Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0H2SFK8

Protein Details
Accession A0A0H2SFK8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-42VAKSSLPDMKRRKPSKSTRRNQEEEARRMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-32KRRKPSKSTR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019529  Syntaxin-18_N  
IPR000727  T_SNARE_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0015031  P:protein transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF10496  Syntaxin-18_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50192  T_SNARE  
Amino Acid Sequences MAFTDITNDFREIVAKSSLPDMKRRKPSKSTRRNQEEEARRMINKEFMREAYSILNHVNNLSRMLASIRRPYLNVDASSSSLTQRQPSRALELTGEGAEQTWSGIRSLTNEERDQIDLQAKVILSKCRDRVRQMEELNNRQRAELSAQESSGLLRFLPSRLKQDSSSDLSSTLFLHNSGVTTYLTSRLAEASQTQSGMQEERIKRQTERTRTLGSGATLEGLVPAPVNAPQMTNSTSTRSWLGDAASNLAATILLPSASSNAQTKPAYVPQLQSPAQDEWEDDEYDDMELSASQIQQFETENANILKNVQDTLASVEKAESRLQEIAALQTELVTHLTQQSEIIDQIYEDSIVSTETVERGNVQLREAKRRAKDSRLYILIFLLGASFSLLFLHYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.18
3 0.18
4 0.25
5 0.3
6 0.3
7 0.39
8 0.45
9 0.51
10 0.62
11 0.68
12 0.7
13 0.75
14 0.84
15 0.85
16 0.87
17 0.88
18 0.88
19 0.91
20 0.88
21 0.85
22 0.85
23 0.84
24 0.78
25 0.75
26 0.68
27 0.6
28 0.56
29 0.51
30 0.48
31 0.41
32 0.4
33 0.36
34 0.34
35 0.36
36 0.34
37 0.34
38 0.3
39 0.28
40 0.25
41 0.23
42 0.23
43 0.19
44 0.2
45 0.23
46 0.19
47 0.19
48 0.18
49 0.16
50 0.15
51 0.18
52 0.22
53 0.22
54 0.29
55 0.32
56 0.32
57 0.33
58 0.36
59 0.4
60 0.4
61 0.36
62 0.32
63 0.29
64 0.29
65 0.3
66 0.27
67 0.21
68 0.2
69 0.2
70 0.23
71 0.26
72 0.29
73 0.33
74 0.34
75 0.39
76 0.37
77 0.36
78 0.31
79 0.28
80 0.26
81 0.2
82 0.18
83 0.12
84 0.1
85 0.09
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.07
91 0.08
92 0.07
93 0.1
94 0.17
95 0.22
96 0.26
97 0.26
98 0.27
99 0.28
100 0.3
101 0.28
102 0.24
103 0.22
104 0.17
105 0.17
106 0.18
107 0.16
108 0.16
109 0.18
110 0.2
111 0.21
112 0.26
113 0.33
114 0.38
115 0.42
116 0.45
117 0.5
118 0.52
119 0.56
120 0.54
121 0.57
122 0.56
123 0.62
124 0.64
125 0.61
126 0.55
127 0.47
128 0.44
129 0.36
130 0.33
131 0.28
132 0.24
133 0.2
134 0.2
135 0.2
136 0.19
137 0.18
138 0.15
139 0.1
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.08
144 0.15
145 0.17
146 0.22
147 0.25
148 0.27
149 0.27
150 0.3
151 0.34
152 0.32
153 0.31
154 0.26
155 0.23
156 0.21
157 0.21
158 0.18
159 0.14
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.11
186 0.16
187 0.16
188 0.22
189 0.27
190 0.28
191 0.28
192 0.37
193 0.44
194 0.45
195 0.49
196 0.48
197 0.46
198 0.45
199 0.46
200 0.38
201 0.3
202 0.22
203 0.17
204 0.12
205 0.09
206 0.08
207 0.07
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.08
218 0.1
219 0.11
220 0.14
221 0.14
222 0.16
223 0.16
224 0.17
225 0.18
226 0.16
227 0.15
228 0.14
229 0.14
230 0.13
231 0.13
232 0.14
233 0.13
234 0.12
235 0.11
236 0.1
237 0.09
238 0.06
239 0.06
240 0.04
241 0.03
242 0.03
243 0.04
244 0.05
245 0.06
246 0.07
247 0.09
248 0.1
249 0.15
250 0.15
251 0.17
252 0.18
253 0.22
254 0.25
255 0.25
256 0.26
257 0.24
258 0.31
259 0.31
260 0.28
261 0.28
262 0.25
263 0.24
264 0.23
265 0.2
266 0.17
267 0.18
268 0.17
269 0.14
270 0.13
271 0.12
272 0.12
273 0.11
274 0.07
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.08
282 0.08
283 0.09
284 0.11
285 0.12
286 0.13
287 0.13
288 0.16
289 0.16
290 0.17
291 0.16
292 0.15
293 0.16
294 0.14
295 0.14
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.15
300 0.18
301 0.15
302 0.15
303 0.15
304 0.17
305 0.19
306 0.2
307 0.16
308 0.16
309 0.17
310 0.17
311 0.18
312 0.17
313 0.17
314 0.17
315 0.16
316 0.12
317 0.11
318 0.11
319 0.1
320 0.11
321 0.09
322 0.08
323 0.11
324 0.12
325 0.12
326 0.12
327 0.13
328 0.12
329 0.13
330 0.13
331 0.1
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.09
336 0.08
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.09
345 0.09
346 0.1
347 0.13
348 0.2
349 0.2
350 0.21
351 0.27
352 0.3
353 0.41
354 0.46
355 0.51
356 0.52
357 0.61
358 0.66
359 0.69
360 0.73
361 0.71
362 0.75
363 0.72
364 0.67
365 0.58
366 0.51
367 0.42
368 0.33
369 0.25
370 0.15
371 0.09
372 0.07
373 0.07
374 0.06
375 0.05
376 0.06