FuNGI

A0A0H2R7J9

Protein Details

Accession

A0A0H2R7J9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
400-424	TDPASTSSRKRKRRTPRPEPYLLPK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
408-417	RKRKRRTPRP

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 14.333, nucl 13, cyto 12.5, mito_nucl 7.499

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR039385 NGN_Euk IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03439 Spt5-NGN
CDD	cd09888 NGN_Euk

Amino Acid Sequences

MEETTKHTFNFRLVDGTESLTVRAEVLRGTFDEVNAIRTVETKVLKPSEVPSDRWEKTESLSASDQTGIATGNERSTPVNLAQLYHSVSPSTSPLYCEYPSLFLVKRVNAVSTGYRNYSELPKHQMSNRSFSARAFLSLTAGVDHDSESSDGFEEELDKLDESAKALEPEPTSASSHRLAGAPRGDAEEETVEEMIARYRRMDRDSQSCNPPGLADVFDSLLSSQMTGLPCTKTDISLFGVICKIYAHTIKRGAEEMLVIQMYNKMLSVANKDGKFRITSAFAVPIKAPGRIYFEALSIKHVRSICKGIVSLYINSIFFVPLEERVALLETAVARPQMKEGDLVKIRNGLYKGDIGTIFRVLPSNPSLVVKVKSREIHPADDLDAREADSRTRNNGPADTDPASTSSRKRKRRTPRPEPYLLPKHPLKAELIFNGKKVKLIEDGFEFRDKQYTNDGYRLIEVRSDRLERLKTGITEHNAFVNASLEDIERQHPVDGNLPELPPIVDRGPSTFSTPRFLRVNNRVLISNGPAKGSKGTINKLSGEIVIIDLENGGGRTVHSDSSNIIQAEVSWENVTRLFDLGDSVEVKIGTFVGRHGIVGDIQGTTLSIVDRECGESIEVPSSYVDSYSVLSLASQTQREESVLKLGTRVVILKGKYSGKEGALSDVNDHAVTVIEDVSKLRMITGRENVKILPSKKPKKAVTEAEWDKMINDQKKDKAQREAFTALANAIGMDLNEYSVVRKGEPYKHQRRVPEQLLGPPEAWELILPLEQRVLKFWLFVESLGLARRDLEKFAKGEAAKVEPNRRRLLEGVLTFAKSVFISIEDETVGSGDDYIVFEQMDWEMAFVALASALDITVRYVGPLYYDEEDEPVCLIDHINDTFEGKQVYFWKGHYKGRLGVVKQMNGGACRVELESPMFCVGSVVVGGESLLARCGCILAKGPKPKWIRNLALVSSLFDRTTKVARYLPPRAHTPPTLPSLPEYHDETGRGMWLFHPKIASLRKTNYFLVKIESHPDSEVSGRREGKVLIDEDPPMLPFAISIPAVVKVEYQIKKKNEVRTESLPVHTLGITRPRVKKRHAVISGPRTGEVVIYLKSDGDGAQIREELLNLWKE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.29
3	0.3
4	0.28
5	0.24
6	0.23
7	0.19
8	0.18
9	0.16
10	0.15
11	0.13
12	0.1
13	0.11
14	0.13
15	0.13
16	0.18
17	0.18
18	0.17
19	0.23
20	0.22
21	0.24
22	0.22
23	0.22
24	0.17
25	0.17
26	0.2
27	0.2
28	0.22
29	0.22
30	0.29
31	0.32
32	0.32
33	0.33
34	0.35
35	0.39
36	0.41
37	0.41
38	0.39
39	0.46
40	0.46
41	0.47
42	0.46
43	0.37
44	0.36
45	0.42
46	0.36
47	0.32
48	0.34
49	0.32
50	0.3
51	0.3
52	0.26
53	0.18
54	0.18
55	0.13
56	0.1
57	0.12
58	0.12
59	0.14
60	0.14
61	0.15
62	0.16
63	0.17
64	0.2
65	0.18
66	0.24
67	0.22
68	0.23
69	0.23
70	0.25
71	0.27
72	0.25
73	0.24
74	0.18
75	0.18
76	0.18
77	0.18
78	0.19
79	0.17
80	0.17
81	0.2
82	0.24
83	0.25
84	0.25
85	0.25
86	0.24
87	0.24
88	0.26
89	0.24
90	0.25
91	0.3
92	0.29
93	0.32
94	0.3
95	0.3
96	0.26
97	0.29
98	0.29
99	0.29
100	0.32
101	0.29
102	0.29
103	0.29
104	0.31
105	0.35
106	0.35
107	0.35
108	0.39
109	0.41
110	0.45
111	0.5
112	0.56
113	0.52
114	0.54
115	0.54
116	0.51
117	0.48
118	0.43
119	0.43
120	0.35
121	0.33
122	0.28
123	0.23
124	0.2
125	0.19
126	0.19
127	0.14
128	0.14
129	0.12
130	0.1
131	0.1
132	0.08
133	0.09
134	0.09
135	0.09
136	0.09
137	0.09
138	0.09
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.09
143	0.1
144	0.11
145	0.1
146	0.1
147	0.12
148	0.12
149	0.12
150	0.14
151	0.14
152	0.15
153	0.15
154	0.19
155	0.19
156	0.2
157	0.21
158	0.21
159	0.21
160	0.21
161	0.24
162	0.21
163	0.22
164	0.21
165	0.21
166	0.2
167	0.24
168	0.26
169	0.23
170	0.23
171	0.24
172	0.23
173	0.21
174	0.21
175	0.17
176	0.14
177	0.14
178	0.13
179	0.1
180	0.1
181	0.1
182	0.12
183	0.13
184	0.13
185	0.14
186	0.2
187	0.25
188	0.29
189	0.36
190	0.38
191	0.45
192	0.52
193	0.55
194	0.57
195	0.55
196	0.52
197	0.45
198	0.39
199	0.31
200	0.25
201	0.2
202	0.14
203	0.12
204	0.12
205	0.11
206	0.11
207	0.1
208	0.1
209	0.08
210	0.08
211	0.07
212	0.1
213	0.11
214	0.12
215	0.14
216	0.14
217	0.14
218	0.19
219	0.19
220	0.17
221	0.17
222	0.18
223	0.19
224	0.22
225	0.22
226	0.19
227	0.2
228	0.18
229	0.17
230	0.15
231	0.13
232	0.12
233	0.17
234	0.19
235	0.23
236	0.3
237	0.31
238	0.33
239	0.34
240	0.31
241	0.26
242	0.24
243	0.19
244	0.15
245	0.13
246	0.11
247	0.09
248	0.11
249	0.1
250	0.1
251	0.09
252	0.08
253	0.09
254	0.12
255	0.16
256	0.22
257	0.28
258	0.3
259	0.32
260	0.32
261	0.33
262	0.33
263	0.29
264	0.25
265	0.21
266	0.21
267	0.21
268	0.27
269	0.25
270	0.25
271	0.24
272	0.27
273	0.24
274	0.25
275	0.23
276	0.18
277	0.25
278	0.24
279	0.27
280	0.22
281	0.22
282	0.24
283	0.24
284	0.27
285	0.23
286	0.23
287	0.25
288	0.26
289	0.26
290	0.26
291	0.31
292	0.27
293	0.26
294	0.26
295	0.22
296	0.26
297	0.26
298	0.23
299	0.2
300	0.21
301	0.18
302	0.18
303	0.18
304	0.12
305	0.09
306	0.1
307	0.09
308	0.08
309	0.1
310	0.1
311	0.09
312	0.09
313	0.11
314	0.09
315	0.08
316	0.08
317	0.07
318	0.08
319	0.09
320	0.1
321	0.09
322	0.09
323	0.11
324	0.12
325	0.11
326	0.15
327	0.15
328	0.23
329	0.26
330	0.27
331	0.26
332	0.29
333	0.29
334	0.29
335	0.29
336	0.21
337	0.19
338	0.21
339	0.2
340	0.18
341	0.18
342	0.15
343	0.15
344	0.15
345	0.13
346	0.11
347	0.11
348	0.09
349	0.12
350	0.12
351	0.12
352	0.12
353	0.13
354	0.14
355	0.16
356	0.19
357	0.21
358	0.22
359	0.26
360	0.28
361	0.29
362	0.37
363	0.37
364	0.37
365	0.34
366	0.33
367	0.3
368	0.3
369	0.29
370	0.21
371	0.18
372	0.15
373	0.16
374	0.15
375	0.15
376	0.17
377	0.18
378	0.21
379	0.25
380	0.27
381	0.27
382	0.29
383	0.3
384	0.27
385	0.3
386	0.28
387	0.25
388	0.22
389	0.22
390	0.23
391	0.21
392	0.25
393	0.31
394	0.38
395	0.47
396	0.53
397	0.61
398	0.7
399	0.79
400	0.85
401	0.85
402	0.87
403	0.86
404	0.86
405	0.8
406	0.78
407	0.77
408	0.67
409	0.62
410	0.53
411	0.48
412	0.43
413	0.4
414	0.33
415	0.27
416	0.27
417	0.25
418	0.31
419	0.28
420	0.28
421	0.31
422	0.29
423	0.28
424	0.25
425	0.23
426	0.21
427	0.21
428	0.22
429	0.21
430	0.24
431	0.23
432	0.25
433	0.23
434	0.18
435	0.22
436	0.2
437	0.18
438	0.22
439	0.26
440	0.26
441	0.28
442	0.29
443	0.25
444	0.26
445	0.25
446	0.19
447	0.16
448	0.15
449	0.14
450	0.16
451	0.17
452	0.17
453	0.2
454	0.22
455	0.19
456	0.22
457	0.22
458	0.19
459	0.21
460	0.25
461	0.23
462	0.24
463	0.23
464	0.21
465	0.2
466	0.19
467	0.15
468	0.12
469	0.09
470	0.07
471	0.07
472	0.06
473	0.06
474	0.08
475	0.09
476	0.08
477	0.09
478	0.09
479	0.1
480	0.11
481	0.16
482	0.15
483	0.16
484	0.16
485	0.16
486	0.16
487	0.15
488	0.14
489	0.08
490	0.1
491	0.08
492	0.08
493	0.08
494	0.1
495	0.13
496	0.13
497	0.17
498	0.19
499	0.19
500	0.23
501	0.24
502	0.26
503	0.25
504	0.26
505	0.3
506	0.34
507	0.39
508	0.36
509	0.37
510	0.33
511	0.32
512	0.31
513	0.26
514	0.23
515	0.17
516	0.16
517	0.15
518	0.15
519	0.15
520	0.15
521	0.18
522	0.17
523	0.19
524	0.22
525	0.23
526	0.23
527	0.23
528	0.23
529	0.17
530	0.14
531	0.11
532	0.08
533	0.06
534	0.05
535	0.04
536	0.04
537	0.03
538	0.03
539	0.03
540	0.03
541	0.03
542	0.03
543	0.05
544	0.06
545	0.07
546	0.07
547	0.08
548	0.08
549	0.1
550	0.13
551	0.11
552	0.1
553	0.09
554	0.09
555	0.12
556	0.12
557	0.11
558	0.08
559	0.08
560	0.08
561	0.1
562	0.1
563	0.07
564	0.07
565	0.06
566	0.06
567	0.06
568	0.06
569	0.06
570	0.06
571	0.06
572	0.07
573	0.06
574	0.06
575	0.06
576	0.06
577	0.05
578	0.04
579	0.05
580	0.06
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.07
585	0.06
586	0.07
587	0.07
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.04
592	0.04
593	0.04
594	0.04
595	0.04
596	0.04
597	0.04
598	0.05
599	0.06
600	0.06
601	0.06
602	0.07
603	0.07
604	0.08
605	0.09
606	0.09
607	0.08
608	0.08
609	0.08
610	0.08
611	0.07
612	0.06
613	0.05
614	0.06
615	0.06
616	0.06
617	0.05
618	0.05
619	0.05
620	0.07
621	0.09
622	0.09
623	0.09
624	0.1
625	0.11
626	0.12
627	0.12
628	0.1
629	0.13
630	0.14
631	0.14
632	0.13
633	0.13
634	0.13
635	0.13
636	0.13
637	0.1
638	0.13
639	0.13
640	0.14
641	0.18
642	0.19
643	0.19
644	0.21
645	0.22
646	0.18
647	0.21
648	0.2
649	0.19
650	0.19
651	0.18
652	0.16
653	0.15
654	0.15
655	0.11
656	0.11
657	0.08
658	0.06
659	0.06
660	0.05
661	0.05
662	0.04
663	0.05
664	0.05
665	0.06
666	0.07
667	0.06
668	0.07
669	0.09
670	0.11
671	0.16
672	0.23
673	0.27
674	0.27
675	0.28
676	0.27
677	0.29
678	0.33
679	0.31
680	0.34
681	0.39
682	0.47
683	0.53
684	0.61
685	0.62
686	0.63
687	0.69
688	0.67
689	0.62
690	0.63
691	0.6
692	0.53
693	0.49
694	0.41
695	0.33
696	0.3
697	0.31
698	0.25
699	0.26
700	0.29
701	0.33
702	0.42
703	0.5
704	0.5
705	0.54
706	0.55
707	0.54
708	0.54
709	0.52
710	0.44
711	0.37
712	0.32
713	0.22
714	0.16
715	0.13
716	0.07
717	0.05
718	0.05
719	0.04
720	0.04
721	0.04
722	0.04
723	0.04
724	0.05
725	0.05
726	0.08
727	0.09
728	0.09
729	0.12
730	0.18
731	0.25
732	0.34
733	0.44
734	0.52
735	0.6
736	0.65
737	0.68
738	0.7
739	0.72
740	0.67
741	0.63
742	0.54
743	0.51
744	0.49
745	0.44
746	0.36
747	0.28
748	0.24
749	0.17
750	0.15
751	0.09
752	0.07
753	0.06
754	0.08
755	0.07
756	0.07
757	0.1
758	0.11
759	0.11
760	0.13
761	0.16
762	0.14
763	0.14
764	0.14
765	0.16
766	0.15
767	0.15
768	0.14
769	0.12
770	0.13
771	0.14
772	0.14
773	0.1
774	0.11
775	0.14
776	0.14
777	0.16
778	0.18
779	0.19
780	0.2
781	0.21
782	0.26
783	0.23
784	0.24
785	0.23
786	0.24
787	0.25
788	0.29
789	0.38
790	0.38
791	0.44
792	0.46
793	0.45
794	0.44
795	0.41
796	0.41
797	0.38
798	0.34
799	0.33
800	0.29
801	0.28
802	0.26
803	0.24
804	0.19
805	0.12
806	0.12
807	0.07
808	0.07
809	0.09
810	0.09
811	0.1
812	0.09
813	0.09
814	0.09
815	0.08
816	0.07
817	0.05
818	0.05
819	0.04
820	0.05
821	0.05
822	0.06
823	0.06
824	0.06
825	0.06
826	0.06
827	0.06
828	0.07
829	0.06
830	0.06
831	0.06
832	0.06
833	0.06
834	0.05
835	0.05
836	0.03
837	0.03
838	0.03
839	0.03
840	0.03
841	0.03
842	0.03
843	0.04
844	0.05
845	0.05
846	0.05
847	0.06
848	0.06
849	0.07
850	0.09
851	0.12
852	0.12
853	0.13
854	0.13
855	0.14
856	0.15
857	0.13
858	0.12
859	0.09
860	0.08
861	0.07
862	0.07
863	0.07
864	0.1
865	0.1
866	0.11
867	0.11
868	0.13
869	0.13
870	0.15
871	0.15
872	0.12
873	0.15
874	0.18
875	0.21
876	0.2
877	0.22
878	0.3
879	0.34
880	0.4
881	0.42
882	0.42
883	0.44
884	0.5
885	0.55
886	0.47
887	0.5
888	0.5
889	0.46
890	0.43
891	0.41
892	0.35
893	0.29
894	0.29
895	0.2
896	0.15
897	0.14
898	0.14
899	0.12
900	0.11
901	0.13
902	0.13
903	0.14
904	0.14
905	0.13
906	0.12
907	0.11
908	0.1
909	0.08
910	0.07
911	0.06
912	0.05
913	0.05
914	0.05
915	0.05
916	0.05
917	0.05
918	0.07
919	0.06
920	0.06
921	0.06
922	0.08
923	0.07
924	0.09
925	0.15
926	0.2
927	0.28
928	0.38
929	0.4
930	0.48
931	0.55
932	0.6
933	0.63
934	0.65
935	0.62
936	0.61
937	0.65
938	0.58
939	0.57
940	0.51
941	0.44
942	0.37
943	0.33
944	0.25
945	0.19
946	0.19
947	0.16
948	0.21
949	0.21
950	0.23
951	0.27
952	0.34
953	0.42
954	0.5
955	0.54
956	0.53
957	0.57
958	0.58
959	0.59
960	0.55
961	0.52
962	0.48
963	0.47
964	0.45
965	0.4
966	0.37
967	0.34
968	0.34
969	0.33
970	0.32
971	0.29
972	0.28
973	0.28
974	0.27
975	0.24
976	0.24
977	0.21
978	0.16
979	0.16
980	0.24
981	0.25
982	0.25
983	0.25
984	0.23
985	0.31
986	0.38
987	0.42
988	0.4
989	0.46
990	0.5
991	0.54
992	0.57
993	0.57
994	0.52
995	0.47
996	0.45
997	0.42
998	0.38
999	0.39
1000	0.36
1001	0.31
1002	0.29
1003	0.28
1004	0.24
1005	0.25
1006	0.29
1007	0.27
1008	0.33
1009	0.33
1010	0.33
1011	0.35
1012	0.34
1013	0.33
1014	0.32
1015	0.31
1016	0.26
1017	0.26
1018	0.26
1019	0.25
1020	0.25
1021	0.21
1022	0.17
1023	0.15
1024	0.11
1025	0.09
1026	0.09
1027	0.12
1028	0.11
1029	0.11
1030	0.11
1031	0.13
1032	0.14
1033	0.14
1034	0.14
1035	0.14
1036	0.23
1037	0.29
1038	0.35
1039	0.41
1040	0.45
1041	0.55
1042	0.6
1043	0.67
1044	0.66
1045	0.68
1046	0.68
1047	0.67
1048	0.71
1049	0.65
1050	0.61
1051	0.53
1052	0.45
1053	0.39
1054	0.32
1055	0.26
1056	0.23
1057	0.28
1058	0.32
1059	0.39
1060	0.47
1061	0.55
1062	0.62
1063	0.67
1064	0.73
1065	0.73
1066	0.77
1067	0.75
1068	0.76
1069	0.77
1070	0.79
1071	0.8
1072	0.72
1073	0.63
1074	0.53
1075	0.46
1076	0.37
1077	0.29
1078	0.23
1079	0.16
1080	0.16
1081	0.16
1082	0.15
1083	0.15
1084	0.15
1085	0.12
1086	0.14
1087	0.17
1088	0.17
1089	0.2
1090	0.2
1091	0.21
1092	0.21
1093	0.21
1094	0.18

A0A0H2R7J9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer