESVNRALLCLRARSPPFIALDIEERPIEDKETRHTDLVQLRDESTIYLVHLAAMGMARDRMPVQLRELLEDGEILKIANHVRGDGCRLYRSHGCNIRGAVELSQVAIHVDPTAWPLHVSRARRLSNPRFWVKPPAYQNDNTRALEAMSVLYLRRVLSKEAQVSMWHLPLTEKMKLYAANDVDATFRVFIQLSHKPQFATVKRDAYIMDYIEDRARFRGTTRKWKAAGHPNHP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.38
3	0.39
4	0.45
5	0.42
6	0.46
7	0.43
8	0.36
9	0.35
10	0.37
11	0.42
12	0.43
13	0.52
14	0.5
15	0.53
16	0.56
17	0.57
18	0.62
19	0.63
20	0.63
21	0.63
22	0.62
23	0.65
24	0.67
25	0.71
26	0.73
27	0.68
28	0.62
29	0.58
30	0.56
31	0.51
32	0.45
33	0.38
34	0.31
35	0.29
36	0.27
37	0.21
38	0.19
39	0.15
40	0.15
41	0.12
42	0.1
43	0.11
44	0.17
45	0.17
46	0.26
47	0.28
48	0.29
49	0.3
50	0.31
51	0.32
52	0.3
53	0.34
54	0.34
55	0.36
56	0.37
57	0.39
58	0.37
59	0.34
60	0.32
61	0.28
62	0.23
63	0.19
64	0.18
65	0.18
66	0.16
67	0.15
68	0.14
69	0.14
70	0.11
71	0.12
72	0.12
73	0.1
74	0.1
75	0.11
76	0.1
77	0.1
78	0.1
79	0.09
80	0.08
81	0.08
82	0.1
83	0.1
84	0.09
85	0.09
86	0.08
87	0.12
88	0.12
89	0.12
90	0.12
91	0.12
92	0.17
93	0.22
94	0.23
95	0.24
96	0.28
97	0.32
98	0.33
99	0.36
100	0.34
101	0.34
102	0.35
103	0.3
104	0.26
105	0.26
106	0.23
107	0.2
108	0.17
109	0.12
110	0.1
111	0.1
112	0.12
113	0.09
114	0.09
115	0.11
116	0.16
117	0.18
118	0.24
119	0.27
120	0.29
121	0.34
122	0.38
123	0.37
124	0.43
125	0.47
126	0.43
127	0.47
128	0.51
129	0.48
130	0.5
131	0.5
132	0.43
133	0.46
134	0.49
135	0.44
136	0.39
137	0.41
138	0.36
139	0.34
140	0.34
141	0.26
142	0.21
143	0.2
144	0.18
145	0.14
146	0.15
147	0.18
148	0.16
149	0.19
150	0.21
151	0.2
152	0.27
153	0.29
154	0.34
155	0.39
156	0.45
157	0.46
158	0.47
159	0.46
160	0.4
161	0.42
162	0.41
163	0.37
164	0.35
165	0.32
166	0.32
167	0.33
168	0.32
169	0.27
170	0.22
171	0.2
172	0.2
173	0.19
174	0.19
175	0.18
176	0.18
177	0.18
178	0.17
179	0.17
180	0.12
181	0.11
182	0.1
183	0.11
184	0.13
185	0.15
186	0.15
187	0.14
188	0.14
189	0.15
190	0.14
191	0.12
192	0.1
193	0.09
194	0.09
195	0.1
196	0.1
197	0.09
198	0.09
199	0.09
200	0.09
201	0.09
202	0.1
203	0.09
204	0.1
205	0.1
206	0.1
207	0.12
208	0.13
209	0.17
210	0.2
211	0.25
212	0.24
213	0.31
214	0.31
215	0.29
216	0.29
217	0.23
218	0.21
219	0.17
220	0.18
221	0.15
222	0.18
223	0.17
224	0.18
225	0.2
226	0.19
227	0.21
228	0.21
229	0.22
230	0.22
231	0.29
232	0.33
233	0.38
234	0.4
235	0.39
236	0.43
237	0.42
238	0.4
239	0.41
240	0.43
241	0.48
242	0.56
243	0.65
244	0.66
245	0.72
246	0.82
247	0.84
248	0.88
249	0.87
250	0.87
251	0.88
252	0.88
253	0.85
254	0.8
255	0.79
256	0.72
257	0.65
258	0.58
259	0.49
260	0.42
261	0.39
262	0.34
263	0.28
264	0.26
265	0.22
266	0.19
267	0.17
268	0.15
269	0.13
270	0.14
271	0.1
272	0.1
273	0.11
274	0.11
275	0.12
276	0.14
277	0.17
278	0.24
279	0.3
280	0.36
281	0.38
282	0.39
283	0.38
284	0.37
285	0.34
286	0.32
287	0.26
288	0.21
289	0.21
290	0.21
291	0.2
292	0.2
293	0.19
294	0.14
295	0.12
296	0.09
297	0.09
298	0.08
299	0.1
300	0.1
301	0.11
302	0.12
303	0.12
304	0.13
305	0.11
306	0.11
307	0.09
308	0.07
309	0.1
310	0.08
311	0.09
312	0.1
313	0.11
314	0.11
315	0.12
316	0.14
317	0.12
318	0.15
319	0.2
320	0.21
321	0.24
322	0.25
323	0.25
324	0.24
325	0.24
326	0.23
327	0.18
328	0.19
329	0.16
330	0.14
331	0.14
332	0.17
333	0.15
334	0.13
335	0.12
336	0.1
337	0.08
338	0.09
339	0.09
340	0.05
341	0.06
342	0.07
343	0.08
344	0.1
345	0.11
346	0.1
347	0.1
348	0.1
349	0.1
350	0.09
351	0.07
352	0.1
353	0.16
354	0.18
355	0.2
356	0.26
357	0.26
358	0.3
359	0.32
360	0.31
361	0.29
362	0.29
363	0.3
364	0.27
365	0.29
366	0.26
367	0.25
368	0.23
369	0.21
370	0.22
371	0.22
372	0.2
373	0.17
374	0.17
375	0.15
376	0.13
377	0.12
378	0.09
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.06
386	0.06
387	0.04
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.07
392	0.07
393	0.06
394	0.07
395	0.08
396	0.06
397	0.07
398	0.07
399	0.07
400	0.09
401	0.09
402	0.09
403	0.09
404	0.08
405	0.08
406	0.08
407	0.08
408	0.06
409	0.07
410	0.07
411	0.06
412	0.06
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.1
417	0.1
418	0.11
419	0.11
420	0.1
421	0.1
422	0.1
423	0.1
424	0.07
425	0.08
426	0.06
427	0.07
428	0.07
429	0.06
430	0.08
431	0.09
432	0.11
433	0.11
434	0.12
435	0.11
436	0.13
437	0.12
438	0.11
439	0.11
440	0.08
441	0.07
442	0.06
443	0.06
444	0.05
445	0.05
446	0.05
447	0.06
448	0.06
449	0.07
450	0.07
451	0.08
452	0.08
453	0.1
454	0.11
455	0.11
456	0.12
457	0.12
458	0.15
459	0.16
460	0.19
461	0.17
462	0.16
463	0.15
464	0.14
465	0.13
466	0.1
467	0.08
468	0.06
469	0.05
470	0.04
471	0.04
472	0.04
473	0.03
474	0.03
475	0.03
476	0.03
477	0.03
478	0.03
479	0.03
480	0.03
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.05
486	0.06
487	0.07
488	0.08
489	0.09
490	0.09
491	0.09
492	0.1
493	0.1
494	0.09
495	0.09
496	0.07
497	0.06
498	0.05
499	0.05
500	0.04
501	0.04
502	0.03
503	0.02
504	0.03
505	0.04
506	0.04
507	0.04
508	0.04
509	0.04
510	0.05
511	0.05
512	0.07
513	0.08
514	0.09
515	0.11
516	0.14
517	0.14
518	0.14
519	0.15
520	0.14
521	0.12
522	0.14
523	0.15
524	0.14
525	0.18
526	0.19
527	0.21
528	0.21
529	0.24
530	0.27
531	0.28
532	0.33
533	0.31
534	0.3
535	0.27
536	0.27
537	0.25
538	0.2
539	0.19
540	0.13
541	0.14
542	0.14
543	0.14
544	0.13
545	0.12
546	0.11
547	0.09
548	0.07
549	0.05
550	0.04
551	0.04
552	0.04
553	0.05
554	0.04
555	0.04
556	0.03
557	0.03
558	0.03
559	0.03
560	0.03
561	0.04
562	0.07
563	0.12
564	0.13
565	0.16
566	0.18
567	0.19
568	0.2
569	0.26
570	0.25
571	0.23
572	0.22
573	0.21
574	0.2
575	0.2
576	0.18
577	0.12
578	0.09
579	0.08
580	0.08
581	0.06
582	0.05
583	0.05
584	0.04
585	0.05
586	0.04
587	0.04
588	0.04
589	0.03
590	0.03
591	0.05
592	0.07
593	0.07
594	0.07
595	0.1
596	0.11
597	0.13
598	0.14
599	0.15
600	0.15
601	0.15
602	0.18
603	0.16
604	0.15
605	0.15
606	0.16
607	0.13
608	0.12
609	0.15
610	0.14
611	0.18
612	0.18
613	0.16
614	0.14
615	0.16
616	0.16
617	0.17
618	0.18
619	0.17
620	0.21
621	0.21
622	0.22
623	0.22
624	0.23
625	0.2
626	0.19
627	0.2
628	0.17
629	0.17
630	0.16
631	0.18
632	0.18
633	0.25
634	0.23
635	0.22
636	0.28
637	0.32
638	0.39
639	0.4
640	0.42
641	0.36
642	0.38
643	0.4
644	0.33
645	0.31
646	0.26
647	0.24
648	0.21
649	0.19
650	0.16
651	0.12
652	0.12
653	0.1
654	0.09
655	0.09
656	0.07
657	0.08
658	0.09
659	0.09
660	0.1
661	0.1
662	0.09
663	0.1
664	0.13
665	0.14
666	0.13
667	0.13
668	0.14
669	0.14
670	0.13
671	0.13
672	0.11
673	0.09
674	0.12
675	0.12
676	0.1
677	0.11
678	0.15
679	0.17
680	0.18
681	0.22
682	0.19
683	0.2
684	0.2
685	0.23
686	0.21
687	0.18
688	0.21
689	0.19
690	0.19
691	0.19
692	0.22
693	0.18
694	0.18
695	0.18
696	0.16
697	0.19
698	0.25
699	0.33
700	0.32
701	0.33
702	0.32
703	0.34
704	0.33
705	0.3
706	0.27
707	0.19
708	0.18
709	0.17
710	0.17
711	0.14
712	0.13
713	0.12
714	0.14
715	0.17
716	0.16
717	0.16
718	0.21
719	0.21
720	0.24
721	0.25
722	0.24
723	0.26
724	0.27
725	0.29
726	0.3
727	0.31
728	0.28
729	0.26
730	0.25
731	0.2
732	0.2
733	0.17
734	0.12
735	0.11
736	0.11
737	0.13
738	0.13
739	0.12
740	0.14
741	0.2
742	0.26
743	0.3
744	0.35
745	0.39
746	0.48
747	0.5
748	0.54
749	0.57
750	0.52
751	0.53
752	0.49
753	0.49
754	0.44
755	0.45
756	0.41
757	0.37
758	0.4
759	0.38
760	0.42
761	0.41
762	0.46
763	0.47
764	0.52
765	0.56
766	0.54
767	0.56
768	0.58
769	0.61
770	0.6
771	0.63
772	0.6
773	0.57
774	0.62
775	0.64
776	0.62
777	0.56
778	0.54
779	0.56
780	0.59
781	0.58
782	0.55
783	0.52
784	0.48
785	0.47
786	0.41
787	0.36
788	0.34
789	0.29
790	0.3
791	0.3
792	0.29
793	0.27
794	0.26
795	0.2
796	0.16
797	0.15
798	0.14
799	0.13
800	0.16
801	0.19
802	0.24
803	0.24
804	0.26
805	0.25
806	0.24
807	0.25
808	0.29
809	0.37
810	0.43
811	0.49
812	0.54
813	0.56
814	0.61
815	0.68
816	0.69
817	0.67
818	0.67
819	0.67
820	0.69
821	0.74
822	0.68
823	0.62
824	0.55
825	0.47
826	0.37
827	0.32
828	0.28
829	0.21
830	0.19
831	0.2
832	0.23
833	0.23
834	0.25
835	0.25
836	0.25
837	0.3
838	0.3
839	0.28
840	0.3
841	0.31
842	0.29
843	0.27
844	0.24
845	0.18
846	0.18
847	0.17
848	0.13
849	0.1
850	0.11
851	0.1
852	0.11
853	0.12
854	0.11
855	0.09
856	0.08
857	0.09
858	0.12
859	0.14
860	0.16
861	0.18
862	0.25
863	0.28
864	0.31
865	0.32
866	0.33
867	0.32
868	0.3
869	0.29
870	0.23
871	0.25
872	0.22
873	0.22
874	0.17
875	0.16
876	0.16
877	0.16
878	0.17
879	0.17
880	0.17
881	0.23
882	0.3
883	0.33
884	0.32
885	0.32
886	0.36
887	0.39
888	0.42
889	0.39
890	0.33
891	0.31
892	0.3
893	0.3
894	0.23
895	0.18
896	0.14
897	0.1
898	0.1
899	0.09
900	0.08
901	0.08
902	0.08
903	0.07
904	0.07
905	0.07
906	0.06
907	0.07
908	0.07
909	0.08
910	0.09
911	0.13
912	0.17
913	0.19
914	0.22
915	0.27
916	0.28
917	0.3
918	0.31
919	0.26
920	0.22
921	0.21
922	0.17
923	0.12
924	0.11
925	0.08
926	0.07
927	0.09
928	0.1
929	0.14
930	0.13
931	0.14
932	0.16
933	0.18
934	0.23
935	0.26
936	0.27
937	0.27
938	0.28
939	0.32
940	0.38
941	0.41
942	0.45
943	0.49
944	0.48
945	0.49
946	0.5
947	0.46
948	0.41
949	0.38
950	0.29
951	0.23
952	0.21
953	0.17
954	0.15
955	0.13
956	0.11
957	0.1
958	0.09
959	0.07
960	0.07
961	0.07
962	0.09
963	0.1
964	0.09
965	0.11
966	0.11
967	0.2
968	0.26
969	0.3
970	0.36
971	0.44
972	0.47
973	0.53
974	0.63
975	0.64
976	0.68
977	0.73
978	0.72
979	0.68
980	0.68
981	0.71
982	0.65
983	0.64
984	0.62
985	0.62
986	0.6
987	0.61
988	0.65
989	0.63
990	0.66
991	0.58
992	0.51
993	0.43
994	0.37
995	0.31
996	0.25
997	0.16
998	0.1
999	0.1
1000	0.09
1001	0.1
1002	0.11
1003	0.11
1004	0.15
1005	0.16
1006	0.2
1007	0.26
1008	0.33
1009	0.37
1010	0.38
1011	0.39
1012	0.35
1013	0.37
1014	0.36
1015	0.32
1016	0.25
1017	0.2
1018	0.19
1019	0.25
1020	0.29
1021	0.3
1022	0.27
1023	0.27
1024	0.29
1025	0.32
1026	0.32
1027	0.34
1028	0.3
1029	0.26
1030	0.26
1031	0.25
1032	0.23
1033	0.21
1034	0.21
1035	0.14
1036	0.12
1037	0.12
1038	0.12
1039	0.13
1040	0.19
1041	0.27
1042	0.33
1043	0.38
1044	0.4
1045	0.38
1046	0.43
1047	0.52
1048	0.5
1049	0.5
1050	0.49
1051	0.5
1052	0.49
1053	0.5
1054	0.45
1055	0.39
1056	0.38
1057	0.31
1058	0.25
1059	0.2
1060	0.21
1061	0.25
1062	0.26
1063	0.24
1064	0.22
1065	0.23
1066	0.22
1067	0.25
1068	0.33
1069	0.38
1070	0.48
1071	0.55
1072	0.61
1073	0.63
1074	0.68
1075	0.75
1076	0.75

A0A0H2RAF1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer