FuNGI

A0A0H2RDT8

Protein Details

Accession

A0A0H2RDT8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
246-274	APAARQKPTKRLRMQKRRPLPRRIQHEDA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
248-268	AARQKPTKRLRMQKRRPLPRR

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, pero 2, cysk 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03439 Spt5-NGN

Amino Acid Sequences

MVPFSSVGDHARDMEEDDDDDDEVGDVEEDNVSVDEDSELEAEKYDGVEDFLLEPQTMLFRRMDNNSNPESYTTEITLEYRQAKKNAALYRYLESSRTPRIPPALSTMPIFAIKTKIGRQRDVFWFATERWQAIWLGNRKPDVLSVFEVPNSPGWVYVEAKSVETIQNLFDGCIYVSLTSLNLHQRVANIHPSLFKVILSPPRPLGIEAHAWIKVLGGLYHGDIGQVRSVDEDLGIVDVAVVPRLAPAARQKPTKRLRMQKRRPLPRRIQHEDAIEGYSGADIAKTVENGFEMRGHFYEESGFRIVSLSINALEPATPTMLEISNFLDAATERIIREHTDSTTYTDEDVWRVGHIDIHKLSIQCFLKVGDAVEIIGGRRRGMGGYISRTLEEGKVMVALETGYENQPSIVEYEEHVHLVRAVFRRGQSITVKLGAFAGRTGIVEKVLQNGSLVFREAHTLDDLSVPSCFVETSPCDMVMRSHLSTANGSVIAVPGIPAVLDIVDKLAYKYSDKIVYVWKGEKRGKIGRVLAIGSSRAQICVNGKSVLSVKRENLMSPILETLKDGKLPERFRDEIQQKQLKLLINRLIYGVSGPSQLTPSEPALVALPALEIPPSLPPPSPSGQIQRDTDQVSDLNAHTEKMQESVAYDTNPDLPMMWLFDPKIAILRKQYKILVKFSPTVKPISLQKRTAKITKAAEPKMFPLDPSMRPTIEVEYTDNRAIPRCHQMPIENFTISSPQNGGQLLVIYGEMKGTIVRHVKTIHDLVYVKLCSGGSAFKVPKTSVCPVED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.18
3	0.16
4	0.16
5	0.15
6	0.14
7	0.13
8	0.11
9	0.1
10	0.08
11	0.08
12	0.07
13	0.06
14	0.06
15	0.06
16	0.06
17	0.07
18	0.07
19	0.07
20	0.07
21	0.07
22	0.07
23	0.07
24	0.08
25	0.08
26	0.09
27	0.08
28	0.09
29	0.09
30	0.09
31	0.09
32	0.09
33	0.08
34	0.08
35	0.08
36	0.09
37	0.1
38	0.12
39	0.12
40	0.12
41	0.11
42	0.11
43	0.16
44	0.16
45	0.17
46	0.16
47	0.18
48	0.23
49	0.29
50	0.36
51	0.38
52	0.44
53	0.46
54	0.46
55	0.44
56	0.41
57	0.38
58	0.33
59	0.29
60	0.23
61	0.2
62	0.19
63	0.2
64	0.2
65	0.23
66	0.27
67	0.31
68	0.36
69	0.38
70	0.41
71	0.44
72	0.49
73	0.51
74	0.47
75	0.46
76	0.44
77	0.45
78	0.46
79	0.42
80	0.36
81	0.33
82	0.35
83	0.38
84	0.39
85	0.37
86	0.37
87	0.42
88	0.43
89	0.41
90	0.43
91	0.39
92	0.36
93	0.36
94	0.32
95	0.28
96	0.27
97	0.25
98	0.19
99	0.17
100	0.18
101	0.21
102	0.27
103	0.34
104	0.38
105	0.45
106	0.47
107	0.51
108	0.57
109	0.59
110	0.53
111	0.47
112	0.45
113	0.39
114	0.44
115	0.37
116	0.31
117	0.25
118	0.25
119	0.23
120	0.23
121	0.3
122	0.28
123	0.33
124	0.36
125	0.37
126	0.36
127	0.36
128	0.36
129	0.3
130	0.27
131	0.24
132	0.23
133	0.23
134	0.23
135	0.23
136	0.21
137	0.2
138	0.18
139	0.15
140	0.12
141	0.12
142	0.15
143	0.16
144	0.17
145	0.2
146	0.19
147	0.2
148	0.19
149	0.2
150	0.19
151	0.18
152	0.17
153	0.12
154	0.14
155	0.14
156	0.13
157	0.11
158	0.1
159	0.09
160	0.09
161	0.09
162	0.07
163	0.07
164	0.07
165	0.07
166	0.07
167	0.1
168	0.15
169	0.15
170	0.16
171	0.17
172	0.18
173	0.21
174	0.24
175	0.27
176	0.23
177	0.23
178	0.25
179	0.25
180	0.27
181	0.24
182	0.2
183	0.15
184	0.19
185	0.26
186	0.27
187	0.28
188	0.26
189	0.28
190	0.28
191	0.27
192	0.24
193	0.19
194	0.2
195	0.19
196	0.2
197	0.18
198	0.18
199	0.17
200	0.15
201	0.13
202	0.1
203	0.08
204	0.07
205	0.07
206	0.08
207	0.09
208	0.08
209	0.08
210	0.08
211	0.09
212	0.09
213	0.09
214	0.08
215	0.08
216	0.09
217	0.08
218	0.08
219	0.07
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.04
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.05
232	0.05
233	0.07
234	0.15
235	0.23
236	0.29
237	0.37
238	0.4
239	0.5
240	0.58
241	0.66
242	0.67
243	0.69
244	0.76
245	0.79
246	0.87
247	0.87
248	0.9
249	0.91
250	0.9
251	0.9
252	0.89
253	0.86
254	0.85
255	0.83
256	0.78
257	0.71
258	0.64
259	0.56
260	0.46
261	0.39
262	0.28
263	0.2
264	0.15
265	0.1
266	0.08
267	0.06
268	0.04
269	0.03
270	0.05
271	0.05
272	0.06
273	0.06
274	0.06
275	0.07
276	0.08
277	0.08
278	0.09
279	0.09
280	0.11
281	0.11
282	0.14
283	0.13
284	0.13
285	0.15
286	0.14
287	0.16
288	0.15
289	0.14
290	0.11
291	0.12
292	0.12
293	0.09
294	0.09
295	0.07
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.05
305	0.05
306	0.06
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.08
314	0.07
315	0.06
316	0.07
317	0.08
318	0.08
319	0.07
320	0.08
321	0.09
322	0.09
323	0.12
324	0.12
325	0.12
326	0.14
327	0.14
328	0.17
329	0.18
330	0.17
331	0.15
332	0.15
333	0.14
334	0.12
335	0.12
336	0.09
337	0.08
338	0.09
339	0.08
340	0.09
341	0.1
342	0.13
343	0.13
344	0.14
345	0.16
346	0.15
347	0.16
348	0.2
349	0.2
350	0.17
351	0.17
352	0.15
353	0.14
354	0.14
355	0.14
356	0.08
357	0.07
358	0.07
359	0.06
360	0.06
361	0.05
362	0.07
363	0.07
364	0.06
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.07
369	0.1
370	0.11
371	0.14
372	0.16
373	0.16
374	0.16
375	0.17
376	0.17
377	0.14
378	0.11
379	0.08
380	0.05
381	0.06
382	0.05
383	0.05
384	0.04
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.06
399	0.08
400	0.09
401	0.09
402	0.09
403	0.08
404	0.08
405	0.08
406	0.12
407	0.12
408	0.13
409	0.15
410	0.15
411	0.19
412	0.18
413	0.22
414	0.19
415	0.2
416	0.2
417	0.21
418	0.21
419	0.18
420	0.18
421	0.15
422	0.13
423	0.1
424	0.09
425	0.06
426	0.06
427	0.07
428	0.06
429	0.06
430	0.07
431	0.07
432	0.1
433	0.1
434	0.1
435	0.09
436	0.1
437	0.1
438	0.1
439	0.11
440	0.07
441	0.07
442	0.09
443	0.09
444	0.09
445	0.09
446	0.09
447	0.08
448	0.1
449	0.1
450	0.08
451	0.08
452	0.07
453	0.06
454	0.06
455	0.06
456	0.04
457	0.07
458	0.08
459	0.12
460	0.13
461	0.13
462	0.13
463	0.14
464	0.14
465	0.15
466	0.18
467	0.14
468	0.15
469	0.16
470	0.17
471	0.17
472	0.17
473	0.14
474	0.1
475	0.1
476	0.08
477	0.07
478	0.06
479	0.05
480	0.05
481	0.03
482	0.03
483	0.03
484	0.03
485	0.03
486	0.03
487	0.03
488	0.03
489	0.04
490	0.05
491	0.05
492	0.05
493	0.07
494	0.08
495	0.09
496	0.11
497	0.14
498	0.17
499	0.17
500	0.18
501	0.23
502	0.25
503	0.27
504	0.31
505	0.31
506	0.36
507	0.4
508	0.41
509	0.42
510	0.46
511	0.46
512	0.47
513	0.47
514	0.42
515	0.39
516	0.37
517	0.31
518	0.25
519	0.23
520	0.17
521	0.16
522	0.13
523	0.12
524	0.11
525	0.12
526	0.14
527	0.16
528	0.18
529	0.17
530	0.17
531	0.17
532	0.21
533	0.25
534	0.26
535	0.26
536	0.25
537	0.29
538	0.3
539	0.28
540	0.27
541	0.23
542	0.19
543	0.17
544	0.18
545	0.14
546	0.13
547	0.14
548	0.15
549	0.14
550	0.16
551	0.16
552	0.18
553	0.25
554	0.28
555	0.32
556	0.36
557	0.36
558	0.37
559	0.46
560	0.47
561	0.47
562	0.54
563	0.55
564	0.48
565	0.49
566	0.51
567	0.46
568	0.43
569	0.41
570	0.38
571	0.32
572	0.33
573	0.3
574	0.26
575	0.22
576	0.2
577	0.15
578	0.09
579	0.09
580	0.09
581	0.09
582	0.1
583	0.1
584	0.11
585	0.12
586	0.13
587	0.13
588	0.13
589	0.13
590	0.13
591	0.12
592	0.11
593	0.08
594	0.07
595	0.05
596	0.06
597	0.05
598	0.04
599	0.05
600	0.08
601	0.1
602	0.11
603	0.12
604	0.13
605	0.18
606	0.21
607	0.24
608	0.25
609	0.31
610	0.35
611	0.4
612	0.41
613	0.39
614	0.4
615	0.39
616	0.35
617	0.29
618	0.24
619	0.2
620	0.19
621	0.17
622	0.18
623	0.16
624	0.16
625	0.15
626	0.17
627	0.16
628	0.15
629	0.15
630	0.1
631	0.11
632	0.15
633	0.16
634	0.15
635	0.15
636	0.14
637	0.17
638	0.17
639	0.15
640	0.12
641	0.11
642	0.11
643	0.14
644	0.14
645	0.14
646	0.13
647	0.15
648	0.15
649	0.14
650	0.2
651	0.19
652	0.21
653	0.29
654	0.38
655	0.39
656	0.44
657	0.49
658	0.51
659	0.54
660	0.56
661	0.53
662	0.49
663	0.51
664	0.5
665	0.52
666	0.46
667	0.44
668	0.39
669	0.37
670	0.41
671	0.46
672	0.5
673	0.51
674	0.57
675	0.61
676	0.67
677	0.69
678	0.65
679	0.62
680	0.6
681	0.62
682	0.64
683	0.62
684	0.6
685	0.56
686	0.54
687	0.54
688	0.48
689	0.39
690	0.37
691	0.37
692	0.36
693	0.39
694	0.4
695	0.33
696	0.34
697	0.36
698	0.32
699	0.29
700	0.27
701	0.26
702	0.26
703	0.3
704	0.3
705	0.3
706	0.27
707	0.29
708	0.3
709	0.3
710	0.36
711	0.34
712	0.37
713	0.38
714	0.44
715	0.45
716	0.48
717	0.48
718	0.38
719	0.36
720	0.33
721	0.34
722	0.28
723	0.24
724	0.2
725	0.17
726	0.2
727	0.2
728	0.19
729	0.15
730	0.16
731	0.14
732	0.12
733	0.11
734	0.08
735	0.08
736	0.07
737	0.07
738	0.06
739	0.07
740	0.08
741	0.15
742	0.21
743	0.22
744	0.26
745	0.28
746	0.31
747	0.36
748	0.39
749	0.34
750	0.34
751	0.34
752	0.32
753	0.38
754	0.35
755	0.29
756	0.27
757	0.25
758	0.19
759	0.2
760	0.21
761	0.16
762	0.25
763	0.27
764	0.27
765	0.32
766	0.32
767	0.36
768	0.39
769	0.43

A0A0H2RDT8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer