Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BJF7

Protein Details
Accession Q6BJF7    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
800-822SNGYSRKQPMQQQQQQQQQQQQQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027516  EIF3C  
IPR008905  EIF3C_N_dom  
IPR000717  PCI_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0016282  C:eukaryotic 43S preinitiation complex  
GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0005852  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex  
GO:0008541  C:proteasome regulatory particle, lid subcomplex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0031369  F:translation initiation factor binding  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
GO:0043161  P:proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG dha:DEHA2G02750g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05470  eIF-3c_N  
PF01399  PCI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50250  PCI  
Amino Acid Sequences MSRFFVSGYPSDSSSEEEDLLSSSEEELLSSESEEDNFSSDSEFGNDSDNDSSDSDSDGAPSGPTYFLKKDFMKGSGDGSDSDSDDEGRKVVKSAKDKLLDDMRDSIESINTAKRVGNWTNILAEFEKLGRLLIKVGQQKIGTPNFYVKCLANLEDYINETVTNEKESTKKMNATYSRAFNTVRQRVKKQIKEYQSHMDLFRTKPELFETEEPLEGIASTIAGAPQLNGDEDSNAFTSVGAKTFSPIFTTLKQISETRGKKNIDKVEQIQTLEDLLNDTSSTGTPFELISIYQMLLSIRFDASSNQSFMPIDQWKKNEADLNSFLQLLKSKSKEYQVSELGTVTDDIDIEPPANADGVKVVFGSIASLIERLDDEFTRSLQYSDPHSIEYIQRLKDESIIYKLIVKGQLYVESTTPVEIRSKHEAGQLFRIVMRRLEHIHYKPNQLIAANETEAWKNIDTNVDSTIVPRNSDPNDLVVGLADFLTQNAKSIYGKNALLCSIYYYAINNQYVKARDLFLSSHIYSTIHNSESSLQVMYNRALVQLGLSAFKAGVIEESHQALNEIANSQRLKELLGQGFNSKYPSQATTAEKQKLLPFHMHINLELLECVFMTSSLLIEIPAMAAVSSSSKDSKRKASLKSFKSKLDFHERQYFTGPPESIKDHVVHSSIALQKGDWAKAYKLLSSIKIWKLIPDNEQLLSMMKKQLQVEGLRTYIFTYKSIYTKLSIAKLSAIFDIEKESVYSIIDKMIQPGDISGSIDESKSFVNFTTNDHQRTKLQELAIVMNEKVGLLTEKNEKTASNGYSRKQPMQQQQQQQQQQQQQKEQKELLHEENNRFRYANVNANNDEFQTTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.21
4 0.18
5 0.18
6 0.16
7 0.17
8 0.14
9 0.11
10 0.1
11 0.11
12 0.1
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.1
17 0.1
18 0.11
19 0.1
20 0.11
21 0.12
22 0.12
23 0.13
24 0.12
25 0.12
26 0.12
27 0.12
28 0.12
29 0.13
30 0.14
31 0.12
32 0.16
33 0.16
34 0.17
35 0.18
36 0.18
37 0.18
38 0.18
39 0.19
40 0.15
41 0.16
42 0.15
43 0.13
44 0.13
45 0.12
46 0.12
47 0.11
48 0.11
49 0.1
50 0.11
51 0.13
52 0.17
53 0.2
54 0.23
55 0.3
56 0.31
57 0.36
58 0.38
59 0.4
60 0.38
61 0.36
62 0.36
63 0.33
64 0.32
65 0.26
66 0.25
67 0.24
68 0.21
69 0.21
70 0.18
71 0.16
72 0.17
73 0.16
74 0.14
75 0.14
76 0.14
77 0.15
78 0.21
79 0.28
80 0.34
81 0.41
82 0.49
83 0.54
84 0.55
85 0.59
86 0.61
87 0.56
88 0.51
89 0.48
90 0.41
91 0.35
92 0.35
93 0.28
94 0.2
95 0.19
96 0.19
97 0.18
98 0.17
99 0.17
100 0.17
101 0.2
102 0.26
103 0.27
104 0.31
105 0.3
106 0.31
107 0.34
108 0.33
109 0.33
110 0.27
111 0.24
112 0.19
113 0.16
114 0.16
115 0.11
116 0.12
117 0.1
118 0.1
119 0.11
120 0.14
121 0.21
122 0.26
123 0.29
124 0.33
125 0.32
126 0.35
127 0.41
128 0.42
129 0.37
130 0.32
131 0.38
132 0.35
133 0.36
134 0.35
135 0.28
136 0.27
137 0.27
138 0.27
139 0.21
140 0.2
141 0.2
142 0.19
143 0.21
144 0.18
145 0.16
146 0.14
147 0.12
148 0.14
149 0.13
150 0.15
151 0.13
152 0.15
153 0.18
154 0.22
155 0.28
156 0.31
157 0.35
158 0.35
159 0.43
160 0.46
161 0.5
162 0.52
163 0.51
164 0.48
165 0.46
166 0.45
167 0.42
168 0.47
169 0.49
170 0.52
171 0.54
172 0.56
173 0.64
174 0.73
175 0.75
176 0.74
177 0.74
178 0.74
179 0.73
180 0.73
181 0.71
182 0.66
183 0.6
184 0.52
185 0.48
186 0.43
187 0.38
188 0.38
189 0.34
190 0.29
191 0.27
192 0.29
193 0.27
194 0.28
195 0.29
196 0.3
197 0.27
198 0.27
199 0.26
200 0.22
201 0.2
202 0.14
203 0.12
204 0.06
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.04
212 0.05
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.09
223 0.08
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.11
231 0.12
232 0.12
233 0.13
234 0.15
235 0.16
236 0.22
237 0.22
238 0.22
239 0.24
240 0.23
241 0.26
242 0.33
243 0.36
244 0.36
245 0.42
246 0.44
247 0.46
248 0.53
249 0.57
250 0.53
251 0.54
252 0.52
253 0.53
254 0.53
255 0.49
256 0.41
257 0.33
258 0.28
259 0.22
260 0.18
261 0.1
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.13
290 0.15
291 0.17
292 0.15
293 0.16
294 0.16
295 0.16
296 0.2
297 0.21
298 0.23
299 0.25
300 0.27
301 0.29
302 0.3
303 0.32
304 0.31
305 0.27
306 0.28
307 0.27
308 0.28
309 0.25
310 0.25
311 0.23
312 0.19
313 0.2
314 0.17
315 0.19
316 0.19
317 0.2
318 0.23
319 0.28
320 0.33
321 0.33
322 0.37
323 0.34
324 0.34
325 0.32
326 0.29
327 0.24
328 0.19
329 0.16
330 0.1
331 0.07
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.04
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.04
349 0.04
350 0.05
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.05
358 0.05
359 0.06
360 0.06
361 0.08
362 0.09
363 0.09
364 0.1
365 0.11
366 0.11
367 0.11
368 0.12
369 0.14
370 0.18
371 0.18
372 0.17
373 0.17
374 0.18
375 0.17
376 0.22
377 0.22
378 0.19
379 0.19
380 0.2
381 0.2
382 0.21
383 0.22
384 0.17
385 0.15
386 0.15
387 0.15
388 0.16
389 0.16
390 0.15
391 0.16
392 0.14
393 0.13
394 0.13
395 0.15
396 0.15
397 0.15
398 0.13
399 0.12
400 0.12
401 0.11
402 0.1
403 0.09
404 0.09
405 0.1
406 0.14
407 0.19
408 0.2
409 0.21
410 0.24
411 0.27
412 0.26
413 0.3
414 0.26
415 0.2
416 0.21
417 0.21
418 0.18
419 0.17
420 0.17
421 0.14
422 0.16
423 0.18
424 0.24
425 0.24
426 0.31
427 0.32
428 0.34
429 0.33
430 0.32
431 0.31
432 0.24
433 0.23
434 0.17
435 0.16
436 0.12
437 0.12
438 0.11
439 0.1
440 0.11
441 0.12
442 0.1
443 0.08
444 0.08
445 0.1
446 0.1
447 0.11
448 0.11
449 0.12
450 0.11
451 0.12
452 0.17
453 0.15
454 0.15
455 0.15
456 0.17
457 0.17
458 0.19
459 0.19
460 0.14
461 0.14
462 0.14
463 0.13
464 0.1
465 0.08
466 0.06
467 0.05
468 0.04
469 0.03
470 0.03
471 0.05
472 0.05
473 0.06
474 0.06
475 0.07
476 0.08
477 0.1
478 0.13
479 0.15
480 0.16
481 0.16
482 0.17
483 0.16
484 0.15
485 0.14
486 0.13
487 0.1
488 0.1
489 0.09
490 0.09
491 0.12
492 0.15
493 0.17
494 0.15
495 0.15
496 0.18
497 0.2
498 0.2
499 0.19
500 0.16
501 0.15
502 0.16
503 0.16
504 0.15
505 0.19
506 0.18
507 0.17
508 0.16
509 0.16
510 0.14
511 0.18
512 0.18
513 0.13
514 0.13
515 0.13
516 0.15
517 0.15
518 0.16
519 0.12
520 0.09
521 0.1
522 0.12
523 0.11
524 0.12
525 0.11
526 0.1
527 0.09
528 0.09
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.06
536 0.07
537 0.07
538 0.05
539 0.05
540 0.06
541 0.07
542 0.09
543 0.1
544 0.1
545 0.1
546 0.11
547 0.1
548 0.09
549 0.08
550 0.08
551 0.07
552 0.12
553 0.12
554 0.13
555 0.14
556 0.14
557 0.14
558 0.16
559 0.23
560 0.21
561 0.23
562 0.23
563 0.24
564 0.25
565 0.25
566 0.25
567 0.18
568 0.16
569 0.16
570 0.17
571 0.17
572 0.22
573 0.26
574 0.29
575 0.37
576 0.39
577 0.38
578 0.38
579 0.39
580 0.37
581 0.35
582 0.32
583 0.26
584 0.28
585 0.32
586 0.31
587 0.28
588 0.26
589 0.24
590 0.21
591 0.19
592 0.13
593 0.08
594 0.07
595 0.07
596 0.05
597 0.04
598 0.04
599 0.04
600 0.04
601 0.04
602 0.05
603 0.04
604 0.04
605 0.04
606 0.04
607 0.04
608 0.04
609 0.03
610 0.03
611 0.03
612 0.05
613 0.05
614 0.07
615 0.11
616 0.15
617 0.2
618 0.25
619 0.33
620 0.42
621 0.48
622 0.55
623 0.63
624 0.69
625 0.73
626 0.79
627 0.75
628 0.72
629 0.7
630 0.65
631 0.6
632 0.62
633 0.57
634 0.53
635 0.59
636 0.54
637 0.51
638 0.51
639 0.46
640 0.38
641 0.39
642 0.34
643 0.25
644 0.27
645 0.27
646 0.25
647 0.26
648 0.24
649 0.2
650 0.21
651 0.21
652 0.18
653 0.15
654 0.2
655 0.22
656 0.23
657 0.21
658 0.19
659 0.23
660 0.26
661 0.27
662 0.23
663 0.22
664 0.21
665 0.27
666 0.28
667 0.24
668 0.25
669 0.27
670 0.27
671 0.29
672 0.36
673 0.33
674 0.37
675 0.36
676 0.36
677 0.39
678 0.4
679 0.4
680 0.38
681 0.37
682 0.32
683 0.33
684 0.29
685 0.25
686 0.23
687 0.21
688 0.2
689 0.2
690 0.23
691 0.24
692 0.27
693 0.29
694 0.3
695 0.32
696 0.31
697 0.3
698 0.26
699 0.25
700 0.24
701 0.23
702 0.21
703 0.18
704 0.18
705 0.2
706 0.23
707 0.26
708 0.25
709 0.23
710 0.27
711 0.31
712 0.31
713 0.29
714 0.27
715 0.28
716 0.28
717 0.28
718 0.24
719 0.21
720 0.16
721 0.15
722 0.19
723 0.15
724 0.14
725 0.13
726 0.13
727 0.12
728 0.12
729 0.13
730 0.1
731 0.11
732 0.14
733 0.14
734 0.16
735 0.17
736 0.17
737 0.15
738 0.16
739 0.16
740 0.14
741 0.14
742 0.12
743 0.13
744 0.13
745 0.13
746 0.13
747 0.12
748 0.12
749 0.11
750 0.12
751 0.1
752 0.13
753 0.14
754 0.2
755 0.29
756 0.35
757 0.41
758 0.43
759 0.45
760 0.45
761 0.51
762 0.51
763 0.47
764 0.4
765 0.37
766 0.37
767 0.38
768 0.37
769 0.33
770 0.26
771 0.22
772 0.21
773 0.17
774 0.15
775 0.12
776 0.1
777 0.09
778 0.14
779 0.22
780 0.24
781 0.26
782 0.27
783 0.27
784 0.29
785 0.36
786 0.35
787 0.36
788 0.4
789 0.41
790 0.5
791 0.55
792 0.57
793 0.56
794 0.62
795 0.63
796 0.69
797 0.75
798 0.76
799 0.8
800 0.83
801 0.85
802 0.84
803 0.82
804 0.8
805 0.8
806 0.77
807 0.78
808 0.77
809 0.74
810 0.74
811 0.69
812 0.64
813 0.63
814 0.61
815 0.59
816 0.59
817 0.6
818 0.61
819 0.66
820 0.65
821 0.59
822 0.53
823 0.46
824 0.44
825 0.42
826 0.43
827 0.41
828 0.45
829 0.45
830 0.48
831 0.49
832 0.43