Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0H2RTF6

Protein Details
Accession A0A0H2RTF6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-125APANSMSSNKRRKRSAKSSASTPAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-115RRKR
207-231ARKALAEHRRKYPGYSFRPAKDRSR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 11.333, mito 6.5, cyto_mito 6.166, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MPAVRTQKGQGVATMNLKRSASASGGVEDAFHLTWTSPPPPSLSSPGEPTISFSFAPNVTPGTFIAPPPSEDEEIPSEESSLFPEPPAVGGGDGDGLPELVAPANSMSSNKRRKRSAKSSASTPAPDDIASPTSPSSNALDCTTNPSSEPAHIPRPPNAFILFRSSFIRSQHVSAQIEGNHGTLSKIVGMVWHALPFREREVWQAKARKALAEHRRKYPGYSFRPAKDRSRGGGGAGGGNGNGGNSGGTGGSGGGASEDGRAKRDGSIPPTSTSSSTSTTGTTTKRKQREVGPRDVARCEQIAALLSKGLKGKDLEDAIKEFDAKRAPVVITPRFEVPITALQYEGGGGVSSKMSTTTTTPKQELDTMMDTMQMQGMDDQRPSVRKYRRSSSAPLLEAEHSKAAQFMRSASPSPLSSAPFSTMSATTAYTSPPRPQSSFASSTSGSGPASASGEPRTPTQPTYRTQRKRSTSSSPPLRQRTLMTQASLQCMNFYQPHHTQPQHTQQSHQQQSQPPQLTLNTASLGAYGVGAQAGGPMSAPVDSASSSSYMYGQEGSADVFFDIDGSDPSMWYASPSASAAGSSVGGLDDAGMGGGSEFGVGGGFVGQDSWANDFNTFSFHATPSSAISPSAATSPIKPSPLSPLSNITSAAECYSPFQQTPPPNSSSQDVVDPSMPMLVERPYDPLDHQLEPMVQLQSSHLQQNQQQAHQHLAAPIPHHALQIQTTNLPSWSTPSASASEYSHTHSPHDPYSTHHFGGGAYDASSQHQALTPYASSVSDYDYGSMGTGAGSPTSPSTASQAHTPREGSADICASFPSANAQVSYNGFKFEGYYPGEHEQQQHESSKMLVQQHGVGMQGQQGVGMQGQGQGQGGHGGMMIDMEALNGALAPFM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.42
3 0.41
4 0.4
5 0.36
6 0.33
7 0.32
8 0.25
9 0.23
10 0.22
11 0.19
12 0.2
13 0.19
14 0.18
15 0.15
16 0.15
17 0.11
18 0.1
19 0.09
20 0.09
21 0.12
22 0.17
23 0.2
24 0.2
25 0.21
26 0.25
27 0.28
28 0.32
29 0.36
30 0.37
31 0.37
32 0.39
33 0.41
34 0.4
35 0.36
36 0.36
37 0.32
38 0.29
39 0.26
40 0.22
41 0.23
42 0.21
43 0.23
44 0.19
45 0.19
46 0.16
47 0.17
48 0.17
49 0.18
50 0.19
51 0.18
52 0.23
53 0.21
54 0.22
55 0.26
56 0.3
57 0.27
58 0.26
59 0.3
60 0.27
61 0.29
62 0.3
63 0.25
64 0.21
65 0.19
66 0.19
67 0.18
68 0.18
69 0.15
70 0.13
71 0.15
72 0.14
73 0.14
74 0.15
75 0.12
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.08
80 0.08
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.06
91 0.07
92 0.08
93 0.1
94 0.16
95 0.26
96 0.37
97 0.44
98 0.52
99 0.6
100 0.69
101 0.78
102 0.83
103 0.84
104 0.84
105 0.81
106 0.81
107 0.79
108 0.75
109 0.66
110 0.57
111 0.48
112 0.38
113 0.32
114 0.26
115 0.21
116 0.19
117 0.17
118 0.16
119 0.15
120 0.15
121 0.15
122 0.16
123 0.16
124 0.15
125 0.17
126 0.18
127 0.19
128 0.19
129 0.26
130 0.26
131 0.24
132 0.22
133 0.23
134 0.22
135 0.23
136 0.28
137 0.26
138 0.32
139 0.36
140 0.38
141 0.42
142 0.46
143 0.46
144 0.43
145 0.4
146 0.35
147 0.31
148 0.36
149 0.31
150 0.27
151 0.28
152 0.29
153 0.29
154 0.29
155 0.34
156 0.27
157 0.29
158 0.33
159 0.37
160 0.35
161 0.33
162 0.35
163 0.3
164 0.31
165 0.28
166 0.23
167 0.16
168 0.15
169 0.13
170 0.1
171 0.09
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.11
178 0.11
179 0.13
180 0.13
181 0.13
182 0.15
183 0.16
184 0.18
185 0.2
186 0.2
187 0.25
188 0.3
189 0.35
190 0.42
191 0.48
192 0.46
193 0.49
194 0.5
195 0.45
196 0.44
197 0.47
198 0.5
199 0.53
200 0.56
201 0.56
202 0.63
203 0.61
204 0.61
205 0.61
206 0.6
207 0.57
208 0.62
209 0.61
210 0.58
211 0.66
212 0.66
213 0.65
214 0.63
215 0.6
216 0.53
217 0.54
218 0.49
219 0.42
220 0.41
221 0.33
222 0.26
223 0.21
224 0.18
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.06
229 0.05
230 0.04
231 0.03
232 0.03
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.03
242 0.04
243 0.04
244 0.06
245 0.09
246 0.1
247 0.12
248 0.13
249 0.14
250 0.16
251 0.21
252 0.24
253 0.26
254 0.33
255 0.32
256 0.34
257 0.36
258 0.34
259 0.3
260 0.28
261 0.26
262 0.22
263 0.21
264 0.2
265 0.18
266 0.18
267 0.21
268 0.23
269 0.28
270 0.34
271 0.41
272 0.48
273 0.51
274 0.54
275 0.6
276 0.67
277 0.66
278 0.67
279 0.67
280 0.64
281 0.63
282 0.6
283 0.51
284 0.42
285 0.35
286 0.26
287 0.18
288 0.14
289 0.13
290 0.12
291 0.11
292 0.1
293 0.1
294 0.11
295 0.13
296 0.13
297 0.13
298 0.13
299 0.14
300 0.17
301 0.2
302 0.19
303 0.18
304 0.2
305 0.19
306 0.18
307 0.18
308 0.14
309 0.15
310 0.16
311 0.14
312 0.14
313 0.15
314 0.15
315 0.17
316 0.23
317 0.24
318 0.23
319 0.24
320 0.24
321 0.23
322 0.23
323 0.2
324 0.16
325 0.18
326 0.18
327 0.16
328 0.16
329 0.14
330 0.14
331 0.14
332 0.12
333 0.06
334 0.04
335 0.03
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.09
344 0.15
345 0.21
346 0.25
347 0.26
348 0.26
349 0.27
350 0.28
351 0.27
352 0.24
353 0.2
354 0.18
355 0.16
356 0.16
357 0.15
358 0.13
359 0.12
360 0.08
361 0.06
362 0.07
363 0.09
364 0.1
365 0.1
366 0.1
367 0.11
368 0.14
369 0.16
370 0.23
371 0.28
372 0.36
373 0.42
374 0.48
375 0.54
376 0.56
377 0.59
378 0.59
379 0.58
380 0.51
381 0.46
382 0.4
383 0.34
384 0.3
385 0.26
386 0.18
387 0.12
388 0.11
389 0.12
390 0.1
391 0.1
392 0.09
393 0.1
394 0.12
395 0.14
396 0.15
397 0.14
398 0.16
399 0.14
400 0.16
401 0.16
402 0.15
403 0.14
404 0.14
405 0.15
406 0.14
407 0.14
408 0.13
409 0.11
410 0.11
411 0.1
412 0.1
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.1
417 0.12
418 0.14
419 0.19
420 0.21
421 0.22
422 0.24
423 0.28
424 0.31
425 0.33
426 0.31
427 0.29
428 0.26
429 0.26
430 0.24
431 0.2
432 0.14
433 0.11
434 0.1
435 0.07
436 0.08
437 0.07
438 0.07
439 0.08
440 0.09
441 0.1
442 0.12
443 0.13
444 0.13
445 0.15
446 0.19
447 0.23
448 0.25
449 0.34
450 0.43
451 0.49
452 0.56
453 0.63
454 0.64
455 0.66
456 0.67
457 0.65
458 0.63
459 0.65
460 0.67
461 0.65
462 0.67
463 0.66
464 0.62
465 0.56
466 0.49
467 0.45
468 0.43
469 0.38
470 0.3
471 0.28
472 0.28
473 0.29
474 0.28
475 0.22
476 0.15
477 0.13
478 0.14
479 0.13
480 0.13
481 0.16
482 0.18
483 0.22
484 0.27
485 0.28
486 0.3
487 0.34
488 0.43
489 0.47
490 0.45
491 0.44
492 0.45
493 0.54
494 0.56
495 0.53
496 0.48
497 0.43
498 0.49
499 0.55
500 0.5
501 0.39
502 0.36
503 0.33
504 0.3
505 0.27
506 0.21
507 0.13
508 0.11
509 0.11
510 0.09
511 0.09
512 0.07
513 0.05
514 0.04
515 0.03
516 0.03
517 0.03
518 0.03
519 0.03
520 0.03
521 0.03
522 0.03
523 0.03
524 0.03
525 0.03
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.05
530 0.05
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.07
535 0.07
536 0.07
537 0.07
538 0.07
539 0.07
540 0.06
541 0.06
542 0.07
543 0.06
544 0.06
545 0.05
546 0.05
547 0.04
548 0.04
549 0.04
550 0.04
551 0.04
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.06
556 0.06
557 0.06
558 0.06
559 0.07
560 0.05
561 0.06
562 0.07
563 0.07
564 0.07
565 0.07
566 0.06
567 0.06
568 0.06
569 0.05
570 0.05
571 0.04
572 0.04
573 0.04
574 0.03
575 0.03
576 0.03
577 0.03
578 0.02
579 0.02
580 0.02
581 0.02
582 0.02
583 0.02
584 0.02
585 0.02
586 0.02
587 0.02
588 0.02
589 0.02
590 0.03
591 0.02
592 0.03
593 0.03
594 0.04
595 0.05
596 0.07
597 0.09
598 0.1
599 0.11
600 0.11
601 0.11
602 0.13
603 0.13
604 0.13
605 0.12
606 0.12
607 0.13
608 0.13
609 0.13
610 0.13
611 0.14
612 0.13
613 0.11
614 0.11
615 0.11
616 0.1
617 0.11
618 0.11
619 0.09
620 0.11
621 0.16
622 0.18
623 0.2
624 0.19
625 0.19
626 0.26
627 0.3
628 0.31
629 0.27
630 0.3
631 0.3
632 0.31
633 0.31
634 0.23
635 0.19
636 0.17
637 0.17
638 0.12
639 0.1
640 0.11
641 0.13
642 0.14
643 0.13
644 0.14
645 0.2
646 0.26
647 0.32
648 0.35
649 0.36
650 0.36
651 0.38
652 0.38
653 0.34
654 0.29
655 0.26
656 0.22
657 0.2
658 0.19
659 0.18
660 0.15
661 0.14
662 0.12
663 0.09
664 0.09
665 0.09
666 0.1
667 0.1
668 0.13
669 0.14
670 0.15
671 0.16
672 0.21
673 0.24
674 0.23
675 0.23
676 0.22
677 0.21
678 0.21
679 0.24
680 0.18
681 0.14
682 0.13
683 0.14
684 0.17
685 0.18
686 0.2
687 0.19
688 0.22
689 0.26
690 0.35
691 0.37
692 0.37
693 0.4
694 0.38
695 0.4
696 0.38
697 0.36
698 0.29
699 0.28
700 0.25
701 0.22
702 0.23
703 0.23
704 0.22
705 0.21
706 0.19
707 0.18
708 0.18
709 0.2
710 0.2
711 0.17
712 0.17
713 0.18
714 0.18
715 0.17
716 0.15
717 0.15
718 0.16
719 0.16
720 0.16
721 0.17
722 0.19
723 0.19
724 0.21
725 0.18
726 0.19
727 0.19
728 0.22
729 0.24
730 0.23
731 0.25
732 0.28
733 0.3
734 0.31
735 0.33
736 0.29
737 0.3
738 0.39
739 0.41
740 0.37
741 0.34
742 0.3
743 0.26
744 0.28
745 0.25
746 0.16
747 0.11
748 0.12
749 0.12
750 0.14
751 0.16
752 0.14
753 0.13
754 0.14
755 0.15
756 0.15
757 0.17
758 0.16
759 0.15
760 0.16
761 0.15
762 0.14
763 0.13
764 0.15
765 0.14
766 0.14
767 0.14
768 0.14
769 0.13
770 0.12
771 0.12
772 0.08
773 0.06
774 0.07
775 0.06
776 0.06
777 0.07
778 0.07
779 0.08
780 0.1
781 0.1
782 0.1
783 0.14
784 0.17
785 0.18
786 0.25
787 0.31
788 0.32
789 0.35
790 0.35
791 0.32
792 0.32
793 0.32
794 0.25
795 0.22
796 0.22
797 0.19
798 0.18
799 0.17
800 0.16
801 0.15
802 0.14
803 0.15
804 0.14
805 0.15
806 0.16
807 0.17
808 0.19
809 0.22
810 0.28
811 0.24
812 0.23
813 0.22
814 0.21
815 0.22
816 0.21
817 0.24
818 0.22
819 0.23
820 0.26
821 0.3
822 0.34
823 0.33
824 0.36
825 0.34
826 0.37
827 0.39
828 0.38
829 0.35
830 0.32
831 0.31
832 0.31
833 0.31
834 0.3
835 0.28
836 0.26
837 0.28
838 0.29
839 0.29
840 0.25
841 0.21
842 0.17
843 0.17
844 0.17
845 0.14
846 0.12
847 0.12
848 0.12
849 0.11
850 0.11
851 0.08
852 0.1
853 0.1
854 0.11
855 0.12
856 0.11
857 0.11
858 0.12
859 0.12
860 0.09
861 0.09
862 0.08
863 0.07
864 0.07
865 0.07
866 0.05
867 0.05
868 0.05
869 0.04
870 0.04
871 0.04
872 0.04